MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Anaplasma phagocytophilum str. Dog2 genome

Total Repeats: 30938

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_021881	TGC	2	6	23263	23268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526464114
502	NC_021881	GCAA	2	8	23280	23287	50 %	0 %	25 %	25 %	526464114
503	NC_021881	TTAT	2	8	23304	23311	25 %	75 %	0 %	0 %	526464114
504	NC_021881	CTC	2	6	23320	23325	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526464114
505	NC_021881	TTATT	2	10	23332	23341	20 %	80 %	0 %	0 %	526464114
506	NC_021881	T	6	6	23406	23411	0 %	100 %	0 %	0 %	526464114
507	NC_021881	CTC	2	6	23461	23466	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526464114
508	NC_021881	ATTC	2	8	23521	23528	25 %	50 %	0 %	25 %	526464114
509	NC_021881	ATT	2	6	23596	23601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
510	NC_021881	T	6	6	23658	23663	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
511	NC_021881	T	6	6	23669	23674	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
512	NC_021881	GTTT	2	8	23749	23756	0 %	75 %	25 %	0 %	526464728
513	NC_021881	CAA	2	6	23757	23762	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526464728
514	NC_021881	AAT	2	6	23848	23853	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526464728
515	NC_021881	GTTG	2	8	23866	23873	0 %	50 %	50 %	0 %	526464728
516	NC_021881	CAA	2	6	23893	23898	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526464728
517	NC_021881	TGA	2	6	23907	23912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464728
518	NC_021881	TGC	2	6	23947	23952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526464728
519	NC_021881	TTC	2	6	24005	24010	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526464728
520	NC_021881	GTA	2	6	24037	24042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464728
521	NC_021881	CTAT	2	8	24043	24050	25 %	50 %	0 %	25 %	526464728
522	NC_021881	A	8	8	24107	24114	100 %	0 %	0 %	0 %	526464728
523	NC_021881	TAA	2	6	24177	24182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526464728
524	NC_021881	GAA	2	6	24191	24196	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526464728
525	NC_021881	ACG	2	6	24215	24220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526464728
526	NC_021881	T	7	7	24306	24312	0 %	100 %	0 %	0 %	526464728
527	NC_021881	TTC	2	6	24342	24347	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526464728
528	NC_021881	CA	3	6	24350	24355	50 %	0 %	0 %	50 %	526464728
529	NC_021881	ACTG	2	8	24364	24371	25 %	25 %	25 %	25 %	526464728
530	NC_021881	TG	3	6	24390	24395	0 %	50 %	50 %	0 %	526464728
531	NC_021881	TA	3	6	24401	24406	50 %	50 %	0 %	0 %	526464728
532	NC_021881	AGT	2	6	24432	24437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464728
533	NC_021881	A	6	6	24469	24474	100 %	0 %	0 %	0 %	526464728
534	NC_021881	TAA	2	6	24493	24498	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
535	NC_021881	TGC	2	6	24535	24540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526464115
536	NC_021881	TTA	2	6	24555	24560	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526464115
537	NC_021881	GAA	3	9	24584	24592	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526464115
538	NC_021881	ATT	2	6	24610	24615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526464115
539	NC_021881	T	8	8	24721	24728	0 %	100 %	0 %	0 %	526464115
540	NC_021881	GAG	2	6	24817	24822	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526464115
541	NC_021881	AAG	2	6	24831	24836	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526464115
542	NC_021881	AT	3	6	24872	24877	50 %	50 %	0 %	0 %	526464115
543	NC_021881	CTC	2	6	24881	24886	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526464115
544	NC_021881	CTT	2	6	24922	24927	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526464115
545	NC_021881	ATT	2	6	24974	24979	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526464115
546	NC_021881	CAGG	2	8	25021	25028	25 %	0 %	50 %	25 %	526464115
547	NC_021881	TGT	2	6	25121	25126	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526464115
548	NC_021881	TCT	2	6	25190	25195	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526464115
549	NC_021881	TAA	2	6	25220	25225	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526464115
550	NC_021881	GAA	2	6	25242	25247	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526464115
551	NC_021881	GAA	2	6	25265	25270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526464115
552	NC_021881	TCT	2	6	25272	25277	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526464115
553	NC_021881	GCA	2	6	25282	25287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526464115
554	NC_021881	GTA	2	6	25296	25301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464115
555	NC_021881	ATA	2	6	25425	25430	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526464115
556	NC_021881	ATG	2	6	25458	25463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464115
557	NC_021881	GA	3	6	25478	25483	50 %	0 %	50 %	0 %	526464115
558	NC_021881	TTC	2	6	25537	25542	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526464116
559	NC_021881	TCG	2	6	25553	25558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526464116
560	NC_021881	TGTA	2	8	25587	25594	25 %	50 %	25 %	0 %	526464116
561	NC_021881	TGATG	2	10	25621	25630	20 %	40 %	40 %	0 %	526464116
562	NC_021881	TTC	2	6	25631	25636	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526464116
563	NC_021881	T	6	6	25640	25645	0 %	100 %	0 %	0 %	526464116
564	NC_021881	TCT	2	6	25683	25688	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526464116
565	NC_021881	TCA	2	6	25691	25696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464116
566	NC_021881	ATC	2	6	25708	25713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464116
567	NC_021881	CAGT	2	8	25865	25872	25 %	25 %	25 %	25 %	526464116
