MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Agrobacterium fabrum str. C58 plasmid At

Total Repeats: 9111

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_003064	TGA	2	6	32014	32019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16119259
502	NC_003064	GC	3	6	32020	32025	0 %	0 %	50 %	50 %	16119259
503	NC_003064	CGG	2	6	32064	32069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16119259
504	NC_003064	TTG	2	6	32072	32077	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16119259
505	NC_003064	GGA	2	6	32086	32091	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16119259
506	NC_003064	GAGGC	2	10	32132	32141	20 %	0 %	60 %	20 %	16119259
507	NC_003064	TCC	2	6	32419	32424	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16119259
508	NC_003064	CAA	2	6	32534	32539	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16119259
509	NC_003064	TTC	2	6	32541	32546	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16119259
510	NC_003064	TCG	2	6	32881	32886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119260
511	NC_003064	AAG	2	6	32997	33002	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16119260
512	NC_003064	TCG	2	6	33025	33030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119260
513	NC_003064	CAT	2	6	33047	33052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16119260
514	NC_003064	CTC	2	6	33105	33110	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16119260
515	NC_003064	CTT	2	6	33203	33208	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16119260
516	NC_003064	GTT	2	6	33257	33262	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16119260
517	NC_003064	AAGT	2	8	33274	33281	50 %	25 %	25 %	0 %	16119260
518	NC_003064	AATG	2	8	33294	33301	50 %	25 %	25 %	0 %	16119260
519	NC_003064	CAA	2	6	33372	33377	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16119260
520	NC_003064	CAC	2	6	33398	33403	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16119260
521	NC_003064	AAC	2	6	33429	33434	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16119260
522	NC_003064	CAATG	2	10	33453	33462	40 %	20 %	20 %	20 %	16119260
523	NC_003064	TCG	2	6	33482	33487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119260
524	NC_003064	TGAA	2	8	33641	33648	50 %	25 %	25 %	0 %	159186467
525	NC_003064	AAC	2	6	33677	33682	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159186467
526	NC_003064	AT	4	8	33817	33824	50 %	50 %	0 %	0 %	159186467
527	NC_003064	ATT	2	6	33883	33888	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	159186467
528	NC_003064	TG	3	6	33982	33987	0 %	50 %	50 %	0 %	159186467
529	NC_003064	ATT	2	6	34120	34125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	159186467
530	NC_003064	T	6	6	34124	34129	0 %	100 %	0 %	0 %	159186467
531	NC_003064	TGA	2	6	34314	34319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159186467
532	NC_003064	TTTC	2	8	34321	34328	0 %	75 %	0 %	25 %	159186467
533	NC_003064	GA	4	8	34385	34392	50 %	0 %	50 %	0 %	159186467
534	NC_003064	ATGA	2	8	34474	34481	50 %	25 %	25 %	0 %	159186467
535	NC_003064	T	7	7	34534	34540	0 %	100 %	0 %	0 %	159186467
536	NC_003064	CT	3	6	34547	34552	0 %	50 %	0 %	50 %	159186467
537	NC_003064	GCA	2	6	34590	34595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159186467
538	NC_003064	ATC	2	6	34618	34623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159186467
539	NC_003064	AACC	2	8	35250	35257	50 %	0 %	0 %	50 %	17938623
540	NC_003064	ACGAC	2	10	35289	35298	40 %	0 %	20 %	40 %	17938623
541	NC_003064	TGC	2	6	35313	35318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17938623
542	NC_003064	CTTTTT	2	12	35387	35398	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	17938623
543	NC_003064	GCA	2	6	35536	35541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16119262
544	NC_003064	TGCC	2	8	35579	35586	0 %	25 %	25 %	50 %	16119262
545	NC_003064	CAT	2	6	35616	35621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16119262
546	NC_003064	CAG	2	6	35724	35729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16119262
547	NC_003064	GGT	2	6	35738	35743	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16119262
548	NC_003064	CA	3	6	35791	35796	50 %	0 %	0 %	50 %	16119262
549	NC_003064	ACA	2	6	35815	35820	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16119262
550	NC_003064	GAT	2	6	35907	35912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16119262
551	NC_003064	CAA	2	6	35957	35962	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16119262
