MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Anaplasma phagocytophilum str. Dog2 genome

Total Repeats: 30938

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
21001	NC_021881	AAG	2	6	1004543	1004548	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21002	NC_021881	CCT	2	6	1004556	1004561	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21003	NC_021881	GA	3	6	1004562	1004567	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21004	NC_021881	CTG	2	6	1004600	1004605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21005	NC_021881	A	7	7	1004725	1004731	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21006	NC_021881	AAT	2	6	1004759	1004764	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21007	NC_021881	GT	3	6	1004767	1004772	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
21008	NC_021881	CTT	2	6	1004805	1004810	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21009	NC_021881	AT	3	6	1004838	1004843	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21010	NC_021881	GATA	2	8	1004881	1004888	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
21011	NC_021881	TCC	2	6	1004997	1005002	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526465137
21012	NC_021881	GT	3	6	1005057	1005062	0 %	50 %	50 %	0 %	526465137
21013	NC_021881	AATA	2	8	1005073	1005080	75 %	25 %	0 %	0 %	526465137
21014	NC_021881	TAC	2	6	1005114	1005119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526465137
21015	NC_021881	GGC	2	6	1005166	1005171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526465137
21016	NC_021881	TCA	2	6	1005236	1005241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526465137
21017	NC_021881	ATT	2	6	1005268	1005273	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526465137
21018	NC_021881	GT	3	6	1005303	1005308	0 %	50 %	50 %	0 %	526465137
21019	NC_021881	AATA	2	8	1005319	1005326	75 %	25 %	0 %	0 %	526465137
21020	NC_021881	TAC	2	6	1005360	1005365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526465137
21021	NC_021881	GGC	2	6	1005412	1005417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526465137
21022	NC_021881	ATT	2	6	1005513	1005518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526465138
21023	NC_021881	GT	3	6	1005548	1005553	0 %	50 %	50 %	0 %	526465138
21024	NC_021881	AATA	2	8	1005564	1005571	75 %	25 %	0 %	0 %	526465138
21025	NC_021881	TAC	2	6	1005605	1005610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526465138
21026	NC_021881	GGC	2	6	1005657	1005662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526465138
21027	NC_021881	TCA	2	6	1005727	1005732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21028	NC_021881	AT	3	6	1005744	1005749	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21029	NC_021881	TGC	2	6	1005765	1005770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21030	NC_021881	AAGCA	2	10	1005778	1005787	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
21031	NC_021881	TAC	2	6	1005794	1005799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21032	NC_021881	TTC	2	6	1005897	1005902	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526464512
21033	NC_021881	GA	3	6	1005916	1005921	50 %	0 %	50 %	0 %	526464512
21034	NC_021881	TCA	2	6	1005971	1005976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464512
21035	NC_021881	CTGC	2	8	1006046	1006053	0 %	25 %	25 %	50 %	526464512
21036	NC_021881	TGT	2	6	1006084	1006089	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526464512
21037	NC_021881	TTAG	2	8	1006192	1006199	25 %	50 %	25 %	0 %	526464512
21038	NC_021881	TTC	2	6	1006223	1006228	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526464512
21039	NC_021881	CAT	2	6	1006308	1006313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464512
21040	NC_021881	TAA	2	6	1006419	1006424	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526464512
21041	NC_021881	CT	4	8	1006494	1006501	0 %	50 %	0 %	50 %	526464512
21042	NC_021881	TGAC	2	8	1006552	1006559	25 %	25 %	25 %	25 %	526464512
21043	NC_021881	ACTT	2	8	1006577	1006584	25 %	50 %	0 %	25 %	526464512
21044	NC_021881	CT	3	6	1006588	1006593	0 %	50 %	0 %	50 %	526464512
21045	NC_021881	CTT	2	6	1006608	1006613	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526464512
21046	NC_021881	T	6	6	1006663	1006668	0 %	100 %	0 %	0 %	526464512
21047	NC_021881	TGC	2	6	1006701	1006706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526464512
21048	NC_021881	TACAAA	2	12	1006725	1006736	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	526464512
21049	NC_021881	AGA	2	6	1006748	1006753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526464512
21050	NC_021881	AGA	2	6	1006885	1006890	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526464512
21051	NC_021881	ATC	2	6	1006944	1006949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464512
21052	NC_021881	TA	3	6	1006982	1006987	50 %	50 %	0 %	0 %	526464512
21053	NC_021881	GCAT	2	8	1007020	1007027	25 %	25 %	25 %	25 %	526464512
21054	NC_021881	CTGC	2	8	1007033	1007040	0 %	25 %	25 %	50 %	526464512
21055	NC_021881	TGATA	2	10	1007057	1007066	40 %	40 %	20 %	0 %	526464512
21056	NC_021881	CAA	2	6	1007100	1007105	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526464512
21057	NC_021881	ATT	2	6	1007142	1007147	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526464512
21058	NC_021881	GCT	2	6	1007170	1007175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526464512
21059	NC_021881	CAA	2	6	1007225	1007230	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526464512
21060	NC_021881	AT	3	6	1007312	1007317	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21061	NC_021881	CAGT	2	8	1007416	1007423	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
21062	NC_021881	TTCG	2	8	1007486	1007493	0 %	50 %	25 %	25 %	526464513
21063	NC_021881	TAG	2	6	1007518	1007523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464513
21064	NC_021881	TA	3	6	1007534	1007539	50 %	50 %	0 %	0 %	526464513
21065	NC_021881	GC	3	6	1007565	1007570	0 %	0 %	50 %	50 %	526464513
21066	NC_021881	TG	3	6	1007604	1007609	0 %	50 %	50 %	0 %	526464513
21067	NC_021881	T	6	6	1007711	1007716	0 %	100 %	0 %	0 %	526464513
21068	NC_021881	GCGT	2	8	1007818	1007825	0 %	25 %	50 %	25 %	526464513
21069	NC_021881	GAA	2	6	1007832	1007837	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526464513
