MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Alcanivorax borkumensis SK2 chromosome

Total Repeats: 53874

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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25002	NC_008260	CGC	2	6	1442880	1442885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110834128
25003	NC_008260	TGA	2	6	1442933	1442938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110834128
25004	NC_008260	AG	3	6	1442952	1442957	50 %	0 %	50 %	0 %	110834128
25005	NC_008260	GGC	2	6	1442968	1442973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110834128
25006	NC_008260	TCC	2	6	1443028	1443033	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	110834128
25007	NC_008260	TCGT	2	8	1443048	1443055	0 %	50 %	25 %	25 %	110834128
25008	NC_008260	TGC	2	6	1443056	1443061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110834128
25009	NC_008260	TGA	2	6	1443083	1443088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110834128
25010	NC_008260	GAA	2	6	1443115	1443120	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110834128
25011	NC_008260	ATGG	2	8	1443136	1443143	25 %	25 %	50 %	0 %	110834128
25012	NC_008260	GCC	2	6	1443160	1443165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110834128
25013	NC_008260	GAA	2	6	1443177	1443182	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110834128
25014	NC_008260	CAA	2	6	1443186	1443191	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110834128
25015	NC_008260	GAA	2	6	1443250	1443255	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110834128
25016	NC_008260	ACT	2	6	1443352	1443357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110834128
25017	NC_008260	TCA	2	6	1443404	1443409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110834128
25018	NC_008260	GAT	2	6	1443612	1443617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110834128
25019	NC_008260	CAA	2	6	1443621	1443626	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110834128
25020	NC_008260	GCC	2	6	1443679	1443684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110834128
25021	NC_008260	GGCC	2	8	1443741	1443748	0 %	0 %	50 %	50 %	110834128
25022	NC_008260	GAC	2	6	1443766	1443771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110834128
25023	NC_008260	ACT	2	6	1443786	1443791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110834128
25024	NC_008260	TGAGC	2	10	1443798	1443807	20 %	20 %	40 %	20 %	110834128
25025	NC_008260	GAA	2	6	1443811	1443816	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110834128
25026	NC_008260	CAG	2	6	1443820	1443825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110834128
25027	NC_008260	AAC	2	6	1443835	1443840	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110834128
25028	NC_008260	GCT	2	6	1443890	1443895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110834128
25029	NC_008260	ATG	2	6	1443914	1443919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110834128
25030	NC_008260	CCAG	2	8	1443956	1443963	25 %	0 %	25 %	50 %	110834128
25031	NC_008260	CAC	2	6	1443982	1443987	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110834128
25032	NC_008260	CGT	2	6	1444183	1444188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110834128
25033	NC_008260	ACT	2	6	1444372	1444377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110834130
25034	NC_008260	CCA	2	6	1444384	1444389	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110834130
25035	NC_008260	TGC	2	6	1444416	1444421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110834130
25036	NC_008260	GC	3	6	1444535	1444540	0 %	0 %	50 %	50 %	110834130
25037	NC_008260	GCTG	2	8	1444570	1444577	0 %	25 %	50 %	25 %	110834130
25038	NC_008260	GCT	2	6	1444592	1444597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110834130
25039	NC_008260	GTA	2	6	1444615	1444620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110834130
25040	NC_008260	TAA	2	6	1444659	1444664	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110834130
25041	NC_008260	GTT	3	9	1444747	1444755	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110834130
25042	NC_008260	CTG	2	6	1444763	1444768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110834130
25043	NC_008260	TTG	2	6	1444847	1444852	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110834130
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25045	NC_008260	GTA	2	6	1445005	1445010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110834130
25046	NC_008260	ATGG	2	8	1445060	1445067	25 %	25 %	50 %	0 %	110834130
25047	NC_008260	ACGGG	2	10	1445086	1445095	20 %	0 %	60 %	20 %	110834130
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25049	NC_008260	TGC	2	6	1445167	1445172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110834129
25050	NC_008260	ACAGTA	2	12	1445177	1445188	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	110834129
25051	NC_008260	CCA	2	6	1445227	1445232	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110834129
