MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Achromobacter xylosoxidans NH44784-1996 complete genome

Total Repeats: 192222

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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146002	NC_021285	GCC	2	6	5305322	5305327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528986731
146003	NC_021285	GCT	3	9	5305362	5305370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528986731
146004	NC_021285	CAG	2	6	5305402	5305407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528986731
146005	NC_021285	CGCC	2	8	5305410	5305417	0 %	0 %	25 %	75 %	528986731
146006	NC_021285	TGG	2	6	5305455	5305460	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528986731
146007	NC_021285	CAC	2	6	5305477	5305482	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528986731
146008	NC_021285	CTTGC	2	10	5305507	5305516	0 %	40 %	20 %	40 %	528986731
146009	NC_021285	CGA	2	6	5305524	5305529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528986731
146010	NC_021285	CGCCAG	2	12	5305555	5305566	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	528986731
146011	NC_021285	CGC	2	6	5305567	5305572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528986731
146012	NC_021285	CAG	2	6	5305582	5305587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528986731
146013	NC_021285	GCG	2	6	5305640	5305645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528986731
146014	NC_021285	CGC	2	6	5305665	5305670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528986731
146015	NC_021285	TCGC	2	8	5305696	5305703	0 %	25 %	25 %	50 %	528986731
146016	NC_021285	GC	3	6	5305735	5305740	0 %	0 %	50 %	50 %	528986731
146017	NC_021285	GTCCCA	2	12	5305767	5305778	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	528986731
146018	NC_021285	CTG	2	6	5305788	5305793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528986732
146019	NC_021285	GCG	2	6	5305807	5305812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528986732
146020	NC_021285	CAC	2	6	5305881	5305886	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528986732
146021	NC_021285	GATGC	2	10	5305887	5305896	20 %	20 %	40 %	20 %	528986732
146022	NC_021285	CTTC	2	8	5305898	5305905	0 %	50 %	0 %	50 %	528986732
146023	NC_021285	CGG	2	6	5305907	5305912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528986732
146024	NC_021285	CTG	2	6	5305968	5305973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528986732
146025	NC_021285	TCG	2	6	5306014	5306019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528986732
146026	NC_021285	CG	3	6	5306049	5306054	0 %	0 %	50 %	50 %	528986732
146027	NC_021285	GCGCTG	2	12	5306067	5306078	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	528986732
146028	NC_021285	CCCG	2	8	5306079	5306086	0 %	0 %	25 %	75 %	528986732
146029	NC_021285	CCA	2	6	5306108	5306113	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528986732
146030	NC_021285	GCC	2	6	5306170	5306175	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528986732
146031	NC_021285	CTG	2	6	5306184	5306189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528986732
146032	NC_021285	AAC	2	6	5306242	5306247	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528986732
146033	NC_021285	GCA	2	6	5306258	5306263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528986732
146034	NC_021285	CTGC	2	8	5306274	5306281	0 %	25 %	25 %	50 %	528986732
146035	NC_021285	TGG	2	6	5306300	5306305	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528986732
146036	NC_021285	CCA	2	6	5306321	5306326	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528986732
146037	NC_021285	CGA	2	6	5306402	5306407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528986732
146038	NC_021285	CGC	2	6	5306444	5306449	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528986732
146039	NC_021285	GCCGG	2	10	5306466	5306475	0 %	0 %	60 %	40 %	528986732
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146042	NC_021285	GGCC	2	8	5306526	5306533	0 %	0 %	50 %	50 %	528986732
146043	NC_021285	CTG	2	6	5306598	5306603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528986732
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146049	NC_021285	TTCA	2	8	5306943	5306950	25 %	50 %	0 %	25 %	528986732
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146052	NC_021285	AGGA	2	8	5307112	5307119	50 %	0 %	50 %	0 %	528986732
146053	NC_021285	CG	4	8	5307169	5307176	0 %	0 %	50 %	50 %	528986732
146054	NC_021285	CAG	2	6	5307198	5307203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528986732
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146071	NC_021285	GC	3	6	5307747	5307752	0 %	0 %	50 %	50 %	528986732
