MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1 chromosome

Total Repeats: 74307

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_008340	CGG	2	6	601405	601410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319715
13502	NC_008340	GTT	2	6	601437	601442	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114319715
13503	NC_008340	CGC	2	6	601446	601451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319715
13504	NC_008340	TCT	2	6	601606	601611	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114319716
13505	NC_008340	TCT	2	6	601627	601632	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114319716
13506	NC_008340	ACC	2	6	601677	601682	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319716
13507	NC_008340	TGA	2	6	601699	601704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319716
13508	NC_008340	GC	3	6	601733	601738	0 %	0 %	50 %	50 %	114319716
13509	NC_008340	CCT	2	6	601741	601746	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114319716
13510	NC_008340	GGCC	2	8	601804	601811	0 %	0 %	50 %	50 %	114319716
13511	NC_008340	CCA	2	6	601837	601842	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319716
13512	NC_008340	CCT	2	6	601876	601881	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114319716
13513	NC_008340	CGT	2	6	601918	601923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319716
13514	NC_008340	GCA	3	9	601963	601971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319716
13515	NC_008340	GCG	2	6	602015	602020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319716
13516	NC_008340	CGG	2	6	602062	602067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319716
13517	NC_008340	CCA	2	6	602074	602079	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319716
13518	NC_008340	ATG	2	6	602112	602117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319716
13519	NC_008340	GCG	2	6	602140	602145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319716
13520	NC_008340	TGC	2	6	602151	602156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319716
13521	NC_008340	TGA	2	6	602170	602175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319716
13522	NC_008340	GGGT	2	8	602187	602194	0 %	25 %	75 %	0 %	114319716
13523	NC_008340	GCG	2	6	602231	602236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319716
13524	NC_008340	GCA	2	6	602245	602250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319716
13525	NC_008340	GTC	2	6	602258	602263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319716
13526	NC_008340	GGC	2	6	602342	602347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319716
13527	NC_008340	GAT	2	6	602411	602416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319716
13528	NC_008340	CGG	2	6	602449	602454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319716
13529	NC_008340	TCA	2	6	602482	602487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114319716
13530	NC_008340	TTG	2	6	602514	602519	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114319716
13531	NC_008340	GGT	2	6	602573	602578	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319716
13532	NC_008340	CCA	2	6	602710	602715	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319716
13533	NC_008340	GAT	2	6	602738	602743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319716
13534	NC_008340	CTTGGA	2	12	602768	602779	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	114319716
13535	NC_008340	TCT	2	6	602782	602787	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114319716
13536	NC_008340	CGT	2	6	602839	602844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319716
13537	NC_008340	CAT	2	6	602861	602866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114319716
13538	NC_008340	ATC	2	6	602868	602873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114319716
13539	NC_008340	AGA	3	9	602884	602892	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114319716
13540	NC_008340	TCG	2	6	602952	602957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319716
13541	NC_008340	CGTCCT	2	12	603013	603024	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	114319716
13542	NC_008340	GC	3	6	603057	603062	0 %	0 %	50 %	50 %	114319716
13543	NC_008340	CCT	3	9	603064	603072	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114319716
13544	NC_008340	CGT	2	6	603103	603108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319716
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13547	NC_008340	GTA	2	6	603182	603187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319716
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13549	NC_008340	CGC	2	6	603322	603327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319716
13550	NC_008340	GT	3	6	603340	603345	0 %	50 %	50 %	0 %	114319716
13551	NC_008340	TCC	2	6	603348	603353	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114319716
13552	NC_008340	CAG	2	6	603362	603367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319716
13553	NC_008340	GC	3	6	603401	603406	0 %	0 %	50 %	50 %	114319716
13554	NC_008340	GGC	2	6	603455	603460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319716
13555	NC_008340	GTC	2	6	603578	603583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319716
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13558	NC_008340	CGG	2	6	603676	603681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319716
13559	NC_008340	CCGG	2	8	603700	603707	0 %	0 %	50 %	50 %	114319716
13560	NC_008340	GTG	2	6	603708	603713	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319716
