MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1 chromosome

Total Repeats: 74307

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
57001	NC_008340	GGC	2	6	2521214	2521219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321363
57002	NC_008340	TCC	2	6	2521312	2521317	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114321364
57003	NC_008340	CGGC	2	8	2521403	2521410	0 %	0 %	50 %	50 %	114321364
57004	NC_008340	GCT	2	6	2521425	2521430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321364
57005	NC_008340	GCG	2	6	2521457	2521462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321364
57006	NC_008340	GCC	2	6	2521648	2521653	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321364
57007	NC_008340	GAT	2	6	2521707	2521712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114321364
57008	NC_008340	GA	3	6	2521784	2521789	50 %	0 %	50 %	0 %	114321364
57009	NC_008340	CCT	2	6	2521805	2521810	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114321364
57010	NC_008340	CGT	2	6	2521811	2521816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321364
57011	NC_008340	CAC	2	6	2521917	2521922	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114321364
57012	NC_008340	CGA	2	6	2521970	2521975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321364
57013	NC_008340	CGG	2	6	2521985	2521990	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321364
57014	NC_008340	GGC	4	12	2522070	2522081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321364
57015	NC_008340	C	6	6	2522104	2522109	0 %	0 %	0 %	100 %	114321364
57016	NC_008340	ACC	2	6	2522119	2522124	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114321364
57017	NC_008340	CAC	2	6	2522160	2522165	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114321364
57018	NC_008340	TCA	2	6	2522168	2522173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114321364
57019	NC_008340	CGA	2	6	2522178	2522183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321364
57020	NC_008340	GGC	2	6	2522190	2522195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321364
57021	NC_008340	CTG	2	6	2522241	2522246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321364
57022	NC_008340	TCC	2	6	2522263	2522268	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114321364
57023	NC_008340	TCT	2	6	2522291	2522296	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114321364
57024	NC_008340	GCG	2	6	2522310	2522315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321364
57025	NC_008340	CGG	2	6	2522324	2522329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321364
57026	NC_008340	GCT	2	6	2522348	2522353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321364
57027	NC_008340	CGGC	2	8	2522390	2522397	0 %	0 %	50 %	50 %	114321364
57028	NC_008340	GCG	2	6	2522439	2522444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321364
57029	NC_008340	GCG	2	6	2522676	2522681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321365
57030	NC_008340	GCG	2	6	2522724	2522729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321365
57031	NC_008340	CTTCAT	2	12	2522733	2522744	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	114321365
57032	NC_008340	TTG	2	6	2522752	2522757	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114321365
57033	NC_008340	ACC	2	6	2522758	2522763	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114321365
57034	NC_008340	CCA	2	6	2522834	2522839	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114321365
57035	NC_008340	GCG	2	6	2522870	2522875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321365
57036	NC_008340	GCC	2	6	2522915	2522920	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321365
57037	NC_008340	GTA	2	6	2522931	2522936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114321365
57038	NC_008340	GCG	2	6	2522937	2522942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321365
57039	NC_008340	TGG	2	6	2522960	2522965	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114321365
57040	NC_008340	GCCG	2	8	2522975	2522982	0 %	0 %	50 %	50 %	114321365
57041	NC_008340	GGCC	2	8	2523005	2523012	0 %	0 %	50 %	50 %	114321365
57042	NC_008340	CAT	2	6	2523015	2523020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114321365
57043	NC_008340	TGC	2	6	2523065	2523070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321365
57044	NC_008340	GCC	2	6	2523114	2523119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321365
57045	NC_008340	GGC	2	6	2523133	2523138	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321365
57046	NC_008340	TGG	2	6	2523317	2523322	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114321365
57047	NC_008340	CGG	2	6	2523361	2523366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321366
57048	NC_008340	TTC	2	6	2523393	2523398	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114321366
57049	NC_008340	GGCC	2	8	2523464	2523471	0 %	0 %	50 %	50 %	114321366
57050	NC_008340	GC	3	6	2523490	2523495	0 %	0 %	50 %	50 %	114321366
