MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Anaplasma phagocytophilum str. JM

Total Repeats: 31148

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
27001	NC_021880	TCT	2	6	1284410	1284415	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27002	NC_021880	TA	3	6	1284441	1284446	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27003	NC_021880	AC	3	6	1284447	1284452	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
27004	NC_021880	CT	3	6	1284508	1284513	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
27005	NC_021880	CTCAG	2	10	1284588	1284597	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
27006	NC_021880	CAAT	2	8	1284661	1284668	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
27007	NC_021880	A	7	7	1284683	1284689	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27008	NC_021880	AAG	2	6	1284706	1284711	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27009	NC_021880	CAG	2	6	1284759	1284764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27010	NC_021880	AT	3	6	1284782	1284787	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27011	NC_021880	TGCA	2	8	1284858	1284865	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
27012	NC_021880	CA	4	8	1284864	1284871	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
27013	NC_021880	ACTC	2	8	1284876	1284883	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
27014	NC_021880	CAACA	2	10	1284895	1284904	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
27015	NC_021880	AAAAAC	2	12	1284946	1284957	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
27016	NC_021880	GAT	2	6	1285007	1285012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27017	NC_021880	AAC	3	9	1285026	1285034	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27018	NC_021880	TCAA	2	8	1285038	1285045	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
27019	NC_021880	GCTCC	2	10	1285095	1285104	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
27020	NC_021880	CT	3	6	1285132	1285137	0 %	50 %	0 %	50 %	526463381
27021	NC_021880	CGC	2	6	1285190	1285195	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526463381
27022	NC_021880	CAG	2	6	1285252	1285257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526463381
27023	NC_021880	A	6	6	1285289	1285294	100 %	0 %	0 %	0 %	526463381
27024	NC_021880	TGCCC	2	10	1285374	1285383	0 %	20 %	20 %	60 %	526463381
27025	NC_021880	CGTA	2	8	1285431	1285438	25 %	25 %	25 %	25 %	526463381
27026	NC_021880	AC	3	6	1285442	1285447	50 %	0 %	0 %	50 %	526463381
27027	NC_021880	CAAA	2	8	1285456	1285463	75 %	0 %	0 %	25 %	526463381
27028	NC_021880	CAA	2	6	1285553	1285558	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526463381
27029	NC_021880	CCA	2	6	1285560	1285565	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526463381
27030	NC_021880	TTC	3	9	1285629	1285637	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526463381
27031	NC_021880	TATC	2	8	1285648	1285655	25 %	50 %	0 %	25 %	526463381
27032	NC_021880	CAT	2	6	1285660	1285665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526463381
27033	NC_021880	CTA	2	6	1285678	1285683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526463381
27034	NC_021880	TAT	2	6	1285748	1285753	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526463381
27035	NC_021880	ACT	2	6	1285763	1285768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526463381
27036	NC_021880	ATT	2	6	1285919	1285924	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526463381
27037	NC_021880	CA	3	6	1285982	1285987	50 %	0 %	0 %	50 %	526463381
27038	NC_021880	CTT	2	6	1286039	1286044	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526463381
27039	NC_021880	CA	3	6	1286089	1286094	50 %	0 %	0 %	50 %	526463381
27040	NC_021880	CAT	2	6	1286116	1286121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526463381
27041	NC_021880	AGC	2	6	1286123	1286128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526463381
27042	NC_021880	AGC	2	6	1286147	1286152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526463381
27043	NC_021880	ATT	2	6	1286189	1286194	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526463381
27044	NC_021880	TCA	2	6	1286214	1286219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526463381
27045	NC_021880	ACA	2	6	1286238	1286243	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526463381
27046	NC_021880	TTC	2	6	1286259	1286264	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526463381
27047	NC_021880	CAC	2	6	1286287	1286292	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526463381
27048	NC_021880	CA	3	6	1286342	1286347	50 %	0 %	0 %	50 %	526463381
27049	NC_021880	CAC	2	6	1286369	1286374	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526463381
27050	NC_021880	TAT	2	6	1286386	1286391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526463381
27051	NC_021880	CT	3	6	1286403	1286408	0 %	50 %	0 %	50 %	526463381
27052	NC_021880	CCT	2	6	1286410	1286415	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526463381
27053	NC_021880	TCA	2	6	1286493	1286498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526463381
27054	NC_021880	T	6	6	1286562	1286567	0 %	100 %	0 %	0 %	526463381
27055	NC_021880	CTC	2	6	1286612	1286617	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526463381
27056	NC_021880	CTCC	2	8	1286620	1286627	0 %	25 %	0 %	75 %	526463381
27057	NC_021880	TATT	2	8	1286687	1286694	25 %	75 %	0 %	0 %	526463382
27058	NC_021880	CAT	2	6	1286695	1286700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526463382
27059	NC_021880	TCT	2	6	1286732	1286737	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526463382
27060	NC_021880	AC	4	8	1286782	1286789	50 %	0 %	0 %	50 %	526463382
27061	NC_021880	CA	4	8	1286898	1286905	50 %	0 %	0 %	50 %	526463382
