MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1 chromosome

Total Repeats: 74307

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
54001	NC_008340	AGC	2	6	2398866	2398871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321261
54002	NC_008340	GAG	2	6	2398893	2398898	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114321261
54003	NC_008340	CAC	3	9	2398925	2398933	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114321261
54004	NC_008340	GCA	2	6	2398951	2398956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321261
54005	NC_008340	GTT	2	6	2399000	2399005	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114321261
54006	NC_008340	CAGGTC	2	12	2399018	2399029	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	114321261
54007	NC_008340	GCA	2	6	2399050	2399055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321261
54008	NC_008340	CAG	2	6	2399111	2399116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321261
54009	NC_008340	TGG	2	6	2399618	2399623	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114321262
54010	NC_008340	CCG	2	6	2399669	2399674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321262
54011	NC_008340	CAG	2	6	2399700	2399705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321262
54012	NC_008340	GCC	2	6	2399716	2399721	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321262
54013	NC_008340	CGC	2	6	2399739	2399744	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321262
54014	NC_008340	ACG	2	6	2399837	2399842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321262
54015	NC_008340	CAG	2	6	2399955	2399960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321262
54016	NC_008340	CGAC	2	8	2399990	2399997	25 %	0 %	25 %	50 %	114321262
54017	NC_008340	CCG	2	6	2400161	2400166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321262
54018	NC_008340	AGG	2	6	2400173	2400178	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114321262
54019	NC_008340	G	6	6	2400181	2400186	0 %	0 %	100 %	0 %	114321262
54020	NC_008340	CCA	2	6	2400228	2400233	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114321262
54021	NC_008340	CGA	2	6	2400315	2400320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321262
54022	NC_008340	CAC	2	6	2400336	2400341	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114321262
54023	NC_008340	CCT	2	6	2400359	2400364	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114321262
54024	NC_008340	CGA	2	6	2400375	2400380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321262
54025	NC_008340	GAC	2	6	2400391	2400396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321262
54026	NC_008340	TCG	2	6	2400404	2400409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321262
54027	NC_008340	CAA	2	6	2400432	2400437	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114321262
54028	NC_008340	ACG	2	6	2400467	2400472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321262
54029	NC_008340	CTG	2	6	2400489	2400494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321262
54030	NC_008340	CTGG	2	8	2400528	2400535	0 %	25 %	50 %	25 %	114321262
54031	NC_008340	CTGG	2	8	2400597	2400604	0 %	25 %	50 %	25 %	114321262
54032	NC_008340	ACG	2	6	2400605	2400610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321262
54033	NC_008340	ACG	2	6	2400626	2400631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321262
54034	NC_008340	GGC	3	9	2401006	2401014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321263
54035	NC_008340	TGG	2	6	2401149	2401154	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114321263
54036	NC_008340	CGCC	2	8	2401231	2401238	0 %	0 %	25 %	75 %	114321263
54037	NC_008340	AGG	2	6	2401260	2401265	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114321263
54038	NC_008340	GCA	2	6	2401342	2401347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321263
54039	NC_008340	GCA	2	6	2401396	2401401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321263
54040	NC_008340	CAA	2	6	2401415	2401420	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114321263
54041	NC_008340	GGT	2	6	2401426	2401431	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114321263
54042	NC_008340	ATC	2	6	2401466	2401471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114321263
54043	NC_008340	ACC	2	6	2401524	2401529	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114321263
54044	NC_008340	CAC	2	6	2401570	2401575	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114321263
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54046	NC_008340	GAG	3	9	2401601	2401609	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114321263
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54048	NC_008340	TCC	2	6	2401787	2401792	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114321264
54049	NC_008340	CGC	2	6	2401829	2401834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321264
54050	NC_008340	CCAG	2	8	2401864	2401871	25 %	0 %	25 %	50 %	114321264
54051	NC_008340	TGG	2	6	2401926	2401931	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114321264
54052	NC_008340	CAG	3	9	2401949	2401957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321264
54053	NC_008340	CGG	2	6	2401963	2401968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321264
54054	NC_008340	GCG	2	6	2402013	2402018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321264
54055	NC_008340	GCA	2	6	2402062	2402067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321264
54056	NC_008340	CAG	2	6	2402129	2402134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321265
54057	NC_008340	CCA	2	6	2402149	2402154	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114321265
54058	NC_008340	GCC	2	6	2402197	2402202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321265
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54060	NC_008340	CAG	2	6	2402261	2402266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321265
54061	NC_008340	GTA	2	6	2402267	2402272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114321265
54062	NC_008340	AAG	2	6	2402280	2402285	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114321265
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54065	NC_008340	GAA	2	6	2402558	2402563	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114321265
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54086	NC_008340	GGA	2	6	2403629	2403634	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114321267
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54100	NC_008340	GCA	2	6	2404162	2404167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321267
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54102	NC_008340	CTT	2	6	2404193	2404198	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114321267
54103	NC_008340	TGG	2	6	2404204	2404209	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114321267
54104	NC_008340	CAA	2	6	2404253	2404258	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114321267
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54114	NC_008340	GCC	2	6	2404935	2404940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321268
54115	NC_008340	CCA	2	6	2404954	2404959	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114321268
54116	NC_008340	GCT	3	9	2404972	2404980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321268
54117	NC_008340	GCCG	2	8	2405040	2405047	0 %	0 %	50 %	50 %	114321268
54118	NC_008340	GAC	2	6	2405069	2405074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321268
