MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1 chromosome

Total Repeats: 74307

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_008340	GCC	3	9	441173	441181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319555
10002	NC_008340	GA	3	6	441328	441333	50 %	0 %	50 %	0 %	114319556
10003	NC_008340	CCG	2	6	441388	441393	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319556
10004	NC_008340	CGA	2	6	441428	441433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319556
10005	NC_008340	GCC	2	6	441454	441459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319556
10006	NC_008340	CAA	2	6	441476	441481	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114319556
10007	NC_008340	GCC	3	9	441522	441530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319556
10008	NC_008340	ACG	2	6	441553	441558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319556
10009	NC_008340	GGA	2	6	441620	441625	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319556
10010	NC_008340	CGA	2	6	441647	441652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319556
10011	NC_008340	GGA	2	6	441653	441658	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319556
10012	NC_008340	GGC	2	6	441659	441664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319556
10013	NC_008340	AAGG	2	8	441669	441676	50 %	0 %	50 %	0 %	114319556
10014	NC_008340	ATC	2	6	441684	441689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114319556
10015	NC_008340	CAAC	2	8	441725	441732	50 %	0 %	0 %	50 %	114319556
10016	NC_008340	CCGGCA	2	12	441787	441798	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	114319556
10017	NC_008340	GTG	2	6	441858	441863	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319556
10018	NC_008340	CGG	2	6	441874	441879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319556
10019	NC_008340	ACG	2	6	441955	441960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319556
10020	NC_008340	GGGT	2	8	441988	441995	0 %	25 %	75 %	0 %	114319556
10021	NC_008340	G	6	6	442009	442014	0 %	0 %	100 %	0 %	114319556
10022	NC_008340	TCA	2	6	442069	442074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114319556
10023	NC_008340	CCG	2	6	442147	442152	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319556
10024	NC_008340	TGC	2	6	442225	442230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319556
10025	NC_008340	CTT	2	6	442256	442261	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114319556
10026	NC_008340	CCGC	2	8	442264	442271	0 %	0 %	25 %	75 %	114319556
10027	NC_008340	GTG	2	6	442275	442280	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319556
10028	NC_008340	CCTGGA	2	12	442344	442355	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	114319557
10029	NC_008340	TGG	2	6	442367	442372	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319557
10030	NC_008340	GGC	2	6	442398	442403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319557
10031	NC_008340	CCG	2	6	442407	442412	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319557
10032	NC_008340	GGC	2	6	442431	442436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319557
10033	NC_008340	G	6	6	442438	442443	0 %	0 %	100 %	0 %	114319557
10034	NC_008340	GTG	2	6	442474	442479	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319557
10035	NC_008340	GCC	2	6	442493	442498	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319557
10036	NC_008340	GGT	2	6	442620	442625	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319557
10037	NC_008340	TGG	2	6	442679	442684	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319557
10038	NC_008340	CTG	2	6	442702	442707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319557
10039	NC_008340	GGC	2	6	442722	442727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319557
10040	NC_008340	GGA	2	6	442728	442733	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319557
10041	NC_008340	GCG	2	6	442758	442763	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319557
10042	NC_008340	GGCC	2	8	442770	442777	0 %	0 %	50 %	50 %	114319557
10043	NC_008340	TGA	2	6	442895	442900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319558
10044	NC_008340	CGA	2	6	442933	442938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319558
10045	NC_008340	ATCGC	2	10	442946	442955	20 %	20 %	20 %	40 %	114319558
10046	NC_008340	CTG	2	6	442993	442998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319558
10047	NC_008340	GATG	2	8	443031	443038	25 %	25 %	50 %	0 %	114319558
10048	NC_008340	TGGCC	2	10	443043	443052	0 %	20 %	40 %	40 %	114319558
10049	NC_008340	GC	3	6	443089	443094	0 %	0 %	50 %	50 %	114319558
10050	NC_008340	CAT	2	6	443097	443102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114319558
10051	NC_008340	TGC	2	6	443126	443131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319558
10052	NC_008340	GCC	2	6	443142	443147	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319558
10053	NC_008340	TGC	2	6	443156	443161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319558
10054	NC_008340	GGT	2	6	443166	443171	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319558
10055	NC_008340	GAT	2	6	443215	443220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319558
10056	NC_008340	TGC	2	6	443249	443254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319558