27062	NC_021880	AC	3	6	1286906	1286911	50 %	0 %	0 %	50 %	526463382
27063	NC_021880	ATG	2	6	1286957	1286962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526463382
27064	NC_021880	A	6	6	1286986	1286991	100 %	0 %	0 %	0 %	526463382
27065	NC_021880	CCA	2	6	1287060	1287065	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526463382
27066	NC_021880	CG	3	6	1287157	1287162	0 %	0 %	50 %	50 %	526463383
27067	NC_021880	TTA	2	6	1287171	1287176	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526463383
27068	NC_021880	TGCC	2	8	1287227	1287234	0 %	25 %	25 %	50 %	526463383
27069	NC_021880	TCT	2	6	1287292	1287297	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526463383
27070	NC_021880	TCCTCT	2	12	1287459	1287470	0 %	50 %	0 %	50 %	526463383
27071	NC_021880	CAC	2	6	1287484	1287489	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526463383
27072	NC_021880	CCT	2	6	1287521	1287526	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526463383
27073	NC_021880	CCA	2	6	1287553	1287558	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526463383
27074	NC_021880	ACAA	2	8	1287588	1287595	75 %	0 %	0 %	25 %	526463383
27075	NC_021880	A	7	7	1287648	1287654	100 %	0 %	0 %	0 %	526463383
27076	NC_021880	CTA	2	6	1287655	1287660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526463383
27077	NC_021880	TAC	2	6	1287674	1287679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526463383
27078	NC_021880	AAACCA	2	12	1287812	1287823	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526463384
27079	NC_021880	CTT	2	6	1287865	1287870	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526463384
27080	NC_021880	GAA	2	6	1287901	1287906	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526463384
27081	NC_021880	ATA	2	6	1287973	1287978	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526463384
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27083	NC_021880	GAA	2	6	1288031	1288036	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526463384
27084	NC_021880	TAC	2	6	1288056	1288061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526463384
27085	NC_021880	TC	3	6	1288092	1288097	0 %	50 %	0 %	50 %	526463384
27086	NC_021880	ATC	2	6	1288147	1288152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526463384
27087	NC_021880	AT	3	6	1288255	1288260	50 %	50 %	0 %	0 %	526463384
27088	NC_021880	TAC	2	6	1288290	1288295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526463384
27089	NC_021880	AGA	2	6	1288318	1288323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526463384
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27091	NC_021880	CCT	2	6	1288338	1288343	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526463384
27092	NC_021880	TAA	2	6	1288350	1288355	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526463384
27093	NC_021880	AGC	2	6	1288363	1288368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526463384
27094	NC_021880	TAT	2	6	1288377	1288382	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526463384
27095	NC_021880	TAA	2	6	1288400	1288405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526463384
27096	NC_021880	TCAG	2	8	1288430	1288437	25 %	25 %	25 %	25 %	526463384
27097	NC_021880	GAA	2	6	1288454	1288459	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526463384
27098	NC_021880	TAC	2	6	1288473	1288478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526463384
27099	NC_021880	ACC	2	6	1288528	1288533	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526463384
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27101	NC_021880	TC	3	6	1288675	1288680	0 %	50 %	0 %	50 %	526463384
27102	NC_021880	AACCA	2	10	1288699	1288708	60 %	0 %	0 %	40 %	526463384
27103	NC_021880	CAG	2	6	1288782	1288787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526463384
27104	NC_021880	CAA	2	6	1288840	1288845	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526463384
27105	NC_021880	TCT	2	6	1288846	1288851	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526463384
27106	NC_021880	ACA	2	6	1289006	1289011	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526463384
27107	NC_021880	TTC	2	6	1289033	1289038	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526463384
27108	NC_021880	TCT	2	6	1289094	1289099	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526463384
27109	NC_021880	CTT	2	6	1289128	1289133	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526463384
27110	NC_021880	GTTA	2	8	1289146	1289153	25 %	50 %	25 %	0 %	526463384
27111	NC_021880	CAT	2	6	1289184	1289189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526463384
27112	NC_021880	ACC	2	6	1289246	1289251	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526463384
27113	NC_021880	AAT	2	6	1289262	1289267	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526463384
27114	NC_021880	CTG	2	6	1289321	1289326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526463384
27115	NC_021880	CCA	2	6	1289355	1289360	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526463384
27116	NC_021880	AAC	2	6	1289375	1289380	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526463384
27117	NC_021880	A	6	6	1289395	1289400	100 %	0 %	0 %	0 %	526463384
27118	NC_021880	CTT	2	6	1289442	1289447	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526463384
27119	NC_021880	CTA	2	6	1289517	1289522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526463384
27120	NC_021880	TACA	2	8	1289602	1289609	50 %	25 %	0 %	25 %	526463384
27121	NC_021880	TCT	2	6	1289664	1289669	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526463384
27122	NC_021880	CAG	2	6	1289677	1289682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526463384
27123	NC_021880	ACA	2	6	1289741	1289746	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526463384
