MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1 chromosome

Total Repeats: 74307

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_008340	AGC	2	6	483587	483592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319596
11002	NC_008340	ACC	2	6	483674	483679	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319596
11003	NC_008340	TGCGGC	2	12	483680	483691	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	114319596
11004	NC_008340	CCCA	2	8	483821	483828	25 %	0 %	0 %	75 %	114319597
11005	NC_008340	GCG	2	6	483829	483834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319597
11006	NC_008340	GC	3	6	483842	483847	0 %	0 %	50 %	50 %	114319597
11007	NC_008340	GCCA	2	8	483897	483904	25 %	0 %	25 %	50 %	114319597
11008	NC_008340	CCAG	2	8	483922	483929	25 %	0 %	25 %	50 %	114319597
11009	NC_008340	GTG	2	6	483951	483956	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319597
11010	NC_008340	GCC	3	9	483993	484001	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319597
11011	NC_008340	GCC	3	9	484031	484039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319597
11012	NC_008340	CAG	2	6	484112	484117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319597
11013	NC_008340	CGG	2	6	484217	484222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319597
11014	NC_008340	CAG	2	6	484247	484252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319597
11015	NC_008340	CCG	2	6	484253	484258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319597
11016	NC_008340	AGC	2	6	484260	484265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319597
11017	NC_008340	GC	3	6	484276	484281	0 %	0 %	50 %	50 %	114319597
11018	NC_008340	C	6	6	484281	484286	0 %	0 %	0 %	100 %	114319597
11019	NC_008340	GTCCC	2	10	484314	484323	0 %	20 %	20 %	60 %	114319597
11020	NC_008340	TGC	2	6	484326	484331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319597
11021	NC_008340	C	6	6	484428	484433	0 %	0 %	0 %	100 %	114319597
11022	NC_008340	CG	3	6	484445	484450	0 %	0 %	50 %	50 %	114319597
11023	NC_008340	TCC	2	6	484452	484457	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114319597
11024	NC_008340	GCG	2	6	484476	484481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319597
11025	NC_008340	GC	3	6	484501	484506	0 %	0 %	50 %	50 %	114319597
11026	NC_008340	CGG	3	9	484530	484538	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319597
11027	NC_008340	GTG	2	6	484551	484556	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319597
11028	NC_008340	CCG	2	6	484567	484572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319597
11029	NC_008340	GGT	2	6	484601	484606	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319597
11030	NC_008340	CGG	2	6	484701	484706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319597
11031	NC_008340	CTG	2	6	484733	484738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319597
11032	NC_008340	G	6	6	484762	484767	0 %	0 %	100 %	0 %	114319597
11033	NC_008340	GCCC	2	8	484846	484853	0 %	0 %	25 %	75 %	114319597
11034	NC_008340	CCA	2	6	484861	484866	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319597
11035	NC_008340	GCG	2	6	484869	484874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319597
11036	NC_008340	CG	3	6	484924	484929	0 %	0 %	50 %	50 %	114319597
11037	NC_008340	CTG	2	6	484963	484968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319598
11038	NC_008340	GTG	2	6	485027	485032	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319598
11039	NC_008340	GGGCA	2	10	485077	485086	20 %	0 %	60 %	20 %	114319598
11040	NC_008340	CAC	2	6	485176	485181	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319598
11041	NC_008340	CCG	2	6	485188	485193	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319598
11042	NC_008340	GTG	2	6	485249	485254	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319598
11043	NC_008340	GAT	2	6	485272	485277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319598
11044	NC_008340	C	6	6	485294	485299	0 %	0 %	0 %	100 %	114319598
11045	NC_008340	CAC	2	6	485314	485319	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319598
11046	NC_008340	GCG	2	6	485360	485365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319598
11047	NC_008340	GCG	2	6	485386	485391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319598
11048	NC_008340	GTA	2	6	485500	485505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319598
11049	NC_008340	CGGG	2	8	485520	485527	0 %	0 %	75 %	25 %	114319598
11050	NC_008340	TCG	2	6	485642	485647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319598
11051	NC_008340	GCT	2	6	485676	485681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319598
11052	NC_008340	AAGC	2	8	485694	485701	50 %	0 %	25 %	25 %	114319598
11053	NC_008340	GCCG	2	8	485733	485740	0 %	0 %	50 %	50 %	114319598
11054	NC_008340	GAG	2	6	485753	485758	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319598
11055	NC_008340	CTC	2	6	485791	485796	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114319598
11056	NC_008340	CCT	2	6	485799	485804	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114319598
11057	NC_008340	CTC	2	6	485827	485832	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114319598
11058	NC_008340	GTCG	2	8	485889	485896	0 %	25 %	50 %	25 %	114319598
11059	NC_008340	GAT	2	6	485917	485922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319598
11060	NC_008340	CG	3	6	485937	485942	0 %	0 %	50 %	50 %	114319598
11061	NC_008340	GCCC	2	8	486001	486008	0 %	0 %	25 %	75 %	114319598
11062	NC_008340	CAC	2	6	486033	486038	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319598
11063	NC_008340	CGT	2	6	486099	486104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319598
11064	NC_008340	CCAG	2	8	486135	486142	25 %	0 %	25 %	50 %	114319598
