MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1 chromosome

Total Repeats: 74307

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
59001	NC_008340	ACC	2	6	2611305	2611310	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114321448
59002	NC_008340	CGA	3	9	2611351	2611359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321448
59003	NC_008340	CGG	2	6	2611446	2611451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321448
59004	NC_008340	CGCA	2	8	2611532	2611539	25 %	0 %	25 %	50 %	114321448
59005	NC_008340	GATC	2	8	2612297	2612304	25 %	25 %	25 %	25 %	114321449
59006	NC_008340	CAA	2	6	2612370	2612375	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114321449
59007	NC_008340	GCC	2	6	2612439	2612444	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321449
59008	NC_008340	CCT	2	6	2612456	2612461	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114321449
59009	NC_008340	CGC	2	6	2612471	2612476	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321449
59010	NC_008340	CAC	2	6	2612500	2612505	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114321449
59011	NC_008340	CTG	2	6	2612582	2612587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321450
59012	NC_008340	AAC	2	6	2612588	2612593	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114321450
59013	NC_008340	CTGG	2	8	2612656	2612663	0 %	25 %	50 %	25 %	114321450
59014	NC_008340	GGC	2	6	2612734	2612739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321450
59015	NC_008340	CCT	2	6	2612752	2612757	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114321450
59016	NC_008340	CCG	3	9	2612776	2612784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321450
59017	NC_008340	TCG	2	6	2612871	2612876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321450
59018	NC_008340	ACC	2	6	2612903	2612908	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114321450
59019	NC_008340	GAC	2	6	2612936	2612941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321450
59020	NC_008340	GCT	2	6	2612950	2612955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321450
59021	NC_008340	CGA	2	6	2612992	2612997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321450
59022	NC_008340	TAC	2	6	2613164	2613169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114321450
59023	NC_008340	GCC	2	6	2613185	2613190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321450
59024	NC_008340	CCCA	2	8	2613233	2613240	25 %	0 %	0 %	75 %	114321450
59025	NC_008340	TCG	3	9	2613246	2613254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321450
59026	NC_008340	ACG	2	6	2613279	2613284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321450
59027	NC_008340	GCC	2	6	2613285	2613290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321450
59028	NC_008340	AGG	2	6	2613306	2613311	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114321450
59029	NC_008340	CTG	2	6	2613313	2613318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321450
59030	NC_008340	CTT	2	6	2613383	2613388	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114321450
59031	NC_008340	TCT	3	9	2613450	2613458	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114321450
59032	NC_008340	GCCG	2	8	2613572	2613579	0 %	0 %	50 %	50 %	114321450
59033	NC_008340	GCC	2	6	2613657	2613662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321450
59034	NC_008340	GCC	3	9	2613680	2613688	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321450
59035	NC_008340	CCA	2	6	2613708	2613713	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114321450
59036	NC_008340	CG	3	6	2613737	2613742	0 %	0 %	50 %	50 %	114321450
59037	NC_008340	C	6	6	2613776	2613781	0 %	0 %	0 %	100 %	114321450
59038	NC_008340	C	6	6	2613787	2613792	0 %	0 %	0 %	100 %	114321450
59039	NC_008340	GGC	2	6	2613814	2613819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321450
59040	NC_008340	GTGA	2	8	2613856	2613863	25 %	25 %	50 %	0 %	114321450
59041	NC_008340	AGA	2	6	2614445	2614450	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114321451
59042	NC_008340	CAC	2	6	2614458	2614463	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114321451
59043	NC_008340	C	6	6	2614463	2614468	0 %	0 %	0 %	100 %	114321451
59044	NC_008340	CTG	2	6	2614483	2614488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321451
59045	NC_008340	TCC	2	6	2614528	2614533	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114321451
59046	NC_008340	GAC	2	6	2614543	2614548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321451
59047	NC_008340	GCA	2	6	2614560	2614565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321451
59048	NC_008340	GCC	2	6	2614585	2614590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321451
59049	NC_008340	CGA	2	6	2614620	2614625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321451
59050	NC_008340	TGA	2	6	2614680	2614685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114321451
59051	NC_008340	ACC	2	6	2614735	2614740	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114321451
59052	NC_008340	CAC	2	6	2614755	2614760	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114321451
59053	NC_008340	AGG	2	6	2614805	2614810	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114321451
59054	NC_008340	ACCGG	2	10	2614815	2614824	20 %	0 %	40 %	40 %	114321451
59055	NC_008340	CGC	2	6	2614830	2614835	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321451
59056	NC_008340	CAG	2	6	2614843	2614848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321451
59057	NC_008340	GAC	2	6	2614849	2614854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321451
59058	NC_008340	CGG	2	6	2614863	2614868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321451
