MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Anaplasma marginale str. Gypsy Plains genome

Total Repeats: 22964

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7501	NC_022784	GCA	2	6	399384	399389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625560
7502	NC_022784	ACCT	2	8	399407	399414	25 %	25 %	0 %	50 %	557625560
7503	NC_022784	TG	3	6	399492	399497	0 %	50 %	50 %	0 %	557625560
7504	NC_022784	CTG	2	6	399535	399540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625560
7505	NC_022784	CTT	2	6	399582	399587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557625560
7506	NC_022784	CTT	2	6	399627	399632	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557625560
7507	NC_022784	T	6	6	399723	399728	0 %	100 %	0 %	0 %	557625560
7508	NC_022784	CACG	2	8	399775	399782	25 %	0 %	25 %	50 %	557625560
7509	NC_022784	AAT	2	6	399814	399819	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557625560
7510	NC_022784	A	6	6	399824	399829	100 %	0 %	0 %	0 %	557625560
7511	NC_022784	TA	3	6	399848	399853	50 %	50 %	0 %	0 %	557625560
7512	NC_022784	T	6	6	399899	399904	0 %	100 %	0 %	0 %	557625560
7513	NC_022784	CA	3	6	399928	399933	50 %	0 %	0 %	50 %	557625560
7514	NC_022784	GT	3	6	399944	399949	0 %	50 %	50 %	0 %	557625560
7515	NC_022784	CGC	2	6	399964	399969	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557625560
7516	NC_022784	CTT	2	6	400016	400021	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557625560
7517	NC_022784	TGCC	2	8	400073	400080	0 %	25 %	25 %	50 %	557625560
7518	NC_022784	GTA	2	6	400082	400087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7519	NC_022784	TGT	2	6	400147	400152	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557625561
7520	NC_022784	TGC	2	6	400165	400170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625561
7521	NC_022784	CCA	2	6	400231	400236	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557625561
7522	NC_022784	TATC	2	8	400285	400292	25 %	50 %	0 %	25 %	557625561
7523	NC_022784	CGA	2	6	400382	400387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625561
7524	NC_022784	GCCT	2	8	400470	400477	0 %	25 %	25 %	50 %	557625561
7525	NC_022784	CCA	2	6	400485	400490	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557625561
7526	NC_022784	CAG	2	6	400531	400536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625561
7527	NC_022784	GAGC	2	8	400567	400574	25 %	0 %	50 %	25 %	557625561
7528	NC_022784	CCA	2	6	400589	400594	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557625561
7529	NC_022784	ATC	2	6	400598	400603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557625561
7530	NC_022784	ATC	2	6	400616	400621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557625561
7531	NC_022784	ACTTAT	2	12	400624	400635	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	557625561
7532	NC_022784	CAG	2	6	400696	400701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625561
7533	NC_022784	TA	3	6	400703	400708	50 %	50 %	0 %	0 %	557625561
7534	NC_022784	CTT	2	6	400728	400733	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557625561
7535	NC_022784	CCT	2	6	400750	400755	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557625561
7536	NC_022784	GCG	2	6	400786	400791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7537	NC_022784	CTG	2	6	400858	400863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625562
7538	NC_022784	GCA	2	6	400942	400947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625562
7539	NC_022784	CTA	2	6	400964	400969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557625562
7540	NC_022784	CAT	2	6	401087	401092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557625562
7541	NC_022784	A	6	6	401138	401143	100 %	0 %	0 %	0 %	557625562
7542	NC_022784	CAA	2	6	401179	401184	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557625562
7543	NC_022784	CAC	2	6	401348	401353	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7544	NC_022784	CAA	2	6	401414	401419	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7545	NC_022784	AGT	2	6	401463	401468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7546	NC_022784	TTC	2	6	401521	401526	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7547	NC_022784	CAG	2	6	401599	401604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625563
7548	NC_022784	TC	3	6	401605	401610	0 %	50 %	0 %	50 %	557625563
7549	NC_022784	AG	3	6	401612	401617	50 %	0 %	50 %	0 %	557625563
7550	NC_022784	GA	3	6	401646	401651	50 %	0 %	50 %	0 %	557625563
7551	NC_022784	TATG	2	8	401709	401716	25 %	50 %	25 %	0 %	557625563
7552	NC_022784	TAT	2	6	401725	401730	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557625563
7553	NC_022784	CAA	2	6	401876	401881	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557625563
7554	NC_022784	TA	3	6	401919	401924	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7555	NC_022784	TAA	2	6	401941	401946	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7556	NC_022784	TTG	2	6	401961	401966	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7557	NC_022784	TA	3	6	402014	402019	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7558	NC_022784	CA	3	6	402029	402034	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7559	NC_022784	TAG	2	6	402117	402122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7560	NC_022784	T	6	6	402173	402178	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7561	NC_022784	ATG	2	6	402249	402254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7562	NC_022784	CG	3	6	402359	402364	0 %	0 %	50 %	50 %	557625564
