MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Aeropyrum camini SY1 = JCM 12091 DNA

Total Repeats: 35929

< Previous12...60616263646566676869707172Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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31002	NC_022521	CGG	2	6	1369223	1369228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549456058
31003	NC_022521	TGG	2	6	1369351	1369356	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549456058
31004	NC_022521	TAG	2	6	1369423	1369428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549456058
31005	NC_022521	ACTG	2	8	1369538	1369545	25 %	25 %	25 %	25 %	549456058
31006	NC_022521	CTT	2	6	1369559	1369564	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549456058
31007	NC_022521	TGG	2	6	1369644	1369649	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549456058
31008	NC_022521	TGG	2	6	1369702	1369707	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549456058
31009	NC_022521	CTA	2	6	1369799	1369804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549456059
31010	NC_022521	CTAT	2	8	1369848	1369855	25 %	50 %	0 %	25 %	549456059
31011	NC_022521	TAG	2	6	1369879	1369884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549456059
31012	NC_022521	TCA	2	6	1369933	1369938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549456059
31013	NC_022521	AGGA	2	8	1369946	1369953	50 %	0 %	50 %	0 %	549456059
31014	NC_022521	ATC	2	6	1369968	1369973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549456059
31015	NC_022521	CCT	2	6	1369988	1369993	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549456059
31016	NC_022521	AGG	2	6	1370016	1370021	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549456059
31017	NC_022521	CCTA	2	8	1370065	1370072	25 %	25 %	0 %	50 %	549456059
31018	NC_022521	CCG	2	6	1370138	1370143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549456059
31019	NC_022521	TCG	2	6	1370179	1370184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549456059
31020	NC_022521	CAGAGG	2	12	1370235	1370246	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	549456059
31021	NC_022521	CAC	2	6	1370303	1370308	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549456059
31022	NC_022521	GTA	2	6	1370319	1370324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549456059
31023	NC_022521	AAT	2	6	1370336	1370341	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549456059
31024	NC_022521	TGA	2	6	1370347	1370352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549456059
31025	NC_022521	CTG	2	6	1370385	1370390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549456059
31026	NC_022521	CA	3	6	1370393	1370398	50 %	0 %	0 %	50 %	549456059
31027	NC_022521	TGG	2	6	1370458	1370463	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549456059
31028	NC_022521	CGG	2	6	1370473	1370478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549456059
31029	NC_022521	GGA	2	6	1370546	1370551	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549456059
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31031	NC_022521	C	6	6	1370597	1370602	0 %	0 %	0 %	100 %	549456059
31032	NC_022521	GT	3	6	1370644	1370649	0 %	50 %	50 %	0 %	549456059
31033	NC_022521	GGAG	2	8	1370685	1370692	25 %	0 %	75 %	0 %	549456059
31034	NC_022521	CGG	2	6	1370742	1370747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549456060
31035	NC_022521	GAC	2	6	1370916	1370921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549456060
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31038	NC_022521	GGA	2	6	1371026	1371031	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549456060
31039	NC_022521	GAT	2	6	1371039	1371044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549456060
31040	NC_022521	CCA	2	6	1371216	1371221	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549456060
31041	NC_022521	CGA	2	6	1371377	1371382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549456060
31042	NC_022521	GAG	2	6	1371477	1371482	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549456060
31043	NC_022521	CAG	2	6	1371543	1371548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549456060
31044	NC_022521	GCTC	2	8	1371725	1371732	0 %	25 %	25 %	50 %	549456060
31045	NC_022521	TA	3	6	1371771	1371776	50 %	50 %	0 %	0 %	549456060
31046	NC_022521	G	6	6	1371777	1371782	0 %	0 %	100 %	0 %	549456060
31047	NC_022521	GGT	2	6	1371798	1371803	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31048	NC_022521	CCT	2	6	1371819	1371824	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549456061
31049	NC_022521	TGC	2	6	1371845	1371850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549456061
31050	NC_022521	CTC	2	6	1371871	1371876	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549456061
31051	NC_022521	AAG	2	6	1371922	1371927	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549456061
31052	NC_022521	GGAGG	2	10	1371964	1371973	20 %	0 %	80 %	0 %	549456061
31053	NC_022521	CGC	2	6	1372038	1372043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549456061
31054	NC_022521	TGC	2	6	1372304	1372309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549456061
31055	NC_022521	GAG	2	6	1372432	1372437	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549456061
31056	NC_022521	GGA	2	6	1372497	1372502	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549456061
31057	NC_022521	TGC	2	6	1372727	1372732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31058	NC_022521	TTA	2	6	1372747	1372752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31059	NC_022521	GGT	2	6	1372788	1372793	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31060	NC_022521	GGA	2	6	1372816	1372821	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549456062
31061	NC_022521	AGG	2	6	1372920	1372925	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549456062
31062	NC_022521	TTC	2	6	1372997	1373002	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549456062
