MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1 chromosome

Total Repeats: 74307

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
61501	NC_008340	CGACC	2	10	2722809	2722818	20 %	0 %	20 %	60 %	114321544
61502	NC_008340	C	7	7	2722866	2722872	0 %	0 %	0 %	100 %	114321544
61503	NC_008340	TTGGTC	2	12	2722967	2722978	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	114321544
61504	NC_008340	TCC	2	6	2722979	2722984	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114321544
61505	NC_008340	CCT	2	6	2723091	2723096	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114321544
61506	NC_008340	CGG	2	6	2723126	2723131	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321544
61507	NC_008340	CGC	2	6	2723163	2723168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321544
61508	NC_008340	CGT	2	6	2723235	2723240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321544
61509	NC_008340	GATC	2	8	2723247	2723254	25 %	25 %	25 %	25 %	114321544
61510	NC_008340	ATG	2	6	2723258	2723263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114321544
61511	NC_008340	CG	3	6	2723288	2723293	0 %	0 %	50 %	50 %	114321544
61512	NC_008340	C	6	6	2723308	2723313	0 %	0 %	0 %	100 %	114321544
61513	NC_008340	CG	3	6	2723403	2723408	0 %	0 %	50 %	50 %	114321544
61514	NC_008340	TGC	2	6	2723505	2723510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321544
61515	NC_008340	CCG	2	6	2723548	2723553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321544
61516	NC_008340	CAT	2	6	2723640	2723645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114321544
61517	NC_008340	TCA	2	6	2723708	2723713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114321544
61518	NC_008340	CCG	2	6	2723724	2723729	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321544
61519	NC_008340	AGG	2	6	2723765	2723770	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114321544
61520	NC_008340	ACC	2	6	2723775	2723780	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114321544
61521	NC_008340	ACC	3	9	2723936	2723944	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114321545
61522	NC_008340	CAC	2	6	2723999	2724004	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114321545
61523	NC_008340	GC	3	6	2724082	2724087	0 %	0 %	50 %	50 %	114321545
61524	NC_008340	TCA	2	6	2724103	2724108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114321545
61525	NC_008340	CCT	2	6	2724578	2724583	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114321546
61526	NC_008340	GTG	2	6	2724654	2724659	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114321546
61527	NC_008340	CTG	2	6	2724666	2724671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321546
61528	NC_008340	CGT	2	6	2724683	2724688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321546
61529	NC_008340	GAT	2	6	2724720	2724725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114321546
61530	NC_008340	GGGT	3	12	2724794	2724805	0 %	25 %	75 %	0 %	114321546
61531	NC_008340	CAG	2	6	2724822	2724827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321546
61532	NC_008340	CGG	2	6	2724845	2724850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321546
61533	NC_008340	GGC	2	6	2724860	2724865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321546
61534	NC_008340	AGC	2	6	2724877	2724882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321546
61535	NC_008340	CAT	2	6	2724900	2724905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114321546
61536	NC_008340	GGA	2	6	2724918	2724923	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114321546
61537	NC_008340	GC	3	6	2725102	2725107	0 %	0 %	50 %	50 %	114321546
61538	NC_008340	GTA	2	6	2725170	2725175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114321546
61539	NC_008340	TCC	2	6	2725186	2725191	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114321546
61540	NC_008340	ATG	2	6	2725198	2725203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114321546
61541	NC_008340	GTG	2	6	2725246	2725251	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114321546
61542	NC_008340	CAG	2	6	2725281	2725286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321546
61543	NC_008340	TTG	2	6	2725300	2725305	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114321546
61544	NC_008340	GCCG	2	8	2725364	2725371	0 %	0 %	50 %	50 %	114321546
61545	NC_008340	CGGC	2	8	2725415	2725422	0 %	0 %	50 %	50 %	114321546
61546	NC_008340	CGGC	2	8	2725450	2725457	0 %	0 %	50 %	50 %	114321546
61547	NC_008340	AGC	2	6	2725540	2725545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321546
61548	NC_008340	CGG	2	6	2725560	2725565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321546
61549	NC_008340	GCA	2	6	2725580	2725585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321546
61550	NC_008340	TCC	2	6	2725651	2725656	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114321546
61551	NC_008340	AGC	2	6	2725672	2725677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321546
