MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1 chromosome

Total Repeats: 74307

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_008340	ACG	2	6	621698	621703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319733
14002	NC_008340	GGC	2	6	621776	621781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319733
14003	NC_008340	CGA	2	6	621891	621896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319733
14004	NC_008340	GGC	2	6	621900	621905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319733
14005	NC_008340	TCGG	2	8	621952	621959	0 %	25 %	50 %	25 %	114319733
14006	NC_008340	CGC	2	6	622026	622031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319733
14007	NC_008340	GCG	2	6	622068	622073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319733
14008	NC_008340	AAC	2	6	622438	622443	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114319734
14009	NC_008340	CGT	2	6	622479	622484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319734
14010	NC_008340	CGC	2	6	622508	622513	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319734
14011	NC_008340	CATC	2	8	622636	622643	25 %	25 %	0 %	50 %	114319735
14012	NC_008340	GGT	2	6	622714	622719	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319735
14013	NC_008340	CCG	2	6	622735	622740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319735
14014	NC_008340	GGGGC	2	10	622768	622777	0 %	0 %	80 %	20 %	114319735
14015	NC_008340	CGC	2	6	622792	622797	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319735
14016	NC_008340	GCTC	2	8	622937	622944	0 %	25 %	25 %	50 %	114319735
14017	NC_008340	GCC	2	6	623139	623144	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319735
14018	NC_008340	GC	3	6	623146	623151	0 %	0 %	50 %	50 %	114319735
14019	NC_008340	GGT	2	6	623188	623193	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319735
14020	NC_008340	CGA	2	6	623266	623271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319735
14021	NC_008340	ACC	2	6	623294	623299	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319735
14022	NC_008340	CGGT	2	8	623349	623356	0 %	25 %	50 %	25 %	114319735
14023	NC_008340	TGG	2	6	623382	623387	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319735
14024	NC_008340	GGA	2	6	623407	623412	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319735
14025	NC_008340	GGTG	2	8	623413	623420	0 %	25 %	75 %	0 %	114319735
14026	NC_008340	CTG	3	9	623429	623437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319735
14027	NC_008340	TGG	2	6	623442	623447	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319735
14028	NC_008340	CG	3	6	623476	623481	0 %	0 %	50 %	50 %	114319735
14029	NC_008340	GCA	2	6	623488	623493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319735
14030	NC_008340	CGGT	2	8	623568	623575	0 %	25 %	50 %	25 %	114319735
14031	NC_008340	TCC	2	6	623577	623582	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114319735
14032	NC_008340	CGA	2	6	623584	623589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319735
14033	NC_008340	CGG	2	6	623619	623624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319735
14034	NC_008340	CGA	2	6	623641	623646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319735
14035	NC_008340	GAG	2	6	623651	623656	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319735
14036	NC_008340	CCA	2	6	623713	623718	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319735
14037	NC_008340	GGC	2	6	623721	623726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319735
14038	NC_008340	GGA	3	9	623773	623781	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319735
14039	NC_008340	CTG	2	6	623795	623800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319735
14040	NC_008340	GAGACT	2	12	623864	623875	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	114319735
14041	NC_008340	GGC	2	6	624037	624042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319736
14042	NC_008340	GCG	2	6	624059	624064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319736
14043	NC_008340	GCC	2	6	624075	624080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319736
14044	NC_008340	CAA	2	6	624099	624104	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114319736
14045	NC_008340	AAG	2	6	624139	624144	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114319736
14046	NC_008340	GGC	2	6	624145	624150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319736
14047	NC_008340	CGG	3	9	624162	624170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319736
14048	NC_008340	TGC	2	6	624440	624445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319736
14049	NC_008340	AGC	2	6	624566	624571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319736
14050	NC_008340	GGT	2	6	624594	624599	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319736
14051	NC_008340	GGA	2	6	624642	624647	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319736
14052	NC_008340	GAG	3	9	624688	624696	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319736
14053	NC_008340	TGA	2	6	624707	624712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319736
14054	NC_008340	CGA	2	6	624720	624725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319736
14055	NC_008340	AGG	2	6	624812	624817	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319736
14056	NC_008340	GCC	2	6	624876	624881	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319736
14057	NC_008340	CAG	2	6	624931	624936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319736
14058	NC_008340	GAG	2	6	625012	625017	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319736
14059	NC_008340	CAG	2	6	625161	625166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319736
14060	NC_008340	GGT	2	6	625189	625194	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319736
14061	NC_008340	GGCGT	2	10	625235	625244	0 %	20 %	60 %	20 %	114319736
14062	NC_008340	ACG	2	6	625265	625270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319736
14063	NC_008340	GC	3	6	625273	625278	0 %	0 %	50 %	50 %	114319736
14064	NC_008340	CGC	2	6	625295	625300	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319736
14065	NC_008340	GGC	2	6	625303	625308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319736
14066	NC_008340	GC	4	8	625332	625339	0 %	0 %	50 %	50 %	114319736
