MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Aeropyrum pernix K1

Total Repeats: 33140

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_000854	GCT	2	6	558130	558135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118431221
11002	NC_000854	GCA	2	6	558175	558180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118431221
11003	NC_000854	CTA	2	6	558211	558216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118431221
11004	NC_000854	GTGG	2	8	558280	558287	0 %	25 %	75 %	0 %	118431221
11005	NC_000854	GCG	2	6	558291	558296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118431221
11006	NC_000854	TGT	2	6	558331	558336	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118431221
11007	NC_000854	AGC	2	6	558339	558344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118431221
11008	NC_000854	C	6	6	558344	558349	0 %	0 %	0 %	100 %	118431221
11009	NC_000854	GCC	3	9	558482	558490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118431221
11010	NC_000854	TCG	2	6	558507	558512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118431221
11011	NC_000854	GGCT	2	8	558518	558525	0 %	25 %	50 %	25 %	118431221
11012	NC_000854	GCC	2	6	558563	558568	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118431221
11013	NC_000854	CTCAGC	2	12	558675	558686	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	118431222
11014	NC_000854	AGG	2	6	558700	558705	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118431222
11015	NC_000854	TGG	2	6	558792	558797	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118431222
11016	NC_000854	CCG	2	6	558814	558819	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118431222
11017	NC_000854	GAA	2	6	558821	558826	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118431222
11018	NC_000854	G	6	6	558842	558847	0 %	0 %	100 %	0 %	118431222
11019	NC_000854	TGT	2	6	558848	558853	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118431222
11020	NC_000854	GCA	2	6	558874	558879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118431222
11021	NC_000854	CGC	3	9	558950	558958	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118431222
11022	NC_000854	CCG	2	6	559034	559039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118431223
11023	NC_000854	GCTTC	2	10	559080	559089	0 %	40 %	20 %	40 %	118431223
11024	NC_000854	GTG	2	6	559090	559095	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118431223
11025	NC_000854	CCG	2	6	559185	559190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118431223
11026	NC_000854	CGC	2	6	559207	559212	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118431223
11027	NC_000854	TGG	2	6	559239	559244	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118431223
11028	NC_000854	GGC	2	6	559258	559263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118431223
11029	NC_000854	GCT	2	6	559264	559269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118431223
11030	NC_000854	GGTGGC	2	12	559378	559389	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	14601017
11031	NC_000854	TTC	2	6	559409	559414	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14601017
11032	NC_000854	TAGC	2	8	559422	559429	25 %	25 %	25 %	25 %	14601017
11033	NC_000854	ACT	2	6	559503	559508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14601017
11034	NC_000854	GGC	2	6	559556	559561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	14601017
11035	NC_000854	AGC	2	6	559582	559587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	14601017
11036	NC_000854	CTG	2	6	559610	559615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	14601017
11037	NC_000854	CAA	2	6	559792	559797	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118431224
11038	NC_000854	GAT	2	6	559801	559806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118431224
11039	NC_000854	TCG	2	6	559818	559823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118431224
11040	NC_000854	GCG	2	6	559877	559882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118431224
11041	NC_000854	TAG	2	6	559887	559892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118431224
11042	NC_000854	CTC	2	6	559904	559909	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118431224
11043	NC_000854	CCT	2	6	560022	560027	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118431225
11044	NC_000854	CTC	2	6	560029	560034	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118431225
11045	NC_000854	TGG	2	6	560039	560044	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118431225
11046	NC_000854	GCT	2	6	560071	560076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118431225
11047	NC_000854	GGCG	2	8	560079	560086	0 %	0 %	75 %	25 %	118431225
11048	NC_000854	TGC	2	6	560102	560107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118431225
11049	NC_000854	GGC	2	6	560241	560246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118431225
11050	NC_000854	ACG	2	6	560294	560299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118431225
11051	NC_000854	GAG	2	6	560355	560360	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118431225
11052	NC_000854	TGGC	2	8	560384	560391	0 %	25 %	50 %	25 %	118431225
11053	NC_000854	GCC	2	6	560398	560403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118431225
11054	NC_000854	CCTACA	2	12	560432	560443	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	118431225
11055	NC_000854	TGT	2	6	560592	560597	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118431225
11056	NC_000854	CCG	2	6	560612	560617	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118431225
11057	NC_000854	CGG	2	6	560685	560690	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118431225
11058	NC_000854	GGT	2	6	560781	560786	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118431225
11059	NC_000854	ACA	2	6	560900	560905	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118431225
11060	NC_000854	CGG	2	6	560961	560966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118431225
11061	NC_000854	G	6	6	560974	560979	0 %	0 %	100 %	0 %	118431225
