MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1 chromosome

Total Repeats: 74307

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_008340	TGG	2	6	578607	578612	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319695
13002	NC_008340	GTG	2	6	578627	578632	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319695
13003	NC_008340	CG	3	6	578704	578709	0 %	0 %	50 %	50 %	114319695
13004	NC_008340	GAG	2	6	578729	578734	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319695
13005	NC_008340	GCC	2	6	578746	578751	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319695
13006	NC_008340	GGC	2	6	578772	578777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319695
13007	NC_008340	GCG	2	6	578820	578825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319695
13008	NC_008340	CGG	2	6	578988	578993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319695
13009	NC_008340	CGC	2	6	579024	579029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319695
13010	NC_008340	CGA	2	6	579115	579120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319695
13011	NC_008340	CTGCCC	2	12	579125	579136	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	114319695
13012	NC_008340	CTGTCC	2	12	579269	579280	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	114319695
13013	NC_008340	G	7	7	579281	579287	0 %	0 %	100 %	0 %	114319695
13014	NC_008340	GAT	2	6	579497	579502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319695
13015	NC_008340	GGCG	2	8	579561	579568	0 %	0 %	75 %	25 %	114319695
13016	NC_008340	GCCG	2	8	579601	579608	0 %	0 %	50 %	50 %	114319695
13017	NC_008340	CTG	2	6	579674	579679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319695
13018	NC_008340	GTG	2	6	579704	579709	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319695
13019	NC_008340	GCC	2	6	579721	579726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319695
13020	NC_008340	GGGT	2	8	579766	579773	0 %	25 %	75 %	0 %	114319695
13021	NC_008340	GCCG	2	8	579818	579825	0 %	0 %	50 %	50 %	114319695
13022	NC_008340	GCC	2	6	579926	579931	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319695
13023	NC_008340	CGA	2	6	579946	579951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319695
13024	NC_008340	GC	3	6	579996	580001	0 %	0 %	50 %	50 %	114319695
13025	NC_008340	GAG	2	6	580007	580012	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319695
13026	NC_008340	GTGG	2	8	580100	580107	0 %	25 %	75 %	0 %	114319695
13027	NC_008340	CGG	2	6	580165	580170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319695
13028	NC_008340	CGA	2	6	580249	580254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319695
13029	NC_008340	GCC	2	6	580259	580264	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319695
13030	NC_008340	GGT	3	9	580285	580293	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319695
13031	NC_008340	CCGG	2	8	580302	580309	0 %	0 %	50 %	50 %	114319695
13032	NC_008340	GAG	2	6	580310	580315	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319695
13033	NC_008340	CGG	2	6	580339	580344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319695
13034	NC_008340	CCTGGC	2	12	580366	580377	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	114319695
13035	NC_008340	CCTGG	2	10	580483	580492	0 %	20 %	40 %	40 %	114319695
13036	NC_008340	CTG	2	6	580528	580533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319695
13037	NC_008340	TG	4	8	580557	580564	0 %	50 %	50 %	0 %	114319695
13038	NC_008340	CGC	3	9	580579	580587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319695
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13040	NC_008340	GC	3	6	580669	580674	0 %	0 %	50 %	50 %	114319695
13041	NC_008340	GAC	2	6	580778	580783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319695
13042	NC_008340	GAG	2	6	580796	580801	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319695
13043	NC_008340	GC	3	6	580928	580933	0 %	0 %	50 %	50 %	114319695
13044	NC_008340	TGC	2	6	581019	581024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319695
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13050	NC_008340	GCGG	2	8	581364	581371	0 %	0 %	75 %	25 %	114319695
13051	NC_008340	CAG	2	6	581414	581419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319695
13052	NC_008340	GTG	4	12	581441	581452	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319695
13053	NC_008340	TGG	3	9	581472	581480	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319695
13054	NC_008340	GAG	2	6	581483	581488	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319695
13055	NC_008340	TGG	2	6	581493	581498	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319695
13056	NC_008340	TGGACG	2	12	581508	581519	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	114319695
13057	NC_008340	CGCTGA	2	12	581544	581555	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	114319695
13058	NC_008340	CGA	3	9	581608	581616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319695
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13060	NC_008340	CTG	2	6	581702	581707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319695
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13066	NC_008340	GAT	2	6	581917	581922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319695
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13084	NC_008340	CCCG	2	8	582619	582626	0 %	0 %	25 %	75 %	114319696
13085	NC_008340	CAC	2	6	582650	582655	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319696
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13089	NC_008340	TCGGT	2	10	582730	582739	0 %	40 %	40 %	20 %	114319696
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13092	NC_008340	GCA	2	6	582838	582843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319696
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13095	NC_008340	TCG	2	6	582894	582899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319696
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13102	NC_008340	TC	3	6	583309	583314	0 %	50 %	0 %	50 %	114319697
13103	NC_008340	CGC	2	6	583396	583401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319697
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13106	NC_008340	CGC	2	6	583453	583458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319697
13107	NC_008340	CCGTG	2	10	583462	583471	0 %	20 %	40 %	40 %	114319697
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13119	NC_008340	GGCC	2	8	583814	583821	0 %	0 %	50 %	50 %	114319697
13120	NC_008340	CGG	2	6	583843	583848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319697
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13341	NC_008340	GAC	2	6	594546	594551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319706
13342	NC_008340	ACG	2	6	594556	594561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319706
13343	NC_008340	CTGG	2	8	594756	594763	0 %	25 %	50 %	25 %	114319707
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13348	NC_008340	CTG	4	12	594919	594930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319707
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13354	NC_008340	CTT	2	6	595065	595070	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114319707
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13475	NC_008340	CTG	2	6	600596	600601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319713
13476	NC_008340	TCG	2	6	600615	600620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319713
13477	NC_008340	CAC	2	6	600658	600663	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319713
13478	NC_008340	GGC	2	6	600672	600677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319713
13479	NC_008340	ATC	2	6	600732	600737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114319713
13480	NC_008340	GGA	2	6	600781	600786	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319713
13481	NC_008340	CCG	2	6	600799	600804	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319713
13482	NC_008340	CGT	2	6	600857	600862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319714
13483	NC_008340	C	6	6	600865	600870	0 %	0 %	0 %	100 %	114319714
13484	NC_008340	GAT	2	6	600890	600895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319714
13485	NC_008340	GTG	2	6	600915	600920	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319714
13486	NC_008340	AGC	2	6	600928	600933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319714
13487	NC_008340	CTGC	2	8	600974	600981	0 %	25 %	25 %	50 %	114319714
13488	NC_008340	GC	3	6	600980	600985	0 %	0 %	50 %	50 %	114319714
13489	NC_008340	GCGGG	2	10	601010	601019	0 %	0 %	80 %	20 %	114319714
13490	NC_008340	CGG	2	6	601045	601050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319714
13491	NC_008340	GCT	2	6	601121	601126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319714
13492	NC_008340	CAA	2	6	601193	601198	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114319714
13493	NC_008340	CT	3	6	601210	601215	0 %	50 %	0 %	50 %	114319714
13494	NC_008340	CGG	2	6	601222	601227	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319714
13495	NC_008340	CGC	2	6	601248	601253	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319714
13496	NC_008340	G	6	6	601272	601277	0 %	0 %	100 %	0 %	114319714
13497	NC_008340	GGA	2	6	601280	601285	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319714
13498	NC_008340	TGG	2	6	601345	601350	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319715
13499	NC_008340	TGA	2	6	601358	601363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319715
13500	NC_008340	GGC	3	9	601371	601379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319715

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