MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1 chromosome

Total Repeats: 74307

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
58001	NC_008340	ACC	3	9	2565898	2565906	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114321412
58002	NC_008340	CCAAGT	2	12	2565983	2565994	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	114321412
58003	NC_008340	GCT	2	6	2566023	2566028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321412
58004	NC_008340	TGA	2	6	2566055	2566060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114321412
58005	NC_008340	GTG	2	6	2566078	2566083	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114321412
58006	NC_008340	GGC	2	6	2566182	2566187	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321412
58007	NC_008340	GGT	2	6	2566203	2566208	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114321412
58008	NC_008340	ACA	2	6	2566379	2566384	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114321412
58009	NC_008340	CAA	2	6	2566422	2566427	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114321412
58010	NC_008340	ATC	2	6	2566429	2566434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114321412
58011	NC_008340	CTG	2	6	2566435	2566440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321412
58012	NC_008340	ACCA	2	8	2566510	2566517	50 %	0 %	0 %	50 %	114321412
58013	NC_008340	TGC	2	6	2566577	2566582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321412
58014	NC_008340	AGA	2	6	2566622	2566627	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114321412
58015	NC_008340	ACA	2	6	2567586	2567591	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114321413
58016	NC_008340	C	6	6	2567592	2567597	0 %	0 %	0 %	100 %	114321413
58017	NC_008340	TTC	2	6	2567614	2567619	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114321413
58018	NC_008340	C	6	6	2567619	2567624	0 %	0 %	0 %	100 %	114321413
58019	NC_008340	ACC	2	6	2567656	2567661	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114321413
58020	NC_008340	CG	3	6	2567673	2567678	0 %	0 %	50 %	50 %	114321413
58021	NC_008340	CGG	2	6	2567715	2567720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321413
58022	NC_008340	CAGCG	2	10	2567761	2567770	20 %	0 %	40 %	40 %	114321413
58023	NC_008340	GCCGC	2	10	2567779	2567788	0 %	0 %	40 %	60 %	114321413
58024	NC_008340	GCT	2	6	2567829	2567834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321413
58025	NC_008340	CCG	2	6	2567859	2567864	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321413
58026	NC_008340	TCG	2	6	2567867	2567872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321413
58027	NC_008340	GCG	2	6	2567879	2567884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321413
58028	NC_008340	TGG	2	6	2567936	2567941	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114321413
58029	NC_008340	CG	3	6	2567950	2567955	0 %	0 %	50 %	50 %	114321413
58030	NC_008340	CGC	2	6	2568072	2568077	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321413
58031	NC_008340	CTT	2	6	2568090	2568095	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114321413
58032	NC_008340	TCG	2	6	2568119	2568124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321413
58033	NC_008340	CAT	2	6	2568168	2568173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114321413
58034	NC_008340	CAT	2	6	2568177	2568182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114321413
58035	NC_008340	GCG	2	6	2568218	2568223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321413
58036	NC_008340	GCTG	2	8	2568236	2568243	0 %	25 %	50 %	25 %	114321413
58037	NC_008340	CGA	2	6	2568267	2568272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321413
58038	NC_008340	GCC	2	6	2568277	2568282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321413
58039	NC_008340	GGT	2	6	2568303	2568308	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114321413
58040	NC_008340	CGG	2	6	2568336	2568341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321413
58041	NC_008340	GC	3	6	2568376	2568381	0 %	0 %	50 %	50 %	114321413
58042	NC_008340	GCCC	2	8	2568530	2568537	0 %	0 %	25 %	75 %	114321414
58043	NC_008340	GGGC	2	8	2568623	2568630	0 %	0 %	75 %	25 %	114321414
58044	NC_008340	GTG	2	6	2568639	2568644	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114321414
58045	NC_008340	CAC	2	6	2568677	2568682	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114321414
58046	NC_008340	CTG	2	6	2568702	2568707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321414
58047	NC_008340	GGT	2	6	2568716	2568721	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114321414
58048	NC_008340	GCG	2	6	2568746	2568751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321414
58049	NC_008340	GCC	2	6	2568850	2568855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321414
58050	NC_008340	TGG	2	6	2568877	2568882	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114321414
58051	NC_008340	AGC	2	6	2568913	2568918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321414
58052	NC_008340	TGAG	2	8	2568957	2568964	25 %	25 %	50 %	0 %	114321414
58053	NC_008340	ATCCTG	2	12	2568992	2569003	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	114321415
58054	NC_008340	GTG	2	6	2569076	2569081	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114321415
58055	NC_008340	ACGGC	2	10	2569200	2569209	20 %	0 %	40 %	40 %	114321415
58056	NC_008340	CTG	2	6	2569301	2569306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321415
58057	NC_008340	GC	3	6	2569307	2569312	0 %	0 %	50 %	50 %	114321415
58058	NC_008340	GAC	2	6	2569355	2569360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321415
58059	NC_008340	TGG	2	6	2569380	2569385	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114321415
58060	NC_008340	GCCC	2	8	2569389	2569396	0 %	0 %	25 %	75 %	114321415
58061	NC_008340	TCA	2	6	2569401	2569406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114321415
58062	NC_008340	GCT	2	6	2569408	2569413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321415
58063	NC_008340	GTG	2	6	2569436	2569441	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114321415
58064	NC_008340	CAG	2	6	2569454	2569459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321415
58065	NC_008340	GCG	2	6	2569460	2569465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321415
58066	NC_008340	AGG	2	6	2569527	2569532	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114321415
58067	NC_008340	GCT	2	6	2569551	2569556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321415
58068	NC_008340	GTG	2	6	2569559	2569564	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114321415