27124	NC_021880	TAA	2	6	1289763	1289768	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526463384
27125	NC_021880	CTT	2	6	1289800	1289805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526463384
27126	NC_021880	TTA	2	6	1289832	1289837	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526463384
27127	NC_021880	TCC	2	6	1289864	1289869	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526463384
27128	NC_021880	CCG	2	6	1289958	1289963	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526463384
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27131	NC_021880	TAC	2	6	1290107	1290112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526463385
27132	NC_021880	TTA	2	6	1290206	1290211	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526463385
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27142	NC_021880	CTATC	2	10	1290623	1290632	20 %	40 %	0 %	40 %	526463385
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27145	NC_021880	TGC	2	6	1290759	1290764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526463385
27146	NC_021880	ACCTTG	2	12	1290973	1290984	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	526463385
27147	NC_021880	CA	3	6	1290996	1291001	50 %	0 %	0 %	50 %	526463385
27148	NC_021880	ACA	3	9	1291027	1291035	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526463385
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27151	NC_021880	CCT	2	6	1291073	1291078	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526463385
27152	NC_021880	ACA	2	6	1291106	1291111	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526463385
27153	NC_021880	CAA	2	6	1291122	1291127	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27154	NC_021880	ACA	2	6	1291170	1291175	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27155	NC_021880	CTA	2	6	1291244	1291249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526463386
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27173	NC_021880	CTCTA	2	10	1292296	1292305	20 %	40 %	0 %	40 %	526464003
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27185	NC_021880	TA	3	6	1292794	1292799	50 %	50 %	0 %	0 %	526463387
27186	NC_021880	CA	3	6	1292802	1292807	50 %	0 %	0 %	50 %	526463387
27187	NC_021880	GCAC	2	8	1292819	1292826	25 %	0 %	25 %	50 %	526463387
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27190	NC_021880	TAAC	2	8	1292877	1292884	50 %	25 %	0 %	25 %	526463387
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27195	NC_021880	CGT	2	6	1293176	1293181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526463387
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27210	NC_021880	CACT	2	8	1294066	1294073	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
27211	NC_021880	TAG	2	6	1294111	1294116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27212	NC_021880	ACAG	2	8	1294141	1294148	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
27213	NC_021880	TGC	2	6	1294158	1294163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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27215	NC_021880	TGC	2	6	1294196	1294201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27216	NC_021880	CTA	2	6	1294235	1294240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464004
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27218	NC_021880	ATG	2	6	1294265	1294270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464004
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27220	NC_021880	ATC	2	6	1294335	1294340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464004
27221	NC_021880	ATC	2	6	1294362	1294367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464004
27222	NC_021880	GA	3	6	1294427	1294432	50 %	0 %	50 %	0 %	526464004
27223	NC_021880	AAGC	2	8	1294463	1294470	50 %	0 %	25 %	25 %	526464004
27224	NC_021880	CAA	2	6	1294490	1294495	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526464004
27225	NC_021880	ACC	2	6	1294509	1294514	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526464004
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27228	NC_021880	CTA	2	6	1294655	1294660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464004
27229	NC_021880	T	6	6	1294664	1294669	0 %	100 %	0 %	0 %	526464004
27230	NC_021880	CAT	2	6	1294670	1294675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464004
27231	NC_021880	TAC	2	6	1294742	1294747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464004
27232	NC_021880	TGC	2	6	1294748	1294753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526464004
27233	NC_021880	ATC	2	6	1294759	1294764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464004
27234	NC_021880	TAC	2	6	1294856	1294861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464004
27235	NC_021880	TGTC	2	8	1294880	1294887	0 %	50 %	25 %	25 %	526464004
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27471	NC_021880	A	6	6	1305802	1305807	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27472	NC_021880	CT	3	6	1305958	1305963	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
27473	NC_021880	TAT	2	6	1305966	1305971	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27474	NC_021880	TAT	2	6	1306004	1306009	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27475	NC_021880	GGC	2	6	1306032	1306037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
27476	NC_021880	GTG	2	6	1306056	1306061	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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27478	NC_021880	A	6	6	1306281	1306286	100 %	0 %	0 %	0 %	526464010
27479	NC_021880	TGG	2	6	1306305	1306310	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526464010
27480	NC_021880	T	7	7	1306323	1306329	0 %	100 %	0 %	0 %	526464010
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