MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1 chromosome

Total Repeats: 74307

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
23001	NC_008340	AGG	2	6	1021317	1021322	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114320063
23002	NC_008340	CAG	2	6	1021327	1021332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114320063
23003	NC_008340	TGG	2	6	1021335	1021340	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114320063
23004	NC_008340	GAG	2	6	1021451	1021456	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114320063
23005	NC_008340	TGC	2	6	1021467	1021472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114320063
23006	NC_008340	CAG	2	6	1021478	1021483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114320063
23007	NC_008340	AGC	2	6	1021561	1021566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114320063
23008	NC_008340	CCA	2	6	1021578	1021583	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114320064
23009	NC_008340	CAG	2	6	1021622	1021627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114320064
23010	NC_008340	CGGC	2	8	1021663	1021670	0 %	0 %	50 %	50 %	114320064
23011	NC_008340	GAC	2	6	1021688	1021693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114320064
23012	NC_008340	CCGG	2	8	1021694	1021701	0 %	0 %	50 %	50 %	114320064
23013	NC_008340	CTGGAG	2	12	1021715	1021726	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	114320064
23014	NC_008340	GGC	2	6	1021855	1021860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114320064
23015	NC_008340	CGGG	2	8	1022016	1022023	0 %	0 %	75 %	25 %	114320064
23016	NC_008340	GGT	2	6	1022026	1022031	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114320064
23017	NC_008340	CAGCGG	2	12	1022170	1022181	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	114320064
23018	NC_008340	CAT	2	6	1022182	1022187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114320064
23019	NC_008340	CGCC	2	8	1022202	1022209	0 %	0 %	25 %	75 %	114320064
23020	NC_008340	CGA	2	6	1022290	1022295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114320064
23021	NC_008340	CGGTGG	2	12	1022301	1022312	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	114320064
23022	NC_008340	CCG	2	6	1022364	1022369	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114320064
23023	NC_008340	CGGC	2	8	1022401	1022408	0 %	0 %	50 %	50 %	114320064
23024	NC_008340	GGA	2	6	1022410	1022415	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114320064
23025	NC_008340	CAA	2	6	1022470	1022475	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114320064
23026	NC_008340	GAC	2	6	1022495	1022500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114320064
23027	NC_008340	AAT	2	6	1022519	1022524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114320064
23028	NC_008340	CAT	2	6	1022569	1022574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114320064
23029	NC_008340	CTG	2	6	1022645	1022650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114320064
23030	NC_008340	TGG	2	6	1022724	1022729	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114320064
23031	NC_008340	GCA	2	6	1022743	1022748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114320064
23032	NC_008340	CAGC	2	8	1022820	1022827	25 %	0 %	25 %	50 %	114320065
23033	NC_008340	CGC	2	6	1022835	1022840	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114320065
23034	NC_008340	CGGC	2	8	1022851	1022858	0 %	0 %	50 %	50 %	114320065
23035	NC_008340	CGA	2	6	1022877	1022882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114320065
23036	NC_008340	GC	3	6	1022927	1022932	0 %	0 %	50 %	50 %	114320065
23037	NC_008340	CG	3	6	1022941	1022946	0 %	0 %	50 %	50 %	114320065
23038	NC_008340	CCA	2	6	1022973	1022978	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114320065
23039	NC_008340	CCCCA	2	10	1023073	1023082	20 %	0 %	0 %	80 %	114320065
23040	NC_008340	CAG	2	6	1023091	1023096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114320065
23041	NC_008340	GCC	2	6	1023125	1023130	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114320065
23042	NC_008340	CCG	2	6	1023143	1023148	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114320065
23043	NC_008340	CAG	2	6	1023175	1023180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114320065
23044	NC_008340	CCG	2	6	1023181	1023186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114320065
23045	NC_008340	CCT	2	6	1023234	1023239	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114320065
23046	NC_008340	CAG	2	6	1023268	1023273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114320065
23047	NC_008340	AGC	2	6	1023360	1023365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114320065
23048	NC_008340	CCA	2	6	1023376	1023381	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114320065
23049	NC_008340	GTG	2	6	1023394	1023399	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114320065
23050	NC_008340	GC	3	6	1023468	1023473	0 %	0 %	50 %	50 %	114320066
