MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1 chromosome

Total Repeats: 74307

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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61002	NC_008340	TCG	2	6	2702270	2702275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321525
61003	NC_008340	GCC	2	6	2702359	2702364	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321526
61004	NC_008340	CAG	2	6	2702413	2702418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321526
61005	NC_008340	GCAGC	2	10	2702455	2702464	20 %	0 %	40 %	40 %	114321526
61006	NC_008340	GC	3	6	2702476	2702481	0 %	0 %	50 %	50 %	114321526
61007	NC_008340	GGT	2	6	2702493	2702498	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114321526
61008	NC_008340	GGC	2	6	2702518	2702523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321526
61009	NC_008340	GCC	2	6	2702572	2702577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321526
61010	NC_008340	GCC	2	6	2702615	2702620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321526
61011	NC_008340	GC	3	6	2702722	2702727	0 %	0 %	50 %	50 %	114321526
61012	NC_008340	GCCG	2	8	2702796	2702803	0 %	0 %	50 %	50 %	114321526
61013	NC_008340	CTG	2	6	2702905	2702910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321526
61014	NC_008340	AGGT	2	8	2702987	2702994	25 %	25 %	50 %	0 %	114321526
61015	NC_008340	GCCC	2	8	2703026	2703033	0 %	0 %	25 %	75 %	114321526
61016	NC_008340	ACC	2	6	2703071	2703076	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114321526
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61019	NC_008340	TTG	2	6	2703221	2703226	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114321527
61020	NC_008340	GCCA	2	8	2703239	2703246	25 %	0 %	25 %	50 %	114321527
61021	NC_008340	CCA	2	6	2703262	2703267	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114321527
61022	NC_008340	CGG	2	6	2703370	2703375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321527
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61026	NC_008340	CGT	2	6	2703546	2703551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321527
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61032	NC_008340	CAT	2	6	2703778	2703783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114321527
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61051	NC_008340	GTC	2	6	2704339	2704344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321527
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61462	NC_008340	GGC	2	6	2721168	2721173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321543
61463	NC_008340	GA	3	6	2721186	2721191	50 %	0 %	50 %	0 %	114321543
61464	NC_008340	GGTA	2	8	2721209	2721216	25 %	25 %	50 %	0 %	114321543
61465	NC_008340	TCC	3	9	2721283	2721291	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114321543
61466	NC_008340	CCAC	2	8	2721298	2721305	25 %	0 %	0 %	75 %	114321543
61467	NC_008340	GCC	3	9	2721324	2721332	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321543
61468	NC_008340	CGC	2	6	2721485	2721490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321543
61469	NC_008340	CAC	2	6	2721552	2721557	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114321543
61470	NC_008340	TCC	2	6	2721577	2721582	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114321543
61471	NC_008340	CAGAT	2	10	2721598	2721607	40 %	20 %	20 %	20 %	114321543
61472	NC_008340	CAC	2	6	2721654	2721659	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114321543
61473	NC_008340	TGT	2	6	2721701	2721706	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114321543
61474	NC_008340	CTC	2	6	2721726	2721731	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114321543
61475	NC_008340	AAG	2	6	2721769	2721774	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114321543
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61477	NC_008340	CCAC	2	8	2721836	2721843	25 %	0 %	0 %	75 %	114321543
61478	NC_008340	GCA	2	6	2721886	2721891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321543
61479	NC_008340	CCA	2	6	2721914	2721919	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114321543
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61481	NC_008340	GTA	2	6	2721993	2721998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114321543
61482	NC_008340	CCAG	2	8	2722019	2722026	25 %	0 %	25 %	50 %	114321543
61483	NC_008340	CGT	2	6	2722034	2722039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321543
61484	NC_008340	AGCG	2	8	2722051	2722058	25 %	0 %	50 %	25 %	114321543
61485	NC_008340	GTC	2	6	2722104	2722109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321543
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61488	NC_008340	TCC	2	6	2722150	2722155	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114321543
61489	NC_008340	CAT	2	6	2722161	2722166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114321543
61490	NC_008340	ATC	2	6	2722183	2722188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114321543
61491	NC_008340	TTCA	2	8	2722251	2722258	25 %	50 %	0 %	25 %	114321543
61492	NC_008340	CGG	2	6	2722271	2722276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321543
61493	NC_008340	CCGT	2	8	2722281	2722288	0 %	25 %	25 %	50 %	114321543
61494	NC_008340	GCT	2	6	2722368	2722373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321543
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61496	NC_008340	GC	3	6	2722401	2722406	0 %	0 %	50 %	50 %	114321543
61497	NC_008340	GAT	2	6	2722470	2722475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114321543
61498	NC_008340	CCT	2	6	2722490	2722495	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114321543
61499	NC_008340	CAG	2	6	2722524	2722529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321543
61500	NC_008340	CAG	3	9	2722608	2722616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321543

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