MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Anaplasma phagocytophilum str. Dog2 genome

Total Repeats: 30938

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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23002	NC_021881	GTAC	2	8	1098610	1098617	25 %	25 %	25 %	25 %	526464557
23003	NC_021881	TACA	2	8	1098635	1098642	50 %	25 %	0 %	25 %	526464557
23004	NC_021881	TGA	2	6	1098714	1098719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464557
23005	NC_021881	GTT	2	6	1098733	1098738	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526464557
23006	NC_021881	GAA	2	6	1098905	1098910	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526464557
23007	NC_021881	GGT	3	9	1098912	1098920	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526464557
23008	NC_021881	TGA	2	6	1098975	1098980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464557
23009	NC_021881	GCT	2	6	1099072	1099077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526464557
23010	NC_021881	GTG	2	6	1099124	1099129	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526464557
23011	NC_021881	T	6	6	1099139	1099144	0 %	100 %	0 %	0 %	526464557
23012	NC_021881	ATT	2	6	1099153	1099158	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526464557
23013	NC_021881	CAA	2	6	1099191	1099196	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526464557
23014	NC_021881	CAG	2	6	1099204	1099209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526464557
23015	NC_021881	GTT	2	6	1099219	1099224	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526464557
23016	NC_021881	CTG	2	6	1099294	1099299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526464557
23017	NC_021881	TACA	2	8	1099333	1099340	50 %	25 %	0 %	25 %	526464557
23018	NC_021881	GAA	2	6	1099366	1099371	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526464557
23019	NC_021881	TCT	2	6	1099396	1099401	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526464557
23020	NC_021881	AG	3	6	1099425	1099430	50 %	0 %	50 %	0 %	526464557
23021	NC_021881	GTA	2	6	1099435	1099440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464557
23022	NC_021881	CTG	2	6	1099490	1099495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526464557
23023	NC_021881	ATC	2	6	1099571	1099576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464557
23024	NC_021881	TA	3	6	1099708	1099713	50 %	50 %	0 %	0 %	526464557
23025	NC_021881	TGG	2	6	1099763	1099768	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526464557
23026	NC_021881	TAT	2	6	1099824	1099829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526465174
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23029	NC_021881	ATC	2	6	1099967	1099972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526465174
23030	NC_021881	AAC	2	6	1099985	1099990	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526465174
23031	NC_021881	GA	3	6	1100062	1100067	50 %	0 %	50 %	0 %	526465174
23032	NC_021881	GAA	2	6	1100118	1100123	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526465174
23033	NC_021881	AGG	2	6	1100197	1100202	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526465174
23034	NC_021881	GCT	2	6	1100213	1100218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526465174
23035	NC_021881	GA	3	6	1100309	1100314	50 %	0 %	50 %	0 %	526465174
23036	NC_021881	ATG	2	6	1100334	1100339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526465174
23037	NC_021881	TAA	2	6	1100368	1100373	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526465174
23038	NC_021881	TCT	2	6	1100441	1100446	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526465174
23039	NC_021881	TGT	2	6	1100463	1100468	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526465174
23040	NC_021881	GAG	2	6	1100476	1100481	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526465174
23041	NC_021881	AG	3	6	1100480	1100485	50 %	0 %	50 %	0 %	526465174
23042	NC_021881	GCT	2	6	1100494	1100499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526465174
23043	NC_021881	GTC	2	6	1100521	1100526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526465174
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23048	NC_021881	TGA	2	6	1100674	1100679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526465174
23049	NC_021881	ATCTC	2	10	1100716	1100725	20 %	40 %	0 %	40 %	526465174
23050	NC_021881	TAT	2	6	1100728	1100733	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526465174
23051	NC_021881	GCTCAG	2	12	1100766	1100777	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	526465174
23052	NC_021881	GTT	2	6	1100847	1100852	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526465174
23053	NC_021881	GTA	2	6	1100877	1100882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526465174
23054	NC_021881	TTGCT	2	10	1100905	1100914	0 %	60 %	20 %	20 %	526465174
23055	NC_021881	TA	3	6	1100952	1100957	50 %	50 %	0 %	0 %	526465174
23056	NC_021881	AGG	2	6	1101026	1101031	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526465174
23057	NC_021881	TAA	2	6	1101095	1101100	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23058	NC_021881	TTG	2	6	1101251	1101256	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23059	NC_021881	TA	3	6	1101352	1101357	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23060	NC_021881	TCG	2	6	1101379	1101384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23061	NC_021881	TTTG	2	8	1101388	1101395	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
23062	NC_021881	CTA	2	6	1101452	1101457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23063	NC_021881	AAG	2	6	1101583	1101588	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23064	NC_021881	ATT	2	6	1101598	1101603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23065	NC_021881	TTAT	2	8	1101638	1101645	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
23066	NC_021881	TAC	2	6	1101649	1101654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23067	NC_021881	CTC	2	6	1101704	1101709	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526465175
23068	NC_021881	CCT	2	6	1101726	1101731	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526465175
23069	NC_021881	TCT	2	6	1101801	1101806	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526465175
23070	NC_021881	AGC	2	6	1101868	1101873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23071	NC_021881	TCT	2	6	1101916	1101921	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23072	NC_021881	GCA	2	6	1101969	1101974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23073	NC_021881	GCA	2	6	1102070	1102075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23074	NC_021881	CTACA	2	10	1102079	1102088	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