59059	NC_008340	TCA	2	6	2614877	2614882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114321451
59060	NC_008340	ACC	2	6	2614924	2614929	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114321451
59061	NC_008340	CCT	2	6	2614961	2614966	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114321451
59062	NC_008340	GTG	3	9	2614975	2614983	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114321451
59063	NC_008340	CGA	2	6	2614995	2615000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321451
59064	NC_008340	GAG	2	6	2615008	2615013	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114321451
59065	NC_008340	ACT	2	6	2615039	2615044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114321451
59066	NC_008340	GCC	2	6	2615071	2615076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321451
59067	NC_008340	TCGG	2	8	2615124	2615131	0 %	25 %	50 %	25 %	114321451
59068	NC_008340	TTC	2	6	2615140	2615145	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114321451
59069	NC_008340	GGA	2	6	2615241	2615246	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114321451
59070	NC_008340	ACC	2	6	2615254	2615259	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114321451
59071	NC_008340	TGCC	2	8	2615364	2615371	0 %	25 %	25 %	50 %	114321451
59072	NC_008340	CAA	2	6	2615469	2615474	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114321451
59073	NC_008340	CGA	2	6	2615502	2615507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321451
59074	NC_008340	CTT	2	6	2615508	2615513	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114321451
59075	NC_008340	CGA	2	6	2615514	2615519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321451
59076	NC_008340	CGG	2	6	2615547	2615552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321451
59077	NC_008340	TACAA	2	10	2616562	2616571	60 %	20 %	0 %	20 %	114321452
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59080	NC_008340	TTC	2	6	2616871	2616876	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114321453
59081	NC_008340	A	6	6	2616889	2616894	100 %	0 %	0 %	0 %	114321453
59082	NC_008340	CCG	3	9	2616916	2616924	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321453
59083	NC_008340	GAA	2	6	2616948	2616953	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114321453
59084	NC_008340	GC	3	6	2616967	2616972	0 %	0 %	50 %	50 %	114321453
59085	NC_008340	CGC	2	6	2617019	2617024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321453
59086	NC_008340	GT	3	6	2617065	2617070	0 %	50 %	50 %	0 %	114321453
59087	NC_008340	TGGC	2	8	2617109	2617116	0 %	25 %	50 %	25 %	114321453
59088	NC_008340	CGC	2	6	2617225	2617230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321453
59089	NC_008340	GCTGA	2	10	2617246	2617255	20 %	20 %	40 %	20 %	114321453
59090	NC_008340	GCGG	2	8	2618171	2618178	0 %	0 %	75 %	25 %	114321454
59091	NC_008340	CAA	2	6	2618270	2618275	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114321454
59092	NC_008340	GC	3	6	2618276	2618281	0 %	0 %	50 %	50 %	114321454
59093	NC_008340	GC	3	6	2618300	2618305	0 %	0 %	50 %	50 %	114321454
59094	NC_008340	CGCAGG	2	12	2618362	2618373	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	114321454
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59097	NC_008340	GCTG	2	8	2618498	2618505	0 %	25 %	50 %	25 %	114321454
59098	NC_008340	GAC	2	6	2618538	2618543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321454
59099	NC_008340	GCG	2	6	2618564	2618569	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321454
59100	NC_008340	GCA	2	6	2618697	2618702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321454
59101	NC_008340	AGCC	2	8	2618707	2618714	25 %	0 %	25 %	50 %	114321455
59102	NC_008340	CAC	2	6	2618809	2618814	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114321455
59103	NC_008340	CGA	2	6	2618842	2618847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321455
59104	NC_008340	TGG	2	6	2618861	2618866	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114321455
59105	NC_008340	CCA	2	6	2618887	2618892	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114321455
59106	NC_008340	GAC	2	6	2618897	2618902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321455
59107	NC_008340	GCC	2	6	2619008	2619013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321455
59108	NC_008340	AGC	2	6	2619123	2619128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321455
59109	NC_008340	GA	3	6	2619138	2619143	50 %	0 %	50 %	0 %	114321455
59110	NC_008340	CCG	2	6	2619758	2619763	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321456
59111	NC_008340	C	6	6	2619778	2619783	0 %	0 %	0 %	100 %	114321456
59112	NC_008340	ACTT	2	8	2619798	2619805	25 %	50 %	0 %	25 %	114321456
59113	NC_008340	GAT	2	6	2619843	2619848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114321456
59114	NC_008340	CAG	2	6	2619879	2619884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321456
59115	NC_008340	GCT	2	6	2619896	2619901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321456
59116	NC_008340	CGT	2	6	2619915	2619920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321456
59117	NC_008340	CGA	2	6	2619938	2619943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321456
59118	NC_008340	GTA	2	6	2620000	2620005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114321457
59119	NC_008340	TTG	2	6	2620013	2620018	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114321457
59120	NC_008340	CGA	2	6	2620023	2620028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321457
59121	NC_008340	CGA	2	6	2620098	2620103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321457
59122	NC_008340	CTG	2	6	2620110	2620115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321457