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146228	NC_021285	CCG	2	6	5313957	5313962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528986733
146229	NC_021285	TACGG	2	10	5313976	5313985	20 %	20 %	40 %	20 %	528986733
146230	NC_021285	GCG	2	6	5313986	5313991	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528986733
146231	NC_021285	CGC	2	6	5314018	5314023	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528986733
146232	NC_021285	AAAC	2	8	5314035	5314042	75 %	0 %	0 %	25 %	528986733
146233	NC_021285	GCC	2	6	5314048	5314053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528986733
146234	NC_021285	TCCAT	2	10	5314098	5314107	20 %	40 %	0 %	40 %	528986733
146235	NC_021285	CCGGT	2	10	5314160	5314169	0 %	20 %	40 %	40 %	528986733
146236	NC_021285	CGA	2	6	5314209	5314214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528986733
146237	NC_021285	GAC	2	6	5314279	5314284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528986733
146238	NC_021285	GATG	2	8	5314285	5314292	25 %	25 %	50 %	0 %	528986733
146239	NC_021285	TGGTC	2	10	5314428	5314437	0 %	40 %	40 %	20 %	528986733
146240	NC_021285	GAGG	2	8	5314441	5314448	25 %	0 %	75 %	0 %	528986733
146241	NC_021285	GTC	2	6	5314465	5314470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528986733
146242	NC_021285	CT	3	6	5314516	5314521	0 %	50 %	0 %	50 %	528986733
146243	NC_021285	CAG	2	6	5314599	5314604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528986733
146244	NC_021285	CGA	2	6	5314638	5314643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
146245	NC_021285	TAA	2	6	5314668	5314673	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
146246	NC_021285	TTG	2	6	5314692	5314697	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
146247	NC_021285	AGC	2	6	5314711	5314716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
146248	NC_021285	CAGCCG	3	18	5314722	5314739	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
146249	NC_021285	CAC	2	6	5314756	5314761	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
146250	NC_021285	GCA	2	6	5314775	5314780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
146251	NC_021285	AGG	2	6	5314845	5314850	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
146252	NC_021285	ATC	2	6	5314904	5314909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
146253	NC_021285	ACG	2	6	5314913	5314918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
146254	NC_021285	CGT	2	6	5315011	5315016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
146255	NC_021285	GTA	2	6	5315017	5315022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
146256	NC_021285	TGC	2	6	5315050	5315055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
146257	NC_021285	TCT	2	6	5315078	5315083	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
146258	NC_021285	AGC	2	6	5315121	5315126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
146259	NC_021285	TCC	2	6	5315151	5315156	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
146260	NC_021285	CAAA	2	8	5315257	5315264	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
146261	NC_021285	TGG	2	6	5315274	5315279	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
146262	NC_021285	CTTCC	2	10	5315300	5315309	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
146263	NC_021285	AAC	2	6	5315347	5315352	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
146264	NC_021285	CGC	2	6	5315377	5315382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
146265	NC_021285	GCC	2	6	5315445	5315450	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
146266	NC_021285	GCC	2	6	5315567	5315572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
146267	NC_021285	T	7	7	5315587	5315593	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
146268	NC_021285	AAT	2	6	5315682	5315687	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
146269	NC_021285	CG	3	6	5315735	5315740	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
146270	NC_021285	ACG	2	6	5315791	5315796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
146271	NC_021285	CG	3	6	5315946	5315951	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
146272	NC_021285	GCC	3	9	5315992	5316000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
146273	NC_021285	CTC	2	6	5316002	5316007	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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146275	NC_021285	CGC	2	6	5316067	5316072	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
146276	NC_021285	GCC	2	6	5316084	5316089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
146277	NC_021285	CCAG	2	8	5316094	5316101	25 %	0 %	25 %	50 %	528986734
