MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Anaplasma marginale str. St. Maries chromosome

Total Repeats: 20269

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
17001	NC_004842	GCA	2	6	1006644	1006649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56417148
17002	NC_004842	TGCA	2	8	1006738	1006745	25 %	25 %	25 %	25 %	56417148
17003	NC_004842	C	6	6	1006786	1006791	0 %	0 %	0 %	100 %	56417148
17004	NC_004842	TCC	2	6	1006826	1006831	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56417148
17005	NC_004842	ATAC	2	8	1006851	1006858	50 %	25 %	0 %	25 %	56417148
17006	NC_004842	GTT	2	6	1006888	1006893	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56417148
17007	NC_004842	AAG	2	6	1006918	1006923	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56417148
17008	NC_004842	TGT	2	6	1007034	1007039	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56417148
17009	NC_004842	ACT	2	6	1007042	1007047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56417148
17010	NC_004842	ATC	2	6	1007050	1007055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56417148
17011	NC_004842	GCA	2	6	1007219	1007224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56417148
17012	NC_004842	TGT	2	6	1007255	1007260	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56417148
17013	NC_004842	TTG	2	6	1007261	1007266	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56417148
17014	NC_004842	ACCCC	2	10	1007304	1007313	20 %	0 %	0 %	80 %	56417148
17015	NC_004842	TTC	2	6	1007399	1007404	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56417148
17016	NC_004842	TCA	2	6	1007415	1007420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56417148
17017	NC_004842	CAACA	2	10	1007431	1007440	60 %	0 %	0 %	40 %	56417148
17018	NC_004842	AT	3	6	1007472	1007477	50 %	50 %	0 %	0 %	56417148
17019	NC_004842	GCA	2	6	1007569	1007574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56417149
17020	NC_004842	ACA	2	6	1007688	1007693	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56417149
17021	NC_004842	TGA	2	6	1007726	1007731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56417149
17022	NC_004842	TTG	2	6	1007746	1007751	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56417149
17023	NC_004842	GTC	2	6	1007756	1007761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56417149
17024	NC_004842	CAA	2	6	1007773	1007778	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56417149
17025	NC_004842	ATGC	2	8	1007781	1007788	25 %	25 %	25 %	25 %	56417149
17026	NC_004842	CCT	2	6	1007842	1007847	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56417149
17027	NC_004842	TCC	2	6	1007975	1007980	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56417149
17028	NC_004842	GCA	2	6	1008091	1008096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56417149
17029	NC_004842	CTG	2	6	1008129	1008134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56417149
17030	NC_004842	ACA	2	6	1008186	1008191	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56417149
17031	NC_004842	AAG	2	6	1008250	1008255	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56417149
17032	NC_004842	CAG	2	6	1008257	1008262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56417149
17033	NC_004842	CGA	2	6	1008277	1008282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56417149
17034	NC_004842	ACC	2	6	1008335	1008340	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56417149
17035	NC_004842	CAA	2	6	1008529	1008534	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56417149
17036	NC_004842	AC	3	6	1008556	1008561	50 %	0 %	0 %	50 %	56417149
17037	NC_004842	AGT	2	6	1008612	1008617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56417149
17038	NC_004842	GTG	2	6	1008663	1008668	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56417149
17039	NC_004842	GCC	2	6	1008799	1008804	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56417149
17040	NC_004842	AC	3	6	1008833	1008838	50 %	0 %	0 %	50 %	56417149
17041	NC_004842	CAA	2	6	1008844	1008849	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56417149
17042	NC_004842	CAG	2	6	1008850	1008855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56417149
17043	NC_004842	GAA	2	6	1008902	1008907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56417149
17044	NC_004842	CAG	2	6	1008944	1008949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56417149
17045	NC_004842	GC	3	6	1008978	1008983	0 %	0 %	50 %	50 %	56417149
17046	NC_004842	CAG	2	6	1009021	1009026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56417149
17047	NC_004842	CCA	2	6	1009027	1009032	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56417149
17048	NC_004842	GCA	2	6	1009065	1009070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56417149
17049	NC_004842	GA	3	6	1009197	1009202	50 %	0 %	50 %	0 %	56417150
17050	NC_004842	A	6	6	1009325	1009330	100 %	0 %	0 %	0 %	56417150
17051	NC_004842	GTG	2	6	1009351	1009356	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56417150
17052	NC_004842	TGG	2	6	1009376	1009381	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56417150
17053	NC_004842	TTG	2	6	1009398	1009403	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56417150
17054	NC_004842	GGC	2	6	1009412	1009417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56417150
17055	NC_004842	GCC	2	6	1009441	1009446	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56417150
17056	NC_004842	CTG	2	6	1009614	1009619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56417150
17057	NC_004842	GTG	2	6	1009625	1009630	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56417150
17058	NC_004842	CA	3	6	1009663	1009668	50 %	0 %	0 %	50 %	56417150
17059	NC_004842	GCAT	2	8	1009738	1009745	25 %	25 %	25 %	25 %	56417150
17060	NC_004842	GTCT	2	8	1009751	1009758	0 %	50 %	25 %	25 %	56417150
17061	NC_004842	T	6	6	1009887	1009892	0 %	100 %	0 %	0 %	56417150
17062	NC_004842	GTT	2	6	1009926	1009931	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56417150
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17064	NC_004842	CA	3	6	1009957	1009962	50 %	0 %	0 %	50 %	56417150
17065	NC_004842	CTTG	2	8	1009974	1009981	0 %	50 %	25 %	25 %	56417150
17066	NC_004842	G	7	7	1010123	1010129	0 %	0 %	100 %	0 %	56417150
17067	NC_004842	GCAC	2	8	1010353	1010360	25 %	0 %	25 %	50 %	56417150
17068	NC_004842	CAT	2	6	1010383	1010388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56417150
17069	NC_004842	TGCA	2	8	1010498	1010505	25 %	25 %	25 %	25 %	56417150
