MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Anaplasma phagocytophilum str. JM

Total Repeats: 31148

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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21002	NC_021880	GT	3	6	1002812	1002817	0 %	50 %	50 %	0 %	526463252
21003	NC_021880	GA	3	6	1002853	1002858	50 %	0 %	50 %	0 %	526463252
21004	NC_021880	AGG	2	6	1002889	1002894	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526463252
21005	NC_021880	GCA	2	6	1003027	1003032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526463252
21006	NC_021880	GCG	2	6	1003046	1003051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526463252
21007	NC_021880	TGGC	2	8	1003067	1003074	0 %	25 %	50 %	25 %	526463252
21008	NC_021880	TAA	2	6	1003121	1003126	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526463252
21009	NC_021880	CTC	2	6	1003154	1003159	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526463252
21010	NC_021880	TGGTG	2	10	1003218	1003227	0 %	40 %	60 %	0 %	526463252
21011	NC_021880	GAA	2	6	1003251	1003256	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526463252
21012	NC_021880	CATAT	2	10	1003310	1003319	40 %	40 %	0 %	20 %	526463252
21013	NC_021880	AAGGCG	2	12	1003337	1003348	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	526463252
21014	NC_021880	GC	3	6	1003353	1003358	0 %	0 %	50 %	50 %	526463252
21015	NC_021880	AT	3	6	1003385	1003390	50 %	50 %	0 %	0 %	526463252
21016	NC_021880	GATT	2	8	1003401	1003408	25 %	50 %	25 %	0 %	526463252
21017	NC_021880	TTG	2	6	1003457	1003462	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526463252
21018	NC_021880	CGA	2	6	1003511	1003516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526463252
21019	NC_021880	TCG	2	6	1003519	1003524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526463252
21020	NC_021880	GCA	2	6	1003584	1003589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526463252
21021	NC_021880	GAG	2	6	1003666	1003671	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526463252
21022	NC_021880	GGT	2	6	1003711	1003716	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526463252
21023	NC_021880	CTT	2	6	1003772	1003777	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21024	NC_021880	AGA	2	6	1003784	1003789	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21025	NC_021880	GGT	2	6	1003792	1003797	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21026	NC_021880	TG	3	6	1003859	1003864	0 %	50 %	50 %	0 %	526463875
21027	NC_021880	GA	3	6	1003896	1003901	50 %	0 %	50 %	0 %	526463875
21028	NC_021880	TG	3	6	1003926	1003931	0 %	50 %	50 %	0 %	526463875
21029	NC_021880	TGT	2	6	1003957	1003962	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526463875
21030	NC_021880	CTG	2	6	1003983	1003988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21031	NC_021880	TAC	2	6	1004021	1004026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526463876
21032	NC_021880	GGT	2	6	1004036	1004041	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526463876
21033	NC_021880	GTT	2	6	1004069	1004074	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526463876
21034	NC_021880	GAC	2	6	1004113	1004118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526463876
21035	NC_021880	T	7	7	1004169	1004175	0 %	100 %	0 %	0 %	526463876
21036	NC_021880	TCCT	2	8	1004309	1004316	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21037	NC_021880	ATT	2	6	1004338	1004343	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21038	NC_021880	ATT	2	6	1004360	1004365	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21039	NC_021880	TAA	2	6	1004422	1004427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21040	NC_021880	ATTG	3	12	1004438	1004449	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
21041	NC_021880	TGCA	2	8	1004552	1004559	25 %	25 %	25 %	25 %	526463253
21042	NC_021880	ATG	2	6	1004587	1004592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526463253
21043	NC_021880	AAT	2	6	1004633	1004638	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526463253
21044	NC_021880	AT	3	6	1004677	1004682	50 %	50 %	0 %	0 %	526463253
21045	NC_021880	CCCG	2	8	1004690	1004697	0 %	0 %	25 %	75 %	526463253
21046	NC_021880	TC	3	6	1004805	1004810	0 %	50 %	0 %	50 %	526463253
21047	NC_021880	AT	3	6	1004934	1004939	50 %	50 %	0 %	0 %	526463253
21048	NC_021880	TA	3	6	1004959	1004964	50 %	50 %	0 %	0 %	526463253
21049	NC_021880	ATT	2	6	1004987	1004992	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526463253
21050	NC_021880	GTTT	2	8	1005031	1005038	0 %	75 %	25 %	0 %	526463253
21051	NC_021880	TGT	2	6	1005077	1005082	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526463253
21052	NC_021880	CGT	2	6	1005083	1005088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526463253
21053	NC_021880	AAG	2	6	1005099	1005104	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526463253
21054	NC_021880	TAA	2	6	1005208	1005213	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526463253
21055	NC_021880	A	6	6	1005323	1005328	100 %	0 %	0 %	0 %	526463253
