MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1 chromosome

Total Repeats: 74307

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
56001	NC_008340	TGC	2	6	2482185	2482190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321332
56002	NC_008340	TCC	2	6	2482203	2482208	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114321332
56003	NC_008340	GCC	2	6	2482226	2482231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321332
56004	NC_008340	GGCCAC	2	12	2482243	2482254	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	114321332
56005	NC_008340	CGG	2	6	2482291	2482296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321332
56006	NC_008340	CG	3	6	2482304	2482309	0 %	0 %	50 %	50 %	114321332
56007	NC_008340	CTG	3	9	2482373	2482381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321332
56008	NC_008340	GCGGTG	2	12	2482424	2482435	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	114321332
56009	NC_008340	CTG	2	6	2482439	2482444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321332
56010	NC_008340	CGG	2	6	2482485	2482490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321332
56011	NC_008340	CCG	3	9	2482560	2482568	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321332
56012	NC_008340	CCAC	2	8	2482581	2482588	25 %	0 %	0 %	75 %	114321332
56013	NC_008340	GGC	2	6	2482609	2482614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321332
56014	NC_008340	CGGCAG	2	12	2482647	2482658	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	114321332
56015	NC_008340	CTG	2	6	2482715	2482720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321332
56016	NC_008340	TGC	2	6	2482728	2482733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321332
56017	NC_008340	GCT	3	9	2482735	2482743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321332
56018	NC_008340	GCG	2	6	2482769	2482774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321332
56019	NC_008340	GGCG	2	8	2482789	2482796	0 %	0 %	75 %	25 %	114321332
56020	NC_008340	CTG	3	9	2482850	2482858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321332
56021	NC_008340	CGG	2	6	2482860	2482865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321332
56022	NC_008340	CGC	2	6	2482870	2482875	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321332
56023	NC_008340	CCA	2	6	2482903	2482908	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114321332
56024	NC_008340	GCC	2	6	2482955	2482960	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321332
56025	NC_008340	CGC	2	6	2482972	2482977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321332
56026	NC_008340	CTG	3	9	2482994	2483002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321332
56027	NC_008340	TGG	2	6	2483013	2483018	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114321332
56028	NC_008340	CCCTGG	2	12	2483046	2483057	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	114321332
56029	NC_008340	TCGGCC	2	12	2483064	2483075	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	114321332
56030	NC_008340	CGG	3	9	2483092	2483100	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321332
56031	NC_008340	GGGT	2	8	2483105	2483112	0 %	25 %	75 %	0 %	114321332
56032	NC_008340	GCTGG	2	10	2483146	2483155	0 %	20 %	60 %	20 %	114321332
56033	NC_008340	CCG	2	6	2483163	2483168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321332
56034	NC_008340	GCG	2	6	2483169	2483174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321332
56035	NC_008340	TGG	2	6	2483241	2483246	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114321332
56036	NC_008340	GGT	2	6	2483266	2483271	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114321332
56037	NC_008340	TGC	2	6	2483280	2483285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321332
56038	NC_008340	TGG	2	6	2483325	2483330	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114321332
56039	NC_008340	TGG	2	6	2483340	2483345	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114321332
56040	NC_008340	GGC	2	6	2483362	2483367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321332
56041	NC_008340	CGG	2	6	2483398	2483403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321332
56042	NC_008340	CGA	2	6	2483425	2483430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321333
56043	NC_008340	GGC	2	6	2483432	2483437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321333
56044	NC_008340	TGC	2	6	2483455	2483460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321333
56045	NC_008340	CTC	2	6	2483465	2483470	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114321333
56046	NC_008340	GCT	2	6	2483477	2483482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321333
56047	NC_008340	CAT	2	6	2483512	2483517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114321333
56048	NC_008340	C	6	6	2483571	2483576	0 %	0 %	0 %	100 %	114321333
56049	NC_008340	CAG	2	6	2483609	2483614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321333
56050	NC_008340	GT	3	6	2483670	2483675	0 %	50 %	50 %	0 %	114321333
56051	NC_008340	GCACCA	2	12	2483680	2483691	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	114321333
56052	NC_008340	TCC	2	6	2483730	2483735	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114321333
56053	NC_008340	CGG	2	6	2483765	2483770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321333
56054	NC_008340	CAG	2	6	2483906	2483911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321333
56055	NC_008340	TCC	2	6	2483937	2483942	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114321333
56056	NC_008340	CAC	2	6	2483968	2483973	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114321333
56057	NC_008340	ACC	2	6	2483982	2483987	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114321333
56058	NC_008340	GCC	2	6	2483988	2483993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321333
56059	NC_008340	ACG	2	6	2484015	2484020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321333
56060	NC_008340	AGG	2	6	2484037	2484042	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114321333
56061	NC_008340	CG	3	6	2484178	2484183	0 %	0 %	50 %	50 %	114321334
56062	NC_008340	GTG	2	6	2484199	2484204	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114321334
56063	NC_008340	AAC	2	6	2484213	2484218	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114321334
56064	NC_008340	TGG	2	6	2484256	2484261	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114321334
56065	NC_008340	CGG	2	6	2484391	2484396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321334
56066	NC_008340	TGC	2	6	2484415	2484420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321334
56067	NC_008340	CGCCAT	2	12	2484422	2484433	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	114321334
56068	NC_008340	GACCA	2	10	2484435	2484444	40 %	0 %	20 %	40 %	114321334
56069	NC_008340	ACC	2	6	2484496	2484501	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114321334
