MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Aeropyrum pernix K1

Total Repeats: 33140

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_000854	TGC	2	6	219629	219634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	14600616
4002	NC_000854	TCT	2	6	219752	219757	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14600616
4003	NC_000854	CTTCT	2	10	219778	219787	0 %	60 %	0 %	40 %	14600616
4004	NC_000854	AGG	2	6	219899	219904	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14600616
4005	NC_000854	CAG	2	6	219950	219955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	14600616
4006	NC_000854	AAAT	2	8	220070	220077	75 %	25 %	0 %	0 %	14600616
4007	NC_000854	GCCA	2	8	220092	220099	25 %	0 %	25 %	50 %	14600616
4008	NC_000854	ATCA	2	8	220148	220155	50 %	25 %	0 %	25 %	14600616
4009	NC_000854	GCC	3	9	220170	220178	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	14600616
4010	NC_000854	AG	3	6	220208	220213	50 %	0 %	50 %	0 %	14600616
4011	NC_000854	GGA	2	6	220249	220254	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14600616
4012	NC_000854	AT	3	6	220338	220343	50 %	50 %	0 %	0 %	14600616
4013	NC_000854	GTC	2	6	220358	220363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	14600616
4014	NC_000854	ATGT	2	8	220415	220422	25 %	50 %	25 %	0 %	14600616
4015	NC_000854	GGC	2	6	220427	220432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	14600616
4016	NC_000854	TATAT	2	10	220512	220521	40 %	60 %	0 %	0 %	14600616
4017	NC_000854	TTA	2	6	220525	220530	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14600616
4018	NC_000854	CTCACC	2	12	220544	220555	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	118430987
4019	NC_000854	TC	3	6	220621	220626	0 %	50 %	0 %	50 %	118430987
4020	NC_000854	TA	3	6	220703	220708	50 %	50 %	0 %	0 %	118430987
4021	NC_000854	CTC	2	6	220710	220715	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118430987
4022	NC_000854	GCT	2	6	220741	220746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118430987
4023	NC_000854	TCA	2	6	220759	220764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118430987
4024	NC_000854	CCT	2	6	220783	220788	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118430987
4025	NC_000854	TCT	2	6	220901	220906	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118430987
4026	NC_000854	GCT	2	6	221003	221008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118430987
4027	NC_000854	TCC	2	6	221061	221066	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118430987
4028	NC_000854	GAA	2	6	221253	221258	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118430987
4029	NC_000854	GTTGAA	2	12	221298	221309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118430987
4030	NC_000854	TTG	2	6	221330	221335	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118430987
4031	NC_000854	GCTCA	2	10	221445	221454	20 %	20 %	20 %	40 %	118430987
4032	NC_000854	ACT	2	6	221470	221475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118430987
4033	NC_000854	AGT	2	6	221501	221506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118430987
4034	NC_000854	TA	3	6	221589	221594	50 %	50 %	0 %	0 %	118430987
4035	NC_000854	TATT	2	8	221678	221685	25 %	75 %	0 %	0 %	118430987
4036	NC_000854	AAG	2	6	221719	221724	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118430987
4037	NC_000854	T	6	6	221736	221741	0 %	100 %	0 %	0 %	118430987
4038	NC_000854	CGT	2	6	221891	221896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118430987
4039	NC_000854	CTC	2	6	221907	221912	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118430987
4040	NC_000854	TAT	2	6	222054	222059	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118430987
4041	NC_000854	CTG	2	6	222062	222067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118430987
4042	NC_000854	TCT	2	6	222167	222172	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118430987
4043	NC_000854	GT	4	8	222268	222275	0 %	50 %	50 %	0 %	118430987
4044	NC_000854	CATA	2	8	222316	222323	50 %	25 %	0 %	25 %	118430987
4045	NC_000854	ATC	2	6	222363	222368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118430987
4046	NC_000854	CTT	2	6	222372	222377	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118430987
4047	NC_000854	AGG	2	6	222395	222400	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118430987
4048	NC_000854	CTT	2	6	222416	222421	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118430987
4049	NC_000854	GTC	2	6	222552	222557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118430987
4050	NC_000854	TA	3	6	222576	222581	50 %	50 %	0 %	0 %	118430987
4051	NC_000854	CATA	2	8	222649	222656	50 %	25 %	0 %	25 %	118430987
4052	NC_000854	GA	3	6	222685	222690	50 %	0 %	50 %	0 %	118430987
4053	NC_000854	TGA	2	6	222732	222737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118430987
4054	NC_000854	TTA	2	6	222763	222768	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118430987
4055	NC_000854	TGT	2	6	222822	222827	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118430987
4056	NC_000854	GCTG	2	8	222834	222841	0 %	25 %	50 %	25 %	118430987
4057	NC_000854	CCT	2	6	222847	222852	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118430987
4058	NC_000854	AAT	2	6	222865	222870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118430987
4059	NC_000854	GCT	2	6	222907	222912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118430987
