MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Aeropyrum pernix K1

Total Repeats: 33140

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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11502	NC_000854	TAGG	2	8	586125	586132	25 %	25 %	50 %	0 %	14601055
11503	NC_000854	GGA	2	6	586165	586170	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14601055
11504	NC_000854	GGC	2	6	586265	586270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	14601055
11505	NC_000854	AGG	2	6	586436	586441	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118431251
11506	NC_000854	CCT	2	6	586484	586489	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118431251
11507	NC_000854	GTT	2	6	586508	586513	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118431251
11508	NC_000854	GAGG	2	8	586540	586547	25 %	0 %	75 %	0 %	118431251
11509	NC_000854	CT	3	6	586565	586570	0 %	50 %	0 %	50 %	118431251
11510	NC_000854	TCC	2	6	586617	586622	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118431251
11511	NC_000854	AT	3	6	586623	586628	50 %	50 %	0 %	0 %	118431251
11512	NC_000854	C	6	6	586632	586637	0 %	0 %	0 %	100 %	118431251
11513	NC_000854	G	6	6	586674	586679	0 %	0 %	100 %	0 %	118431251
11514	NC_000854	ACA	2	6	586830	586835	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118431251
11515	NC_000854	GGT	2	6	586855	586860	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118431251
11516	NC_000854	CGC	2	6	586875	586880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118431251
11517	NC_000854	CCG	2	6	586910	586915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118431251
11518	NC_000854	GCT	2	6	586933	586938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118431251
11519	NC_000854	GCC	2	6	586951	586956	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118431251
11520	NC_000854	GGA	2	6	586963	586968	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118431251
11521	NC_000854	TCGG	2	8	586988	586995	0 %	25 %	50 %	25 %	118431251
11522	NC_000854	AGG	2	6	587009	587014	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118431251
11523	NC_000854	GCC	2	6	587056	587061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118431251
11524	NC_000854	GGA	2	6	587062	587067	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118431251
11525	NC_000854	GAG	2	6	587069	587074	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118431251
11526	NC_000854	AGC	2	6	587161	587166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118431251
11527	NC_000854	GGA	2	6	587191	587196	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118431251
11528	NC_000854	TCC	2	6	587208	587213	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118431251
11529	NC_000854	CT	3	6	587227	587232	0 %	50 %	0 %	50 %	118431251
11530	NC_000854	GCTT	2	8	587302	587309	0 %	50 %	25 %	25 %	118431251
11531	NC_000854	TGT	2	6	587317	587322	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118431251
11532	NC_000854	GCT	2	6	587380	587385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118431251
11533	NC_000854	CCT	2	6	587443	587448	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118431251
11534	NC_000854	GATAA	2	10	587706	587715	60 %	20 %	20 %	0 %	118431252
11535	NC_000854	CTA	2	6	587736	587741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118431252
11536	NC_000854	TGC	2	6	587758	587763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118431252
11537	NC_000854	GCCA	2	8	587846	587853	25 %	0 %	25 %	50 %	118431252
11538	NC_000854	AGGC	2	8	587976	587983	25 %	0 %	50 %	25 %	118431252
11539	NC_000854	GGC	2	6	588119	588124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118431252
11540	NC_000854	GGC	2	6	588167	588172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118431252
11541	NC_000854	TGG	2	6	588215	588220	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118431252
11542	NC_000854	TGC	2	6	588269	588274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118431252
11543	NC_000854	GAG	2	6	588278	588283	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118431252
11544	NC_000854	GGCT	2	8	588297	588304	0 %	25 %	50 %	25 %	118431252
11545	NC_000854	GCCAG	2	10	588350	588359	20 %	0 %	40 %	40 %	118431252
11546	NC_000854	GGC	2	6	588440	588445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118431252
11547	NC_000854	GGAG	2	8	588508	588515	25 %	0 %	75 %	0 %	118431252
11548	NC_000854	GTT	2	6	588534	588539	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118431252
11549	NC_000854	CGAG	2	8	588547	588554	25 %	0 %	50 %	25 %	118431252
11550	NC_000854	TTGA	2	8	588651	588658	25 %	50 %	25 %	0 %	118431252
11551	NC_000854	TGA	2	6	588685	588690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118431252
11552	NC_000854	GCC	2	6	588749	588754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118431252
11553	NC_000854	ACT	2	6	588793	588798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118431252
11554	NC_000854	ACCT	2	8	588819	588826	25 %	25 %	0 %	50 %	118431253
11555	NC_000854	GGC	2	6	588829	588834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118431253
11556	NC_000854	TTA	2	6	588947	588952	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118431253
11557	NC_000854	AAT	2	6	588958	588963	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118431253
11558	NC_000854	CT	3	6	588972	588977	0 %	50 %	0 %	50 %	118431253
11559	NC_000854	TAG	2	6	588987	588992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118431253
11560	NC_000854	AGG	2	6	589059	589064	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118431253
11561	NC_000854	GTC	2	6	589083	589088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118431253