25052	NC_008260	GTG	2	6	1445366	1445371	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110834129
25053	NC_008260	CGT	2	6	1445424	1445429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110834129
25054	NC_008260	TGG	2	6	1445481	1445486	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110834129
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25056	NC_008260	GCTG	2	8	1445598	1445605	0 %	25 %	50 %	25 %	110834129
25057	NC_008260	TGT	2	6	1445622	1445627	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110834129
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25060	NC_008260	GTA	2	6	1445805	1445810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110834129
25061	NC_008260	GGC	2	6	1445839	1445844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110834129
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25066	NC_008260	GCG	2	6	1446161	1446166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110834131
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25068	NC_008260	GCCA	2	8	1446212	1446219	25 %	0 %	25 %	50 %	110834131
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25073	NC_008260	TCCA	2	8	1446456	1446463	25 %	25 %	0 %	50 %	110834131
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25083	NC_008260	GGC	3	9	1446882	1446890	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110834132
25084	NC_008260	TTC	2	6	1446912	1446917	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110834132
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25087	NC_008260	GTT	4	12	1447149	1447160	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110834133
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25089	NC_008260	GCTC	2	8	1447331	1447338	0 %	25 %	25 %	50 %	110834133
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25099	NC_008260	AGC	2	6	1447844	1447849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110834133
25100	NC_008260	GTC	2	6	1447927	1447932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110834133
25101	NC_008260	GACT	2	8	1447993	1448000	25 %	25 %	25 %	25 %	110834133
25102	NC_008260	GCA	2	6	1448054	1448059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110834133
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25105	NC_008260	TCG	2	6	1448233	1448238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110834134
25106	NC_008260	ACG	2	6	1448343	1448348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110834134
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25108	NC_008260	ATG	2	6	1448566	1448571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110834134
25109	NC_008260	TGG	2	6	1448636	1448641	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110834134
25110	NC_008260	CA	3	6	1448701	1448706	50 %	0 %	0 %	50 %	110834134
25111	NC_008260	CAG	2	6	1448721	1448726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110834134
25112	NC_008260	GGT	2	6	1448790	1448795	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110834134
25113	NC_008260	GGT	2	6	1448991	1448996	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110834134
25114	NC_008260	GCA	2	6	1449119	1449124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110834134
25115	NC_008260	GTT	2	6	1449141	1449146	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110834134
25116	NC_008260	TCTTT	2	10	1449215	1449224	0 %	80 %	0 %	20 %	110834134
25117	NC_008260	CAT	2	6	1449248	1449253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110834134
25118	NC_008260	TGG	3	9	1449257	1449265	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110834134
25119	NC_008260	TCA	2	6	1449347	1449352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110834134
25120	NC_008260	CCAG	2	8	1449392	1449399	25 %	0 %	25 %	50 %	110834134
25121	NC_008260	TGG	2	6	1449443	1449448	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110834134
25122	NC_008260	TAA	2	6	1449701	1449706	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110834135
25123	NC_008260	CTTT	2	8	1449711	1449718	0 %	75 %	0 %	25 %	110834135
25124	NC_008260	CGCC	2	8	1449739	1449746	0 %	0 %	25 %	75 %	110834135
25125	NC_008260	GGC	2	6	1449765	1449770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110834135
25126	NC_008260	GC	3	6	1449791	1449796	0 %	0 %	50 %	50 %	110834135
25127	NC_008260	TGCG	2	8	1449800	1449807	0 %	25 %	50 %	25 %	110834135
25128	NC_008260	TTG	2	6	1449811	1449816	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110834135
25129	NC_008260	CAT	2	6	1449914	1449919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110834135
25130	NC_008260	TTG	2	6	1449997	1450002	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110834135
25131	NC_008260	TGCC	2	8	1450010	1450017	0 %	25 %	25 %	50 %	110834135
25132	NC_008260	GCA	2	6	1450022	1450027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110834135
25133	NC_008260	AAGC	2	8	1450092	1450099	50 %	0 %	25 %	25 %	110834135
25134	NC_008260	CTGG	2	8	1450121	1450128	0 %	25 %	50 %	25 %	110834135