23051	NC_008340	CAG	2	6	1023516	1023521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114320066
23052	NC_008340	GCACC	2	10	1023608	1023617	20 %	0 %	20 %	60 %	114320066
23053	NC_008340	GTG	2	6	1023646	1023651	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114320066
23054	NC_008340	CGG	2	6	1023662	1023667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114320066
23055	NC_008340	GCC	2	6	1023697	1023702	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114320066
23056	NC_008340	GGC	2	6	1023771	1023776	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114320066
23057	NC_008340	GCA	2	6	1023788	1023793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114320066
23058	NC_008340	GGCA	2	8	1023796	1023803	25 %	0 %	50 %	25 %	114320066
23059	NC_008340	GCA	2	6	1023914	1023919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114320066
23060	NC_008340	GCC	2	6	1023929	1023934	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114320066
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23062	NC_008340	GTC	2	6	1023963	1023968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114320066
23063	NC_008340	CCG	2	6	1023974	1023979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114320066
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23066	NC_008340	CCGCC	2	10	1024124	1024133	0 %	0 %	20 %	80 %	114320066
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23068	NC_008340	GAT	2	6	1024161	1024166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114320066
23069	NC_008340	GCC	2	6	1024186	1024191	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114320066
23070	NC_008340	GCC	2	6	1024251	1024256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114320067
23071	NC_008340	GC	3	6	1024264	1024269	0 %	0 %	50 %	50 %	114320067
23072	NC_008340	GCCA	2	8	1024280	1024287	25 %	0 %	25 %	50 %	114320067
23073	NC_008340	GCTCCA	2	12	1024344	1024355	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	114320067
23074	NC_008340	CAG	2	6	1024357	1024362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114320067
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23077	NC_008340	GAA	2	6	1024444	1024449	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114320067
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23079	NC_008340	CTG	3	9	1024468	1024476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114320067
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23083	NC_008340	GCA	2	6	1024515	1024520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114320067
23084	NC_008340	TCC	2	6	1024556	1024561	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114320067
23085	NC_008340	GCCCG	2	10	1024575	1024584	0 %	0 %	40 %	60 %	114320067
23086	NC_008340	GGC	2	6	1024590	1024595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114320067
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23088	NC_008340	TGA	2	6	1024788	1024793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114320067
23089	NC_008340	CCA	2	6	1024903	1024908	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114320067
23090	NC_008340	GGCCC	2	10	1024918	1024927	0 %	0 %	40 %	60 %	114320067
23091	NC_008340	CAG	2	6	1024990	1024995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114320067
23092	NC_008340	CCCGT	2	10	1024996	1025005	0 %	20 %	20 %	60 %	114320067
23093	NC_008340	CAG	2	6	1025023	1025028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114320067
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23097	NC_008340	GAG	2	6	1025286	1025291	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114320068
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23099	NC_008340	TGG	2	6	1025365	1025370	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114320068
23100	NC_008340	CAC	2	6	1025480	1025485	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114320068
23101	NC_008340	CTG	2	6	1025493	1025498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114320068
23102	NC_008340	CTG	2	6	1025543	1025548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114320068
23103	NC_008340	TGCC	2	8	1025597	1025604	0 %	25 %	25 %	50 %	114320068
23104	NC_008340	GCC	2	6	1025613	1025618	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114320068
23105	NC_008340	CGA	2	6	1025630	1025635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114320068
23106	NC_008340	GGA	2	6	1025735	1025740	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114320068
23107	NC_008340	GCGG	2	8	1025765	1025772	0 %	0 %	75 %	25 %	114320068
23108	NC_008340	CTG	2	6	1025805	1025810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114320068
23109	NC_008340	C	6	6	1025825	1025830	0 %	0 %	0 %	100 %	114320068
23110	NC_008340	CGG	3	9	1025846	1025854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114320068
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23112	NC_008340	TGG	2	6	1025879	1025884	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114320068