4060	NC_000854	CT	3	6	223497	223502	0 %	50 %	0 %	50 %	118430988
4061	NC_000854	GGC	2	6	223573	223578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118430988
4062	NC_000854	GTA	2	6	223595	223600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118430988
4063	NC_000854	GTGAT	2	10	223656	223665	20 %	40 %	40 %	0 %	118430988
4064	NC_000854	TGGA	2	8	223670	223677	25 %	25 %	50 %	0 %	118430988
4065	NC_000854	GGA	2	6	223690	223695	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118430988
4066	NC_000854	TGA	2	6	223782	223787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118430988
4067	NC_000854	GGC	2	6	223788	223793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118430988
4068	NC_000854	ACC	2	6	223803	223808	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	118430988
4069	NC_000854	GCC	2	6	223886	223891	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118430988
4070	NC_000854	AGGCTT	2	12	223976	223987	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	118430988
4071	NC_000854	CAG	2	6	224045	224050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118430988
4072	NC_000854	GCT	2	6	224070	224075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118430988
4073	NC_000854	GT	3	6	224086	224091	0 %	50 %	50 %	0 %	118430988
4074	NC_000854	GTT	2	6	224174	224179	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118430988
4075	NC_000854	CGGG	2	8	224194	224201	0 %	0 %	75 %	25 %	118430988
4076	NC_000854	CTA	2	6	224203	224208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118430988
4077	NC_000854	GCT	2	6	224225	224230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118430988
4078	NC_000854	GGA	2	6	224287	224292	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118430988
4079	NC_000854	CTG	2	6	224307	224312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118430988
4080	NC_000854	GGTGC	2	10	224375	224384	0 %	20 %	60 %	20 %	118430988
4081	NC_000854	TC	3	6	224414	224419	0 %	50 %	0 %	50 %	118430988
4082	NC_000854	ATA	2	6	224432	224437	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118430988
4083	NC_000854	G	6	6	224488	224493	0 %	0 %	100 %	0 %	118430988
4084	NC_000854	AGG	3	9	224512	224520	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118430988
4085	NC_000854	CCT	2	6	224544	224549	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118430988
4086	NC_000854	CCG	2	6	224559	224564	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118430988
4087	NC_000854	CCT	2	6	224672	224677	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118430988
4088	NC_000854	GGA	2	6	224704	224709	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118430988
4089	NC_000854	GTG	2	6	224721	224726	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118430988
4090	NC_000854	TGG	2	6	224745	224750	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118430988
4091	NC_000854	CAG	2	6	224847	224852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118430989
4092	NC_000854	GCCGTT	2	12	224856	224867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118430989
4093	NC_000854	TGG	2	6	224894	224899	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118430989
4094	NC_000854	GGC	2	6	224970	224975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118430989
4095	NC_000854	GGC	2	6	225010	225015	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118430989
4096	NC_000854	CGT	2	6	225021	225026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118430989
4097	NC_000854	GCT	2	6	225047	225052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118430989
4098	NC_000854	TGT	2	6	225135	225140	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118430989
4099	NC_000854	GAG	2	6	225151	225156	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118430989
4100	NC_000854	AC	3	6	225176	225181	50 %	0 %	0 %	50 %	118430989
4101	NC_000854	ACC	2	6	225188	225193	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	118430989
4102	NC_000854	AGG	2	6	225219	225224	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118430989
4103	NC_000854	AGA	2	6	225276	225281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118430989
4104	NC_000854	CTGG	2	8	225291	225298	0 %	25 %	50 %	25 %	118430989
4105	NC_000854	GTGG	2	8	225353	225360	0 %	25 %	75 %	0 %	118430989
4106	NC_000854	CGT	3	9	225411	225419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118430989
4107	NC_000854	CGG	2	6	225422	225427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118430989
4108	NC_000854	TGG	2	6	225605	225610	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118430989
4109	NC_000854	GGGCTA	2	12	225716	225727	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	118430989
4110	NC_000854	ACG	2	6	225737	225742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118430989
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4112	NC_000854	GGA	2	6	225840	225845	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118430989
4113	NC_000854	G	7	7	225904	225910	0 %	0 %	100 %	0 %	118430989
4114	NC_000854	CGT	2	6	225927	225932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118430989
4115	NC_000854	GAG	2	6	225939	225944	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118430989
4116	NC_000854	GGTCT	2	10	225963	225972	0 %	40 %	40 %	20 %	118430989
4117	NC_000854	CCA	2	6	226014	226019	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	118430989
4118	NC_000854	CCTA	2	8	226046	226053	25 %	25 %	0 %	50 %	118430989
