MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1 chromosome

Total Repeats: 74307

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
50001	NC_008340	ACC	2	6	2221896	2221901	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114321101
50002	NC_008340	GCCA	2	8	2221930	2221937	25 %	0 %	25 %	50 %	114321101
50003	NC_008340	GAG	2	6	2221938	2221943	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114321101
50004	NC_008340	CGG	2	6	2221946	2221951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321101
50005	NC_008340	G	6	6	2221967	2221972	0 %	0 %	100 %	0 %	114321101
50006	NC_008340	GCC	2	6	2222042	2222047	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321101
50007	NC_008340	CGCC	3	12	2222044	2222055	0 %	0 %	25 %	75 %	114321101
50008	NC_008340	GGC	2	6	2222082	2222087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321101
50009	NC_008340	CCA	2	6	2222132	2222137	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114321101
50010	NC_008340	GGC	2	6	2222181	2222186	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321101
50011	NC_008340	TGC	2	6	2222189	2222194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321101
50012	NC_008340	TCC	2	6	2222236	2222241	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114321101
50013	NC_008340	GCT	2	6	2222257	2222262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321101
50014	NC_008340	TCC	2	6	2222281	2222286	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114321101
50015	NC_008340	AGGC	2	8	2222338	2222345	25 %	0 %	50 %	25 %	114321101
50016	NC_008340	GC	3	6	2222386	2222391	0 %	0 %	50 %	50 %	114321101
50017	NC_008340	CTC	2	6	2222427	2222432	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114321101
50018	NC_008340	GTTC	2	8	2222483	2222490	0 %	50 %	25 %	25 %	114321101
50019	NC_008340	GTC	2	6	2222512	2222517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321102
50020	NC_008340	CTC	2	6	2222530	2222535	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114321102
50021	NC_008340	CGC	3	9	2222553	2222561	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321102
50022	NC_008340	GAG	2	6	2222572	2222577	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114321102
50023	NC_008340	TGC	2	6	2222594	2222599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321102
50024	NC_008340	CCA	2	6	2222655	2222660	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114321102
50025	NC_008340	GTC	2	6	2222764	2222769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321102
50026	NC_008340	CTG	2	6	2222791	2222796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321102
50027	NC_008340	CGG	2	6	2222799	2222804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321102
50028	NC_008340	GCC	2	6	2222819	2222824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321102
50029	NC_008340	GGC	2	6	2222827	2222832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321102
50030	NC_008340	CGG	2	6	2222840	2222845	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321102
50031	NC_008340	CG	4	8	2222861	2222868	0 %	0 %	50 %	50 %	114321102
50032	NC_008340	CGG	2	6	2222910	2222915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321102
50033	NC_008340	GCC	2	6	2222930	2222935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321102
50034	NC_008340	GCC	2	6	2222938	2222943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321102
50035	NC_008340	T	6	6	2222954	2222959	0 %	100 %	0 %	0 %	114321102
50036	NC_008340	ATG	2	6	2223053	2223058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114321102
50037	NC_008340	ATG	2	6	2223384	2223389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114321103
50038	NC_008340	GCG	3	9	2223414	2223422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321103
50039	NC_008340	CGA	2	6	2223461	2223466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321103
50040	NC_008340	GAG	2	6	2223486	2223491	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114321103
50041	NC_008340	GC	3	6	2223547	2223552	0 %	0 %	50 %	50 %	114321103
50042	NC_008340	ACG	2	6	2223571	2223576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321103
50043	NC_008340	CGG	2	6	2223608	2223613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321103
50044	NC_008340	GCC	2	6	2223652	2223657	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321103
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50046	NC_008340	TGGG	2	8	2223729	2223736	0 %	25 %	75 %	0 %	114321103
50047	NC_008340	ACC	2	6	2223753	2223758	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114321103
50048	NC_008340	CAG	2	6	2223774	2223779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321103
50049	NC_008340	GCC	2	6	2223783	2223788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321103
50050	NC_008340	CAA	2	6	2223812	2223817	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114321103
50051	NC_008340	CAG	2	6	2223827	2223832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321103
50052	NC_008340	ACT	2	6	2223835	2223840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114321103
50053	NC_008340	GGA	2	6	2223851	2223856	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114321103
50054	NC_008340	CTT	2	6	2223917	2223922	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114321103
50055	NC_008340	ACT	2	6	2223961	2223966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114321103
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50058	NC_008340	CGC	2	6	2224082	2224087	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321103
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50061	NC_008340	CAT	2	6	2224265	2224270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114321103
50062	NC_008340	ACT	2	6	2224396	2224401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114321103
50063	NC_008340	CAT	2	6	2224496	2224501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114321103