7563	NC_022784	TGC	2	6	402424	402429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625564
7564	NC_022784	AG	3	6	402527	402532	50 %	0 %	50 %	0 %	557625564
7565	NC_022784	T	7	7	402574	402580	0 %	100 %	0 %	0 %	557625564
7566	NC_022784	GCA	2	6	402592	402597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625564
7567	NC_022784	ACA	2	6	402645	402650	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557625564
7568	NC_022784	TGGC	2	8	402790	402797	0 %	25 %	50 %	25 %	557625564
7569	NC_022784	TGA	2	6	402973	402978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557625564
7570	NC_022784	ATT	2	6	403004	403009	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557625564
7571	NC_022784	TGA	2	6	403021	403026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557625564
7572	NC_022784	TGC	2	6	403102	403107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625564
7573	NC_022784	AGT	2	6	403213	403218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557625564
7574	NC_022784	GAT	2	6	403226	403231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557625564
7575	NC_022784	AGG	2	6	403254	403259	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557625564
7576	NC_022784	GGC	2	6	403358	403363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557625564
7577	NC_022784	GTA	2	6	403439	403444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557625564
7578	NC_022784	GAG	2	6	403505	403510	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557625564
7579	NC_022784	G	8	8	403524	403531	0 %	0 %	100 %	0 %	557625564
7580	NC_022784	ATC	3	9	403542	403550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557625564
7581	NC_022784	T	6	6	403622	403627	0 %	100 %	0 %	0 %	557625564
7582	NC_022784	GCG	2	6	403646	403651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557625564
7583	NC_022784	AGG	2	6	403666	403671	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557625564
7584	NC_022784	CAA	2	6	403690	403695	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557625564
7585	NC_022784	TGC	2	6	403698	403703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625564
7586	NC_022784	TAT	2	6	403712	403717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557625564
7587	NC_022784	GTGGA	2	10	403722	403731	20 %	20 %	60 %	0 %	557625564
7588	NC_022784	TTTAC	2	10	403747	403756	20 %	60 %	0 %	20 %	557625564
7589	NC_022784	GGA	2	6	403804	403809	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557625564
7590	NC_022784	TA	3	6	403854	403859	50 %	50 %	0 %	0 %	557625564
7591	NC_022784	ACT	2	6	403875	403880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557625564
7592	NC_022784	GAA	2	6	403960	403965	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557625564
7593	NC_022784	TGT	2	6	403969	403974	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557625564
7594	NC_022784	CAT	2	6	403987	403992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557625564
7595	NC_022784	TTAT	2	8	404021	404028	25 %	75 %	0 %	0 %	557625564
7596	NC_022784	GTT	2	6	404116	404121	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557625564
7597	NC_022784	CTG	2	6	404157	404162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625564
7598	NC_022784	GTAT	2	8	404339	404346	25 %	50 %	25 %	0 %	557625564
7599	NC_022784	AGG	2	6	404407	404412	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557625564
7600	NC_022784	TATGT	2	10	404419	404428	20 %	60 %	20 %	0 %	557625564
7601	NC_022784	ACAG	2	8	404430	404437	50 %	0 %	25 %	25 %	557625564
7602	NC_022784	GTA	2	6	404511	404516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557625564
7603	NC_022784	GCGCA	2	10	404576	404585	20 %	0 %	40 %	40 %	557625564
7604	NC_022784	AAG	2	6	404598	404603	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557625564
7605	NC_022784	TATAAT	2	12	404752	404763	50 %	50 %	0 %	0 %	557625564
7606	NC_022784	GTGG	2	8	404764	404771	0 %	25 %	75 %	0 %	557625564
7607	NC_022784	CACGC	2	10	404800	404809	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
7608	NC_022784	ATG	2	6	404819	404824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7609	NC_022784	CGC	2	6	404853	404858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7610	NC_022784	TGA	2	6	405002	405007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7611	NC_022784	GCT	2	6	405098	405103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557626128
7612	NC_022784	G	6	6	405211	405216	0 %	0 %	100 %	0 %	557626128
7613	NC_022784	A	7	7	405286	405292	100 %	0 %	0 %	0 %	557626128
7614	NC_022784	TCAT	2	8	405340	405347	25 %	50 %	0 %	25 %	557626128
7615	NC_022784	GAG	2	6	405452	405457	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557626128
7616	NC_022784	TA	4	8	405475	405482	50 %	50 %	0 %	0 %	557626128
7617	NC_022784	TGG	2	6	405562	405567	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557626128
7618	NC_022784	AGAC	2	8	405568	405575	50 %	0 %	25 %	25 %	557626128
7619	NC_022784	A	8	8	405609	405616	100 %	0 %	0 %	0 %	557626128
7620	NC_022784	TTG	2	6	405637	405642	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557626128
7621	NC_022784	G	6	6	405664	405669	0 %	0 %	100 %	0 %	557626128
7622	NC_022784	ACC	2	6	405696	405701	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557626128
7623	NC_022784	CTT	2	6	405707	405712	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557626128
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