10057	NC_008340	GGA	2	6	443265	443270	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319558
10058	NC_008340	GGA	2	6	443274	443279	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319558
10059	NC_008340	GCCC	2	8	443303	443310	0 %	0 %	25 %	75 %	114319558
10060	NC_008340	GTG	2	6	443386	443391	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319558
10061	NC_008340	CGG	2	6	443400	443405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319558
10062	NC_008340	CGA	3	9	443460	443468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319558
10063	NC_008340	GGA	2	6	443544	443549	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319558
10064	NC_008340	CGG	2	6	443601	443606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319558
10065	NC_008340	TGG	2	6	443609	443614	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319558
10066	NC_008340	GTC	2	6	443618	443623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319558
10067	NC_008340	CGA	2	6	443643	443648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319558
10068	NC_008340	GCTGGA	2	12	443652	443663	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	114319558
10069	NC_008340	GCG	2	6	443697	443702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319558
10070	NC_008340	GACG	2	8	443748	443755	25 %	0 %	50 %	25 %	114319558
10071	NC_008340	G	6	6	443777	443782	0 %	0 %	100 %	0 %	114319559
10072	NC_008340	GCC	2	6	443797	443802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319559
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10083	NC_008340	CG	3	6	443937	443942	0 %	0 %	50 %	50 %	114319559
10084	NC_008340	GCC	2	6	443952	443957	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319559
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10087	NC_008340	CGC	3	9	444031	444039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319559
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10089	NC_008340	GCC	2	6	444060	444065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319559
10090	NC_008340	CTG	2	6	444096	444101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319559
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10092	NC_008340	GGCCC	2	10	444122	444131	0 %	0 %	40 %	60 %	114319559
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10102	NC_008340	G	6	6	444364	444369	0 %	0 %	100 %	0 %	114319559
10103	NC_008340	TGG	2	6	444370	444375	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319559
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10119	NC_008340	ACG	2	6	445114	445119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319559
10120	NC_008340	CGC	2	6	445160	445165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319559
10121	NC_008340	GGT	2	6	445223	445228	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319559
10122	NC_008340	CTG	2	6	445239	445244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319559
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10124	NC_008340	TGG	2	6	445272	445277	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319559
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10135	NC_008340	TCG	2	6	445721	445726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319560
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10139	NC_008340	TCG	2	6	445877	445882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319560
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10152	NC_008340	GCT	2	6	446662	446667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319561
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10223	NC_008340	CGCC	2	8	449277	449284	0 %	0 %	25 %	75 %	114319563
10224	NC_008340	CTG	2	6	449299	449304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319563
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10230	NC_008340	GCG	2	6	449478	449483	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319563
10231	NC_008340	GCC	2	6	449562	449567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319563
10232	NC_008340	CTG	3	9	449575	449583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319563
10233	NC_008340	CTG	2	6	449664	449669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319563
10234	NC_008340	GGGC	2	8	449676	449683	0 %	0 %	75 %	25 %	114319563
10235	NC_008340	GGCT	2	8	449695	449702	0 %	25 %	50 %	25 %	114319563
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10237	NC_008340	GAC	2	6	449740	449745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319563
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10239	NC_008340	CTG	2	6	449782	449787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319563
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10345	NC_008340	GCTG	2	8	453633	453640	0 %	25 %	50 %	25 %	114319568
10346	NC_008340	GAC	2	6	453677	453682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319568
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10351	NC_008340	GC	3	6	453752	453757	0 %	0 %	50 %	50 %	114319568
10352	NC_008340	GCG	2	6	453763	453768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319568
10353	NC_008340	CTT	2	6	453769	453774	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114319568
10354	NC_008340	ATCT	2	8	453854	453861	25 %	50 %	0 %	25 %	114319569
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10478	NC_008340	ATCG	2	8	459076	459083	25 %	25 %	25 %	25 %	114319571
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