57051	NC_008340	CGGTG	2	10	2523711	2523720	0 %	20 %	60 %	20 %	114321366
57052	NC_008340	GACC	2	8	2523729	2523736	25 %	0 %	25 %	50 %	114321366
57053	NC_008340	CCT	2	6	2523797	2523802	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114321366
57054	NC_008340	CAG	2	6	2523825	2523830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321366
57055	NC_008340	CCG	2	6	2523862	2523867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321366
57056	NC_008340	GGC	3	9	2523873	2523881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321366
57057	NC_008340	AGGT	2	8	2523886	2523893	25 %	25 %	50 %	0 %	114321366
57058	NC_008340	GCA	2	6	2523914	2523919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321366
57059	NC_008340	CGT	2	6	2523920	2523925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321366
57060	NC_008340	CCA	2	6	2524025	2524030	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114321366
57061	NC_008340	CGC	2	6	2524044	2524049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321366
57062	NC_008340	GTG	2	6	2524063	2524068	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114321366
57063	NC_008340	GCG	2	6	2524081	2524086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321366
57064	NC_008340	CAT	2	6	2524089	2524094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114321366
57065	NC_008340	CGGTGA	2	12	2524109	2524120	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	114321366
57066	NC_008340	GC	3	6	2524137	2524142	0 %	0 %	50 %	50 %	114321366
57067	NC_008340	CTC	2	6	2524179	2524184	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114321366
57068	NC_008340	CGCA	2	8	2524206	2524213	25 %	0 %	25 %	50 %	114321366
57069	NC_008340	GCC	2	6	2524257	2524262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321366
57070	NC_008340	GAG	2	6	2524434	2524439	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114321366
57071	NC_008340	TGG	3	9	2524445	2524453	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114321366
57072	NC_008340	GGC	2	6	2524512	2524517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321366
57073	NC_008340	T	6	6	2524537	2524542	0 %	100 %	0 %	0 %	114321366
57074	NC_008340	GCC	2	6	2524574	2524579	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321366
57075	NC_008340	CAG	2	6	2524590	2524595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321366
57076	NC_008340	GGC	2	6	2524624	2524629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321367
57077	NC_008340	GCCG	2	8	2524668	2524675	0 %	0 %	50 %	50 %	114321367
57078	NC_008340	GGCGCT	2	12	2524710	2524721	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	114321367
57079	NC_008340	TGC	2	6	2524772	2524777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321367
57080	NC_008340	CAT	2	6	2524849	2524854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114321367
57081	NC_008340	GC	3	6	2525030	2525035	0 %	0 %	50 %	50 %	114321368
57082	NC_008340	GTT	2	6	2525037	2525042	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114321368
57083	NC_008340	GCG	2	6	2525081	2525086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321368
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57085	NC_008340	CCA	2	6	2525100	2525105	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114321368
57086	NC_008340	CGC	2	6	2525163	2525168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321368
57087	NC_008340	CCT	2	6	2525312	2525317	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114321369
57088	NC_008340	CCT	3	9	2525342	2525350	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114321369
57089	NC_008340	CGG	2	6	2525417	2525422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321369
57090	NC_008340	GCC	2	6	2525435	2525440	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321369
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57092	NC_008340	CGGG	2	8	2525536	2525543	0 %	0 %	75 %	25 %	114321369
57093	NC_008340	GACG	2	8	2525549	2525556	25 %	0 %	50 %	25 %	114321369
57094	NC_008340	TGC	2	6	2525597	2525602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321369
57095	NC_008340	GC	3	6	2525643	2525648	0 %	0 %	50 %	50 %	114321369
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57098	NC_008340	CGA	2	6	2525726	2525731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321369
57099	NC_008340	AGC	2	6	2525770	2525775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321369
57100	NC_008340	TCG	2	6	2525776	2525781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321369
57101	NC_008340	CTC	2	6	2525787	2525792	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114321369
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57103	NC_008340	CCA	2	6	2525825	2525830	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114321369
57104	NC_008340	CAG	2	6	2525880	2525885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321369
57105	NC_008340	AC	3	6	2525912	2525917	50 %	0 %	0 %	50 %	114321369
57106	NC_008340	TCG	2	6	2525940	2525945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321370