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17072	NC_004842	GGA	2	6	1010591	1010596	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56417150
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17074	NC_004842	CTG	2	6	1010722	1010727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56417151
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17076	NC_004842	TAACA	2	10	1010831	1010840	60 %	20 %	0 %	20 %	56417151
17077	NC_004842	AT	3	6	1010898	1010903	50 %	50 %	0 %	0 %	56417151
17078	NC_004842	TGA	2	6	1011152	1011157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56417151
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17083	NC_004842	TGTT	2	8	1011352	1011359	0 %	75 %	25 %	0 %	56417151
17084	NC_004842	CAG	2	6	1011371	1011376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56417151
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17087	NC_004842	ATGG	2	8	1011525	1011532	25 %	25 %	50 %	0 %	56417151
17088	NC_004842	CGC	2	6	1011563	1011568	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56417151
17089	NC_004842	AACC	2	8	1011569	1011576	50 %	0 %	0 %	50 %	56417151
17090	NC_004842	AGT	2	6	1011722	1011727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56417151
17091	NC_004842	ATTG	2	8	1011788	1011795	25 %	50 %	25 %	0 %	56417151
17092	NC_004842	GTC	2	6	1011816	1011821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56417151
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17100	NC_004842	TGCT	2	8	1012066	1012073	0 %	50 %	25 %	25 %	56417151
17101	NC_004842	G	6	6	1012091	1012096	0 %	0 %	100 %	0 %	56417151
17102	NC_004842	GTG	2	6	1012141	1012146	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56417151
17103	NC_004842	CGA	2	6	1012238	1012243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56417151
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17105	NC_004842	GAG	2	6	1012287	1012292	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56417151
17106	NC_004842	CGA	2	6	1012406	1012411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56417151
17107	NC_004842	T	6	6	1012816	1012821	0 %	100 %	0 %	0 %	161544980
17108	NC_004842	CCT	2	6	1012874	1012879	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	161544980
17109	NC_004842	AGT	2	6	1012895	1012900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161544980
17110	NC_004842	CG	3	6	1012910	1012915	0 %	0 %	50 %	50 %	161544980
17111	NC_004842	TGG	2	6	1013017	1013022	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161544980
17112	NC_004842	CGC	2	6	1013030	1013035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161544980
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17116	NC_004842	AAAG	2	8	1013182	1013189	75 %	0 %	25 %	0 %	161544980
17117	NC_004842	CAA	2	6	1013218	1013223	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161544980
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17238	NC_004842	CAA	2	6	1020210	1020215	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56417159
17239	NC_004842	GGT	2	6	1020308	1020313	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56417159
17240	NC_004842	CATACA	2	12	1020343	1020354	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	56417159
17241	NC_004842	ATGGAG	2	12	1020751	1020762	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	56417160
17242	NC_004842	AGG	2	6	1020802	1020807	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56417160
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17244	NC_004842	GCT	3	9	1020917	1020925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56417160
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17246	NC_004842	ATC	2	6	1021074	1021079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56417160
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17253	NC_004842	ACT	2	6	1021327	1021332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56417160
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17257	NC_004842	ATT	2	6	1021483	1021488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56417160
17258	NC_004842	GCT	2	6	1021559	1021564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56417160
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17310	NC_004842	TGC	2	6	1024329	1024334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56417162
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17325	NC_004842	CA	3	6	1025314	1025319	50 %	0 %	0 %	50 %	56417163
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17333	NC_004842	TA	3	6	1025473	1025478	50 %	50 %	0 %	0 %	56417163
17334	NC_004842	AAGG	2	8	1025616	1025623	50 %	0 %	50 %	0 %	56417163
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17341	NC_004842	A	6	6	1025965	1025970	100 %	0 %	0 %	0 %	56417164
17342	NC_004842	CT	3	6	1026035	1026040	0 %	50 %	0 %	50 %	56417164
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17345	NC_004842	CAA	2	6	1026258	1026263	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56417164
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17350	NC_004842	CAT	2	6	1026358	1026363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56417164
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17354	NC_004842	CAG	2	6	1026804	1026809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56417165
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17474	NC_004842	TGA	2	6	1033232	1033237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56417173
17475	NC_004842	GTG	2	6	1033269	1033274	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56417173
17476	NC_004842	CGG	2	6	1033328	1033333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56417173
17477	NC_004842	TAT	2	6	1033452	1033457	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56417173
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17480	NC_004842	CAG	2	6	1034587	1034592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56417174
17481	NC_004842	ATG	2	6	1034718	1034723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56417174
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17491	NC_004842	AG	3	6	1038571	1038576	50 %	0 %	50 %	0 %	56417175
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17493	NC_004842	GTA	2	6	1038590	1038595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56417175
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17500	NC_004842	TGA	2	6	1038874	1038879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56417175

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