MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1 chromosome

Total Repeats: 74307

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
54501	NC_008340	GTC	2	6	2421129	2421134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321277
54502	NC_008340	GCGCCG	2	12	2421141	2421152	0 %	0 %	50 %	50 %	114321277
54503	NC_008340	CCG	2	6	2421171	2421176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321277
54504	NC_008340	CAG	2	6	2421177	2421182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321277
54505	NC_008340	CGC	2	6	2421186	2421191	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321277
54506	NC_008340	CCT	2	6	2421251	2421256	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114321277
54507	NC_008340	CAG	2	6	2421270	2421275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321277
54508	NC_008340	CGT	2	6	2421299	2421304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321277
54509	NC_008340	TCA	2	6	2421329	2421334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114321277
54510	NC_008340	GCCG	2	8	2421362	2421369	0 %	0 %	50 %	50 %	114321277
54511	NC_008340	CGC	2	6	2421382	2421387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321277
54512	NC_008340	CGC	2	6	2421395	2421400	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321277
54513	NC_008340	CAG	2	6	2421408	2421413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321277
54514	NC_008340	CCG	2	6	2421511	2421516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321277
54515	NC_008340	GCA	2	6	2421629	2421634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321277
54516	NC_008340	TGC	2	6	2421677	2421682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321277
54517	NC_008340	GCC	2	6	2421777	2421782	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321277
54518	NC_008340	GCC	2	6	2421816	2421821	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321277
54519	NC_008340	CCG	2	6	2421857	2421862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321277
54520	NC_008340	GCG	2	6	2421883	2421888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321277
54521	NC_008340	GTG	2	6	2421889	2421894	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114321277
54522	NC_008340	CGGC	2	8	2421901	2421908	0 %	0 %	50 %	50 %	114321277
54523	NC_008340	CCT	2	6	2421947	2421952	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114321277
54524	NC_008340	GGC	2	6	2421989	2421994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321277
54525	NC_008340	GC	3	6	2422020	2422025	0 %	0 %	50 %	50 %	114321277
54526	NC_008340	CGG	2	6	2422049	2422054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321277
54527	NC_008340	GC	3	6	2422117	2422122	0 %	0 %	50 %	50 %	114321277
54528	NC_008340	GGC	2	6	2422123	2422128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321277
54529	NC_008340	CCG	2	6	2422129	2422134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321277
54530	NC_008340	ATG	2	6	2422135	2422140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114321277
54531	NC_008340	CCGG	2	8	2422198	2422205	0 %	0 %	50 %	50 %	114321277
54532	NC_008340	TCC	2	6	2422303	2422308	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114321277
54533	NC_008340	AGGCC	2	10	2422316	2422325	20 %	0 %	40 %	40 %	114321277
54534	NC_008340	ACC	2	6	2422420	2422425	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114321277
54535	NC_008340	CGG	2	6	2422457	2422462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321277
54536	NC_008340	TCC	2	6	2422492	2422497	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114321277
54537	NC_008340	C	6	6	2422496	2422501	0 %	0 %	0 %	100 %	114321277
54538	NC_008340	GCA	2	6	2422550	2422555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321277
54539	NC_008340	CCG	2	6	2422562	2422567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321277
54540	NC_008340	CGG	2	6	2422601	2422606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321277
54541	NC_008340	CG	3	6	2422615	2422620	0 %	0 %	50 %	50 %	114321277
54542	NC_008340	TCA	2	6	2422628	2422633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114321277
54543	NC_008340	GCG	3	9	2422648	2422656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321277
54544	NC_008340	GCC	2	6	2422668	2422673	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321277
54545	NC_008340	GAT	2	6	2422686	2422691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114321277
54546	NC_008340	GCT	2	6	2422748	2422753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321277
54547	NC_008340	AGCG	2	8	2422846	2422853	25 %	0 %	50 %	25 %	114321277
54548	NC_008340	CCGG	3	12	2422868	2422879	0 %	0 %	50 %	50 %	114321277
54549	NC_008340	CCA	2	6	2422896	2422901	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114321277
54550	NC_008340	CGCC	2	8	2422907	2422914	0 %	0 %	25 %	75 %	114321277