61552	NC_008340	TGA	2	6	2725682	2725687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114321546
61553	NC_008340	GAT	2	6	2725692	2725697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114321546
61554	NC_008340	CAT	2	6	2725703	2725708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114321546
61555	NC_008340	CAGGTC	2	12	2725761	2725772	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	114321546
61556	NC_008340	GGCC	2	8	2725781	2725788	0 %	0 %	50 %	50 %	114321546
61557	NC_008340	ATC	2	6	2725789	2725794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114321546
61558	NC_008340	GCGCT	2	10	2725810	2725819	0 %	20 %	40 %	40 %	114321546
61559	NC_008340	CCT	2	6	2725862	2725867	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114321546
61560	NC_008340	GCC	2	6	2725880	2725885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321546
61561	NC_008340	GGC	2	6	2725892	2725897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321546
61562	NC_008340	CCA	2	6	2725904	2725909	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114321546
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61564	NC_008340	CGGCA	2	10	2725971	2725980	20 %	0 %	40 %	40 %	114321546
61565	NC_008340	GCG	2	6	2726033	2726038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321546
61566	NC_008340	GTT	2	6	2726066	2726071	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114321546
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61568	NC_008340	CAT	2	6	2726283	2726288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114321547
61569	NC_008340	T	7	7	2726318	2726324	0 %	100 %	0 %	0 %	114321547
61570	NC_008340	CTGGCC	2	12	2726351	2726362	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	114321547
61571	NC_008340	GCA	2	6	2726367	2726372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321547
61572	NC_008340	GAG	2	6	2726402	2726407	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114321547
61573	NC_008340	GAG	2	6	2726495	2726500	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114321547
61574	NC_008340	CCG	2	6	2726538	2726543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321547
61575	NC_008340	GCA	2	6	2726581	2726586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321547
61576	NC_008340	CAG	2	6	2726624	2726629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321547
61577	NC_008340	GGCCT	2	10	2726678	2726687	0 %	20 %	40 %	40 %	114321547
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61584	NC_008340	CGA	2	6	2726968	2726973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321547
61585	NC_008340	CGA	2	6	2726980	2726985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321547
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61587	NC_008340	CCGC	2	8	2727111	2727118	0 %	0 %	25 %	75 %	114321547
61588	NC_008340	GCC	2	6	2727134	2727139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321547
61589	NC_008340	GAG	2	6	2727140	2727145	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114321547
61590	NC_008340	GCACG	2	10	2727148	2727157	20 %	0 %	40 %	40 %	114321547
61591	NC_008340	TGG	2	6	2727165	2727170	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114321547
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61600	NC_008340	CCG	2	6	2727456	2727461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321547
61601	NC_008340	CTT	2	6	2727469	2727474	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114321547
61602	NC_008340	ACCC	2	8	2727493	2727500	25 %	0 %	0 %	75 %	114321547
61603	NC_008340	GAG	2	6	2727521	2727526	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114321547
61604	NC_008340	TGC	2	6	2727561	2727566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321547
61605	NC_008340	GCG	2	6	2727574	2727579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321547
61606	NC_008340	CGA	2	6	2727580	2727585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321547
61607	NC_008340	CCT	2	6	2727630	2727635	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114321547
61608	NC_008340	GGA	3	9	2727649	2727657	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114321547
61609	NC_008340	GGCAC	2	10	2727710	2727719	20 %	0 %	40 %	40 %	114321547
61610	NC_008340	GGA	3	9	2727754	2727762	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114321547
61611	NC_008340	CGG	3	9	2727781	2727789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321547
61612	NC_008340	CGACTC	2	12	2727808	2727819	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	114321547
61613	NC_008340	GATCGA	2	12	2727874	2727885	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	114321547
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61846	NC_008340	GTC	2	6	2737311	2737316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321554
61847	NC_008340	GCATC	2	10	2737319	2737328	20 %	20 %	20 %	40 %	114321554
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61961	NC_008340	CTC	2	6	2741419	2741424	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	161484716
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