MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1 chromosome

Total Repeats: 74307

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
22501	NC_008340	GGC	2	6	999701	999706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114320041
22502	NC_008340	GTG	2	6	999759	999764	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114320041
22503	NC_008340	GGCCG	2	10	999787	999796	0 %	0 %	60 %	40 %	114320041
22504	NC_008340	GGA	2	6	999800	999805	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114320041
22505	NC_008340	ATC	2	6	999891	999896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114320041
22506	NC_008340	CG	4	8	999902	999909	0 %	0 %	50 %	50 %	114320041
22507	NC_008340	CGC	2	6	999926	999931	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114320041
22508	NC_008340	T	6	6	1000101	1000106	0 %	100 %	0 %	0 %	114320042
22509	NC_008340	CTC	2	6	1000161	1000166	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114320042
22510	NC_008340	GC	3	6	1000236	1000241	0 %	0 %	50 %	50 %	114320042
22511	NC_008340	GCT	2	6	1000259	1000264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114320042
22512	NC_008340	CT	3	6	1000279	1000284	0 %	50 %	0 %	50 %	114320042
22513	NC_008340	CGG	3	9	1000292	1000300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114320042
22514	NC_008340	TCG	2	6	1000303	1000308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114320042
22515	NC_008340	CCT	2	6	1000340	1000345	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114320042
22516	NC_008340	AGCG	2	8	1000432	1000439	25 %	0 %	50 %	25 %	114320042
22517	NC_008340	CGG	2	6	1000469	1000474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114320042
22518	NC_008340	TCT	2	6	1000475	1000480	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114320042
22519	NC_008340	TGGT	2	8	1000486	1000493	0 %	50 %	50 %	0 %	114320042
22520	NC_008340	CCT	2	6	1000496	1000501	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114320042
22521	NC_008340	GCT	2	6	1000538	1000543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114320042
22522	NC_008340	GAGCCC	2	12	1000567	1000578	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	114320042
22523	NC_008340	CCA	2	6	1000616	1000621	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114320042
22524	NC_008340	CAG	2	6	1000638	1000643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114320042
22525	NC_008340	CTC	2	6	1000646	1000651	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114320042
22526	NC_008340	TTGGT	2	10	1000658	1000667	0 %	60 %	40 %	0 %	114320042
22527	NC_008340	CAG	2	6	1000768	1000773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114320043
22528	NC_008340	CAGG	2	8	1000813	1000820	25 %	0 %	50 %	25 %	114320043
22529	NC_008340	CAC	2	6	1000822	1000827	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114320043
22530	NC_008340	AGC	2	6	1000838	1000843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114320043
22531	NC_008340	AGC	2	6	1000853	1000858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114320043
22532	NC_008340	CAC	3	9	1000864	1000872	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114320043
22533	NC_008340	GGT	2	6	1000951	1000956	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114320043
22534	NC_008340	GGCGCA	2	12	1000968	1000979	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	114320043
22535	NC_008340	CGT	2	6	1001007	1001012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114320043
22536	NC_008340	CCA	2	6	1001049	1001054	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114320043
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22538	NC_008340	CAC	2	6	1001089	1001094	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114320043
22539	NC_008340	GTG	2	6	1001114	1001119	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114320043
22540	NC_008340	CAG	2	6	1001146	1001151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114320043
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22542	NC_008340	GCGGT	2	10	1001169	1001178	0 %	20 %	60 %	20 %	114320043
22543	NC_008340	AGC	2	6	1001243	1001248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114320043
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22545	NC_008340	GCA	2	6	1001265	1001270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114320043
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22548	NC_008340	GCCG	2	8	1001326	1001333	0 %	0 %	50 %	50 %	114320043
22549	NC_008340	CGC	2	6	1001374	1001379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114320043
22550	NC_008340	GGTC	2	8	1001385	1001392	0 %	25 %	50 %	25 %	114320043
22551	NC_008340	TGG	2	6	1001553	1001558	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114320043
22552	NC_008340	CGC	2	6	1001650	1001655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114320043
22553	NC_008340	CGG	2	6	1001670	1001675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114320043
22554	NC_008340	GTC	2	6	1001734	1001739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114320043
22555	NC_008340	GTC	2	6	1001824	1001829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114320043
22556	NC_008340	TGGG	2	8	1001889	1001896	0 %	25 %	75 %	0 %	114320043
22557	NC_008340	CAC	2	6	1001899	1001904	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114320043
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22562	NC_008340	GCGG	2	8	1002016	1002023	0 %	0 %	75 %	25 %	114320043
22563	NC_008340	GCC	2	6	1002046	1002051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114320043
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22585	NC_008340	TCA	2	6	1002714	1002719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114320043
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22603	NC_008340	ACCC	2	8	1003366	1003373	25 %	0 %	0 %	75 %	114320043
22604	NC_008340	CCAG	2	8	1003410	1003417	25 %	0 %	25 %	50 %	114320043
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22610	NC_008340	CGGCG	2	10	1003714	1003723	0 %	0 %	60 %	40 %	114320043
22611	NC_008340	GCA	2	6	1003770	1003775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114320043
22612	NC_008340	CAG	2	6	1003810	1003815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114320043
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22616	NC_008340	CAC	2	6	1003995	1004000	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114320044
22617	NC_008340	CGCC	2	8	1004051	1004058	0 %	0 %	25 %	75 %	114320044
22618	NC_008340	GCT	2	6	1004069	1004074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114320044
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22962	NC_008340	CTG	2	6	1019765	1019770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114320063
22963	NC_008340	GCC	2	6	1019816	1019821	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114320063
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22989	NC_008340	GGC	2	6	1020817	1020822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114320063
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