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31065	NC_022521	GGC	2	6	1373135	1373140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549456062
31066	NC_022521	CTAT	2	8	1373219	1373226	25 %	50 %	0 %	25 %	549456062
31067	NC_022521	TTGACA	2	12	1373256	1373267	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	549456062
31068	NC_022521	GTC	2	6	1373306	1373311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549456062
31069	NC_022521	CGA	2	6	1373341	1373346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549456062
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31072	NC_022521	TAC	2	6	1373421	1373426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549456062
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31083	NC_022521	GGA	2	6	1374069	1374074	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549456062
31084	NC_022521	TCA	2	6	1374090	1374095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549456062
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31087	NC_022521	TCT	2	6	1374215	1374220	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549456063
31088	NC_022521	CCT	2	6	1374303	1374308	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549456063
31089	NC_022521	GCG	2	6	1374353	1374358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549456063
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31099	NC_022521	C	6	6	1374955	1374960	0 %	0 %	0 %	100 %	549456063
31100	NC_022521	GCG	2	6	1375000	1375005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549456063
31101	NC_022521	CAG	2	6	1375050	1375055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549456063
31102	NC_022521	TGCAG	2	10	1375059	1375068	20 %	20 %	40 %	20 %	549456063
31103	NC_022521	TCCT	2	8	1375258	1375265	0 %	50 %	0 %	50 %	549456063
31104	NC_022521	AGC	2	6	1375266	1375271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549456063
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31106	NC_022521	CAGC	2	8	1375415	1375422	25 %	0 %	25 %	50 %	549456064
31107	NC_022521	GT	3	6	1375439	1375444	0 %	50 %	50 %	0 %	549456064
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31112	NC_022521	AG	3	6	1375710	1375715	50 %	0 %	50 %	0 %	549456064
31113	NC_022521	GTT	2	6	1375731	1375736	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549456064
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31228	NC_022521	G	6	6	1381055	1381060	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
31229	NC_022521	CAA	2	6	1381099	1381104	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549456067
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31233	NC_022521	TGA	2	6	1381265	1381270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549456067
31234	NC_022521	GCT	2	6	1381320	1381325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549456067
31235	NC_022521	ATG	2	6	1381425	1381430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549456067
31236	NC_022521	GGA	2	6	1381509	1381514	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549456067
31237	NC_022521	ATT	2	6	1381540	1381545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549456067
31238	NC_022521	GTG	2	6	1381548	1381553	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549456067
31239	NC_022521	CTT	2	6	1381571	1381576	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549456067
31240	NC_022521	CTT	2	6	1381647	1381652	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549456067
31241	NC_022521	CGG	2	6	1381685	1381690	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549456067
31242	NC_022521	CTGG	2	8	1381766	1381773	0 %	25 %	50 %	25 %	549456067
31243	NC_022521	CT	3	6	1381861	1381866	0 %	50 %	0 %	50 %	549456067
31244	NC_022521	GAG	2	6	1381874	1381879	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549456067
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31247	NC_022521	TGA	2	6	1382003	1382008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549456067
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31250	NC_022521	CTC	2	6	1382129	1382134	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549456067
31251	NC_022521	CT	3	6	1382147	1382152	0 %	50 %	0 %	50 %	549456067
31252	NC_022521	CTC	2	6	1382160	1382165	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549456067
31253	NC_022521	GCC	2	6	1382180	1382185	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549456067
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31256	NC_022521	TTC	2	6	1382307	1382312	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549456067
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31258	NC_022521	CGA	2	6	1382395	1382400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549456067
31259	NC_022521	CTG	2	6	1382418	1382423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549456067
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31263	NC_022521	AC	3	6	1382697	1382702	50 %	0 %	0 %	50 %	549456067
31264	NC_022521	GTA	2	6	1382707	1382712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549456067
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31292	NC_022521	TAG	2	6	1384111	1384116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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31349	NC_022521	T	6	6	1386495	1386500	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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31452	NC_022521	CTGCA	2	10	1391417	1391426	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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31467	NC_022521	TAT	2	6	1392123	1392128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31468	NC_022521	A	7	7	1392134	1392140	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31469	NC_022521	GTT	2	6	1392158	1392163	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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