MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Alcanivorax borkumensis SK2 chromosome

Total Repeats: 53874

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_008260	CGGCCA	2	12	226710	226721	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	110833070
4002	NC_008260	CCTT	2	8	226766	226773	0 %	50 %	0 %	50 %	110833070
4003	NC_008260	T	7	7	226795	226801	0 %	100 %	0 %	0 %	110833070
4004	NC_008260	TTG	2	6	226828	226833	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110833070
4005	NC_008260	GCGT	2	8	226849	226856	0 %	25 %	50 %	25 %	110833070
4006	NC_008260	CAG	2	6	226921	226926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110833070
4007	NC_008260	A	6	6	226992	226997	100 %	0 %	0 %	0 %	110833070
4008	NC_008260	CTT	2	6	227001	227006	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110833070
4009	NC_008260	GCC	2	6	227066	227071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110833070
4010	NC_008260	CGG	2	6	227100	227105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110833070
4011	NC_008260	TCC	2	6	227116	227121	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	110833070
4012	NC_008260	GCGA	2	8	227144	227151	25 %	0 %	50 %	25 %	110833070
4013	NC_008260	T	6	6	227179	227184	0 %	100 %	0 %	0 %	110833070
4014	NC_008260	GAT	2	6	227475	227480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110833071
4015	NC_008260	GCA	2	6	227534	227539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110833071
4016	NC_008260	GCC	2	6	227541	227546	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110833071
4017	NC_008260	GGT	2	6	227586	227591	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110833071
4018	NC_008260	TTGT	2	8	227613	227620	0 %	75 %	25 %	0 %	110833071
4019	NC_008260	GCA	2	6	227666	227671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110833071
4020	NC_008260	GTC	2	6	227727	227732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110833071
4021	NC_008260	GAT	2	6	227784	227789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110833071
4022	NC_008260	GAT	2	6	227832	227837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110833071
4023	NC_008260	CCG	2	6	227941	227946	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110833071
4024	NC_008260	TTG	2	6	227974	227979	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110833071
4025	NC_008260	CGGT	2	8	228022	228029	0 %	25 %	50 %	25 %	110833071
4026	NC_008260	CCG	2	6	228100	228105	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110833071
4027	NC_008260	TCA	2	6	228137	228142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110833071
4028	NC_008260	TAC	2	6	228144	228149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110833071
4029	NC_008260	T	6	6	228166	228171	0 %	100 %	0 %	0 %	110833071
4030	NC_008260	CTC	2	6	228174	228179	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	110833071
4031	NC_008260	GCC	2	6	228195	228200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110833071
4032	NC_008260	TGA	2	6	228206	228211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110833071
4033	NC_008260	GTG	2	6	228217	228222	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110833071
4034	NC_008260	TGCA	2	8	228505	228512	25 %	25 %	25 %	25 %	110833072
4035	NC_008260	GTT	2	6	228513	228518	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110833072
4036	NC_008260	TCG	2	6	228554	228559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110833072
4037	NC_008260	CCA	2	6	228576	228581	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110833072
4038	NC_008260	GTG	2	6	228590	228595	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110833072
4039	NC_008260	CG	3	6	228601	228606	0 %	0 %	50 %	50 %	110833072
4040	NC_008260	TGG	3	9	228651	228659	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110833072
4041	NC_008260	GGC	2	6	228660	228665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110833072
4042	NC_008260	TGT	2	6	228717	228722	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110833072
4043	NC_008260	GTG	2	6	228752	228757	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110833072
4044	NC_008260	CGG	2	6	228789	228794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110833072
4045	NC_008260	CAG	2	6	228820	228825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110833072
4046	NC_008260	GAA	2	6	228874	228879	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110833072
4047	NC_008260	CTTT	2	8	228917	228924	0 %	75 %	0 %	25 %	110833072
4048	NC_008260	GGCA	2	8	228994	229001	25 %	0 %	50 %	25 %	110833072
4049	NC_008260	GAT	2	6	229096	229101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110833072
4050	NC_008260	GTCGCC	2	12	229132	229143	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	110833072
4051	NC_008260	GTTCCT	2	12	229167	229178	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	110833072
4052	NC_008260	TAC	2	6	229180	229185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110833072
4053	NC_008260	GGGC	2	8	229355	229362	0 %	0 %	75 %	25 %	110833072
4054	NC_008260	TTC	3	9	229414	229422	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110833072
4055	NC_008260	ATG	2	6	229559	229564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110833072