56070	NC_008340	GCT	2	6	2484506	2484511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321334
56071	NC_008340	GCG	2	6	2484538	2484543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321334
56072	NC_008340	CCG	2	6	2484571	2484576	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321334
56073	NC_008340	GGC	2	6	2484584	2484589	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321334
56074	NC_008340	CTG	2	6	2484594	2484599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321334
56075	NC_008340	GC	3	6	2484617	2484622	0 %	0 %	50 %	50 %	114321334
56076	NC_008340	A	6	6	2484651	2484656	100 %	0 %	0 %	0 %	114321334
56077	NC_008340	GCT	2	6	2484680	2484685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321334
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56080	NC_008340	GACC	2	8	2484743	2484750	25 %	0 %	25 %	50 %	114321334
56081	NC_008340	CCG	2	6	2484770	2484775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321334
56082	NC_008340	TGG	2	6	2484784	2484789	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114321334
56083	NC_008340	CTG	2	6	2484840	2484845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321334
56084	NC_008340	CCG	2	6	2484883	2484888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321334
56085	NC_008340	ACG	2	6	2484919	2484924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321334
56086	NC_008340	ACCCC	2	10	2484925	2484934	20 %	0 %	0 %	80 %	114321334
56087	NC_008340	CCG	2	6	2485084	2485089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321334
56088	NC_008340	GAC	2	6	2485098	2485103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321334
56089	NC_008340	CTG	2	6	2485104	2485109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321334
56090	NC_008340	CGCC	2	8	2485115	2485122	0 %	0 %	25 %	75 %	114321334
56091	NC_008340	ATC	2	6	2485182	2485187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114321334
56092	NC_008340	CCTGCA	2	12	2485466	2485477	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	114321334
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56095	NC_008340	GGC	2	6	2485553	2485558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321334
56096	NC_008340	CTG	2	6	2485566	2485571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321334
56097	NC_008340	ACCT	2	8	2485593	2485600	25 %	25 %	0 %	50 %	114321334
56098	NC_008340	CGG	2	6	2485655	2485660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321334
56099	NC_008340	CAC	2	6	2485682	2485687	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114321334
56100	NC_008340	GTG	2	6	2485818	2485823	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114321334
56101	NC_008340	GGC	2	6	2485847	2485852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321334
56102	NC_008340	CGGCCC	2	12	2485871	2485882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321334
56103	NC_008340	CGG	2	6	2485892	2485897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321334
56104	NC_008340	CCG	2	6	2485921	2485926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321334
56105	NC_008340	CCG	2	6	2485954	2485959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321334
56106	NC_008340	GGT	2	6	2485982	2485987	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114321334
56107	NC_008340	ACG	2	6	2486023	2486028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321334
56108	NC_008340	G	6	6	2486251	2486256	0 %	0 %	100 %	0 %	114321334
56109	NC_008340	GGGT	2	8	2486298	2486305	0 %	25 %	75 %	0 %	114321334
56110	NC_008340	ATGG	2	8	2486382	2486389	25 %	25 %	50 %	0 %	114321334
56111	NC_008340	CGGC	2	8	2486395	2486402	0 %	0 %	50 %	50 %	114321334
56112	NC_008340	CCCG	2	8	2486403	2486410	0 %	0 %	25 %	75 %	114321334
56113	NC_008340	ACCC	2	8	2486435	2486442	25 %	0 %	0 %	75 %	114321334
56114	NC_008340	TCCGGC	2	12	2486616	2486627	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	114321334
56115	NC_008340	TCC	2	6	2486650	2486655	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114321334
56116	NC_008340	CGCC	2	8	2486666	2486673	0 %	0 %	25 %	75 %	114321334
56117	NC_008340	ACCC	2	8	2486692	2486699	25 %	0 %	0 %	75 %	114321334
56118	NC_008340	CGA	2	6	2486723	2486728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321334
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56120	NC_008340	ACC	2	6	2486775	2486780	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114321334
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56122	NC_008340	GCG	2	6	2486917	2486922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321334
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56127	NC_008340	CGGC	2	8	2487272	2487279	0 %	0 %	50 %	50 %	114321334
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56136	NC_008340	GCGG	2	8	2487428	2487435	0 %	0 %	75 %	25 %	114321334
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56143	NC_008340	GCA	2	6	2487656	2487661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321334
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56164	NC_008340	CGGG	2	8	2488902	2488909	0 %	0 %	75 %	25 %	114321334
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56209	NC_008340	GCCC	2	8	2490390	2490397	0 %	0 %	25 %	75 %	114321334
56210	NC_008340	GC	3	6	2490404	2490409	0 %	0 %	50 %	50 %	114321334
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56220	NC_008340	CGACCG	2	12	2490655	2490666	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	114321334
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56223	NC_008340	CAG	2	6	2490894	2490899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321335
56224	NC_008340	TTG	2	6	2490913	2490918	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114321335
56225	NC_008340	CAG	2	6	2490972	2490977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321335
56226	NC_008340	GTC	2	6	2491062	2491067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321335
56227	NC_008340	C	6	6	2491093	2491098	0 %	0 %	0 %	100 %	114321335
56228	NC_008340	GCA	2	6	2491118	2491123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321335
56229	NC_008340	GC	3	6	2491152	2491157	0 %	0 %	50 %	50 %	114321335
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56233	NC_008340	GGC	2	6	2491284	2491289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321335
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56464	NC_008340	TGA	2	6	2499718	2499723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114321343
56465	NC_008340	CCAGG	2	10	2499755	2499764	20 %	0 %	40 %	40 %	114321343
56466	NC_008340	GCCAG	2	10	2499820	2499829	20 %	0 %	40 %	40 %	114321343
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56491	NC_008340	GGCG	2	8	2500812	2500819	0 %	0 %	75 %	25 %	114321344
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56497	NC_008340	CGC	2	6	2501018	2501023	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321344
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