54119	NC_008340	CCG	3	9	2405079	2405087	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321268
54120	NC_008340	GCG	2	6	2405115	2405120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321268
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54122	NC_008340	GGT	2	6	2405188	2405193	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114321268
54123	NC_008340	GC	3	6	2405198	2405203	0 %	0 %	50 %	50 %	114321268
54124	NC_008340	GTG	2	6	2405216	2405221	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114321268
54125	NC_008340	CGA	2	6	2405236	2405241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321268
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54131	NC_008340	GGC	2	6	2405584	2405589	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321268
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54142	NC_008340	CGC	2	6	2405958	2405963	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321269
54143	NC_008340	GAG	2	6	2405967	2405972	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114321269
54144	NC_008340	CTG	3	9	2405976	2405984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321269
54145	NC_008340	ACT	2	6	2405998	2406003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114321269
54146	NC_008340	TGGC	2	8	2406039	2406046	0 %	25 %	50 %	25 %	114321269
54147	NC_008340	CCTGGC	2	12	2406053	2406064	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	114321269
54148	NC_008340	GCA	2	6	2406101	2406106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321269
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54154	NC_008340	GCC	2	6	2406303	2406308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321269
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54162	NC_008340	GAG	2	6	2406666	2406671	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114321269
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54184	NC_008340	ATC	2	6	2407632	2407637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114321269
54185	NC_008340	AGCCC	2	10	2407870	2407879	20 %	0 %	20 %	60 %	114321270
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54195	NC_008340	TGA	2	6	2408237	2408242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114321270
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54200	NC_008340	CGG	2	6	2408512	2408517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321271
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54202	NC_008340	CAT	2	6	2408562	2408567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114321271
54203	NC_008340	GCT	2	6	2408595	2408600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321271
54204	NC_008340	GGC	2	6	2408644	2408649	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321271
54205	NC_008340	TGG	2	6	2408762	2408767	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114321271
54206	NC_008340	TTC	2	6	2408773	2408778	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114321271
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54211	NC_008340	CCA	2	6	2408960	2408965	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114321271
54212	NC_008340	GTG	2	6	2409007	2409012	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114321271
54213	NC_008340	CAG	2	6	2409015	2409020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321271
54214	NC_008340	AGC	2	6	2409050	2409055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321271
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54217	NC_008340	GGA	2	6	2409240	2409245	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114321271
54218	NC_008340	CTG	2	6	2409247	2409252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321271
54219	NC_008340	GAT	2	6	2409267	2409272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114321271
54220	NC_008340	CGG	2	6	2409288	2409293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321271
54221	NC_008340	CTG	2	6	2409328	2409333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321271
54222	NC_008340	ACC	2	6	2409383	2409388	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114321271
54223	NC_008340	CTA	2	6	2409402	2409407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114321271
54224	NC_008340	TGG	2	6	2409430	2409435	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114321271
54225	NC_008340	GAG	2	6	2409475	2409480	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114321271
54226	NC_008340	TGC	2	6	2409503	2409508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321271
54227	NC_008340	GCC	2	6	2409519	2409524	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321271
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54229	NC_008340	GGA	2	6	2409603	2409608	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114321271
54230	NC_008340	TCT	2	6	2409647	2409652	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114321271
54231	NC_008340	GGA	2	6	2409693	2409698	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114321271
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54340	NC_008340	CGG	2	6	2414574	2414579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321273
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54342	NC_008340	GAT	2	6	2414659	2414664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114321273
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54461	NC_008340	TCC	2	6	2419524	2419529	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114321276
54462	NC_008340	GCC	2	6	2419637	2419642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321276
54463	NC_008340	CACCCG	2	12	2419652	2419663	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	114321276
54464	NC_008340	GCC	2	6	2419664	2419669	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321276
54465	NC_008340	CCA	2	6	2419693	2419698	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114321276
54466	NC_008340	AGC	2	6	2419707	2419712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321276
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54471	NC_008340	GTA	2	6	2419973	2419978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114321276
54472	NC_008340	AGGA	2	8	2420013	2420020	50 %	0 %	50 %	0 %	114321276
54473	NC_008340	GTC	2	6	2420030	2420035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321276
54474	NC_008340	GCCG	2	8	2420113	2420120	0 %	0 %	50 %	50 %	114321276
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54480	NC_008340	ACC	3	9	2420268	2420276	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114321276
54481	NC_008340	GCC	2	6	2420300	2420305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321276
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54483	NC_008340	CCGG	2	8	2420389	2420396	0 %	0 %	50 %	50 %	114321276
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54488	NC_008340	GCG	2	6	2420537	2420542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321276
54489	NC_008340	CGG	2	6	2420551	2420556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321276
54490	NC_008340	TGG	2	6	2420586	2420591	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114321276
54491	NC_008340	TCT	2	6	2420698	2420703	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114321276
54492	NC_008340	TCC	2	6	2420712	2420717	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114321276
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54499	NC_008340	CCA	2	6	2420993	2420998	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114321277
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