MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Aeropyrum camini SY1 = JCM 12091 DNA

Total Repeats: 35929

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12001	NC_022521	TCA	2	6	541454	541459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549455224
12002	NC_022521	CT	3	6	541501	541506	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12003	NC_022521	CT	3	6	541567	541572	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12004	NC_022521	CTT	2	6	541583	541588	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12005	NC_022521	TAT	3	9	541600	541608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12006	NC_022521	TTCT	2	8	541640	541647	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
12007	NC_022521	TC	3	6	541785	541790	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12008	NC_022521	CTT	3	9	541794	541802	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12009	NC_022521	CT	3	6	541830	541835	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12010	NC_022521	TCC	2	6	541836	541841	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12011	NC_022521	AT	3	6	541873	541878	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12012	NC_022521	TAACCT	2	12	541891	541902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12013	NC_022521	CTT	2	6	541935	541940	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549455225
12014	NC_022521	TAT	2	6	542036	542041	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549455225
12015	NC_022521	CCA	2	6	542201	542206	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549455225
12016	NC_022521	CTTTA	2	10	542232	542241	20 %	60 %	0 %	20 %	549455225
12017	NC_022521	CGA	2	6	542297	542302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549455225
12018	NC_022521	TAT	2	6	542385	542390	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549455225
12019	NC_022521	CTC	2	6	542443	542448	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549455226
12020	NC_022521	CTC	2	6	542455	542460	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549455226
12021	NC_022521	TCC	3	9	542484	542492	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549455226
12022	NC_022521	CTA	2	6	542502	542507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549455226
12023	NC_022521	CG	3	6	542542	542547	0 %	0 %	50 %	50 %	549455226
12024	NC_022521	CCTC	2	8	542601	542608	0 %	25 %	0 %	75 %	549455226
12025	NC_022521	ACCTTA	2	12	542636	542647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549455226
12026	NC_022521	CT	3	6	542669	542674	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12027	NC_022521	ATGA	2	8	542756	542763	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
12028	NC_022521	ATC	2	6	542788	542793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12029	NC_022521	G	6	6	542836	542841	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
12030	NC_022521	GGCCCA	2	12	542859	542870	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
12031	NC_022521	TTG	2	6	542941	542946	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12032	NC_022521	TGT	2	6	542947	542952	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12033	NC_022521	ATA	3	9	542978	542986	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12034	NC_022521	ATA	2	6	542990	542995	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12035	NC_022521	TAGTT	2	10	543045	543054	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
12036	NC_022521	CCTAAT	2	12	543057	543068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12037	NC_022521	AAAAT	2	10	543140	543149	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
12038	NC_022521	TA	3	6	543158	543163	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12039	NC_022521	TAAT	2	8	543192	543199	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12040	NC_022521	ATT	2	6	543268	543273	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12041	NC_022521	ATT	2	6	543285	543290	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12042	NC_022521	TGT	2	6	543432	543437	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549455227
12043	NC_022521	AGG	2	6	543447	543452	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549455227
12044	NC_022521	ATG	2	6	543700	543705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549455227
12045	NC_022521	TAGG	2	8	543722	543729	25 %	25 %	50 %	0 %	549455227
12046	NC_022521	GAG	2	6	543763	543768	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549455227
12047	NC_022521	TGT	2	6	543831	543836	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549455227
12048	NC_022521	CGG	2	6	543861	543866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549455227
12049	NC_022521	GC	4	8	543878	543885	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12050	NC_022521	GGC	2	6	543886	543891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12051	NC_022521	TTG	2	6	543906	543911	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12052	NC_022521	TTG	2	6	543934	543939	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12053	NC_022521	TGACCT	2	12	543944	543955	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
12054	NC_022521	GT	3	6	543956	543961	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12055	NC_022521	TTC	2	6	543973	543978	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12056	NC_022521	GGC	2	6	543986	543991	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12057	NC_022521	GCC	2	6	544017	544022	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12058	NC_022521	TA	3	6	544067	544072	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12059	NC_022521	GAT	2	6	544126	544131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549455228
12060	NC_022521	TCG	2	6	544211	544216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549455228
12061	NC_022521	GCTG	2	8	544263	544270	0 %	25 %	50 %	25 %	549455228
12062	NC_022521	TGG	2	6	544301	544306	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549455228
12063	NC_022521	TCC	2	6	544321	544326	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549455228
12064	NC_022521	C	6	6	544329	544334	0 %	0 %	0 %	100 %	549455228
12065	NC_022521	TTC	2	6	544384	544389	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549455228
12066	NC_022521	GA	3	6	544455	544460	50 %	0 %	50 %	0 %	549455228
12067	NC_022521	CAG	2	6	544546	544551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549455228
12068	NC_022521	GTG	2	6	544645	544650	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549455228
12069	NC_022521	CTC	2	6	544654	544659	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549455228
12070	NC_022521	AG	3	6	544673	544678	50 %	0 %	50 %	0 %	549455228
12071	NC_022521	CA	3	6	544698	544703	50 %	0 %	0 %	50 %	549455228
12072	NC_022521	GGA	2	6	544719	544724	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549455228
12073	NC_022521	GATAG	2	10	544729	544738	40 %	20 %	40 %	0 %	549455228
12074	NC_022521	TGG	2	6	544833	544838	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549455229
12075	NC_022521	ACA	2	6	544890	544895	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549455229
12076	NC_022521	GATAG	2	10	544925	544934	40 %	20 %	40 %	0 %	549455229
12077	NC_022521	TGG	2	6	544944	544949	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549455229
12078	NC_022521	GAG	2	6	544964	544969	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549455229