4056	NC_008260	TAG	2	6	229595	229600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110833072
4057	NC_008260	GGC	2	6	229695	229700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110833072
4058	NC_008260	CCA	2	6	229710	229715	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110833072
4059	NC_008260	AGGT	2	8	229769	229776	25 %	25 %	50 %	0 %	110833072
4060	NC_008260	TAG	2	6	229873	229878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110833072
4061	NC_008260	TCG	2	6	229886	229891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110833072
4062	NC_008260	TCC	2	6	229898	229903	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	110833072
4063	NC_008260	GC	3	6	229952	229957	0 %	0 %	50 %	50 %	110833072
4064	NC_008260	TCG	2	6	230060	230065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110833072
4065	NC_008260	CAG	2	6	230110	230115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110833072
4066	NC_008260	CAG	2	6	230125	230130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110833072
4067	NC_008260	GGT	2	6	230131	230136	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110833072
4068	NC_008260	AGG	2	6	230138	230143	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	110833072
4069	NC_008260	TAT	2	6	230190	230195	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110833072
4070	NC_008260	GC	3	6	230202	230207	0 %	0 %	50 %	50 %	110833072
4071	NC_008260	GCC	2	6	230254	230259	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110833072
4072	NC_008260	TTG	3	9	230273	230281	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110833072
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4075	NC_008260	GCGA	2	8	230407	230414	25 %	0 %	50 %	25 %	110833072
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4086	NC_008260	CGC	2	6	231012	231017	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110833073
4087	NC_008260	GCT	2	6	231117	231122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110833073
4088	NC_008260	CAG	2	6	231134	231139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110833073
4089	NC_008260	ATC	2	6	231256	231261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110833073
4090	NC_008260	GCA	2	6	231285	231290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110833073
4091	NC_008260	GC	3	6	231335	231340	0 %	0 %	50 %	50 %	110833073
4092	NC_008260	CGG	2	6	231351	231356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110833073
4093	NC_008260	GTCG	2	8	231361	231368	0 %	25 %	50 %	25 %	110833073
4094	NC_008260	GTT	2	6	231545	231550	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110833074
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4100	NC_008260	T	6	6	231796	231801	0 %	100 %	0 %	0 %	110833074
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4102	NC_008260	CTT	2	6	231831	231836	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110833074
4103	NC_008260	CGG	2	6	231848	231853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110833074
4104	NC_008260	CGG	3	9	231878	231886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110833074
4105	NC_008260	CCA	2	6	231914	231919	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110833074
4106	NC_008260	CATA	2	8	231935	231942	50 %	25 %	0 %	25 %	110833074
4107	NC_008260	GGGT	2	8	231983	231990	0 %	25 %	75 %	0 %	110833074
4108	NC_008260	CCGGC	2	10	231998	232007	0 %	0 %	40 %	60 %	110833074
4109	NC_008260	TTG	2	6	232078	232083	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110833074
4110	NC_008260	CGG	2	6	232124	232129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110833074
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4112	NC_008260	CCG	2	6	232175	232180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110833074
4113	NC_008260	CTG	2	6	232182	232187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110833074
4114	NC_008260	GCTGCC	2	12	232242	232253	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	110833074
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4116	NC_008260	GCCATG	2	12	232398	232409	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	110833074
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4119	NC_008260	GT	3	6	232522	232527	0 %	50 %	50 %	0 %	110833074
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4121	NC_008260	CGG	2	6	232640	232645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110833074
4122	NC_008260	CAG	2	6	232677	232682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110833074
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4238	NC_008260	G	6	6	239473	239478	0 %	0 %	100 %	0 %	110833082
4239	NC_008260	TGCGC	2	10	239664	239673	0 %	20 %	40 %	40 %	110833082
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4242	NC_008260	TC	3	6	239942	239947	0 %	50 %	0 %	50 %	110833082
4243	NC_008260	GAA	2	6	239959	239964	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110833082
4244	NC_008260	AGT	2	6	240001	240006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110833082
4245	NC_008260	AGT	2	6	240174	240179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110833083
4246	NC_008260	GTT	2	6	240272	240277	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110833083
4247	NC_008260	ATT	2	6	240278	240283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110833083
