MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Anaplasma phagocytophilum str. Dog2 genome

Total Repeats: 30938

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
19501	NC_021881	AAT	2	6	934545	934550	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19502	NC_021881	ACA	2	6	934566	934571	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526464496
19503	NC_021881	TCT	2	6	934637	934642	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526464496
19504	NC_021881	CTA	2	6	934715	934720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464496
19505	NC_021881	CTA	2	6	934728	934733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464496
19506	NC_021881	CG	3	6	934814	934819	0 %	0 %	50 %	50 %	526464496
19507	NC_021881	CTCTT	2	10	934820	934829	0 %	60 %	0 %	40 %	526464496
19508	NC_021881	CAG	2	6	935046	935051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526464496
19509	NC_021881	TCT	2	6	935127	935132	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526464496
19510	NC_021881	AAG	2	6	935154	935159	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526464496
19511	NC_021881	TC	3	6	935197	935202	0 %	50 %	0 %	50 %	526464496
19512	NC_021881	GTT	2	6	935331	935336	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526464496
19513	NC_021881	TAC	2	6	935395	935400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464496
19514	NC_021881	TCTA	2	8	935470	935477	25 %	50 %	0 %	25 %	526464496
19515	NC_021881	CTT	2	6	935527	935532	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526464496
19516	NC_021881	CAA	2	6	935586	935591	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526464496
19517	NC_021881	CA	3	6	935644	935649	50 %	0 %	0 %	50 %	526464496
19518	NC_021881	T	6	6	935678	935683	0 %	100 %	0 %	0 %	526464496
19519	NC_021881	TCT	2	6	935771	935776	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526464496
19520	NC_021881	GCA	2	6	935789	935794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526464496
19521	NC_021881	CAT	2	6	935821	935826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464496
19522	NC_021881	CGT	2	6	935832	935837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526464496
19523	NC_021881	TA	3	6	935866	935871	50 %	50 %	0 %	0 %	526464496
19524	NC_021881	T	7	7	935893	935899	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19525	NC_021881	T	7	7	936140	936146	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19526	NC_021881	TAA	2	6	936174	936179	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19527	NC_021881	CCA	2	6	936209	936214	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19528	NC_021881	AT	3	6	936339	936344	50 %	50 %	0 %	0 %	526465094
19529	NC_021881	CTTT	2	8	936379	936386	0 %	75 %	0 %	25 %	526465094
19530	NC_021881	TGC	2	6	936725	936730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19531	NC_021881	CATA	2	8	936812	936819	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
19532	NC_021881	TTC	2	6	936847	936852	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19533	NC_021881	TTCT	2	8	936913	936920	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
19534	NC_021881	ATGC	2	8	937167	937174	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
19535	NC_021881	CTA	2	6	937176	937181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19536	NC_021881	ATC	2	6	937226	937231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19537	NC_021881	T	6	6	937305	937310	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19538	NC_021881	CAA	2	6	937327	937332	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19539	NC_021881	A	7	7	937341	937347	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19540	NC_021881	ATGC	2	8	937445	937452	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
19541	NC_021881	ATC	2	6	937508	937513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19542	NC_021881	CAC	2	6	937623	937628	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19543	NC_021881	CA	3	6	937637	937642	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
19544	NC_021881	TAA	2	6	937811	937816	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19545	NC_021881	TAT	2	6	937897	937902	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19546	NC_021881	GGA	2	6	937955	937960	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526465096
19547	NC_021881	CTA	2	6	938028	938033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526465096
19548	NC_021881	AT	4	8	938045	938052	50 %	50 %	0 %	0 %	526465096
19549	NC_021881	T	7	7	938135	938141	0 %	100 %	0 %	0 %	526465096
19550	NC_021881	CCT	2	6	938194	938199	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19551	NC_021881	ATTT	2	8	938300	938307	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
19552	NC_021881	ATA	2	6	938382	938387	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19553	NC_021881	A	7	7	938517	938523	100 %	0 %	0 %	0 %	526464497
19554	NC_021881	AGA	2	6	938577	938582	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526464497
19555	NC_021881	GCT	2	6	938730	938735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526464497
19556	NC_021881	TA	3	6	938809	938814	50 %	50 %	0 %	0 %	526464497
19557	NC_021881	CAA	2	6	938933	938938	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526464497
19558	NC_021881	A	6	6	938941	938946	100 %	0 %	0 %	0 %	526464497
19559	NC_021881	CTA	2	6	938953	938958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464497
19560	NC_021881	TGCA	2	8	939037	939044	25 %	25 %	25 %	25 %	526464497
19561	NC_021881	A	6	6	939044	939049	100 %	0 %	0 %	0 %	526464497
19562	NC_021881	AGA	3	9	939054	939062	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526464497
19563	NC_021881	GAT	2	6	939138	939143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464497