4119	NC_000854	GCA	2	6	226148	226153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118430989
4120	NC_000854	GTG	2	6	226193	226198	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118430990
4121	NC_000854	CGT	2	6	226246	226251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118430990
4122	NC_000854	GAG	2	6	226253	226258	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118430990
4123	NC_000854	GTG	2	6	226275	226280	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118430990
4124	NC_000854	TG	3	6	226347	226352	0 %	50 %	50 %	0 %	118430990
4125	NC_000854	TC	3	6	226378	226383	0 %	50 %	0 %	50 %	118430990
4126	NC_000854	GA	3	6	226384	226389	50 %	0 %	50 %	0 %	118430990
4127	NC_000854	GAG	2	6	226436	226441	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118430990
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4131	NC_000854	ATG	2	6	226509	226514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118430990
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4133	NC_000854	G	6	6	226594	226599	0 %	0 %	100 %	0 %	118430990
4134	NC_000854	GTA	2	6	226601	226606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118430990
4135	NC_000854	CGT	2	6	226621	226626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118430990
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4155	NC_000854	TGGAG	2	10	227543	227552	20 %	20 %	60 %	0 %	14600622
4156	NC_000854	TCT	2	6	227643	227648	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14600622
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4232	NC_000854	TGC	2	6	231132	231137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118430994
4233	NC_000854	AGG	2	6	231203	231208	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118430994
4234	NC_000854	ATC	2	6	231244	231249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118430994
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4239	NC_000854	CGC	3	9	231486	231494	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118430994
4240	NC_000854	ACC	2	6	231521	231526	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	118430994
4241	NC_000854	ATA	2	6	231535	231540	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118430994
4242	NC_000854	CGT	2	6	231549	231554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118430994
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4244	NC_000854	CTC	2	6	231634	231639	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118430994
4245	NC_000854	CAC	2	6	231666	231671	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	118430994
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4354	NC_000854	CCCTAA	2	12	237488	237499	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	118430998
4355	NC_000854	TCC	2	6	237595	237600	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118430998
4356	NC_000854	GCTATA	2	12	237613	237624	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	118430998
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4358	NC_000854	CCCT	2	8	237688	237695	0 %	25 %	0 %	75 %	118430998
4359	NC_000854	CCT	3	9	237731	237739	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118430998
4360	NC_000854	C	6	6	237750	237755	0 %	0 %	0 %	100 %	118430998
4361	NC_000854	CTG	2	6	237814	237819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118430998
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4366	NC_000854	AAC	2	6	238474	238479	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118430999
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4398	NC_000854	AGT	2	6	240749	240754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14600639
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4484	NC_000854	CTC	2	6	246107	246112	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118431005
4485	NC_000854	ATG	2	6	246129	246134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118431005
4486	NC_000854	CGG	2	6	246187	246192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118431005
4487	NC_000854	CTG	2	6	246209	246214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118431005
4488	NC_000854	GGA	2	6	246232	246237	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118431005
4489	NC_000854	ACC	2	6	246251	246256	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	118431005
4490	NC_000854	TCT	2	6	246289	246294	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118431005
4491	NC_000854	TCC	2	6	246319	246324	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118431005
4492	NC_000854	G	6	6	246343	246348	0 %	0 %	100 %	0 %	118431005
4493	NC_000854	GAG	2	6	246386	246391	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118431005
4494	NC_000854	CGT	2	6	246409	246414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118431005
4495	NC_000854	GAG	2	6	246431	246436	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118431005
4496	NC_000854	TCA	2	6	246492	246497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118431005
4497	NC_000854	TA	3	6	246509	246514	50 %	50 %	0 %	0 %	118431005
4498	NC_000854	CCT	2	6	246517	246522	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118431005
4499	NC_000854	GGA	2	6	246584	246589	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118431005
4500	NC_000854	GTA	2	6	246590	246595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118431005

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