MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Anaplasma phagocytophilum str. HZ2

Total Repeats: 31043

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021879	ATG	2	6	14	19	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021879	T	6	6	35	40	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021879	TGT	2	6	46	51	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021879	TAA	2	6	55	60	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021879	TTC	2	6	61	66	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_021879	GAAAA	2	10	128	137	80 %	0 %	20 %	0 %	526461593
7	NC_021879	TCG	2	6	147	152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526461593
8	NC_021879	CG	3	6	173	178	0 %	0 %	50 %	50 %	526461593
9	NC_021879	TAT	2	6	179	184	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526461593
10	NC_021879	AGG	2	6	223	228	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526461593
11	NC_021879	TC	3	6	262	267	0 %	50 %	0 %	50 %	526461593
12	NC_021879	ATT	2	6	282	287	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526461593
13	NC_021879	GAA	2	6	434	439	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526461593
14	NC_021879	GAC	2	6	458	463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526461593
15	NC_021879	CAG	2	6	522	527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526461593
16	NC_021879	TAC	2	6	537	542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526461593
17	NC_021879	TCA	2	6	629	634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526461593
18	NC_021879	ATA	2	6	678	683	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526461593
19	NC_021879	CTG	2	6	714	719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526461593
20	NC_021879	ATG	2	6	858	863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526461593
21	NC_021879	AACT	2	8	945	952	50 %	25 %	0 %	25 %	526461593
22	NC_021879	TGC	2	6	991	996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526461593
23	NC_021879	AGT	2	6	1015	1020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526461593
24	NC_021879	AAGA	2	8	1022	1029	75 %	0 %	25 %	0 %	526461593
25	NC_021879	GGA	2	6	1054	1059	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526461593
26	NC_021879	TGC	2	6	1138	1143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526461593
27	NC_021879	CAG	2	6	1171	1176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526461593
28	NC_021879	GGC	2	6	1201	1206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526461593
29	NC_021879	GTT	2	6	1244	1249	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526461593
30	NC_021879	ATG	2	6	1251	1256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526461593
31	NC_021879	ATG	2	6	1265	1270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526461593
32	NC_021879	T	6	6	1274	1279	0 %	100 %	0 %	0 %	526461593
33	NC_021879	ATTATG	2	12	1304	1315	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	526461593
34	NC_021879	TCA	2	6	1336	1341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526461593
35	NC_021879	ATT	2	6	1444	1449	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526461593
36	NC_021879	AC	3	6	1476	1481	50 %	0 %	0 %	50 %	526461593
37	NC_021879	A	6	6	1518	1523	100 %	0 %	0 %	0 %	526461593
38	NC_021879	TGA	2	6	1564	1569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526461593
39	NC_021879	GAA	3	9	1595	1603	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526461593
40	NC_021879	CAG	2	6	1646	1651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526461593
41	NC_021879	A	7	7	1694	1700	100 %	0 %	0 %	0 %	526461593
42	NC_021879	A	6	6	1959	1964	100 %	0 %	0 %	0 %	526461593
43	NC_021879	AGC	2	6	2005	2010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526461593
44	NC_021879	ATT	2	6	2013	2018	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526461593
45	NC_021879	CGT	2	6	2101	2106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526461593
46	NC_021879	ACAGC	2	10	2108	2117	40 %	0 %	20 %	40 %	526461593
47	NC_021879	TAT	2	6	2132	2137	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526461593
48	NC_021879	AGA	2	6	2156	2161	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526461593
49	NC_021879	TATGG	2	10	2192	2201	20 %	40 %	40 %	0 %	526461593
50	NC_021879	ACA	2	6	2306	2311	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526461593
51	NC_021879	A	6	6	2323	2328	100 %	0 %	0 %	0 %	526461593
52	NC_021879	GGA	2	6	2355	2360	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526461593
53	NC_021879	AGT	2	6	2402	2407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526461593
54	NC_021879	A	6	6	2464	2469	100 %	0 %	0 %	0 %	526461593
55	NC_021879	ATT	2	6	2533	2538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526461593