14067	NC_008340	TGA	2	6	625369	625374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319736
14068	NC_008340	GAT	2	6	625379	625384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319737
14069	NC_008340	TGG	3	9	625408	625416	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319737
14070	NC_008340	CCG	2	6	625562	625567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319737
14071	NC_008340	TCG	2	6	625627	625632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319737
14072	NC_008340	CAG	2	6	625734	625739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319737
14073	NC_008340	CGA	2	6	625748	625753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319737
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14076	NC_008340	TGAGCG	2	12	625934	625945	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	114319737
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14083	NC_008340	TGC	2	6	626457	626462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319738
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14086	NC_008340	GCC	2	6	626495	626500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319738
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14088	NC_008340	C	6	6	626567	626572	0 %	0 %	0 %	100 %	114319738
14089	NC_008340	GCT	2	6	626593	626598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319738
14090	NC_008340	CACCGG	2	12	626599	626610	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	114319738
14091	NC_008340	CGGT	2	8	626656	626663	0 %	25 %	50 %	25 %	114319738
14092	NC_008340	GC	3	6	626699	626704	0 %	0 %	50 %	50 %	114319738
14093	NC_008340	GCCCG	2	10	626771	626780	0 %	0 %	40 %	60 %	114319738
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14097	NC_008340	ACCTGG	2	12	626913	626924	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	114319738
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14100	NC_008340	GCT	2	6	626989	626994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319738
14101	NC_008340	CGA	2	6	627040	627045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319738
14102	NC_008340	TGC	2	6	627075	627080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319738
14103	NC_008340	CGG	2	6	627100	627105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319738
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14105	NC_008340	CGT	2	6	627206	627211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319738
14106	NC_008340	CGC	2	6	627283	627288	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319738
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14110	NC_008340	GC	3	6	627502	627507	0 %	0 %	50 %	50 %	114319738
14111	NC_008340	GTG	2	6	627521	627526	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319738
14112	NC_008340	CAG	2	6	627542	627547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319738
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14114	NC_008340	CCG	2	6	627574	627579	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319738
14115	NC_008340	GCA	2	6	627583	627588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319738
14116	NC_008340	GAC	2	6	627590	627595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319738
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14118	NC_008340	GTA	2	6	627707	627712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319739
14119	NC_008340	AGGGCA	2	12	627738	627749	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	114319739
14120	NC_008340	GGT	2	6	627751	627756	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319739
14121	NC_008340	GGT	2	6	627784	627789	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319739
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14123	NC_008340	GTG	2	6	627911	627916	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319739
14124	NC_008340	CTG	2	6	627932	627937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319739
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14131	NC_008340	CGC	2	6	628124	628129	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319739
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14137	NC_008340	CTG	2	6	628349	628354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319739
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14223	NC_008340	GCC	2	6	632545	632550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319742
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14229	NC_008340	GCG	2	6	632692	632697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319742
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14232	NC_008340	CGGG	2	8	632811	632818	0 %	0 %	75 %	25 %	114319742
14233	NC_008340	GTG	2	6	632851	632856	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319742
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14235	NC_008340	GAT	2	6	633087	633092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319743
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14237	NC_008340	GGA	2	6	633144	633149	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319743
14238	NC_008340	GCC	2	6	633155	633160	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319743
14239	NC_008340	CAA	2	6	633180	633185	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114319743
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14351	NC_008340	CGCT	2	8	638024	638031	0 %	25 %	25 %	50 %	114319748
14352	NC_008340	CAA	2	6	638107	638112	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114319748
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14475	NC_008340	CCA	2	6	644605	644610	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319753
14476	NC_008340	CCA	2	6	644632	644637	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319753
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14478	NC_008340	ACC	2	6	644683	644688	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319753
14479	NC_008340	GC	3	6	644800	644805	0 %	0 %	50 %	50 %	114319753
14480	NC_008340	TGA	2	6	644821	644826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319753
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14483	NC_008340	CAG	2	6	644925	644930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319753
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