59123	NC_008340	CGC	2	6	2620123	2620128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321457
59124	NC_008340	ATG	2	6	2620332	2620337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114321458
59125	NC_008340	GCCC	2	8	2620347	2620354	0 %	0 %	25 %	75 %	114321458
59126	NC_008340	GCG	2	6	2620400	2620405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321458
59127	NC_008340	GT	3	6	2620421	2620426	0 %	50 %	50 %	0 %	114321458
59128	NC_008340	CGC	2	6	2620480	2620485	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321458
59129	NC_008340	TG	3	6	2620513	2620518	0 %	50 %	50 %	0 %	114321458
59130	NC_008340	ATG	2	6	2620519	2620524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114321458
59131	NC_008340	CGAG	2	8	2620535	2620542	25 %	0 %	50 %	25 %	114321458
59132	NC_008340	TGC	3	9	2620555	2620563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321458
59133	NC_008340	CGA	2	6	2620601	2620606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321458
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59135	NC_008340	CGA	2	6	2620709	2620714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321458
59136	NC_008340	TGGC	2	8	2620793	2620800	0 %	25 %	50 %	25 %	114321459
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59139	NC_008340	GCC	2	6	2620892	2620897	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321459
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59144	NC_008340	CGA	2	6	2621353	2621358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321459
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59146	NC_008340	CGC	2	6	2621638	2621643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321459
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59148	NC_008340	AGC	2	6	2621664	2621669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321459
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59151	NC_008340	G	7	7	2621822	2621828	0 %	0 %	100 %	0 %	114321459
59152	NC_008340	GGC	2	6	2621833	2621838	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321459
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59154	NC_008340	GCT	2	6	2621893	2621898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321459
59155	NC_008340	C	7	7	2621967	2621973	0 %	0 %	0 %	100 %	114321459
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59164	NC_008340	CGGC	2	8	2622864	2622871	0 %	0 %	50 %	50 %	114321460
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59173	NC_008340	CA	3	6	2623167	2623172	50 %	0 %	0 %	50 %	114321460
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59204	NC_008340	ATCGGA	2	12	2624663	2624674	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	114321461
59205	NC_008340	TAGCC	2	10	2624717	2624726	20 %	20 %	20 %	40 %	114321461
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59216	NC_008340	TGC	2	6	2625394	2625399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321461
59217	NC_008340	GC	3	6	2625404	2625409	0 %	0 %	50 %	50 %	114321461
59218	NC_008340	ACA	2	6	2625421	2625426	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114321461
59219	NC_008340	CGA	2	6	2625527	2625532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321461
59220	NC_008340	CCG	2	6	2625571	2625576	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321461
59221	NC_008340	CAC	2	6	2625628	2625633	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114321461
59222	NC_008340	TCG	2	6	2625667	2625672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321461
59223	NC_008340	TGA	2	6	2625790	2625795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114321462
59224	NC_008340	GACA	2	8	2625829	2625836	50 %	0 %	25 %	25 %	114321462
59225	NC_008340	GGA	2	6	2625842	2625847	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114321462
59226	NC_008340	CAC	2	6	2625910	2625915	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114321462
59227	NC_008340	CGT	2	6	2626001	2626006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321462
59228	NC_008340	GCA	2	6	2626042	2626047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321462
59229	NC_008340	GCT	2	6	2626063	2626068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321462
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59231	NC_008340	TCG	2	6	2626143	2626148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321462
59232	NC_008340	ACC	2	6	2626187	2626192	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114321462
59233	NC_008340	GAA	2	6	2626265	2626270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114321462
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59338	NC_008340	CG	3	6	2631029	2631034	0 %	0 %	50 %	50 %	114321468
59339	NC_008340	CTGG	2	8	2631045	2631052	0 %	25 %	50 %	25 %	114321468
59340	NC_008340	GGC	2	6	2631081	2631086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321468
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59342	NC_008340	TTCCA	2	10	2631193	2631202	20 %	40 %	0 %	40 %	114321468
59343	NC_008340	GCA	3	9	2631206	2631214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321468
59344	NC_008340	ACCA	2	8	2631223	2631230	50 %	0 %	0 %	50 %	114321468
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59346	NC_008340	CAT	2	6	2631264	2631269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114321468
59347	NC_008340	TGG	2	6	2631356	2631361	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114321468
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59455	NC_008340	CGGCG	2	10	2636414	2636423	0 %	0 %	60 %	40 %	114321472
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59492	NC_008340	GAAG	2	8	2638225	2638232	50 %	0 %	50 %	0 %	114321474
59493	NC_008340	CGA	2	6	2638251	2638256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321474
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