56	NC_021879	AGA	2	6	2551	2556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526461593
57	NC_021879	TGA	2	6	2580	2585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526461593
58	NC_021879	AAG	2	6	2586	2591	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526461593
59	NC_021879	TA	3	6	2800	2805	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021879	CTG	2	6	2887	2892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526461594
61	NC_021879	TGT	2	6	2923	2928	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526461594
62	NC_021879	AGAGA	2	10	2949	2958	60 %	0 %	40 %	0 %	526461594
63	NC_021879	AGC	2	6	2960	2965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526461594
64	NC_021879	TGATG	2	10	2999	3008	20 %	40 %	40 %	0 %	526461594
65	NC_021879	TGA	2	6	3097	3102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526461594
66	NC_021879	ATC	2	6	3118	3123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526461594
67	NC_021879	TAA	2	6	3196	3201	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526461594
68	NC_021879	A	6	6	3222	3227	100 %	0 %	0 %	0 %	526461594
69	NC_021879	CAC	2	6	3255	3260	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526461594
70	NC_021879	GGA	2	6	3327	3332	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526461594
71	NC_021879	A	6	6	3356	3361	100 %	0 %	0 %	0 %	526461594
72	NC_021879	GAT	2	6	3380	3385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526461594
73	NC_021879	TCA	2	6	3396	3401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526461594
74	NC_021879	TGG	2	6	3422	3427	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526461594
75	NC_021879	GTT	2	6	3480	3485	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526461594
76	NC_021879	TGC	2	6	3500	3505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526461594
77	NC_021879	T	9	9	3594	3602	0 %	100 %	0 %	0 %	526461595
78	NC_021879	GCT	2	6	3603	3608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526461595
79	NC_021879	T	6	6	3658	3663	0 %	100 %	0 %	0 %	526461595
80	NC_021879	CTAT	2	8	3701	3708	25 %	50 %	0 %	25 %	526461595
81	NC_021879	T	6	6	3726	3731	0 %	100 %	0 %	0 %	526461595
82	NC_021879	TC	3	6	3745	3750	0 %	50 %	0 %	50 %	526461595
83	NC_021879	TAG	2	6	3757	3762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526461595
84	NC_021879	GCG	2	6	3933	3938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526461595
85	NC_021879	ACAGA	2	10	3960	3969	60 %	0 %	20 %	20 %	526461595
86	NC_021879	TGT	2	6	4097	4102	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526461595
87	NC_021879	GAG	2	6	4144	4149	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526461595
88	NC_021879	ACA	2	6	4284	4289	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526461595
89	NC_021879	AGC	2	6	4301	4306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526461595
90	NC_021879	TA	3	6	4332	4337	50 %	50 %	0 %	0 %	526461595
91	NC_021879	T	6	6	4345	4350	0 %	100 %	0 %	0 %	526461595
92	NC_021879	GTAGT	2	10	4355	4364	20 %	40 %	40 %	0 %	526461595
93	NC_021879	CAA	3	9	4403	4411	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526461596
94	NC_021879	G	6	6	4447	4452	0 %	0 %	100 %	0 %	526461596
95	NC_021879	GTA	2	6	4650	4655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526461596
96	NC_021879	AGG	2	6	4668	4673	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526461596
97	NC_021879	GGCTTT	2	12	4700	4711	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	526461596
98	NC_021879	TAT	2	6	4811	4816	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526461596
99	NC_021879	TAT	2	6	4928	4933	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526461596
100	NC_021879	GGT	2	6	4995	5000	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526461596
101	NC_021879	A	6	6	5033	5038	100 %	0 %	0 %	0 %	526461596
102	NC_021879	ATG	2	6	5101	5106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_021879	GCA	2	6	5207	5212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_021879	ACG	2	6	5226	5231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_021879	TTA	2	6	5341	5346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526462221
106	NC_021879	TAT	2	6	5359	5364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526462221
107	NC_021879	ATG	2	6	5376	5381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526462221
108	NC_021879	ATG	2	6	5407	5412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526462221
109	NC_021879	ATG	2	6	5422	5427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526462221
110	NC_021879	TTC	2	6	5500	5505	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526462221
111	NC_021879	ATCT	2	8	5613	5620	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
112	NC_021879	CTAT	2	8	5638	5645	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