11562	NC_000854	GCT	2	6	589113	589118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118431253
11563	NC_000854	TCC	2	6	589145	589150	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118431253
11564	NC_000854	AGG	2	6	589160	589165	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118431253
11565	NC_000854	TAT	2	6	589179	589184	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118431253
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11570	NC_000854	GAA	2	6	589242	589247	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118431253
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11572	NC_000854	TCG	2	6	589375	589380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118431253
11573	NC_000854	ATA	2	6	589401	589406	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118431253
11574	NC_000854	TAG	2	6	589415	589420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118431253
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11577	NC_000854	CCTG	2	8	589522	589529	0 %	25 %	25 %	50 %	118431253
11578	NC_000854	GAA	2	6	589536	589541	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118431253
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11581	NC_000854	AGGCG	2	10	589763	589772	20 %	0 %	60 %	20 %	118431254
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11586	NC_000854	AGA	2	6	589920	589925	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118431254
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11588	NC_000854	GCA	2	6	589961	589966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118431254
11589	NC_000854	ACT	2	6	589970	589975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118431254
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11591	NC_000854	TAT	2	6	590067	590072	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118431254
11592	NC_000854	AT	3	6	590115	590120	50 %	50 %	0 %	0 %	118431254
11593	NC_000854	TGA	2	6	590135	590140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118431254
11594	NC_000854	C	7	7	590172	590178	0 %	0 %	0 %	100 %	118431254
11595	NC_000854	CAA	2	6	590234	590239	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118431254
11596	NC_000854	TC	3	6	590277	590282	0 %	50 %	0 %	50 %	118431254
11597	NC_000854	GA	3	6	590390	590395	50 %	0 %	50 %	0 %	118431254
11598	NC_000854	CGG	2	6	590537	590542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118431254
11599	NC_000854	AGT	2	6	590580	590585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118431254
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11601	NC_000854	CTC	2	6	590736	590741	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118431254
11602	NC_000854	GAG	2	6	590744	590749	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118431254
11603	NC_000854	TGC	2	6	590768	590773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118431254
11604	NC_000854	TAG	2	6	590852	590857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118431254
11605	NC_000854	AGGCGG	2	12	591039	591050	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	118431254
11606	NC_000854	GGC	3	9	591055	591063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118431254
11607	NC_000854	CTC	2	6	591069	591074	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118431254
11608	NC_000854	TG	3	6	591088	591093	0 %	50 %	50 %	0 %	118431254
11609	NC_000854	GAT	2	6	591094	591099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118431254
11610	NC_000854	TG	3	6	591105	591110	0 %	50 %	50 %	0 %	118431254
11611	NC_000854	ACT	3	9	591173	591181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118431254
11612	NC_000854	GAT	2	6	591262	591267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118431254
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11614	NC_000854	AGTTTA	2	12	591329	591340	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	118431254
11615	NC_000854	CTA	2	6	591341	591346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118431254
11616	NC_000854	AG	3	6	591357	591362	50 %	0 %	50 %	0 %	118431254
11617	NC_000854	AAG	2	6	591367	591372	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118431254
11618	NC_000854	TCT	2	6	591389	591394	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118431254
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11981	NC_000854	CTC	2	6	609220	609225	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14601080
11982	NC_000854	CAA	2	6	609233	609238	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	14601080
11983	NC_000854	CGA	2	6	609260	609265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	14601080
11984	NC_000854	CCTC	3	12	609404	609415	0 %	25 %	0 %	75 %	14601080
11985	NC_000854	CCT	2	6	609559	609564	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118431264
11986	NC_000854	CCT	3	9	609584	609592	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118431264
11987	NC_000854	CCT	2	6	609595	609600	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118431264
11988	NC_000854	CGC	2	6	609684	609689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118431264
11989	NC_000854	GGC	2	6	609760	609765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118431264
11990	NC_000854	CTA	2	6	609766	609771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118431264
11991	NC_000854	TCG	2	6	609792	609797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118431264
11992	NC_000854	CGG	2	6	609853	609858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118431264
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12000	NC_000854	GCC	2	6	610340	610345	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118431264

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