25135	NC_008260	CAC	2	6	1450208	1450213	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110834135
25136	NC_008260	CAT	2	6	1450223	1450228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110834135
25137	NC_008260	GCT	2	6	1450240	1450245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110834135
25138	NC_008260	CGG	2	6	1450253	1450258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110834135
25139	NC_008260	CAG	2	6	1450266	1450271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110834135
25140	NC_008260	CTG	2	6	1450272	1450277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110834135
25141	NC_008260	CGC	2	6	1450324	1450329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110834136
25142	NC_008260	GCCGG	2	10	1450480	1450489	0 %	0 %	60 %	40 %	110834136
25143	NC_008260	GGT	2	6	1450558	1450563	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110834136
25144	NC_008260	TACGT	2	10	1450586	1450595	20 %	40 %	20 %	20 %	110834136
25145	NC_008260	TCTT	2	8	1450602	1450609	0 %	75 %	0 %	25 %	110834136
25146	NC_008260	CTGG	2	8	1450741	1450748	0 %	25 %	50 %	25 %	110834136
25147	NC_008260	TCTT	2	8	1450815	1450822	0 %	75 %	0 %	25 %	110834136
25148	NC_008260	AAGT	2	8	1450935	1450942	50 %	25 %	25 %	0 %	110834136
25149	NC_008260	TTG	2	6	1450950	1450955	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110834136
25150	NC_008260	GC	3	6	1450965	1450970	0 %	0 %	50 %	50 %	110834136
25151	NC_008260	TTTGC	2	10	1450977	1450986	0 %	60 %	20 %	20 %	110834136
25152	NC_008260	TTG	2	6	1451079	1451084	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110834136
25153	NC_008260	CGT	2	6	1451257	1451262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110834136
25154	NC_008260	TTC	2	6	1451274	1451279	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110834136
25155	NC_008260	GGCG	2	8	1451317	1451324	0 %	0 %	75 %	25 %	110834136
25156	NC_008260	GGA	2	6	1451333	1451338	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	110834136
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25161	NC_008260	CGG	2	6	1451454	1451459	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110834137
25162	NC_008260	ATC	2	6	1451471	1451476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110834137
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25170	NC_008260	A	7	7	1452200	1452206	100 %	0 %	0 %	0 %	110834138
25171	NC_008260	ACTG	2	8	1452241	1452248	25 %	25 %	25 %	25 %	110834138
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25174	NC_008260	TAC	2	6	1452319	1452324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110834138
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25177	NC_008260	CTG	2	6	1452428	1452433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110834138
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25181	NC_008260	CGG	2	6	1452604	1452609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110834139
25182	NC_008260	TGG	2	6	1452643	1452648	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110834139
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25185	NC_008260	CGG	2	6	1452771	1452776	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110834140
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25188	NC_008260	TTG	2	6	1452918	1452923	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110834140
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25190	NC_008260	GAA	2	6	1453096	1453101	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110834140
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25192	NC_008260	TTGGGT	2	12	1453120	1453131	0 %	50 %	50 %	0 %	110834140
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25201	NC_008260	CAGTC	2	10	1453603	1453612	20 %	20 %	20 %	40 %	110834141
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25203	NC_008260	CGG	2	6	1453660	1453665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110834141
25204	NC_008260	TCG	2	6	1453672	1453677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110834141
25205	NC_008260	ATT	2	6	1453967	1453972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110834142
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25207	NC_008260	TGACC	2	10	1454161	1454170	20 %	20 %	20 %	40 %	110834142
25208	NC_008260	TGA	2	6	1454284	1454289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110834142
25209	NC_008260	GAGAAA	2	12	1454300	1454311	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110834142
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25213	NC_008260	CTC	2	6	1454597	1454602	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	110834142
25214	NC_008260	A	6	6	1454636	1454641	100 %	0 %	0 %	0 %	110834142
25215	NC_008260	T	7	7	1454653	1454659	0 %	100 %	0 %	0 %	110834142
25216	NC_008260	GAA	2	6	1454680	1454685	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110834142
25217	NC_008260	TGT	2	6	1454694	1454699	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110834142
25218	NC_008260	ATG	2	6	1454723	1454728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110834142