113	NC_021879	GAA	2	6	5664	5669	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_021879	AAG	2	6	5702	5707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_021879	GTA	2	6	5758	5763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_021879	AAAT	2	8	5824	5831	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_021879	A	6	6	5922	5927	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_021879	ATTA	2	8	5944	5951	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_021879	A	6	6	5957	5962	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_021879	CAAT	2	8	5980	5987	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
121	NC_021879	TTG	2	6	6039	6044	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_021879	AAG	2	6	6090	6095	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_021879	AGA	2	6	6124	6129	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_021879	TGT	2	6	6133	6138	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_021879	TGA	2	6	6203	6208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526462222
126	NC_021879	GGA	2	6	6220	6225	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526462222
127	NC_021879	TGT	2	6	6275	6280	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526462222
128	NC_021879	AG	3	6	6319	6324	50 %	0 %	50 %	0 %	526462222
129	NC_021879	A	6	6	6340	6345	100 %	0 %	0 %	0 %	526462222
130	NC_021879	GTG	2	6	6377	6382	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526462222
131	NC_021879	AAAG	2	8	6402	6409	75 %	0 %	25 %	0 %	526462222
132	NC_021879	GATT	2	8	6456	6463	25 %	50 %	25 %	0 %	526462222
133	NC_021879	TCA	2	6	6538	6543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526462222
134	NC_021879	ATTT	2	8	6584	6591	25 %	75 %	0 %	0 %	526462222
135	NC_021879	T	6	6	6603	6608	0 %	100 %	0 %	0 %	526462222
136	NC_021879	TTTG	2	8	6621	6628	0 %	75 %	25 %	0 %	526462222
137	NC_021879	TAT	2	6	6642	6647	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526462222
138	NC_021879	A	6	6	6672	6677	100 %	0 %	0 %	0 %	526462222
139	NC_021879	TCC	2	6	6682	6687	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526462222
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141	NC_021879	TA	3	6	6783	6788	50 %	50 %	0 %	0 %	526462222
142	NC_021879	GGA	2	6	6799	6804	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526462222
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144	NC_021879	ATA	2	6	6841	6846	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526462222
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147	NC_021879	TGA	2	6	6936	6941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526462222
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149	NC_021879	GAG	2	6	7038	7043	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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164	NC_021879	AT	3	6	7615	7620	50 %	50 %	0 %	0 %	526461597
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173	NC_021879	ATTG	2	8	8117	8124	25 %	50 %	25 %	0 %	526461598
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239	NC_021879	A	7	7	10903	10909	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
240	NC_021879	AGA	2	6	10964	10969	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
241	NC_021879	CATAG	2	10	10976	10985	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
242	NC_021879	GAT	2	6	11031	11036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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244	NC_021879	CTG	2	6	11065	11070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
245	NC_021879	GCA	2	6	11087	11092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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250	NC_021879	TGC	2	6	11360	11365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
251	NC_021879	AT	3	6	11370	11375	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
252	NC_021879	TAA	3	9	11461	11469	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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256	NC_021879	CT	3	6	11661	11666	0 %	50 %	0 %	50 %	526462223
257	NC_021879	TAT	2	6	11728	11733	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526462223
258	NC_021879	ACC	2	6	11744	11749	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526462223
259	NC_021879	ACA	2	6	11787	11792	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526462223
260	NC_021879	ATC	2	6	11856	11861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526462223
261	NC_021879	A	6	6	12072	12077	100 %	0 %	0 %	0 %	526462223
262	NC_021879	CAT	2	6	12086	12091	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526462223
263	NC_021879	A	7	7	12152	12158	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