11065	NC_008340	GC	3	6	486363	486368	0 %	0 %	50 %	50 %	114319598
11066	NC_008340	AGCC	2	8	486394	486401	25 %	0 %	25 %	50 %	114319598
11067	NC_008340	AC	3	6	486489	486494	50 %	0 %	0 %	50 %	114319598
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11069	NC_008340	GAG	2	6	486758	486763	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319599
11070	NC_008340	CTG	2	6	486767	486772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319599
11071	NC_008340	GAT	2	6	486943	486948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319599
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11073	NC_008340	GAG	2	6	486995	487000	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319599
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11077	NC_008340	CGA	2	6	487159	487164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319599
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11086	NC_008340	CG	5	10	487615	487624	0 %	0 %	50 %	50 %	114319599
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11089	NC_008340	AG	3	6	487637	487642	50 %	0 %	50 %	0 %	114319599
11090	NC_008340	GGA	2	6	487678	487683	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319599
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11092	NC_008340	CGA	2	6	487708	487713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319599
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11116	NC_008340	CCT	2	6	494507	494512	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114319600
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11119	NC_008340	GT	3	6	494566	494571	0 %	50 %	50 %	0 %	114319600
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11121	NC_008340	GCA	2	6	494597	494602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319600
11122	NC_008340	CGGC	2	8	494618	494625	0 %	0 %	50 %	50 %	114319600
11123	NC_008340	TGC	2	6	494630	494635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319600
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11238	NC_008340	GGC	2	6	499282	499287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319604
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11240	NC_008340	GAC	2	6	500055	500060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319605
11241	NC_008340	CGG	2	6	500066	500071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319605
11242	NC_008340	GGT	2	6	500079	500084	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319605
11243	NC_008340	GGA	2	6	500142	500147	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319605
11244	NC_008340	GAA	2	6	500247	500252	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114319605
11245	NC_008340	GCG	2	6	500266	500271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319605
11246	NC_008340	TGG	2	6	500291	500296	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319605
11247	NC_008340	CTG	2	6	500300	500305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319605
11248	NC_008340	GGTG	2	8	500355	500362	0 %	25 %	75 %	0 %	114319605
11249	NC_008340	TGG	2	6	500399	500404	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319605
11250	NC_008340	ACG	2	6	500405	500410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319605
11251	NC_008340	TGG	2	6	500426	500431	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319605
11252	NC_008340	TGA	2	6	500475	500480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319605
11253	NC_008340	TGA	2	6	500523	500528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319605
11254	NC_008340	ATC	2	6	500551	500556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114319605
11255	NC_008340	GATG	2	8	500571	500578	25 %	25 %	50 %	0 %	114319605
11256	NC_008340	TCGGG	2	10	500650	500659	0 %	20 %	60 %	20 %	114319605
11257	NC_008340	GGT	2	6	500664	500669	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319605
11258	NC_008340	GTG	2	6	500687	500692	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319605
11259	NC_008340	GAG	2	6	500707	500712	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319605
11260	NC_008340	AGA	2	6	500741	500746	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114319605
11261	NC_008340	GCT	2	6	500817	500822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319605
11262	NC_008340	GCA	2	6	500876	500881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319605
11263	NC_008340	CGC	2	6	500885	500890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319605
11264	NC_008340	G	6	6	500934	500939	0 %	0 %	100 %	0 %	114319605
11265	NC_008340	AC	3	6	500943	500948	50 %	0 %	0 %	50 %	114319605
11266	NC_008340	GGC	2	6	501124	501129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319605
11267	NC_008340	CGT	2	6	501147	501152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319605
11268	NC_008340	ATC	2	6	501160	501165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114319605
11269	NC_008340	AG	3	6	501375	501380	50 %	0 %	50 %	0 %	114319606
11270	NC_008340	TCG	3	9	501410	501418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319606
11271	NC_008340	ATT	2	6	501455	501460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114319606
11272	NC_008340	CGA	2	6	501465	501470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319606
11273	NC_008340	CTG	2	6	501475	501480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319606
11274	NC_008340	GCT	2	6	501495	501500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319606
11275	NC_008340	GTG	2	6	501505	501510	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319606
11276	NC_008340	TGA	3	9	501527	501535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319606
11277	NC_008340	GGT	2	6	501597	501602	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319606