4248	NC_008260	AAT	2	6	240299	240304	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110833083
4249	NC_008260	TTG	2	6	240339	240344	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110833083
4250	NC_008260	T	6	6	240367	240372	0 %	100 %	0 %	0 %	110833083
4251	NC_008260	A	6	6	240391	240396	100 %	0 %	0 %	0 %	110833083
4252	NC_008260	GAC	2	6	240397	240402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110833083
4253	NC_008260	TGA	2	6	240434	240439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110833083
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4255	NC_008260	TTTC	2	8	240515	240522	0 %	75 %	0 %	25 %	110833083
4256	NC_008260	GAT	2	6	240582	240587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110833083
4257	NC_008260	CCT	2	6	240609	240614	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	110833083
4258	NC_008260	TGTGGC	2	12	240623	240634	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	110833083
4259	NC_008260	GTGCG	2	10	240661	240670	0 %	20 %	60 %	20 %	110833083
4260	NC_008260	A	7	7	240680	240686	100 %	0 %	0 %	0 %	110833083
4261	NC_008260	AG	3	6	240723	240728	50 %	0 %	50 %	0 %	110833083
4262	NC_008260	A	6	6	240859	240864	100 %	0 %	0 %	0 %	110833083
4263	NC_008260	ATT	2	6	240903	240908	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110833083
4264	NC_008260	CTG	2	6	240958	240963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110833084
4265	NC_008260	CTG	2	6	240970	240975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110833084
4266	NC_008260	CGC	2	6	241012	241017	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110833084
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4268	NC_008260	TCG	2	6	241108	241113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110833084
4269	NC_008260	TTG	2	6	241206	241211	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110833084
4270	NC_008260	GTC	2	6	241301	241306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110833084
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4272	NC_008260	GAGC	2	8	241411	241418	25 %	0 %	50 %	25 %	110833084
4273	NC_008260	TGA	2	6	241527	241532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110833084
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4276	NC_008260	ATG	2	6	241726	241731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110833084
4277	NC_008260	TTAT	2	8	241738	241745	25 %	75 %	0 %	0 %	110833084
4278	NC_008260	TTG	2	6	241748	241753	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110833084
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4281	NC_008260	CT	3	6	241986	241991	0 %	50 %	0 %	50 %	110833085
4282	NC_008260	GCT	2	6	242014	242019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110833085
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4284	NC_008260	GTG	2	6	242150	242155	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110833085
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4311	NC_008260	TGC	2	6	244024	244029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110833087
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4314	NC_008260	TAC	2	6	244114	244119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110833087
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4333	NC_008260	GAT	2	6	246202	246207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110833089
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4335	NC_008260	GAT	2	6	246262	246267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110833089
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4340	NC_008260	TGA	2	6	247264	247269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110833090
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4346	NC_008260	AG	3	6	247857	247862	50 %	0 %	50 %	0 %	110833091
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4349	NC_008260	GTT	2	6	248073	248078	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110833091
4350	NC_008260	TAT	2	6	248130	248135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110833091
4351	NC_008260	GCCT	2	8	248183	248190	0 %	25 %	25 %	50 %	110833091
4352	NC_008260	GCA	2	6	248226	248231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110833091
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4355	NC_008260	TCCT	2	8	248454	248461	0 %	50 %	0 %	50 %	110833092
4356	NC_008260	TGTTT	2	10	248552	248561	0 %	80 %	20 %	0 %	110833092
4357	NC_008260	GT	3	6	248582	248587	0 %	50 %	50 %	0 %	110833092
4358	NC_008260	GTA	2	6	248589	248594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110833092
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4361	NC_008260	CGA	2	6	248936	248941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110833093
4362	NC_008260	CGG	2	6	248963	248968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110833093
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4364	NC_008260	TCT	2	6	249034	249039	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110833093
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4486	NC_008260	GC	3	6	255059	255064	0 %	0 %	50 %	50 %	110833097
4487	NC_008260	GGTT	2	8	255072	255079	0 %	50 %	50 %	0 %	110833097
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