MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Archaeoglobus fulgidus DSM 4304

Total Repeats: 42128

< Previous12...73747576777879808182838485Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
42001	NC_000917	T	6	6	2172138	2172143	0 %	100 %	0 %	0 %	11500004
42002	NC_000917	GACA	2	8	2172169	2172176	50 %	0 %	25 %	25 %	11500004
42003	NC_000917	GGC	2	6	2172391	2172396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	11500004
42004	NC_000917	AGA	2	6	2172434	2172439	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11500004
42005	NC_000917	GCG	2	6	2172443	2172448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	11500004
42006	NC_000917	AG	3	6	2172449	2172454	50 %	0 %	50 %	0 %	11500004
42007	NC_000917	CAA	2	6	2172562	2172567	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11500004
42008	NC_000917	CGG	2	6	2172579	2172584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	11500004
42009	NC_000917	TGAGG	2	10	2172586	2172595	20 %	20 %	60 %	0 %	11500004
42010	NC_000917	GGA	2	6	2172604	2172609	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	11500004
42011	NC_000917	ACG	2	6	2172612	2172617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	11500004
42012	NC_000917	GGA	2	6	2172656	2172661	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	11500004
42013	NC_000917	GAG	2	6	2172665	2172670	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	11500004
42014	NC_000917	CTA	2	6	2172712	2172717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11500004
42015	NC_000917	A	6	6	2172723	2172728	100 %	0 %	0 %	0 %	11500004
42016	NC_000917	AGG	2	6	2172756	2172761	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	11500004
42017	NC_000917	ACG	2	6	2172798	2172803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	11500004
42018	NC_000917	GAC	2	6	2172824	2172829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	11500004
42019	NC_000917	AAG	2	6	2172857	2172862	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11500004
42020	NC_000917	AG	3	6	2172880	2172885	50 %	0 %	50 %	0 %	11500004
42021	NC_000917	TTC	2	6	2172902	2172907	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11500004
42022	NC_000917	AGA	2	6	2173008	2173013	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11500005
42023	NC_000917	AGG	2	6	2173158	2173163	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	11500005
42024	NC_000917	ATT	2	6	2173355	2173360	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11500005
42025	NC_000917	GAA	2	6	2173435	2173440	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11500005
42026	NC_000917	GGA	2	6	2173450	2173455	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	11500005
42027	NC_000917	GAG	2	6	2173511	2173516	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	11500005
42028	NC_000917	AGA	2	6	2173524	2173529	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11500005
42029	NC_000917	GAG	2	6	2173579	2173584	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	11500005
42030	NC_000917	AG	3	6	2173591	2173596	50 %	0 %	50 %	0 %	11500005
42031	NC_000917	CTG	2	6	2173598	2173603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	11500005
42032	NC_000917	AGG	2	6	2173623	2173628	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	11500005
42033	NC_000917	GAG	2	6	2173646	2173651	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	11500005
42034	NC_000917	GCT	2	6	2173896	2173901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	11500006
42035	NC_000917	A	6	6	2173993	2173998	100 %	0 %	0 %	0 %	11500006
42036	NC_000917	GAA	2	6	2174004	2174009	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11500006
42037	NC_000917	TGT	2	6	2174013	2174018	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	11500006
42038	NC_000917	AT	3	6	2174064	2174069	50 %	50 %	0 %	0 %	11500006
42039	NC_000917	AGGA	2	8	2174107	2174114	50 %	0 %	50 %	0 %	11500006
42040	NC_000917	CCA	3	9	2174136	2174144	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	11500006
42041	NC_000917	GGGA	2	8	2174167	2174174	25 %	0 %	75 %	0 %	11500006
42042	NC_000917	GA	3	6	2174173	2174178	50 %	0 %	50 %	0 %	11500006
42043	NC_000917	TGAT	2	8	2174186	2174193	25 %	50 %	25 %	0 %	11500006
42044	NC_000917	GA	3	6	2174198	2174203	50 %	0 %	50 %	0 %	11500006
42045	NC_000917	ACA	2	6	2174372	2174377	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11500006
42046	NC_000917	CAAT	2	8	2174435	2174442	50 %	25 %	0 %	25 %	11500006
42047	NC_000917	AAG	2	6	2174491	2174496	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11500006
42048	NC_000917	CAA	2	6	2174568	2174573	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11500006
42049	NC_000917	TTG	2	6	2174714	2174719	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	11500006
42050	NC_000917	CGA	2	6	2174724	2174729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	11500006
42051	NC_000917	AAG	2	6	2174758	2174763	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11500006
42052	NC_000917	GAG	2	6	2174776	2174781	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	11500006
42053	NC_000917	GAG	2	6	2174818	2174823	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	11500006
42054	NC_000917	CCG	2	6	2174858	2174863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	11500007
42055	NC_000917	CGG	2	6	2174870	2174875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	11500007
42056	NC_000917	TGC	2	6	2174974	2174979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	11500007
42057	NC_000917	TA	3	6	2175015	2175020	50 %	50 %	0 %	0 %	11500007
42058	NC_000917	TCCCT	2	10	2175073	2175082	0 %	40 %	0 %	60 %	11500007
42059	NC_000917	AGA	2	6	2175113	2175118	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11500007
42060	NC_000917	CTT	2	6	2175152	2175157	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11500007
42061	NC_000917	TGC	2	6	2175188	2175193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	11500007
42062	NC_000917	TGCC	2	8	2175268	2175275	0 %	25 %	25 %	50 %	11500007
42063	NC_000917	GAA	2	6	2175288	2175293	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11500007
42064	NC_000917	TCC	2	6	2175551	2175556	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	11500008