568	NC_021881	CGGT	2	8	25892	25899	0 %	25 %	50 %	25 %	526464116
569	NC_021881	GT	3	6	25906	25911	0 %	50 %	50 %	0 %	526464116
570	NC_021881	AAG	2	6	25919	25924	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
571	NC_021881	ACAAT	2	10	25929	25938	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
572	NC_021881	TAA	2	6	25941	25946	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
573	NC_021881	ATA	2	6	25974	25979	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
574	NC_021881	TAA	2	6	25990	25995	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
575	NC_021881	AGG	2	6	26042	26047	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
576	NC_021881	T	6	6	26075	26080	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
577	NC_021881	TTTA	2	8	26120	26127	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
578	NC_021881	ATT	2	6	26192	26197	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
579	NC_021881	GA	3	6	26226	26231	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
580	NC_021881	ATAA	2	8	26285	26292	75 %	25 %	0 %	0 %	526464729
581	NC_021881	AGA	2	6	26311	26316	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526464729
582	NC_021881	AGA	2	6	26346	26351	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526464729
583	NC_021881	CAA	2	6	26366	26371	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526464729
584	NC_021881	CAC	2	6	26375	26380	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526464729
585	NC_021881	TAG	2	6	26397	26402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464729
586	NC_021881	CTA	2	6	26408	26413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464729
587	NC_021881	T	6	6	26417	26422	0 %	100 %	0 %	0 %	526464729
588	NC_021881	TCGT	2	8	26470	26477	0 %	50 %	25 %	25 %	526464729
589	NC_021881	TC	3	6	26537	26542	0 %	50 %	0 %	50 %	526464729
590	NC_021881	TCG	2	6	26582	26587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526464729
591	NC_021881	CTA	2	6	26590	26595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464729
592	NC_021881	ACT	2	6	26649	26654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464729
593	NC_021881	GCT	2	6	26700	26705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
594	NC_021881	AGC	2	6	26805	26810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
595	NC_021881	AAC	2	6	26835	26840	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
596	NC_021881	TAG	2	6	26862	26867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
597	NC_021881	TAC	2	6	26894	26899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
598	NC_021881	TAA	3	9	26930	26938	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
599	NC_021881	TTAT	2	8	26957	26964	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
600	NC_021881	CTAG	2	8	26967	26974	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
601	NC_021881	AT	3	6	27035	27040	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
602	NC_021881	TC	3	6	27146	27151	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
603	NC_021881	GTAC	2	8	27237	27244	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
604	NC_021881	GTA	2	6	27271	27276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
605	NC_021881	CAA	2	6	27368	27373	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526464730
606	NC_021881	C	6	6	27374	27379	0 %	0 %	0 %	100 %	526464730
607	NC_021881	AAG	2	6	27436	27441	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526464730
608	NC_021881	AGA	2	6	27472	27477	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526464730
609	NC_021881	CAA	2	6	27492	27497	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526464730
610	NC_021881	CTA	2	6	27534	27539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464730
611	NC_021881	T	6	6	27543	27548	0 %	100 %	0 %	0 %	526464730
612	NC_021881	GTT	3	9	27592	27600	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526464730
613	NC_021881	AGTC	2	8	27708	27715	25 %	25 %	25 %	25 %	526464730
614	NC_021881	ACC	2	6	27730	27735	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526464730
615	NC_021881	ACG	2	6	27741	27746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526464730
616	NC_021881	CTT	2	6	27771	27776	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526464730
617	NC_021881	TTA	2	6	27815	27820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526464730
618	NC_021881	CA	3	6	27823	27828	50 %	0 %	0 %	50 %	526464730
619	NC_021881	AGC	3	9	27910	27918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
620	NC_021881	AAC	2	6	27940	27945	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
621	NC_021881	TAG	2	6	27967	27972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
622	NC_021881	CTT	2	6	27987	27992	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
623	NC_021881	CT	3	6	27993	27998	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
624	NC_021881	AAT	2	6	27999	28004	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
625	NC_021881	AAT	2	6	28045	28050	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
626	NC_021881	ATA	2	6	28068	28073	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
627	NC_021881	AAT	2	6	28085	28090	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
628	NC_021881	GTA	2	6	28108	28113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
629	NC_021881	AGGAG	2	10	28192	28201	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
630	NC_021881	TCT	2	6	28319	28324	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
631	NC_021881	ATT	2	6	28349	28354	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
632	NC_021881	CTTA	2	8	28532	28539	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
633	NC_021881	AAGC	2	8	28622	28629	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
634	NC_021881	A	6	6	28750	28755	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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