552	NC_003064	TCA	2	6	36016	36021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16119262
553	NC_003064	TCG	2	6	36058	36063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119262
554	NC_003064	GCAA	2	8	36138	36145	50 %	0 %	25 %	25 %	16119262
555	NC_003064	GAAA	2	8	36245	36252	75 %	0 %	25 %	0 %	16119262
556	NC_003064	ATG	2	6	36307	36312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16119262
557	NC_003064	GAC	2	6	36330	36335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16119262
558	NC_003064	CGT	2	6	36371	36376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119262
559	NC_003064	CTGC	2	8	36485	36492	0 %	25 %	25 %	50 %	16119263
560	NC_003064	GAT	2	6	36518	36523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16119263
561	NC_003064	G	6	6	36540	36545	0 %	0 %	100 %	0 %	16119263
562	NC_003064	CAT	2	6	36571	36576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16119263
563	NC_003064	CCT	2	6	36577	36582	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16119263
564	NC_003064	CAG	2	6	36585	36590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16119263
565	NC_003064	CTA	2	6	36628	36633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16119263
566	NC_003064	TCA	2	6	36651	36656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16119263
567	NC_003064	TTC	2	6	36671	36676	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16119263
568	NC_003064	GTC	2	6	36781	36786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119263
569	NC_003064	GCC	2	6	36809	36814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16119263
570	NC_003064	AAG	2	6	36949	36954	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	17938626
571	NC_003064	TTG	2	6	36961	36966	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	17938626
572	NC_003064	CAA	2	6	37004	37009	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	17938626
573	NC_003064	GTTC	2	8	37019	37026	0 %	50 %	25 %	25 %	17938626
574	NC_003064	A	6	6	37050	37055	100 %	0 %	0 %	0 %	17938626
575	NC_003064	A	6	6	37102	37107	100 %	0 %	0 %	0 %	17938626
576	NC_003064	GAT	2	6	37122	37127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17938626
577	NC_003064	GTGGA	2	10	37163	37172	20 %	20 %	60 %	0 %	17938626
578	NC_003064	TGA	2	6	37193	37198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17938626
579	NC_003064	TAT	2	6	37202	37207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	17938626
580	NC_003064	AGC	2	6	37289	37294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17938626
581	NC_003064	CAA	2	6	37297	37302	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	17938626
582	NC_003064	GAC	3	9	37335	37343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17938626
583	NC_003064	CAA	2	6	37370	37375	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	17938626
584	NC_003064	AGAA	2	8	37486	37493	75 %	0 %	25 %	0 %	17938626
585	NC_003064	A	6	6	37609	37614	100 %	0 %	0 %	0 %	17938626
586	NC_003064	TCG	2	6	39277	39282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119266
587	NC_003064	GCC	2	6	39332	39337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16119266
588	NC_003064	GC	3	6	39389	39394	0 %	0 %	50 %	50 %	16119266
589	NC_003064	TGC	3	9	39421	39429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119266
590	NC_003064	TATG	2	8	39452	39459	25 %	50 %	25 %	0 %	16119266
591	NC_003064	TGA	2	6	39560	39565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16119266
592	NC_003064	ATG	2	6	39597	39602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16119266
593	NC_003064	CCG	2	6	39713	39718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16119266
594	NC_003064	ATTGG	2	10	39727	39736	20 %	40 %	40 %	0 %	16119266
595	NC_003064	CATG	2	8	39818	39825	25 %	25 %	25 %	25 %	16119266
596	NC_003064	ATCA	2	8	39829	39836	50 %	25 %	0 %	25 %	16119266
597	NC_003064	ATCC	2	8	39888	39895	25 %	25 %	0 %	50 %	16119266
598	NC_003064	GCT	2	6	39926	39931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119266
599	NC_003064	GCT	2	6	39974	39979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119266
600	NC_003064	GA	3	6	40010	40015	50 %	0 %	50 %	0 %	16119266
601	NC_003064	TAT	2	6	40017	40022	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16119266
602	NC_003064	TGC	2	6	40027	40032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119266
603	NC_003064	TCG	2	6	40132	40137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119266
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605	NC_003064	CA	3	6	40233	40238	50 %	0 %	0 %	50 %	16119266
