MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1 chromosome

Total Repeats: 74307

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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12002	NC_008340	GCA	2	6	534562	534567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319649
12003	NC_008340	GT	3	6	534689	534694	0 %	50 %	50 %	0 %	114319650
12004	NC_008340	CGC	2	6	534736	534741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319650
12005	NC_008340	GCGG	2	8	534745	534752	0 %	0 %	75 %	25 %	114319650
12006	NC_008340	GAT	2	6	534832	534837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319650
12007	NC_008340	ACG	2	6	534870	534875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319650
12008	NC_008340	GT	3	6	534945	534950	0 %	50 %	50 %	0 %	114319650
12009	NC_008340	GCT	2	6	534961	534966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319650
12010	NC_008340	CGGC	2	8	535004	535011	0 %	0 %	50 %	50 %	114319650
12011	NC_008340	GGGC	2	8	535114	535121	0 %	0 %	75 %	25 %	114319650
12012	NC_008340	GC	3	6	535139	535144	0 %	0 %	50 %	50 %	114319650
12013	NC_008340	ATC	2	6	535193	535198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114319650
12014	NC_008340	GC	3	6	535213	535218	0 %	0 %	50 %	50 %	114319650
12015	NC_008340	CGG	2	6	535279	535284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319650
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12017	NC_008340	TGG	2	6	535413	535418	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319650
12018	NC_008340	CGC	2	6	535420	535425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319650
12019	NC_008340	GTG	3	9	535463	535471	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319650
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12022	NC_008340	CCCA	2	8	535592	535599	25 %	0 %	0 %	75 %	114319650
12023	NC_008340	TGC	2	6	535650	535655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319650
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12030	NC_008340	GGC	2	6	535792	535797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319650
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12034	NC_008340	TGG	2	6	535929	535934	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319651
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12039	NC_008340	AGCGCC	2	12	536187	536198	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	114319651
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12118	NC_008340	CGGA	2	8	540100	540107	25 %	0 %	50 %	25 %	114319654
12119	NC_008340	GAGC	2	8	540108	540115	25 %	0 %	50 %	25 %	114319654
12120	NC_008340	GCCG	2	8	540194	540201	0 %	0 %	50 %	50 %	114319654
12121	NC_008340	ACCGAG	2	12	540241	540252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319654
12122	NC_008340	GTG	2	6	540268	540273	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319654
12123	NC_008340	GCG	2	6	540304	540309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319654
12124	NC_008340	AT	3	6	540441	540446	50 %	50 %	0 %	0 %	114319655
12125	NC_008340	ACT	2	6	540457	540462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114319655
12126	NC_008340	GCG	2	6	540591	540596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319655
12127	NC_008340	CG	3	6	540611	540616	0 %	0 %	50 %	50 %	114319655
12128	NC_008340	GTG	2	6	540654	540659	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319655
12129	NC_008340	CGT	2	6	540670	540675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319655
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12133	NC_008340	GGC	2	6	541811	541816	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319656
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12153	NC_008340	CGA	2	6	542780	542785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319656
12154	NC_008340	CTG	2	6	542796	542801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319656
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12358	NC_008340	GAC	2	6	551073	551078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319664
12359	NC_008340	GTTGGC	2	12	551126	551137	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	114319664
12360	NC_008340	ACGTG	2	10	551178	551187	20 %	20 %	40 %	20 %	114319664
12361	NC_008340	GGCC	2	8	551306	551313	0 %	0 %	50 %	50 %	114319665
12362	NC_008340	GGA	2	6	551390	551395	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319665
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12368	NC_008340	G	6	6	551595	551600	0 %	0 %	100 %	0 %	114319665
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12477	NC_008340	CGG	2	6	555898	555903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319668
12478	NC_008340	TC	3	6	556008	556013	0 %	50 %	0 %	50 %	114319668
12479	NC_008340	GCG	2	6	556019	556024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319668
12480	NC_008340	CCA	2	6	556034	556039	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319668
12481	NC_008340	CTC	2	6	556080	556085	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114319668
12482	NC_008340	G	7	7	556096	556102	0 %	0 %	100 %	0 %	114319668
12483	NC_008340	CTG	2	6	556147	556152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319668
12484	NC_008340	TGG	2	6	556163	556168	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319668
12485	NC_008340	CGG	2	6	556176	556181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319668
12486	NC_008340	CGC	2	6	556197	556202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319668
12487	NC_008340	CCG	2	6	556289	556294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319668
12488	NC_008340	GCT	2	6	556380	556385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319668
12489	NC_008340	GTG	2	6	556390	556395	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319668
12490	NC_008340	ACG	2	6	556396	556401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319668
12491	NC_008340	GCGG	2	8	556409	556416	0 %	0 %	75 %	25 %	114319668
12492	NC_008340	GCC	2	6	556489	556494	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319668
12493	NC_008340	TCA	2	6	556572	556577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114319668
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12495	NC_008340	GCCT	2	8	556648	556655	0 %	25 %	25 %	50 %	114319668
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12498	NC_008340	CTG	2	6	556699	556704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319668
12499	NC_008340	TGA	2	6	556751	556756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319669
12500	NC_008340	CGC	2	6	556772	556777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319669

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