MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1 chromosome

Total Repeats: 74307

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_008340	CAA	2	6	511952	511957	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114319613
11502	NC_008340	GGT	2	6	512003	512008	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319613
11503	NC_008340	CAC	2	6	512013	512018	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319613
11504	NC_008340	CGTGAG	2	12	512079	512090	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	114319613
11505	NC_008340	CACC	2	8	512180	512187	25 %	0 %	0 %	75 %	114319613
11506	NC_008340	ATC	2	6	512190	512195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114319613
11507	NC_008340	TGG	2	6	512287	512292	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319613
11508	NC_008340	GGA	2	6	512363	512368	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319613
11509	NC_008340	TGG	2	6	512407	512412	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319613
11510	NC_008340	ACT	2	6	512461	512466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114319613
11511	NC_008340	CCG	2	6	512473	512478	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319613
11512	NC_008340	ATC	2	6	512484	512489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114319613
11513	NC_008340	TCC	2	6	512550	512555	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114319613
11514	NC_008340	GGT	2	6	512574	512579	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319613
11515	NC_008340	AGC	2	6	512683	512688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319613
11516	NC_008340	GAG	2	6	512724	512729	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319613
11517	NC_008340	GGTGA	2	10	512784	512793	20 %	20 %	60 %	0 %	114319613
11518	NC_008340	TCC	2	6	512824	512829	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114319613
11519	NC_008340	CTG	2	6	512832	512837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319613
11520	NC_008340	TGC	2	6	512944	512949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319613
11521	NC_008340	GCG	2	6	512992	512997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319613
11522	NC_008340	ATG	2	6	513031	513036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319613
11523	NC_008340	GGC	2	6	513044	513049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319613
11524	NC_008340	TGC	2	6	513079	513084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319613
11525	NC_008340	GAC	2	6	513146	513151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319613
11526	NC_008340	GCC	2	6	513168	513173	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319613
11527	NC_008340	TCG	2	6	513220	513225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319613
11528	NC_008340	CGG	2	6	513238	513243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319613
11529	NC_008340	GAG	2	6	513264	513269	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319613
11530	NC_008340	CGG	2	6	513273	513278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319613
11531	NC_008340	CGG	3	9	513298	513306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319613
11532	NC_008340	GTG	2	6	513325	513330	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319613
11533	NC_008340	AAC	2	6	513334	513339	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114319613
11534	NC_008340	GGA	2	6	513380	513385	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319613
11535	NC_008340	CGA	2	6	513532	513537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319614
11536	NC_008340	GCG	2	6	513619	513624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319614
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11538	NC_008340	CG	4	8	513683	513690	0 %	0 %	50 %	50 %	114319614
11539	NC_008340	GGT	2	6	513729	513734	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319614
11540	NC_008340	GTT	2	6	513762	513767	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114319614
11541	NC_008340	GGT	2	6	513777	513782	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319614
11542	NC_008340	GTG	2	6	513816	513821	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319614
11543	NC_008340	GTG	2	6	513823	513828	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319614
11544	NC_008340	CGG	2	6	513829	513834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319614
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11546	NC_008340	GCC	2	6	513856	513861	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319614
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11550	NC_008340	GTCGG	2	10	514184	514193	0 %	20 %	60 %	20 %	114319615
11551	NC_008340	GCG	2	6	514283	514288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319615
11552	NC_008340	ACC	2	6	514291	514296	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319615
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11554	NC_008340	CAA	2	6	514392	514397	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114319615
11555	NC_008340	CAT	2	6	514488	514493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114319616
11556	NC_008340	GAC	2	6	514515	514520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319616
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11558	NC_008340	ATCACC	2	12	514627	514638	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	114319616
11559	NC_008340	CGA	2	6	514646	514651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319616
11560	NC_008340	GCATC	2	10	514689	514698	20 %	20 %	20 %	40 %	114319616
11561	NC_008340	CAT	2	6	514701	514706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114319616
11562	NC_008340	GGTG	2	8	514791	514798	0 %	25 %	75 %	0 %	114319616
11563	NC_008340	CAA	2	6	514869	514874	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114319616
11564	NC_008340	TGG	2	6	515111	515116	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319616
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11566	NC_008340	CGA	2	6	515133	515138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319616
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11568	NC_008340	GCT	2	6	515277	515282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319616
11569	NC_008340	CGA	2	6	515382	515387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319616
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11571	NC_008340	GTG	2	6	515470	515475	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319616
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11574	NC_008340	GTGC	2	8	515575	515582	0 %	25 %	50 %	25 %	114319616
11575	NC_008340	CGC	3	9	515592	515600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319616
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11582	NC_008340	TCG	2	6	516053	516058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319616
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11585	NC_008340	ACG	2	6	516185	516190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319616
11586	NC_008340	CTC	2	6	516195	516200	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114319616
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11588	NC_008340	GAAG	2	8	516237	516244	50 %	0 %	50 %	0 %	114319616
11589	NC_008340	CAT	2	6	516279	516284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114319616
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11592	NC_008340	GGA	2	6	516369	516374	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319616
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11601	NC_008340	AAG	2	6	516639	516644	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114319617
11602	NC_008340	GAC	2	6	516689	516694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319617
11603	NC_008340	CGG	2	6	516700	516705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319617
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11605	NC_008340	GGA	2	6	516776	516781	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319617
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11611	NC_008340	TGG	2	6	517033	517038	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319617
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11618	NC_008340	TCGGG	2	10	517284	517293	0 %	20 %	60 %	20 %	114319617
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11976	NC_008340	ATC	2	6	533397	533402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114319648
11977	NC_008340	GGC	2	6	533462	533467	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319648
11978	NC_008340	GCA	2	6	533519	533524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319648
11979	NC_008340	CAT	2	6	533537	533542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114319648
11980	NC_008340	GC	3	6	533547	533552	0 %	0 %	50 %	50 %	114319648
11981	NC_008340	CCG	2	6	533572	533577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319648
11982	NC_008340	ATC	2	6	533685	533690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114319648
11983	NC_008340	GAG	2	6	533799	533804	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319648
11984	NC_008340	CTG	2	6	533823	533828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319648
11985	NC_008340	GC	3	6	533962	533967	0 %	0 %	50 %	50 %	114319649
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11993	NC_008340	ATC	2	6	534207	534212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114319649
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11995	NC_008340	GC	3	6	534225	534230	0 %	0 %	50 %	50 %	114319649
11996	NC_008340	GCC	2	6	534266	534271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319649
11997	NC_008340	CAG	2	6	534284	534289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319649
11998	NC_008340	GC	3	6	534424	534429	0 %	0 %	50 %	50 %	114319649
11999	NC_008340	TCC	2	6	534474	534479	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114319649
12000	NC_008340	GGC	2	6	534486	534491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319649

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