25219	NC_008260	GTT	2	6	1454766	1454771	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110834142
25220	NC_008260	GTT	2	6	1454782	1454787	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110834142
25221	NC_008260	TAA	2	6	1454830	1454835	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110834142
25222	NC_008260	GAT	2	6	1455016	1455021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110834142
25223	NC_008260	GGC	2	6	1455029	1455034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110834142
25224	NC_008260	AAG	2	6	1455111	1455116	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110834142
25225	NC_008260	TAAT	2	8	1455117	1455124	50 %	50 %	0 %	0 %	110834142
25226	NC_008260	AGA	2	6	1455202	1455207	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110834142
25227	NC_008260	GGT	2	6	1455370	1455375	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110834142
25228	NC_008260	ATG	2	6	1455432	1455437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110834142
25229	NC_008260	TGT	2	6	1455645	1455650	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110834142
25230	NC_008260	G	6	6	1455670	1455675	0 %	0 %	100 %	0 %	110834142
25231	NC_008260	CGG	2	6	1455697	1455702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110834142
25232	NC_008260	GAA	2	6	1455734	1455739	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110834142
25233	NC_008260	CAA	2	6	1455817	1455822	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110834142
25234	NC_008260	A	6	6	1455821	1455826	100 %	0 %	0 %	0 %	110834142
25235	NC_008260	TGC	2	6	1455838	1455843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110834142
25236	NC_008260	GAT	2	6	1455977	1455982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110834142
25237	NC_008260	GAAA	2	8	1455991	1455998	75 %	0 %	25 %	0 %	110834142
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25262	NC_008260	ATT	2	6	1457696	1457701	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110834143
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25348	NC_008260	GGC	2	6	1462669	1462674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110834149
25349	NC_008260	GTT	2	6	1462767	1462772	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110834149
25350	NC_008260	GCGGG	2	10	1462791	1462800	0 %	0 %	80 %	20 %	110834149
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25353	NC_008260	CAG	2	6	1462896	1462901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110834149
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25355	NC_008260	GGC	2	6	1463040	1463045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110834150
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25357	NC_008260	CAGATC	2	12	1463250	1463261	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	110834150
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25362	NC_008260	TGT	2	6	1463360	1463365	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110834150
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25449	NC_008260	TTGT	2	8	1467642	1467649	0 %	75 %	25 %	0 %	110834153
25450	NC_008260	CAA	2	6	1467668	1467673	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110834153
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25452	NC_008260	CTA	2	6	1467733	1467738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110834153
25453	NC_008260	TTCG	2	8	1467749	1467756	0 %	50 %	25 %	25 %	110834153
25454	NC_008260	TAA	2	6	1467761	1467766	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110834153
25455	NC_008260	CG	3	6	1467801	1467806	0 %	0 %	50 %	50 %	110834153
25456	NC_008260	CGG	2	6	1467927	1467932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110834153
25457	NC_008260	GGC	2	6	1468044	1468049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110834153
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25459	NC_008260	GGC	2	6	1468143	1468148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110834153
25460	NC_008260	CGC	2	6	1468170	1468175	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110834153
25461	NC_008260	GCA	2	6	1468376	1468381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110834153
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25463	NC_008260	CAG	2	6	1468610	1468615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110834153
25464	NC_008260	AAT	2	6	1468642	1468647	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110834153
25465	NC_008260	GGC	2	6	1468670	1468675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110834154
25466	NC_008260	TGC	2	6	1468677	1468682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110834154
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25485	NC_008260	GGGC	2	8	1469569	1469576	0 %	0 %	75 %	25 %	110834155
25486	NC_008260	CG	3	6	1469588	1469593	0 %	0 %	50 %	50 %	110834155
25487	NC_008260	TGA	2	6	1469622	1469627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110834155
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