11278	NC_008340	ACC	2	6	501631	501636	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319606
11279	NC_008340	TGG	2	6	501653	501658	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319606
11280	NC_008340	CTGG	2	8	501678	501685	0 %	25 %	50 %	25 %	114319606
11281	NC_008340	CTG	2	6	501691	501696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319606
11282	NC_008340	CAT	2	6	501717	501722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114319606
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11284	NC_008340	GTG	2	6	501874	501879	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319607
11285	NC_008340	GCG	2	6	501900	501905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319607
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11294	NC_008340	TGC	2	6	502588	502593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319608
11295	NC_008340	GCC	2	6	502602	502607	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319608
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11300	NC_008340	CTG	2	6	502873	502878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319609
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11303	NC_008340	GGC	2	6	503043	503048	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319609
11304	NC_008340	TCG	2	6	503069	503074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319609
11305	NC_008340	GGC	2	6	503104	503109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319609
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11307	NC_008340	GAA	2	6	503247	503252	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114319609
11308	NC_008340	CAT	2	6	503295	503300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114319609
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11313	NC_008340	CGGC	2	8	503868	503875	0 %	0 %	50 %	50 %	114319610
11314	NC_008340	CAG	2	6	503894	503899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319610
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11317	NC_008340	TGCA	2	8	503978	503985	25 %	25 %	25 %	25 %	114319610
11318	NC_008340	GCT	3	9	504004	504012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319610
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11322	NC_008340	TCA	2	6	504051	504056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114319610
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11327	NC_008340	GGC	2	6	504262	504267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319610
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11330	NC_008340	GCC	2	6	504485	504490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319611
11331	NC_008340	GCC	3	9	504506	504514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319611
11332	NC_008340	CGAGGC	2	12	504520	504531	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	114319611
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11334	NC_008340	GTG	2	6	504557	504562	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319611
11335	NC_008340	CAA	2	6	504580	504585	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114319611
11336	NC_008340	TCA	2	6	504594	504599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114319611
11337	NC_008340	GGCCTG	2	12	504620	504631	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	114319611
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11340	NC_008340	AAGG	2	8	504674	504681	50 %	0 %	50 %	0 %	114319611
11341	NC_008340	GAG	2	6	504701	504706	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319611
11342	NC_008340	GGCG	2	8	504727	504734	0 %	0 %	75 %	25 %	114319611
11343	NC_008340	AAG	2	6	505012	505017	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114319612
11344	NC_008340	CTG	2	6	505069	505074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319612
11345	NC_008340	AGG	2	6	505109	505114	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319612
11346	NC_008340	CG	3	6	505262	505267	0 %	0 %	50 %	50 %	114319612
11347	NC_008340	AAG	2	6	505355	505360	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114319612
11348	NC_008340	GT	3	6	505457	505462	0 %	50 %	50 %	0 %	114319612
11349	NC_008340	TCG	2	6	505492	505497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319612
11350	NC_008340	GCT	2	6	505503	505508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319612
11351	NC_008340	CTGG	2	8	505542	505549	0 %	25 %	50 %	25 %	114319612
11352	NC_008340	ACA	2	6	505571	505576	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114319612
11353	NC_008340	CGC	2	6	505597	505602	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319612
11354	NC_008340	CTG	2	6	505621	505626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319612
11355	NC_008340	CG	3	6	505627	505632	0 %	0 %	50 %	50 %	114319612
11356	NC_008340	CAG	2	6	505648	505653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319612
11357	NC_008340	TTC	2	6	505666	505671	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114319612
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11359	NC_008340	GGT	2	6	505707	505712	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319612
11360	NC_008340	TGG	2	6	505784	505789	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319612
11361	NC_008340	CG	3	6	505809	505814	0 %	0 %	50 %	50 %	114319612
11362	NC_008340	TCG	2	6	505886	505891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319612
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11479	NC_008340	ATG	2	6	511203	511208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319613
11480	NC_008340	TCG	2	6	511228	511233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319613
11481	NC_008340	ATG	2	6	511281	511286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319613
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