19564	NC_021881	AAT	2	6	939157	939162	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526464497
19565	NC_021881	T	8	8	939311	939318	0 %	100 %	0 %	0 %	526464497
19566	NC_021881	AGCC	2	8	939340	939347	25 %	0 %	25 %	50 %	526464497
19567	NC_021881	AGC	2	6	939491	939496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526464497
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19570	NC_021881	T	6	6	939643	939648	0 %	100 %	0 %	0 %	526464497
19571	NC_021881	ATA	2	6	939686	939691	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526464497
19572	NC_021881	A	7	7	939753	939759	100 %	0 %	0 %	0 %	526464497
19573	NC_021881	TGA	2	6	939798	939803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464497
19574	NC_021881	ATG	2	6	939811	939816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464497
19575	NC_021881	CAG	2	6	939902	939907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526464497
19576	NC_021881	T	6	6	939986	939991	0 %	100 %	0 %	0 %	526464497
19577	NC_021881	CTTT	2	8	940044	940051	0 %	75 %	0 %	25 %	526464497
19578	NC_021881	CA	3	6	940070	940075	50 %	0 %	0 %	50 %	526464497
19579	NC_021881	GGA	2	6	940224	940229	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526464497
19580	NC_021881	TACGT	2	10	940302	940311	20 %	40 %	20 %	20 %	526464497
19581	NC_021881	ATT	2	6	940338	940343	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19582	NC_021881	AGT	3	9	940390	940398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19583	NC_021881	ACT	2	6	940433	940438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19584	NC_021881	TA	3	6	940524	940529	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19585	NC_021881	TAT	2	6	940535	940540	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19586	NC_021881	ATT	2	6	940560	940565	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19587	NC_021881	CGT	2	6	940618	940623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19588	NC_021881	TCA	2	6	940637	940642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19589	NC_021881	TCC	2	6	940657	940662	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19590	NC_021881	TC	3	6	940676	940681	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19591	NC_021881	TCC	2	6	940745	940750	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19592	NC_021881	TAT	2	6	940862	940867	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19593	NC_021881	GC	3	6	940882	940887	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19594	NC_021881	ACT	2	6	940891	940896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19595	NC_021881	A	7	7	940923	940929	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19596	NC_021881	TAT	2	6	940990	940995	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19597	NC_021881	CTA	2	6	941004	941009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19598	NC_021881	CTG	2	6	941029	941034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19599	NC_021881	AAGC	2	8	941146	941153	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
19600	NC_021881	AAT	2	6	941161	941166	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19601	NC_021881	AC	3	6	941235	941240	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
19602	NC_021881	CAT	2	6	941249	941254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19603	NC_021881	AAT	2	6	941255	941260	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19604	NC_021881	AAT	2	6	941339	941344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19605	NC_021881	AC	3	6	941413	941418	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
19606	NC_021881	ATA	2	6	941431	941436	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19607	NC_021881	A	6	6	941482	941487	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19608	NC_021881	CAA	2	6	941519	941524	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19609	NC_021881	A	6	6	941523	941528	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19610	NC_021881	ATG	2	6	941616	941621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19611	NC_021881	TGG	2	6	941629	941634	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19612	NC_021881	ATT	2	6	941704	941709	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19613	NC_021881	TTA	2	6	941750	941755	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19614	NC_021881	TCAG	2	8	941774	941781	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
19615	NC_021881	CA	3	6	941818	941823	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
19616	NC_021881	CATG	2	8	941860	941867	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
19617	NC_021881	T	7	7	941921	941927	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19618	NC_021881	ATG	2	6	941928	941933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19619	NC_021881	TTA	2	6	941972	941977	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19620	NC_021881	CAT	2	6	941998	942003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19621	NC_021881	TA	3	6	942019	942024	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19622	NC_021881	TATGA	2	10	942063	942072	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
19623	NC_021881	A	6	6	942088	942093	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19624	NC_021881	AT	3	6	942222	942227	50 %	50 %	0 %	0 %	526465097
19625	NC_021881	AGC	2	6	942406	942411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526465097
19626	NC_021881	GTG	2	6	942426	942431	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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19628	NC_021881	TAT	2	6	942522	942527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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