21070	NC_021881	TTC	2	6	1007874	1007879	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526464513
21071	NC_021881	TCCA	2	8	1007920	1007927	25 %	25 %	0 %	50 %	526464513
21072	NC_021881	TAG	2	6	1007976	1007981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464513
21073	NC_021881	GA	3	6	1008031	1008036	50 %	0 %	50 %	0 %	526464513
21074	NC_021881	TG	3	6	1008048	1008053	0 %	50 %	50 %	0 %	526464513
21075	NC_021881	GGA	2	6	1008102	1008107	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526464513
21076	NC_021881	GGGT	2	8	1008178	1008185	0 %	25 %	75 %	0 %	526464513
21077	NC_021881	A	6	6	1008212	1008217	100 %	0 %	0 %	0 %	526464513
21078	NC_021881	GCAT	2	8	1008240	1008247	25 %	25 %	25 %	25 %	526464513
21079	NC_021881	TGG	2	6	1008259	1008264	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526464513
21080	NC_021881	CTG	2	6	1008279	1008284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526464513
21081	NC_021881	CG	3	6	1008290	1008295	0 %	0 %	50 %	50 %	526464513
21082	NC_021881	TCGT	2	8	1008297	1008304	0 %	50 %	25 %	25 %	526464513
21083	NC_021881	AGC	2	6	1008363	1008368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526464513
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21085	NC_021881	AAC	2	6	1008474	1008479	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526464513
21086	NC_021881	TCC	2	6	1008535	1008540	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526464513
21087	NC_021881	CAAGA	2	10	1008552	1008561	60 %	0 %	20 %	20 %	526464513
21088	NC_021881	CGTT	2	8	1008599	1008606	0 %	50 %	25 %	25 %	526464513
21089	NC_021881	TAGT	2	8	1008607	1008614	25 %	50 %	25 %	0 %	526464513
21090	NC_021881	T	7	7	1008739	1008745	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21091	NC_021881	CGT	2	6	1008767	1008772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21092	NC_021881	ACA	2	6	1008843	1008848	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21093	NC_021881	TAT	2	6	1008876	1008881	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21094	NC_021881	AC	3	6	1008900	1008905	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
21095	NC_021881	GC	3	6	1008985	1008990	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21096	NC_021881	TTTG	2	8	1008991	1008998	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
21097	NC_021881	CTG	2	6	1009031	1009036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21098	NC_021881	CCA	2	6	1009073	1009078	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21099	NC_021881	AGC	2	6	1009117	1009122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21100	NC_021881	CT	3	6	1009157	1009162	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21101	NC_021881	TC	3	6	1009297	1009302	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21102	NC_021881	TTC	2	6	1009352	1009357	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21103	NC_021881	TTTC	2	8	1009427	1009434	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
21104	NC_021881	GCAGC	2	10	1009541	1009550	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
21105	NC_021881	CTA	2	6	1009562	1009567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21106	NC_021881	TG	3	6	1009581	1009586	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
21107	NC_021881	AAT	2	6	1009597	1009602	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21108	NC_021881	CAT	2	6	1009604	1009609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21109	NC_021881	TAA	2	6	1009806	1009811	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526465139
21110	NC_021881	ACC	2	6	1009817	1009822	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526465139
21111	NC_021881	AGT	2	6	1009845	1009850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526465139
21112	NC_021881	TGCC	2	8	1009882	1009889	0 %	25 %	25 %	50 %	526465139
21113	NC_021881	CA	3	6	1009928	1009933	50 %	0 %	0 %	50 %	526465139
21114	NC_021881	CTA	2	6	1009988	1009993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21115	NC_021881	T	6	6	1010144	1010149	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21116	NC_021881	ACT	2	6	1010193	1010198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21117	NC_021881	AGC	2	6	1010224	1010229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21118	NC_021881	TA	3	6	1010268	1010273	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21119	NC_021881	TTTATG	2	12	1010274	1010285	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21120	NC_021881	A	6	6	1010303	1010308	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21121	NC_021881	GCA	2	6	1010364	1010369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21122	NC_021881	AT	3	6	1010408	1010413	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21123	NC_021881	A	7	7	1010501	1010507	100 %	0 %	0 %	0 %	526465140
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21246	NC_021881	CT	3	6	1015123	1015128	0 %	50 %	0 %	50 %	526465146
21247	NC_021881	CA	4	8	1015143	1015150	50 %	0 %	0 %	50 %	526465146
21248	NC_021881	CAT	2	6	1015196	1015201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21249	NC_021881	CT	3	6	1015228	1015233	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21250	NC_021881	AAG	2	6	1015242	1015247	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21251	NC_021881	AGC	2	6	1015334	1015339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21252	NC_021881	TC	3	6	1015390	1015395	0 %	50 %	0 %	50 %	526464514
21253	NC_021881	TTA	2	6	1015420	1015425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526464514
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21255	NC_021881	CAT	2	6	1015555	1015560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464514
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21259	NC_021881	TGA	2	6	1015946	1015951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464514
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21282	NC_021881	CTT	2	6	1016917	1016922	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526464514
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21358	NC_021881	ACCAT	2	10	1020078	1020087	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
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21362	NC_021881	TAGG	2	8	1020197	1020204	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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