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50066	NC_008340	ACA	2	6	2224573	2224578	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114321103
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50087	NC_008340	CGGGG	2	10	2225699	2225708	0 %	0 %	80 %	20 %	114321105
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50099	NC_008340	CAA	2	6	2226116	2226121	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114321106
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50103	NC_008340	ATG	2	6	2226240	2226245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114321106
50104	NC_008340	GCC	2	6	2226378	2226383	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321106
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50106	NC_008340	GAT	2	6	2226419	2226424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114321106
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50109	NC_008340	GGTGC	2	10	2226504	2226513	0 %	20 %	60 %	20 %	114321106
50110	NC_008340	GC	3	6	2226538	2226543	0 %	0 %	50 %	50 %	114321106
50111	NC_008340	ACGGC	2	10	2226574	2226583	20 %	0 %	40 %	40 %	114321106
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50116	NC_008340	CAG	2	6	2226836	2226841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321106
50117	NC_008340	ATC	2	6	2226888	2226893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114321106
50118	NC_008340	CAG	2	6	2226899	2226904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321106
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50200	NC_008340	GTT	2	6	2230469	2230474	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114321108
50201	NC_008340	AGCATG	2	12	2230485	2230496	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	114321108
50202	NC_008340	GAA	2	6	2230523	2230528	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114321108
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50206	NC_008340	CCG	2	6	2230615	2230620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321108
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50211	NC_008340	CCGGC	2	10	2230788	2230797	0 %	0 %	40 %	60 %	114321108
50212	NC_008340	CTG	2	6	2230802	2230807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321108
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50216	NC_008340	GGCCA	2	10	2230951	2230960	20 %	0 %	40 %	40 %	114321109
50217	NC_008340	GGC	2	6	2230963	2230968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321109
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50220	NC_008340	CAG	2	6	2231089	2231094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321109
50221	NC_008340	TTC	2	6	2231105	2231110	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114321109
50222	NC_008340	TGA	2	6	2231115	2231120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114321109
50223	NC_008340	CAG	2	6	2231146	2231151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321109
50224	NC_008340	CGG	3	9	2231328	2231336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321110
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50226	NC_008340	CCA	2	6	2231365	2231370	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114321110
50227	NC_008340	GGT	2	6	2231408	2231413	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114321110
50228	NC_008340	TGT	2	6	2231440	2231445	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114321110
50229	NC_008340	CGG	2	6	2231452	2231457	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321110
50230	NC_008340	ACCAGG	2	12	2231502	2231513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321110
50231	NC_008340	GCCG	2	8	2231549	2231556	0 %	0 %	50 %	50 %	114321110
50232	NC_008340	CCT	2	6	2231575	2231580	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114321110
50233	NC_008340	CAT	2	6	2231606	2231611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114321110
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50328	NC_008340	CCGC	2	8	2235599	2235606	0 %	0 %	25 %	75 %	114321113
50329	NC_008340	TCCACC	2	12	2235679	2235690	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	114321113
50330	NC_008340	CTT	2	6	2235723	2235728	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114321113
50331	NC_008340	ATC	2	6	2235781	2235786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114321113
50332	NC_008340	GGC	2	6	2235875	2235880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321114
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50334	NC_008340	GTA	2	6	2235908	2235913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114321114
50335	NC_008340	CGC	3	9	2236007	2236015	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321114
50336	NC_008340	CAG	2	6	2236019	2236024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321114
50337	NC_008340	CGA	2	6	2236054	2236059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321114
50338	NC_008340	CCAG	2	8	2236082	2236089	25 %	0 %	25 %	50 %	114321114
50339	NC_008340	GGT	2	6	2236172	2236177	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114321114
50340	NC_008340	CCG	2	6	2236197	2236202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321114
50341	NC_008340	GCCGA	2	10	2236212	2236221	20 %	0 %	40 %	40 %	114321114
50342	NC_008340	CGT	2	6	2236234	2236239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321114
50343	NC_008340	TGG	2	6	2236246	2236251	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114321114
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50345	NC_008340	GGA	2	6	2236286	2236291	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114321114
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50462	NC_008340	GC	3	6	2241607	2241612	0 %	0 %	50 %	50 %	114321121
50463	NC_008340	GCC	2	6	2241616	2241621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321121
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