23075	NC_021881	TC	4	8	1102221	1102228	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23076	NC_021881	TAC	2	6	1102251	1102256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23077	NC_021881	TGT	2	6	1102329	1102334	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23078	NC_021881	CAA	2	6	1102344	1102349	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23079	NC_021881	ATA	2	6	1102361	1102366	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23080	NC_021881	TACT	2	8	1102401	1102408	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
23081	NC_021881	CT	3	6	1102407	1102412	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23082	NC_021881	TAAA	2	8	1102444	1102451	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23083	NC_021881	GAT	2	6	1102466	1102471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23084	NC_021881	ATA	2	6	1102589	1102594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23085	NC_021881	TGA	2	6	1102631	1102636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526465176
23086	NC_021881	ATC	2	6	1102720	1102725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526465176
23087	NC_021881	CGT	2	6	1102763	1102768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526465176
23088	NC_021881	TGA	2	6	1102790	1102795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526465176
23089	NC_021881	A	6	6	1102880	1102885	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23090	NC_021881	AC	3	6	1102948	1102953	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
23091	NC_021881	TAT	2	6	1102966	1102971	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23092	NC_021881	TTC	2	6	1102979	1102984	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23093	NC_021881	CATG	2	8	1103118	1103125	25 %	25 %	25 %	25 %	526465177
23094	NC_021881	ATT	2	6	1103163	1103168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526465177
23095	NC_021881	TCATA	2	10	1103189	1103198	40 %	40 %	0 %	20 %	526465177
23096	NC_021881	GTG	2	6	1103219	1103224	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526465177
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23098	NC_021881	CGCT	2	8	1103293	1103300	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
23099	NC_021881	CCGT	2	8	1103314	1103321	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
23100	NC_021881	TGA	2	6	1103336	1103341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23101	NC_021881	TA	3	6	1103351	1103356	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23102	NC_021881	CAA	2	6	1103363	1103368	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23103	NC_021881	TTCT	2	8	1103376	1103383	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
23104	NC_021881	GA	3	6	1103431	1103436	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23105	NC_021881	ATG	2	6	1103498	1103503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23106	NC_021881	CA	3	6	1103567	1103572	50 %	0 %	0 %	50 %	526465178
23107	NC_021881	TC	3	6	1103696	1103701	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23108	NC_021881	TAC	2	6	1103747	1103752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23109	NC_021881	ACCCT	2	10	1103791	1103800	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
23110	NC_021881	TAC	2	6	1103811	1103816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23111	NC_021881	AAG	2	6	1103859	1103864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23112	NC_021881	AAG	2	6	1103936	1103941	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23113	NC_021881	ACA	2	6	1104005	1104010	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23114	NC_021881	TAT	2	6	1104068	1104073	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23115	NC_021881	GCA	2	6	1104093	1104098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23116	NC_021881	ATGG	2	8	1104125	1104132	25 %	25 %	50 %	0 %	526465179
23117	NC_021881	CTG	2	6	1104190	1104195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526465179
23118	NC_021881	A	6	6	1104221	1104226	100 %	0 %	0 %	0 %	526465179
23119	NC_021881	GCT	2	6	1104503	1104508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526465179
23120	NC_021881	ATT	2	6	1104523	1104528	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526465179
23121	NC_021881	ACT	2	6	1104625	1104630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526465179
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23125	NC_021881	AAAT	2	8	1104863	1104870	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23126	NC_021881	G	6	6	1105022	1105027	0 %	0 %	100 %	0 %	526464558
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23240	NC_021881	TGT	2	6	1109724	1109729	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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23367	NC_021881	G	6	6	1116735	1116740	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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23483	NC_021881	TACC	2	8	1122360	1122367	25 %	25 %	0 %	50 %	526464567
23484	NC_021881	GTA	2	6	1122368	1122373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464567
23485	NC_021881	CAT	2	6	1122484	1122489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464567
23486	NC_021881	TTC	2	6	1122492	1122497	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526464567
23487	NC_021881	ACT	2	6	1122508	1122513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464567
23488	NC_021881	AAC	2	6	1122589	1122594	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526464567
23489	NC_021881	GCT	2	6	1122692	1122697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526464567
23490	NC_021881	TAC	2	6	1122739	1122744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464567
23491	NC_021881	GCT	2	6	1122866	1122871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526464567
23492	NC_021881	CGTA	2	8	1122902	1122909	25 %	25 %	25 %	25 %	526464567
23493	NC_021881	TGC	2	6	1122948	1122953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526464568
23494	NC_021881	TTG	2	6	1122962	1122967	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526464568
23495	NC_021881	TACA	2	8	1122985	1122992	50 %	25 %	0 %	25 %	526464568
23496	NC_021881	GCA	2	6	1123023	1123028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526464568
23497	NC_021881	CATAC	2	10	1123103	1123112	40 %	20 %	0 %	40 %	526464568
23498	NC_021881	TCT	2	6	1123257	1123262	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526464568
23499	NC_021881	AAT	2	6	1123306	1123311	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526464568
23500	NC_021881	GGT	2	6	1123450	1123455	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526464568

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