264	NC_021879	TGGGA	2	10	12163	12172	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
265	NC_021879	TAA	2	6	12238	12243	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
266	NC_021879	TAA	2	6	12264	12269	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
267	NC_021879	A	6	6	12268	12273	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
268	NC_021879	ACT	2	6	12301	12306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
269	NC_021879	TAA	2	6	12330	12335	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
270	NC_021879	CAT	2	6	12365	12370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
271	NC_021879	TATCT	2	10	12392	12401	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
272	NC_021879	GA	3	6	12433	12438	50 %	0 %	50 %	0 %	526461600
273	NC_021879	GGA	2	6	12444	12449	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526461600
274	NC_021879	TTCT	2	8	12527	12534	0 %	75 %	0 %	25 %	526461600
275	NC_021879	CAT	2	6	12622	12627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526461600
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277	NC_021879	A	6	6	12692	12697	100 %	0 %	0 %	0 %	526461600
278	NC_021879	CTA	2	6	12707	12712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526461600
279	NC_021879	TGGG	2	8	12777	12784	0 %	25 %	75 %	0 %	526461600
280	NC_021879	GCA	2	6	12828	12833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526461600
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282	NC_021879	CTTT	2	8	13000	13007	0 %	75 %	0 %	25 %	526461600
283	NC_021879	GAA	2	6	13054	13059	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526461600
284	NC_021879	CTTG	2	8	13137	13144	0 %	50 %	25 %	25 %	526461600
285	NC_021879	G	6	6	13151	13156	0 %	0 %	100 %	0 %	526461600
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289	NC_021879	TCT	2	6	13487	13492	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526461601
290	NC_021879	GAGTT	2	10	13569	13578	20 %	40 %	40 %	0 %	526461601
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370	NC_021879	AAT	2	6	17420	17425	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526461603
371	NC_021879	AT	3	6	17424	17429	50 %	50 %	0 %	0 %	526461603
372	NC_021879	ATC	2	6	17484	17489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
373	NC_021879	AG	3	6	17608	17613	50 %	0 %	50 %	0 %	526462224
374	NC_021879	CTA	2	6	17647	17652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526462224
375	NC_021879	TAA	2	6	17666	17671	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526462224
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380	NC_021879	T	6	6	17898	17903	0 %	100 %	0 %	0 %	526462224
381	NC_021879	TC	4	8	17943	17950	0 %	50 %	0 %	50 %	526462224
382	NC_021879	GTG	2	6	18001	18006	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526462224
383	NC_021879	AG	3	6	18084	18089	50 %	0 %	50 %	0 %	526462224
384	NC_021879	TA	3	6	18101	18106	50 %	50 %	0 %	0 %	526462224
385	NC_021879	GCT	2	6	18152	18157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526461604
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388	NC_021879	AC	3	6	18266	18271	50 %	0 %	0 %	50 %	526461604
389	NC_021879	TAG	2	6	18282	18287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526461604
390	NC_021879	CAAG	2	8	18323	18330	50 %	0 %	25 %	25 %	526461604
391	NC_021879	AGC	2	6	18337	18342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526461604
392	NC_021879	TACAGA	2	12	18409	18420	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	526461604
393	NC_021879	AAT	2	6	18430	18435	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526461604
394	NC_021879	AGG	2	6	18486	18491	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526461604
395	NC_021879	GAG	2	6	18514	18519	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526461604
396	NC_021879	ATG	2	6	18599	18604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526461604
397	NC_021879	TAA	2	6	18613	18618	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526461605
398	NC_021879	AAC	2	6	18639	18644	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526461605
399	NC_021879	CAA	2	6	18735	18740	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526461605
400	NC_021879	AAG	2	6	18747	18752	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526461605
401	NC_021879	AGA	2	6	18806	18811	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526461605
402	NC_021879	AAAGC	2	10	18840	18849	60 %	0 %	20 %	20 %	526461605
403	NC_021879	CAAGAC	2	12	18889	18900	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	526461605
404	NC_021879	AGCA	2	8	18911	18918	50 %	0 %	25 %	25 %	526461605
405	NC_021879	AGA	2	6	18926	18931	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526461605
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