42065	NC_000917	TCT	2	6	2175572	2175577	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11500008
42066	NC_000917	CT	3	6	2175576	2175581	0 %	50 %	0 %	50 %	11500008
42067	NC_000917	TCC	2	6	2175616	2175621	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	11500008
42068	NC_000917	CCCT	2	8	2175838	2175845	0 %	25 %	0 %	75 %	11500008
42069	NC_000917	T	6	6	2175933	2175938	0 %	100 %	0 %	0 %	11500008
42070	NC_000917	TCC	2	6	2175947	2175952	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	11500008
42071	NC_000917	CAG	2	6	2175970	2175975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	11500009
42072	NC_000917	TGT	2	6	2176026	2176031	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	11500009
42073	NC_000917	CCAG	2	8	2176041	2176048	25 %	0 %	25 %	50 %	11500009
42074	NC_000917	ATC	2	6	2176135	2176140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11500009
42075	NC_000917	A	6	6	2176218	2176223	100 %	0 %	0 %	0 %	11500009
42076	NC_000917	CGC	2	6	2176224	2176229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	11500009
42077	NC_000917	CT	3	6	2176251	2176256	0 %	50 %	0 %	50 %	11500009
42078	NC_000917	CCG	2	6	2176414	2176419	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	11500010
42079	NC_000917	ACC	2	6	2176483	2176488	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	11500010
42080	NC_000917	TAT	2	6	2176506	2176511	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11500010
42081	NC_000917	GAGCT	2	10	2176549	2176558	20 %	20 %	40 %	20 %	11500010
42082	NC_000917	CTT	2	6	2176608	2176613	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11500010
42083	NC_000917	CGT	2	6	2176640	2176645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	11500010
42084	NC_000917	CAC	3	9	2176668	2176676	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	11500010
42085	NC_000917	AACG	2	8	2176679	2176686	50 %	0 %	25 %	25 %	11500011
42086	NC_000917	TCT	2	6	2176792	2176797	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11500011
42087	NC_000917	CTT	2	6	2176826	2176831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11500011
42088	NC_000917	CTC	2	6	2176838	2176843	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	11500011
42089	NC_000917	CCG	2	6	2176857	2176862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	11500011
42090	NC_000917	CTG	2	6	2176866	2176871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	11500011
42091	NC_000917	GTT	2	6	2176898	2176903	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	11500011
42092	NC_000917	CAA	2	6	2176927	2176932	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11500011
42093	NC_000917	TCT	2	6	2176976	2176981	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11500011
42094	NC_000917	AGAA	2	8	2177039	2177046	75 %	0 %	25 %	0 %	11500011
42095	NC_000917	ATC	2	6	2177079	2177084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11500011
42096	NC_000917	AGG	2	6	2177102	2177107	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	11500011
42097	NC_000917	CTC	2	6	2177115	2177120	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	11500011
42098	NC_000917	GTA	2	6	2177162	2177167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11500011
42099	NC_000917	GCA	2	6	2177178	2177183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	11500011
42100	NC_000917	CAA	2	6	2177203	2177208	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11500011
42101	NC_000917	TGC	2	6	2177229	2177234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	11500011
42102	NC_000917	CTT	2	6	2177270	2177275	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11500011
42103	NC_000917	CTCC	2	8	2177302	2177309	0 %	25 %	0 %	75 %	11500011
42104	NC_000917	GCCT	2	8	2177361	2177368	0 %	25 %	25 %	50 %	11500011
42105	NC_000917	AAC	2	6	2177372	2177377	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11500011
42106	NC_000917	TAG	2	6	2177421	2177426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11500011
42107	NC_000917	GAA	2	6	2177438	2177443	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11500011
42108	NC_000917	TCCT	2	8	2177456	2177463	0 %	50 %	0 %	50 %	11500011
42109	NC_000917	AAG	2	6	2177468	2177473	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11500011
42110	NC_000917	GTA	2	6	2177615	2177620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11500011
42111	NC_000917	TTTC	2	8	2177624	2177631	0 %	75 %	0 %	25 %	11500011
42112	NC_000917	GTA	2	6	2177661	2177666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11500012
42113	NC_000917	CTT	2	6	2177688	2177693	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11500012
42114	NC_000917	TGA	2	6	2177709	2177714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11500012
42115	NC_000917	TCC	2	6	2177816	2177821	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	11500012
42116	NC_000917	GTA	2	6	2177850	2177855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11500012
42117	NC_000917	GTA	2	6	2177859	2177864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11500012
42118	NC_000917	ATA	2	6	2177874	2177879	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11500012
42119	NC_000917	CTT	2	6	2177904	2177909	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11500012
42120	NC_000917	CAA	2	6	2177915	2177920	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11500012
42121	NC_000917	CTC	2	6	2177928	2177933	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	11500012
42122	NC_000917	C	6	6	2177933	2177938	0 %	0 %	0 %	100 %	11500012
42123	NC_000917	CCT	2	6	2177975	2177980	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	11500012
42124	NC_000917	GTC	2	6	2177982	2177987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	11500012
42125	NC_000917	CTG	2	6	2177989	2177994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	11500012
42126	NC_000917	TGC	2	6	2177998	2178003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	11500012
42127	NC_000917	AGT	2	6	2178095	2178100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11500012
42128	NC_000917	CAA	2	6	2178137	2178142	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11500012

< Previous12...73747576777879808182838485Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.