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57111	NC_008340	CGG	2	6	2526109	2526114	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321370
57112	NC_008340	CCG	2	6	2526243	2526248	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321370
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57114	NC_008340	ATT	2	6	2526396	2526401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114321370
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57116	NC_008340	GTGG	2	8	2526497	2526504	0 %	25 %	75 %	0 %	114321371
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57230	NC_008340	GCG	2	6	2530522	2530527	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321375
57231	NC_008340	CCG	2	6	2530610	2530615	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321375
57232	NC_008340	CGA	2	6	2530635	2530640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321375
57233	NC_008340	GCCC	2	8	2530653	2530660	0 %	0 %	25 %	75 %	114321375
57234	NC_008340	GCT	2	6	2530704	2530709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321375
57235	NC_008340	CGG	2	6	2530735	2530740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321375
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57240	NC_008340	C	6	6	2530925	2530930	0 %	0 %	0 %	100 %	114321376
57241	NC_008340	CG	3	6	2530947	2530952	0 %	0 %	50 %	50 %	114321376
57242	NC_008340	ACT	2	6	2530962	2530967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114321376
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57245	NC_008340	GC	3	6	2531127	2531132	0 %	0 %	50 %	50 %	114321376
57246	NC_008340	CTG	2	6	2531168	2531173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321376
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57250	NC_008340	CGC	2	6	2531405	2531410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321377
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57252	NC_008340	CTG	3	9	2531436	2531444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321377
57253	NC_008340	G	6	6	2531451	2531456	0 %	0 %	100 %	0 %	114321377
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57257	NC_008340	CGA	2	6	2531807	2531812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321377
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57260	NC_008340	TCT	2	6	2531881	2531886	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114321377
57261	NC_008340	CGG	2	6	2531890	2531895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321377
57262	NC_008340	GCC	2	6	2531916	2531921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321378
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57266	NC_008340	CTG	2	6	2532011	2532016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321378
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57321	NC_008340	AGG	3	9	2534201	2534209	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114321379
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57324	NC_008340	CTG	2	6	2534479	2534484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321380
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57327	NC_008340	ACC	3	9	2534600	2534608	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114321380
57328	NC_008340	GCT	2	6	2534620	2534625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321380
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57330	NC_008340	TCA	2	6	2534738	2534743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114321381
57331	NC_008340	CAG	2	6	2534775	2534780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321381
57332	NC_008340	AAG	2	6	2534782	2534787	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114321381
57333	NC_008340	AAC	2	6	2534798	2534803	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114321381
57334	NC_008340	CTG	2	6	2534812	2534817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321381
57335	NC_008340	TGG	2	6	2534864	2534869	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114321381
57336	NC_008340	GCA	2	6	2534885	2534890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321381
57337	NC_008340	TGCCC	2	10	2534910	2534919	0 %	20 %	20 %	60 %	114321381
57338	NC_008340	CTG	2	6	2535016	2535021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321381
57339	NC_008340	TGG	2	6	2535029	2535034	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114321381
57340	NC_008340	CGA	2	6	2535051	2535056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321381
57341	NC_008340	CCA	2	6	2535125	2535130	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114321381
57342	NC_008340	GCT	2	6	2535153	2535158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321381
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57344	NC_008340	CGGC	2	8	2535182	2535189	0 %	0 %	50 %	50 %	114321381
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57449	NC_008340	GTT	2	6	2540137	2540142	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114321388
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