MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1 chromosome

Total Repeats: 74307

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
53501	NC_008340	GC	3	6	2375165	2375170	0 %	0 %	50 %	50 %	114321243
53502	NC_008340	TCT	3	9	2375191	2375199	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114321243
53503	NC_008340	CGG	2	6	2375388	2375393	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321243
53504	NC_008340	CGA	2	6	2375423	2375428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321243
53505	NC_008340	CTG	2	6	2375436	2375441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321243
53506	NC_008340	GAC	2	6	2375442	2375447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321243
53507	NC_008340	AGT	2	6	2375599	2375604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114321244
53508	NC_008340	TGG	2	6	2375616	2375621	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114321244
53509	NC_008340	CGC	2	6	2375719	2375724	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321244
53510	NC_008340	TGG	2	6	2375800	2375805	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114321245
53511	NC_008340	CTG	3	9	2375808	2375816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321245
53512	NC_008340	TGGC	2	8	2375818	2375825	0 %	25 %	50 %	25 %	114321245
53513	NC_008340	G	6	6	2375826	2375831	0 %	0 %	100 %	0 %	114321245
53514	NC_008340	GGC	2	6	2375843	2375848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321245
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53516	NC_008340	CCA	2	6	2375896	2375901	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114321245
53517	NC_008340	CACCG	2	10	2376008	2376017	20 %	0 %	20 %	60 %	114321245
53518	NC_008340	GGC	2	6	2376020	2376025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321245
53519	NC_008340	TCG	2	6	2376052	2376057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321245
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53521	NC_008340	CGC	2	6	2376174	2376179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321245
53522	NC_008340	GATA	2	8	2376192	2376199	50 %	25 %	25 %	0 %	114321246
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53531	NC_008340	GCCGG	2	10	2376481	2376490	0 %	0 %	60 %	40 %	114321246
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53540	NC_008340	GTGGAG	2	12	2376799	2376810	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	114321246
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53544	NC_008340	CG	3	6	2376909	2376914	0 %	0 %	50 %	50 %	114321246
53545	NC_008340	GC	3	6	2377020	2377025	0 %	0 %	50 %	50 %	114321246
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53553	NC_008340	GCC	2	6	2377784	2377789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321247
53554	NC_008340	CGG	2	6	2377837	2377842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321247
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53569	NC_008340	GAG	2	6	2378228	2378233	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114321247
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53586	NC_008340	CCAC	2	8	2378868	2378875	25 %	0 %	0 %	75 %	114321247
53587	NC_008340	AAG	2	6	2378948	2378953	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114321247
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53599	NC_008340	ACC	2	6	2379691	2379696	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114321248
53600	NC_008340	CCAAGG	2	12	2379715	2379726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321248
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53604	NC_008340	GGCCC	2	10	2379878	2379887	0 %	0 %	40 %	60 %	114321248
53605	NC_008340	ATC	2	6	2379918	2379923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114321248
53606	NC_008340	CCA	2	6	2379928	2379933	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114321248
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53610	NC_008340	AGGTGA	2	12	2380354	2380365	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	114321249
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53612	NC_008340	GCCC	2	8	2380434	2380441	0 %	0 %	25 %	75 %	114321249
53613	NC_008340	AAT	2	6	2380447	2380452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114321249
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53615	NC_008340	GTC	2	6	2380623	2380628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321250
53616	NC_008340	CTGA	2	8	2380665	2380672	25 %	25 %	25 %	25 %	114321250
53617	NC_008340	GGTG	2	8	2380709	2380716	0 %	25 %	75 %	0 %	114321250
53618	NC_008340	GTG	3	9	2380714	2380722	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114321250
53619	NC_008340	TGA	2	6	2380772	2380777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114321250
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53622	NC_008340	GTC	2	6	2380884	2380889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321250
53623	NC_008340	GGT	2	6	2380934	2380939	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114321250
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53646	NC_008340	GCT	2	6	2381663	2381668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321250
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53649	NC_008340	TGG	2	6	2381771	2381776	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114321250
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53651	NC_008340	TGG	2	6	2381804	2381809	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114321250
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53717	NC_008340	ACC	2	6	2385062	2385067	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114321251
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53721	NC_008340	G	6	6	2385160	2385165	0 %	0 %	100 %	0 %	114321251
53722	NC_008340	TGA	2	6	2385184	2385189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114321251
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53727	NC_008340	TGA	2	6	2386034	2386039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114321252
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53833	NC_008340	CGA	2	6	2391024	2391029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321255
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53840	NC_008340	GCA	2	6	2391425	2391430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321257
53841	NC_008340	CTT	2	6	2391453	2391458	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114321257
53842	NC_008340	CAC	2	6	2391591	2391596	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114321257
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