23113	NC_008340	CGGTG	2	10	1025936	1025945	0 %	20 %	60 %	20 %	114320068
23114	NC_008340	TGC	2	6	1026001	1026006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114320068
23115	NC_008340	GAT	2	6	1026026	1026031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114320068
23116	NC_008340	GCG	2	6	1026041	1026046	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114320068
23117	NC_008340	GTCCCA	2	12	1026149	1026160	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	114320068
23118	NC_008340	AGG	2	6	1026199	1026204	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114320068
23119	NC_008340	GGGGC	2	10	1026248	1026257	0 %	0 %	80 %	20 %	114320068
23120	NC_008340	GGC	2	6	1026269	1026274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114320068
23121	NC_008340	GC	3	6	1026338	1026343	0 %	0 %	50 %	50 %	114320068
23122	NC_008340	GGA	2	6	1026347	1026352	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114320068
23123	NC_008340	ATCCAG	2	12	1026372	1026383	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	114320068
23124	NC_008340	ACAGTT	2	12	1026424	1026435	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	114320068
23125	NC_008340	GCG	2	6	1026460	1026465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114320068
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23127	NC_008340	GGC	2	6	1026646	1026651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114320069
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23129	NC_008340	TGCG	2	8	1026788	1026795	0 %	25 %	50 %	25 %	114320069
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23133	NC_008340	GCTG	2	8	1026885	1026892	0 %	25 %	50 %	25 %	114320069
23134	NC_008340	GAT	2	6	1026925	1026930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114320069
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23138	NC_008340	CTGC	2	8	1027057	1027064	0 %	25 %	25 %	50 %	114320069
23139	NC_008340	GCC	2	6	1027114	1027119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114320069
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23143	NC_008340	CGA	2	6	1027219	1027224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114320069
23144	NC_008340	CCA	2	6	1027390	1027395	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114320069
23145	NC_008340	TGC	2	6	1027434	1027439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114320069
23146	NC_008340	GCTG	2	8	1027452	1027459	0 %	25 %	50 %	25 %	114320069
23147	NC_008340	TGC	2	6	1027494	1027499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114320069
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23149	NC_008340	CCGG	2	8	1027546	1027553	0 %	0 %	50 %	50 %	114320069
23150	NC_008340	AG	3	6	1027598	1027603	50 %	0 %	50 %	0 %	114320069
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23222	NC_008340	GGGC	2	8	1030302	1030309	0 %	0 %	75 %	25 %	114320072
23223	NC_008340	GCC	2	6	1030313	1030318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114320072
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23228	NC_008340	TCC	2	6	1030637	1030642	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114320072
23229	NC_008340	CGG	2	6	1030650	1030655	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114320072
23230	NC_008340	CATG	2	8	1030665	1030672	25 %	25 %	25 %	25 %	114320072
23231	NC_008340	GCACCC	2	12	1030701	1030712	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	114320072
23232	NC_008340	GGT	2	6	1030776	1030781	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114320072
23233	NC_008340	CGT	2	6	1030791	1030796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114320072
23234	NC_008340	TCC	2	6	1030823	1030828	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114320072
23235	NC_008340	CGATCA	2	12	1030857	1030868	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	114320072
23236	NC_008340	CG	3	6	1030879	1030884	0 %	0 %	50 %	50 %	114320072
23237	NC_008340	GCCG	2	8	1030905	1030912	0 %	0 %	50 %	50 %	114320072
23238	NC_008340	GAA	2	6	1030924	1030929	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114320072
23239	NC_008340	GGT	2	6	1030948	1030953	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114320072
23240	NC_008340	GCC	2	6	1030954	1030959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114320072
23241	NC_008340	GCCGT	2	10	1030985	1030994	0 %	20 %	40 %	40 %	114320072
23242	NC_008340	GCC	2	6	1031019	1031024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114320072
23243	NC_008340	CCG	2	6	1031028	1031033	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114320072
23244	NC_008340	TCA	2	6	1031058	1031063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114320072
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23246	NC_008340	TGTGGG	2	12	1031106	1031117	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114320072
23247	NC_008340	GTGC	2	8	1031139	1031146	0 %	25 %	50 %	25 %	114320072
23248	NC_008340	GAT	2	6	1031212	1031217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114320072