21056	NC_021880	TAC	2	6	1005329	1005334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526463253
21057	NC_021880	A	6	6	1005362	1005367	100 %	0 %	0 %	0 %	526463253
21058	NC_021880	CAA	2	6	1005382	1005387	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526463253
21059	NC_021880	TGA	2	6	1005392	1005397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526463253
21060	NC_021880	CTG	2	6	1005407	1005412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526463253
21061	NC_021880	GTAGA	2	10	1005466	1005475	40 %	20 %	40 %	0 %	526463253
21062	NC_021880	AT	3	6	1005641	1005646	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21063	NC_021880	ATC	2	6	1005663	1005668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21064	NC_021880	TTTTC	2	10	1005691	1005700	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
21065	NC_021880	CAT	2	6	1005713	1005718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21066	NC_021880	TA	4	8	1005746	1005753	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21067	NC_021880	AAG	2	6	1005838	1005843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526463877
21068	NC_021880	GGC	2	6	1005965	1005970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526463877
21069	NC_021880	GAT	2	6	1005989	1005994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526463877
21070	NC_021880	TCA	2	6	1005996	1006001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526463877
21071	NC_021880	TGTGC	2	10	1006018	1006027	0 %	40 %	40 %	20 %	526463877
21072	NC_021880	CATA	2	8	1006095	1006102	50 %	25 %	0 %	25 %	526463877
21073	NC_021880	TGT	2	6	1006124	1006129	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21074	NC_021880	TTCT	2	8	1006162	1006169	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
21075	NC_021880	TTA	2	6	1006253	1006258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21076	NC_021880	ACT	2	6	1006281	1006286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21077	NC_021880	TAT	2	6	1006351	1006356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21078	NC_021880	TTA	3	9	1006403	1006411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21079	NC_021880	A	6	6	1006411	1006416	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21080	NC_021880	TAT	2	6	1006449	1006454	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21081	NC_021880	CTA	2	6	1006482	1006487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21082	NC_021880	ATG	2	6	1006504	1006509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21083	NC_021880	TGC	3	9	1006535	1006543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21084	NC_021880	TCC	2	6	1006599	1006604	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526463878
21085	NC_021880	CCA	2	6	1006606	1006611	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526463878
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21087	NC_021880	GCG	2	6	1006719	1006724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526463878
21088	NC_021880	CTA	2	6	1006786	1006791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526463878
21089	NC_021880	GTA	2	6	1006813	1006818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526463878
21090	NC_021880	CAA	2	6	1006825	1006830	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526463878
21091	NC_021880	CAC	2	6	1006856	1006861	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526463878
21092	NC_021880	AGA	2	6	1006862	1006867	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526463878
21093	NC_021880	A	6	6	1006867	1006872	100 %	0 %	0 %	0 %	526463878
21094	NC_021880	TAG	2	6	1006876	1006881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526463878
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21098	NC_021880	TAC	2	6	1007016	1007021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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21100	NC_021880	GTA	2	6	1007075	1007080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526463879
21101	NC_021880	GGA	2	6	1007100	1007105	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526463879
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21103	NC_021880	A	6	6	1007192	1007197	100 %	0 %	0 %	0 %	526463879
21104	NC_021880	TAG	2	6	1007201	1007206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526463879
21105	NC_021880	TCT	2	6	1007263	1007268	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526463879
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21107	NC_021880	AGT	3	9	1007330	1007338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21108	NC_021880	TAC	2	6	1007341	1007346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21109	NC_021880	ATG	2	6	1007384	1007389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526463880
21110	NC_021880	AGA	2	6	1007392	1007397	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526463880
21111	NC_021880	GTA	2	6	1007400	1007405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526463880
21112	NC_021880	GGA	2	6	1007425	1007430	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526463880