58069	NC_008340	GTG	2	6	2569574	2569579	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114321415
58070	NC_008340	AAGG	2	8	2569601	2569608	50 %	0 %	50 %	0 %	114321415
58071	NC_008340	CGG	2	6	2569633	2569638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321415
58072	NC_008340	GAG	2	6	2569667	2569672	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114321415
58073	NC_008340	GCA	2	6	2569674	2569679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321415
58074	NC_008340	GTGC	2	8	2569685	2569692	0 %	25 %	50 %	25 %	114321415
58075	NC_008340	CAT	2	6	2569699	2569704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114321415
58076	NC_008340	TCCGC	2	10	2569734	2569743	0 %	20 %	20 %	60 %	114321415
58077	NC_008340	GAA	2	6	2569846	2569851	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114321415
58078	NC_008340	CGCC	2	8	2569852	2569859	0 %	0 %	25 %	75 %	114321415
58079	NC_008340	GACCCG	2	12	2569867	2569878	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	114321415
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58081	NC_008340	GAT	2	6	2569948	2569953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114321416
58082	NC_008340	TCGTCC	2	12	2569958	2569969	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	114321416
58083	NC_008340	CGC	2	6	2569977	2569982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321416
58084	NC_008340	CCA	2	6	2570013	2570018	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114321416
58085	NC_008340	CGG	2	6	2570139	2570144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321416
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58087	NC_008340	CAT	2	6	2570224	2570229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114321416
58088	NC_008340	CGGG	2	8	2570266	2570273	0 %	0 %	75 %	25 %	114321416
58089	NC_008340	CGGC	2	8	2570289	2570296	0 %	0 %	50 %	50 %	114321416
58090	NC_008340	GGT	3	9	2570344	2570352	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114321416
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58094	NC_008340	GCA	2	6	2570607	2570612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321416
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58098	NC_008340	GCT	2	6	2570712	2570717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321416
58099	NC_008340	CAG	2	6	2570773	2570778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321416
58100	NC_008340	CTC	2	6	2570809	2570814	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114321416
58101	NC_008340	AGA	2	6	2570829	2570834	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114321416
58102	NC_008340	CACCC	2	10	2570905	2570914	20 %	0 %	0 %	80 %	114321416
58103	NC_008340	GA	3	6	2570959	2570964	50 %	0 %	50 %	0 %	114321416
58104	NC_008340	TGA	3	9	2571014	2571022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114321416
58105	NC_008340	CGC	2	6	2571095	2571100	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321416
58106	NC_008340	CCCACT	2	12	2571102	2571113	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	114321416
58107	NC_008340	CCG	2	6	2571599	2571604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321417
58108	NC_008340	TCT	2	6	2571605	2571610	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114321417
58109	NC_008340	GCC	2	6	2571634	2571639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321417
58110	NC_008340	CTC	2	6	2571651	2571656	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114321417
58111	NC_008340	CCA	2	6	2571665	2571670	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114321417
58112	NC_008340	CCG	2	6	2571776	2571781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321417
58113	NC_008340	A	6	6	2571801	2571806	100 %	0 %	0 %	0 %	114321417
58114	NC_008340	TGT	2	6	2571809	2571814	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114321417
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58116	NC_008340	CTT	2	6	2571879	2571884	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114321417
58117	NC_008340	TCC	2	6	2571895	2571900	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114321417
58118	NC_008340	GGT	2	6	2571920	2571925	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114321417
58119	NC_008340	GATC	2	8	2571929	2571936	25 %	25 %	25 %	25 %	114321417
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58122	NC_008340	GCA	2	6	2572061	2572066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321417
58123	NC_008340	CGC	2	6	2572077	2572082	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321417
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58152	NC_008340	GCCG	2	8	2573560	2573567	0 %	0 %	50 %	50 %	114321418
58153	NC_008340	CGG	2	6	2573629	2573634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321418
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58215	NC_008340	GGGC	2	8	2576222	2576229	0 %	0 %	75 %	25 %	114321420
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58217	NC_008340	CGCC	2	8	2576324	2576331	0 %	0 %	25 %	75 %	114321420
58218	NC_008340	TGC	2	6	2576375	2576380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321420
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58220	NC_008340	CCG	2	6	2576413	2576418	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321420
58221	NC_008340	TGA	2	6	2576444	2576449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114321420
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58223	NC_008340	CCACGT	2	12	2576540	2576551	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	114321421
58224	NC_008340	CTG	2	6	2576563	2576568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321421
58225	NC_008340	TGCCTC	2	12	2576637	2576648	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	114321421
58226	NC_008340	ACCT	2	8	2576749	2576756	25 %	25 %	0 %	50 %	114321422
58227	NC_008340	CCTG	2	8	2576761	2576768	0 %	25 %	25 %	50 %	114321422
58228	NC_008340	TCA	2	6	2576803	2576808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114321422
58229	NC_008340	CCCG	2	8	2576831	2576838	0 %	0 %	25 %	75 %	114321422
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58231	NC_008340	CAG	2	6	2576913	2576918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321422
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58347	NC_008340	GCC	2	6	2582524	2582529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321426
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58459	NC_008340	GAT	2	6	2587015	2587020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114321430
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