23249	NC_008340	GTG	2	6	1031242	1031247	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114320072
23250	NC_008340	GCA	2	6	1031250	1031255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114320072
23251	NC_008340	TCC	2	6	1031261	1031266	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114320072
23252	NC_008340	GCGG	2	8	1031287	1031294	0 %	0 %	75 %	25 %	114320072
23253	NC_008340	CGG	3	9	1031589	1031597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114320073
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23259	NC_008340	GCC	2	6	1031810	1031815	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114320073
23260	NC_008340	GGC	2	6	1031824	1031829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114320073
23261	NC_008340	CGG	2	6	1031834	1031839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114320073
23262	NC_008340	GTC	2	6	1031849	1031854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114320073
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23264	NC_008340	GGC	2	6	1031941	1031946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114320073
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23268	NC_008340	GGT	2	6	1032022	1032027	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114320073
23269	NC_008340	CGGG	2	8	1032031	1032038	0 %	0 %	75 %	25 %	114320073
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23303	NC_008340	GGA	2	6	1033024	1033029	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114320074
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23313	NC_008340	ATG	2	6	1033444	1033449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114320075
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23316	NC_008340	GC	3	6	1033557	1033562	0 %	0 %	50 %	50 %	114320075
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23320	NC_008340	GC	3	6	1033668	1033673	0 %	0 %	50 %	50 %	114320075
23321	NC_008340	ACC	2	6	1033733	1033738	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114320075
23322	NC_008340	GCGACA	2	12	1033748	1033759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114320075
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23327	NC_008340	GAC	2	6	1033996	1034001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114320075
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23331	NC_008340	GCC	2	6	1034218	1034223	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114320075
23332	NC_008340	CGC	2	6	1034241	1034246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114320075
23333	NC_008340	CTT	2	6	1034391	1034396	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114320075
23334	NC_008340	GCT	2	6	1034448	1034453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114320075
23335	NC_008340	GGCCA	2	10	1034527	1034536	20 %	0 %	40 %	40 %	114320075
23336	NC_008340	ACC	2	6	1034584	1034589	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114320075
23337	NC_008340	GGC	2	6	1034625	1034630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114320075
23338	NC_008340	GGTCG	2	10	1034809	1034818	0 %	20 %	60 %	20 %	114320076
23339	NC_008340	TCG	2	6	1034837	1034842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114320076
23340	NC_008340	TCTCGA	2	12	1034862	1034873	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	114320076
23341	NC_008340	GTC	2	6	1034953	1034958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114320076
23342	NC_008340	AAG	2	6	1035005	1035010	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114320076
23343	NC_008340	GCT	2	6	1035099	1035104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114320076
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23345	NC_008340	TGT	2	6	1035141	1035146	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114320076
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23462	NC_008340	GGC	2	6	1040086	1040091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114320080
23463	NC_008340	GC	3	6	1040090	1040095	0 %	0 %	50 %	50 %	114320080
23464	NC_008340	CTC	2	6	1040098	1040103	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114320080
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23466	NC_008340	AGA	2	6	1040178	1040183	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114320080
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23475	NC_008340	GTC	2	6	1040662	1040667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114320080
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23480	NC_008340	CCT	2	6	1040874	1040879	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114320080
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23488	NC_008340	TCA	2	6	1041409	1041414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114320081
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23492	NC_008340	CA	3	6	1041493	1041498	50 %	0 %	0 %	50 %	114320081
23493	NC_008340	GC	3	6	1041500	1041505	0 %	0 %	50 %	50 %	114320081
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