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12080	NC_022521	GGGCT	2	10	545187	545196	0 %	20 %	60 %	20 %	549455229
12081	NC_022521	AGA	2	6	545197	545202	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549455229
12082	NC_022521	GAG	2	6	545213	545218	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549455229
12083	NC_022521	G	6	6	545306	545311	0 %	0 %	100 %	0 %	549455229
12084	NC_022521	ATG	2	6	545375	545380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549455229
12085	NC_022521	CGA	2	6	545428	545433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549455229
12086	NC_022521	TCGTT	2	10	545466	545475	0 %	60 %	20 %	20 %	549455229
12087	NC_022521	GGA	2	6	545494	545499	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549455229
12088	NC_022521	GCT	2	6	545557	545562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549455229
12089	NC_022521	GCC	2	6	545588	545593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549455229
12090	NC_022521	GAT	2	6	545626	545631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549455229
12091	NC_022521	GGGCT	2	10	545652	545661	0 %	20 %	60 %	20 %	549455229
12092	NC_022521	CCT	2	6	545673	545678	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549455229
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12094	NC_022521	TA	3	6	545760	545765	50 %	50 %	0 %	0 %	549455229
12095	NC_022521	AGCCT	2	10	545832	545841	20 %	20 %	20 %	40 %	549455229
12096	NC_022521	CGG	2	6	545869	545874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549455229
12097	NC_022521	GCT	3	9	545899	545907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549455229
12098	NC_022521	CGT	2	6	545923	545928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549455229
12099	NC_022521	TCC	2	6	545942	545947	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549455229
12100	NC_022521	CCT	2	6	545956	545961	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549455229
12101	NC_022521	C	6	6	546152	546157	0 %	0 %	0 %	100 %	549455229
12102	NC_022521	TC	3	6	546179	546184	0 %	50 %	0 %	50 %	549455229
12103	NC_022521	CAC	2	6	546198	546203	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549455229
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12105	NC_022521	TGT	2	6	546400	546405	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549455229
12106	NC_022521	CTG	2	6	546425	546430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549455229
12107	NC_022521	GGGT	2	8	546438	546445	0 %	25 %	75 %	0 %	549455229
12108	NC_022521	AGG	2	6	546469	546474	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549455229
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12111	NC_022521	GCG	3	9	546779	546787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549455229
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12114	NC_022521	CAA	3	9	546897	546905	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549455229
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12118	NC_022521	CTT	2	6	547067	547072	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549455229
12119	NC_022521	TCC	2	6	547110	547115	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549455229
12120	NC_022521	GCT	2	6	547135	547140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549455229
12121	NC_022521	GTT	2	6	547184	547189	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12122	NC_022521	CGC	2	6	547216	547221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12123	NC_022521	GCC	2	6	547258	547263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12124	NC_022521	CA	3	6	547280	547285	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12125	NC_022521	TGT	2	6	547423	547428	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549455230
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12156	NC_022521	GCC	2	6	548736	548741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549455232
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12198	NC_022521	AT	3	6	550572	550577	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12199	NC_022521	GTC	2	6	550638	550643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549455234
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12211	NC_022521	CGG	2	6	551159	551164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549455234
12212	NC_022521	TAC	2	6	551171	551176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549455234
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12214	NC_022521	CCAC	2	8	551218	551225	25 %	0 %	0 %	75 %	549455234
12215	NC_022521	GC	3	6	551258	551263	0 %	0 %	50 %	50 %	549455234
12216	NC_022521	CTA	2	6	551373	551378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549455234
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12220	NC_022521	TACC	2	8	551523	551530	25 %	25 %	0 %	50 %	549455234
12221	NC_022521	G	6	6	551555	551560	0 %	0 %	100 %	0 %	549455234
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12228	NC_022521	GA	3	6	551814	551819	50 %	0 %	50 %	0 %	549455234
12229	NC_022521	ATG	2	6	551945	551950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549455234
12230	NC_022521	ATT	2	6	552157	552162	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549455234
12231	NC_022521	ACC	2	6	552201	552206	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549455234
12232	NC_022521	CAA	2	6	552243	552248	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549455234
12233	NC_022521	GAT	2	6	552292	552297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549455234
12234	NC_022521	GCT	2	6	552321	552326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549455234
12235	NC_022521	CCT	2	6	552405	552410	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549455234
12236	NC_022521	C	7	7	552421	552427	0 %	0 %	0 %	100 %	549455234
12237	NC_022521	GGTG	2	8	552505	552512	0 %	25 %	75 %	0 %	549455234
12238	NC_022521	AAC	2	6	552550	552555	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549455234
12239	NC_022521	CTT	2	6	552603	552608	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549455234
12240	NC_022521	ACT	2	6	552632	552637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549455234
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12242	NC_022521	AAC	3	9	552790	552798	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549455234
12243	NC_022521	G	6	6	552904	552909	0 %	0 %	100 %	0 %	549455234
12244	NC_022521	GAA	2	6	552996	553001	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12245	NC_022521	AGG	2	6	553005	553010	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12246	NC_022521	CTA	2	6	553029	553034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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12248	NC_022521	GGGT	2	8	553114	553121	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
12249	NC_022521	GGA	2	6	553135	553140	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549455235
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12276	NC_022521	TCC	2	6	554330	554335	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12277	NC_022521	AC	3	6	554415	554420	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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12363	NC_022521	TCCA	2	8	557604	557611	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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12365	NC_022521	GTT	2	6	557678	557683	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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