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21114	NC_021880	A	6	6	1007514	1007519	100 %	0 %	0 %	0 %	526463880
21115	NC_021880	TAG	2	6	1007523	1007528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526463880
21116	NC_021880	G	9	9	1007556	1007564	0 %	0 %	100 %	0 %	526463880
21117	NC_021880	TCT	2	6	1007588	1007593	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526463880
21118	NC_021880	TAT	2	6	1007718	1007723	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21119	NC_021880	TTC	2	6	1007813	1007818	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21120	NC_021880	TG	3	6	1007894	1007899	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
21121	NC_021880	GCA	2	6	1007932	1007937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21122	NC_021880	AGTG	2	8	1007974	1007981	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
21123	NC_021880	AAT	2	6	1007982	1007987	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21124	NC_021880	GCT	2	6	1007993	1007998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21125	NC_021880	TAT	2	6	1008020	1008025	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21126	NC_021880	TA	3	6	1008044	1008049	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21127	NC_021880	GT	3	6	1008069	1008074	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
21128	NC_021880	TCA	2	6	1008133	1008138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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21233	NC_021880	GA	3	6	1012953	1012958	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21234	NC_021880	CTG	2	6	1012991	1012996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21235	NC_021880	A	7	7	1013116	1013122	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21236	NC_021880	AAT	2	6	1013150	1013155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21237	NC_021880	GT	3	6	1013158	1013163	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
21238	NC_021880	CTT	2	6	1013196	1013201	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21239	NC_021880	AT	3	6	1013229	1013234	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21240	NC_021880	GATA	2	8	1013272	1013279	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
21241	NC_021880	TCC	2	6	1013388	1013393	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526463883
21242	NC_021880	GT	3	6	1013448	1013453	0 %	50 %	50 %	0 %	526463883
21243	NC_021880	AATA	2	8	1013464	1013471	75 %	25 %	0 %	0 %	526463883
21244	NC_021880	TAC	2	6	1013505	1013510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526463883
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21250	NC_021880	TAC	2	6	1013751	1013756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526463883
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21261	NC_021880	TAC	2	6	1014186	1014191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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21332	NC_021880	TTC	2	6	1017744	1017749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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21349	NC_021880	TTTATG	2	12	1018666	1018677	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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21351	NC_021880	GCA	2	6	1018756	1018761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21352	NC_021880	AT	3	6	1018800	1018805	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21353	NC_021880	A	7	7	1018893	1018899	100 %	0 %	0 %	0 %	526463886
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21486	NC_021880	CTA	2	6	1024189	1024194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526463258
21487	NC_021880	TAA	2	6	1024256	1024261	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526463258
21488	NC_021880	ATA	2	6	1024288	1024293	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526463258
21489	NC_021880	TGA	2	6	1024338	1024343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526463258
21490	NC_021880	ATC	2	6	1024366	1024371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526463258
21491	NC_021880	TCG	2	6	1024384	1024389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526463258
21492	NC_021880	CAC	2	6	1024499	1024504	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526463258
21493	NC_021880	GCC	2	6	1024510	1024515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526463258
21494	NC_021880	TCT	2	6	1024523	1024528	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526463258
21495	NC_021880	ACC	2	6	1024597	1024602	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526463258
21496	NC_021880	ACTGCT	2	12	1024612	1024623	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	526463258
21497	NC_021880	T	6	6	1024623	1024628	0 %	100 %	0 %	0 %	526463258
21498	NC_021880	CAC	2	6	1024638	1024643	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526463258
21499	NC_021880	TATCAT	2	12	1024701	1024712	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	526463258
21500	NC_021880	AAT	2	6	1024741	1024746	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526463258

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