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13563	NC_008340	CGG	2	6	603808	603813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319716
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13570	NC_008340	GTC	2	6	604533	604538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319717
13571	NC_008340	GCC	3	9	604639	604647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319717
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13573	NC_008340	CCAGGC	2	12	604676	604687	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	114319717
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13575	NC_008340	CGGCA	2	10	604866	604875	20 %	0 %	40 %	40 %	114319717
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13577	NC_008340	GTCC	2	8	604976	604983	0 %	25 %	25 %	50 %	114319717
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13585	NC_008340	CAG	2	6	605481	605486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319718
13586	NC_008340	CGG	2	6	605497	605502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319718
13587	NC_008340	CTG	2	6	605505	605510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319718
13588	NC_008340	TGGATA	2	12	605524	605535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319718
13589	NC_008340	CCA	2	6	605564	605569	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319718
13590	NC_008340	CCCGG	2	10	605665	605674	0 %	0 %	40 %	60 %	114319719
13591	NC_008340	AGC	2	6	605693	605698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319719
13592	NC_008340	CCGG	3	12	605703	605714	0 %	0 %	50 %	50 %	114319719
13593	NC_008340	GGC	2	6	605806	605811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319719
13594	NC_008340	GCCG	2	8	605821	605828	0 %	0 %	50 %	50 %	114319719
13595	NC_008340	GCT	2	6	605871	605876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319719
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13600	NC_008340	CGA	2	6	606033	606038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319719
13601	NC_008340	CGGG	2	8	606157	606164	0 %	0 %	75 %	25 %	114319719
13602	NC_008340	TGT	2	6	606183	606188	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114319719
13603	NC_008340	CAC	2	6	606199	606204	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319719
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13605	NC_008340	GGC	2	6	606265	606270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319719
13606	NC_008340	GCC	2	6	606302	606307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319719
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13608	NC_008340	CCA	2	6	606354	606359	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319719
13609	NC_008340	GCT	2	6	606369	606374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319719
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13612	NC_008340	CTC	2	6	606418	606423	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114319719
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13614	NC_008340	CTT	2	6	606466	606471	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114319719
13615	NC_008340	CTT	2	6	606685	606690	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114319719
13616	NC_008340	GTC	2	6	606727	606732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319719
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13974	NC_008340	CGT	2	6	620544	620549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319732
13975	NC_008340	CGC	2	6	620624	620629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319732
13976	NC_008340	TGG	2	6	620696	620701	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319732
13977	NC_008340	CATG	2	8	620703	620710	25 %	25 %	25 %	25 %	114319732
13978	NC_008340	GGT	2	6	620724	620729	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319732
13979	NC_008340	GCCA	2	8	620770	620777	25 %	0 %	25 %	50 %	114319732
13980	NC_008340	CTG	2	6	620782	620787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319732
13981	NC_008340	CGG	2	6	620813	620818	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319732
13982	NC_008340	GC	3	6	620835	620840	0 %	0 %	50 %	50 %	114319732
13983	NC_008340	CTG	2	6	620920	620925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319732
13984	NC_008340	GCC	2	6	620990	620995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319732
13985	NC_008340	GGA	2	6	621000	621005	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319732
13986	NC_008340	CCA	2	6	621026	621031	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319732
13987	NC_008340	GC	3	6	621051	621056	0 %	0 %	50 %	50 %	114319732
13988	NC_008340	CGG	2	6	621061	621066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319732
13989	NC_008340	GCT	2	6	621090	621095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319732
13990	NC_008340	CGGC	2	8	621138	621145	0 %	0 %	50 %	50 %	114319732
13991	NC_008340	CCGT	2	8	621218	621225	0 %	25 %	25 %	50 %	114319733
13992	NC_008340	TGGCCC	2	12	621293	621304	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	114319733
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13994	NC_008340	CTG	2	6	621391	621396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319733
13995	NC_008340	GGC	2	6	621477	621482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319733
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13999	NC_008340	GGC	2	6	621657	621662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319733
14000	NC_008340	GGC	3	9	621675	621683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319733

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