MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1 chromosome

Total Repeats: 74307

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7001	NC_008340	AGA	3	9	308420	308428	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114319431
7002	NC_008340	GGC	2	6	308436	308441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319431
7003	NC_008340	ATCCCG	2	12	308470	308481	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	114319431
7004	NC_008340	GCC	2	6	308555	308560	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319431
7005	NC_008340	GTC	2	6	308585	308590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319431
7006	NC_008340	GGC	2	6	308598	308603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319431
7007	NC_008340	TGC	2	6	308639	308644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319431
7008	NC_008340	GCG	2	6	308654	308659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319431
7009	NC_008340	CCA	3	9	308672	308680	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319431
7010	NC_008340	GC	3	6	308761	308766	0 %	0 %	50 %	50 %	114319431
7011	NC_008340	CTC	2	6	308808	308813	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114319431
7012	NC_008340	AGG	2	6	308864	308869	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319431
7013	NC_008340	AAG	2	6	308872	308877	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114319431
7014	NC_008340	AGG	2	6	308891	308896	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319431
7015	NC_008340	TCC	2	6	308920	308925	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114319431
7016	NC_008340	GCG	2	6	308932	308937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319431
7017	NC_008340	CTA	2	6	308985	308990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114319431
7018	NC_008340	CCTGG	2	10	309021	309030	0 %	20 %	40 %	40 %	114319431
7019	NC_008340	GCC	2	6	309031	309036	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319431
7020	NC_008340	GC	3	6	309049	309054	0 %	0 %	50 %	50 %	114319431
7021	NC_008340	CCG	2	6	309074	309079	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319431
7022	NC_008340	CAC	2	6	309084	309089	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319431
7023	NC_008340	GCA	2	6	309108	309113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319431
7024	NC_008340	CTG	2	6	309133	309138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319431
7025	NC_008340	GCG	2	6	309216	309221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319431
7026	NC_008340	CTA	2	6	309249	309254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114319431
7027	NC_008340	GAG	2	6	309307	309312	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319431
7028	NC_008340	AAG	2	6	309349	309354	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114319431
7029	NC_008340	GAA	2	6	309366	309371	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114319431
7030	NC_008340	GGC	2	6	309426	309431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319431
7031	NC_008340	GCA	2	6	309441	309446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319431
7032	NC_008340	CCT	2	6	309482	309487	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114319431
7033	NC_008340	CCG	2	6	309515	309520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319431
7034	NC_008340	GAA	2	6	309549	309554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114319431
7035	NC_008340	GC	3	6	309591	309596	0 %	0 %	50 %	50 %	114319431
7036	NC_008340	GCG	2	6	309610	309615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319431
7037	NC_008340	TGGA	2	8	309655	309662	25 %	25 %	50 %	0 %	114319431
7038	NC_008340	ACGG	2	8	309685	309692	25 %	0 %	50 %	25 %	114319431
7039	NC_008340	TTC	2	6	309730	309735	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114319431
7040	NC_008340	CGT	2	6	309792	309797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319431
7041	NC_008340	AAG	2	6	309965	309970	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114319432
7042	NC_008340	GGT	2	6	310116	310121	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319432
7043	NC_008340	GTC	2	6	310171	310176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319432
7044	NC_008340	TGG	2	6	310178	310183	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319432
7045	NC_008340	GAG	2	6	310189	310194	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319432
7046	NC_008340	CGCC	2	8	310205	310212	0 %	0 %	25 %	75 %	114319432
7047	NC_008340	GCC	2	6	310252	310257	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319432
7048	NC_008340	GCC	2	6	310276	310281	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319432
7049	NC_008340	GGAGCA	2	12	310377	310388	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	114319432
7050	NC_008340	AGG	2	6	310457	310462	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319432
7051	NC_008340	TCAAGG	2	12	310463	310474	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	114319432
7052	NC_008340	GCCA	2	8	310554	310561	25 %	0 %	25 %	50 %	114319432
7053	NC_008340	AGG	2	6	310562	310567	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319432
7054	NC_008340	GGC	2	6	310575	310580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319432
7055	NC_008340	GCCG	2	8	310596	310603	0 %	0 %	50 %	50 %	114319432
7056	NC_008340	CGC	2	6	310611	310616	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319432
7057	NC_008340	CAGC	2	8	310620	310627	25 %	0 %	25 %	50 %	114319432
7058	NC_008340	CCG	2	6	310699	310704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319432
7059	NC_008340	CGC	2	6	310726	310731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319432
7060	NC_008340	CGG	2	6	310745	310750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319432
7061	NC_008340	CCG	2	6	310752	310757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319432
7062	NC_008340	GCAGG	2	10	310794	310803	20 %	0 %	60 %	20 %	114319432
7063	NC_008340	AGG	2	6	310832	310837	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319432
7064	NC_008340	G	6	6	310869	310874	0 %	0 %	100 %	0 %	114319432
7065	NC_008340	CCGG	2	8	310891	310898	0 %	0 %	50 %	50 %	114319432
7066	NC_008340	CGG	2	6	311159	311164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319432
7067	NC_008340	CAG	2	6	311190	311195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319432
7068	NC_008340	GCCG	2	8	311202	311209	0 %	0 %	50 %	50 %	114319432
7069	NC_008340	TGA	2	6	311211	311216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319432
7070	NC_008340	AAG	2	6	311227	311232	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114319432
7071	NC_008340	TGGCG	2	10	311244	311253	0 %	20 %	60 %	20 %	114319432
7072	NC_008340	TGG	2	6	311273	311278	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319432
7073	NC_008340	CT	3	6	311341	311346	0 %	50 %	0 %	50 %	114319432
7074	NC_008340	CGG	2	6	311424	311429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319432
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7078	NC_008340	CTGG	2	8	311604	311611	0 %	25 %	50 %	25 %	114319432
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7083	NC_008340	CCG	2	6	311964	311969	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319433
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7085	NC_008340	CCA	2	6	311991	311996	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319433
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7087	NC_008340	CGG	2	6	312006	312011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319433
7088	NC_008340	GGC	2	6	312077	312082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319433
7089	NC_008340	CCG	2	6	312087	312092	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319433
7090	NC_008340	GCG	2	6	312101	312106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319433
7091	NC_008340	TGG	2	6	312129	312134	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319433
7092	NC_008340	G	6	6	312151	312156	0 %	0 %	100 %	0 %	114319433
7093	NC_008340	TGC	2	6	312195	312200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319433
7094	NC_008340	CGA	2	6	312217	312222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319433
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7109	NC_008340	CAT	2	6	312580	312585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114319433
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7118	NC_008340	GT	3	6	312939	312944	0 %	50 %	50 %	0 %	114319433
7119	NC_008340	TCG	2	6	312969	312974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319433
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7121	NC_008340	GGC	2	6	313018	313023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319433
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7363	NC_008340	GAC	2	6	323521	323526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319443
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7368	NC_008340	C	6	6	323681	323686	0 %	0 %	0 %	100 %	114319443
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7485	NC_008340	GTG	2	6	328482	328487	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319448
7486	NC_008340	CG	3	6	328545	328550	0 %	0 %	50 %	50 %	114319449
7487	NC_008340	CAG	2	6	328592	328597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319449
7488	NC_008340	CAG	2	6	328691	328696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319449
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7493	NC_008340	AGC	2	6	328863	328868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319449
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7499	NC_008340	CAG	2	6	329075	329080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319449
7500	NC_008340	AGC	2	6	329091	329096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319449

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