54551	NC_008340	AGC	2	6	2422987	2422992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321277
54552	NC_008340	GCG	2	6	2423003	2423008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321277
54553	NC_008340	CAG	2	6	2423016	2423021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321277
54554	NC_008340	CAT	2	6	2423064	2423069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114321277
54555	NC_008340	CGG	2	6	2423225	2423230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321278
54556	NC_008340	CCT	3	9	2423258	2423266	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114321278
54557	NC_008340	GC	3	6	2423287	2423292	0 %	0 %	50 %	50 %	114321278
54558	NC_008340	CCCA	2	8	2423295	2423302	25 %	0 %	0 %	75 %	114321278
54559	NC_008340	CAC	2	6	2423313	2423318	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114321278
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54562	NC_008340	CAT	2	6	2423379	2423384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114321278
54563	NC_008340	CCA	2	6	2423417	2423422	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114321278
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54565	NC_008340	GCCACC	2	12	2423589	2423600	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	114321278
54566	NC_008340	GCG	2	6	2423618	2423623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321278
54567	NC_008340	CGG	2	6	2423689	2423694	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321278
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54569	NC_008340	GCCA	2	8	2424173	2424180	25 %	0 %	25 %	50 %	114321279
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54574	NC_008340	CGGC	2	8	2424475	2424482	0 %	0 %	50 %	50 %	114321279
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54590	NC_008340	CCG	2	6	2424971	2424976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321279
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54599	NC_008340	CAT	2	6	2425233	2425238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114321280
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54601	NC_008340	GCGT	2	8	2425289	2425296	0 %	25 %	50 %	25 %	114321280
54602	NC_008340	GCC	2	6	2425351	2425356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321280
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54605	NC_008340	GACGG	2	10	2425427	2425436	20 %	0 %	60 %	20 %	114321280
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54609	NC_008340	GATCCT	2	12	2425639	2425650	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	114321281
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54616	NC_008340	ACC	2	6	2425965	2425970	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114321281
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54720	NC_008340	TGCCC	2	10	2429875	2429884	0 %	20 %	20 %	60 %	114321282
54721	NC_008340	CCACC	2	10	2429923	2429932	20 %	0 %	0 %	80 %	114321282
54722	NC_008340	TGC	2	6	2429943	2429948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321282
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54724	NC_008340	CTG	2	6	2430119	2430124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321282
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54726	NC_008340	GCTG	2	8	2430264	2430271	0 %	25 %	50 %	25 %	114321282
54727	NC_008340	GCC	2	6	2430282	2430287	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321282
54728	NC_008340	CTG	2	6	2430296	2430301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321282
54729	NC_008340	GCTC	2	8	2430353	2430360	0 %	25 %	25 %	50 %	114321282
54730	NC_008340	GCG	2	6	2430369	2430374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321283
54731	NC_008340	CCA	2	6	2430386	2430391	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114321283
54732	NC_008340	GCA	2	6	2430404	2430409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321283
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54830	NC_008340	CTG	2	6	2435395	2435400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321288
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54834	NC_008340	GC	3	6	2435680	2435685	0 %	0 %	50 %	50 %	114321289
54835	NC_008340	ATC	2	6	2435689	2435694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114321289
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54840	NC_008340	TGC	2	6	2435870	2435875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321289
54841	NC_008340	CGA	2	6	2435894	2435899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321289
54842	NC_008340	GCACC	2	10	2435972	2435981	20 %	0 %	20 %	60 %	114321289
54843	NC_008340	CAGA	2	8	2436021	2436028	50 %	0 %	25 %	25 %	114321289
54844	NC_008340	GGC	3	9	2436033	2436041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321289
54845	NC_008340	TGA	2	6	2436155	2436160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114321289
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