606	NC_003064	TGA	2	6	40322	40327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16119266
607	NC_003064	CGA	2	6	40365	40370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16119266
608	NC_003064	CGA	2	6	40533	40538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16119267
609	NC_003064	TGAG	2	8	40577	40584	25 %	25 %	50 %	0 %	16119267
610	NC_003064	CGA	2	6	40608	40613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16119267
611	NC_003064	ATC	2	6	40654	40659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16119267
612	NC_003064	CGG	2	6	40973	40978	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16119267
613	NC_003064	ATC	2	6	40985	40990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16119267
614	NC_003064	CGC	2	6	41034	41039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16119267
615	NC_003064	TGT	2	6	41100	41105	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16119267
616	NC_003064	TCG	2	6	41120	41125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119267
617	NC_003064	CAG	2	6	41194	41199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16119267
618	NC_003064	TCC	2	6	41219	41224	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16119267
619	NC_003064	TCT	2	6	41298	41303	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16119267
620	NC_003064	TGA	2	6	41316	41321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16119267
621	NC_003064	CGA	2	6	41355	41360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16119267
622	NC_003064	AGC	2	6	41464	41469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16119268
623	NC_003064	TCA	2	6	41482	41487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16119268
624	NC_003064	CAG	2	6	41520	41525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16119268
625	NC_003064	CTT	2	6	41547	41552	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16119268
626	NC_003064	TCT	2	6	41561	41566	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16119268
627	NC_003064	GCG	2	6	41605	41610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16119268
628	NC_003064	GCT	2	6	41678	41683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119268
629	NC_003064	CGA	2	6	41684	41689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16119268
630	NC_003064	CAGC	2	8	41744	41751	25 %	0 %	25 %	50 %	16119268
631	NC_003064	AAT	2	6	41808	41813	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16119268
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633	NC_003064	CTC	2	6	41883	41888	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16119268
634	NC_003064	TCG	2	6	41903	41908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119268
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650	NC_003064	GGACA	2	10	42647	42656	40 %	0 %	40 %	20 %	159186468
651	NC_003064	GCA	2	6	42742	42747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159186468
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758	NC_003064	AGG	2	6	48919	48924	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	159186471
759	NC_003064	AAG	2	6	48996	49001	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	159186471
760	NC_003064	CGA	2	6	49025	49030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159186471
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872	NC_003064	GCG	2	6	54587	54592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159186474
873	NC_003064	TTC	2	6	54598	54603	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159186474
874	NC_003064	GTC	2	6	54613	54618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159186474
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877	NC_003064	TTG	2	6	54761	54766	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	159186474
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879	NC_003064	GA	3	6	54907	54912	50 %	0 %	50 %	0 %	159186474
880	NC_003064	T	6	6	55059	55064	0 %	100 %	0 %	0 %	159186474
881	NC_003064	ACG	2	6	55545	55550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159186475
882	NC_003064	TGT	2	6	55551	55556	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	159186475
883	NC_003064	ATTCGA	2	12	55620	55631	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	159186475
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998	NC_003064	GCCG	2	8	61428	61435	0 %	0 %	50 %	50 %	16119290
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1000	NC_003064	GC	3	6	61537	61542	0 %	0 %	50 %	50 %	16119290

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