11062	NC_000854	CTG	2	6	560995	561000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118431225
11063	NC_000854	TGC	2	6	561014	561019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118431225
11064	NC_000854	TCCGG	2	10	561052	561061	0 %	20 %	40 %	40 %	118431225
11065	NC_000854	GCTG	2	8	561097	561104	0 %	25 %	50 %	25 %	118431225
11066	NC_000854	GCT	2	6	561165	561170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118431225
11067	NC_000854	GGT	2	6	561195	561200	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118431225
11068	NC_000854	CTC	2	6	561217	561222	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118431225
11069	NC_000854	GGC	2	6	561232	561237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118431225
11070	NC_000854	GCG	2	6	561271	561276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118431226
11071	NC_000854	CGC	2	6	561380	561385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118431226
11072	NC_000854	TGT	2	6	561401	561406	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118431226
11073	NC_000854	GGGCG	2	10	561422	561431	0 %	0 %	80 %	20 %	118431226
11074	NC_000854	GGC	2	6	561468	561473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118431226
11075	NC_000854	GCG	2	6	561477	561482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118431226
11076	NC_000854	CGC	2	6	561539	561544	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	14601023
11077	NC_000854	CTG	2	6	561552	561557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	14601023
11078	NC_000854	GTG	2	6	561564	561569	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	14601023
11079	NC_000854	CT	4	8	561570	561577	0 %	50 %	0 %	50 %	14601023
11080	NC_000854	GGC	2	6	561578	561583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	14601023
11081	NC_000854	GTT	2	6	561621	561626	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	14601023
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11083	NC_000854	GCG	2	6	561709	561714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	14601023
11084	NC_000854	CCG	2	6	561742	561747	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	14601023
11085	NC_000854	TGC	2	6	561772	561777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	14601023
11086	NC_000854	CG	3	6	561806	561811	0 %	0 %	50 %	50 %	14601023
11087	NC_000854	TGC	2	6	561860	561865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	14601023
11088	NC_000854	CTG	2	6	561882	561887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	14601023
11089	NC_000854	GGGC	2	8	561895	561902	0 %	0 %	75 %	25 %	14601023
11090	NC_000854	TCG	2	6	561982	561987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	14601023
11091	NC_000854	GGT	2	6	562007	562012	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	14601023
11092	NC_000854	TTC	2	6	562068	562073	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14601023
11093	NC_000854	CGC	2	6	562090	562095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	14601023
11094	NC_000854	CTG	2	6	562113	562118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	14601023
11095	NC_000854	GTC	2	6	562136	562141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	14601023
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11100	NC_000854	CCG	2	6	562519	562524	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	14601024
11101	NC_000854	GGCT	2	8	562582	562589	0 %	25 %	50 %	25 %	14601024
11102	NC_000854	GCCT	2	8	562651	562658	0 %	25 %	25 %	50 %	14601024
11103	NC_000854	CTC	2	6	562718	562723	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14601024
11104	NC_000854	GGTG	2	8	562792	562799	0 %	25 %	75 %	0 %	14601024
11105	NC_000854	G	6	6	562837	562842	0 %	0 %	100 %	0 %	14601024
11106	NC_000854	GGA	2	6	562877	562882	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14601024
11107	NC_000854	ACG	2	6	563122	563127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	14601024
11108	NC_000854	CGC	2	6	563159	563164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	14601024
11109	NC_000854	GA	3	6	563198	563203	50 %	0 %	50 %	0 %	14601024
11110	NC_000854	CTT	2	6	563300	563305	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14601024
11111	NC_000854	CTA	2	6	563414	563419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14601024
11112	NC_000854	GTC	2	6	563445	563450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	14601024
11113	NC_000854	TGG	2	6	563477	563482	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	14601024
11114	NC_000854	TGGAT	2	10	563522	563531	20 %	40 %	40 %	0 %	14601024
11115	NC_000854	CTA	2	6	563570	563575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14601024
11116	NC_000854	GCC	2	6	563598	563603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	14601024
11117	NC_000854	ACT	2	6	563671	563676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14601024
11118	NC_000854	GGC	2	6	563690	563695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	14601024
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11120	NC_000854	AT	3	6	563732	563737	50 %	50 %	0 %	0 %	14601024
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11484	NC_000854	GCC	2	6	583785	583790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118431249
11485	NC_000854	CAT	2	6	583815	583820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118431249
11486	NC_000854	CTT	2	6	584296	584301	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14601053
11487	NC_000854	TAT	2	6	584314	584319	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14601053
11488	NC_000854	CTTA	2	8	584380	584387	25 %	50 %	0 %	25 %	14601053
11489	NC_000854	GAC	2	6	584659	584664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	14601053
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11492	NC_000854	CTC	2	6	584823	584828	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118431250
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11500	NC_000854	GCC	2	6	585923	585928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	14601055

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