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146280	NC_021285	GC	3	6	5316229	5316234	0 %	0 %	50 %	50 %	528986734
146281	NC_021285	CGT	2	6	5316287	5316292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528986734
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146283	NC_021285	CG	3	6	5316334	5316339	0 %	0 %	50 %	50 %	528986734
146284	NC_021285	GCCGC	3	15	5316379	5316393	0 %	0 %	40 %	60 %	528986734
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146295	NC_021285	CTG	2	6	5316747	5316752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528986734
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146300	NC_021285	GAC	2	6	5316864	5316869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528986734
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146302	NC_021285	CCA	2	6	5316929	5316934	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528986734
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146305	NC_021285	TCA	2	6	5317009	5317014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528986734
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146307	NC_021285	TCG	2	6	5317153	5317158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528986734
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146313	NC_021285	TACA	2	8	5317224	5317231	50 %	25 %	0 %	25 %	528986734
146314	NC_021285	GC	3	6	5317232	5317237	0 %	0 %	50 %	50 %	528986734
146315	NC_021285	GTT	2	6	5317244	5317249	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528986734
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146320	NC_021285	GC	3	6	5317335	5317340	0 %	0 %	50 %	50 %	528986734
146321	NC_021285	CCG	2	6	5317357	5317362	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528986734
146322	NC_021285	TCC	2	6	5317380	5317385	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528986734
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146325	NC_021285	GCG	2	6	5317492	5317497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528986734
146326	NC_021285	CGC	2	6	5317498	5317503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528986734
146327	NC_021285	GGT	2	6	5317577	5317582	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528986734
146328	NC_021285	CCGTTT	2	12	5317586	5317597	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	528986734
146329	NC_021285	GCGG	2	8	5317598	5317605	0 %	0 %	75 %	25 %	528986734
146330	NC_021285	GC	4	8	5317699	5317706	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
146331	NC_021285	GC	3	6	5317735	5317740	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
146332	NC_021285	CGC	2	6	5317771	5317776	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
146333	NC_021285	GCC	2	6	5317801	5317806	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
146334	NC_021285	CAT	2	6	5317840	5317845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528986735
146335	NC_021285	AGC	2	6	5317866	5317871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528986735
146336	NC_021285	GCCCG	2	10	5317930	5317939	0 %	0 %	40 %	60 %	528986735
146337	NC_021285	CAGG	2	8	5317944	5317951	25 %	0 %	50 %	25 %	528986735
146338	NC_021285	GCC	2	6	5317957	5317962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528986735
146339	NC_021285	GCC	2	6	5318015	5318020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528986735
146340	NC_021285	CCGC	2	8	5318034	5318041	0 %	0 %	25 %	75 %	528986735
146341	NC_021285	CCGGC	2	10	5318110	5318119	0 %	0 %	40 %	60 %	528986735
146342	NC_021285	GC	3	6	5318118	5318123	0 %	0 %	50 %	50 %	528986735
146343	NC_021285	ACA	2	6	5318211	5318216	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528986735
146344	NC_021285	CGC	2	6	5318238	5318243	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528986735
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146346	NC_021285	TGGCG	2	10	5318254	5318263	0 %	20 %	60 %	20 %	528986735
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146461	NC_021285	AGC	2	6	5323163	5323168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528986735
146462	NC_021285	CAT	2	6	5323265	5323270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
146463	NC_021285	CCGGC	2	10	5323287	5323296	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
146464	NC_021285	ATA	2	6	5323319	5323324	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
146465	NC_021285	T	6	6	5323325	5323330	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
146466	NC_021285	A	7	7	5323373	5323379	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
146467	NC_021285	CATG	2	8	5323408	5323415	25 %	25 %	25 %	25 %	528986736
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146469	NC_021285	CCTG	2	8	5323467	5323474	0 %	25 %	25 %	50 %	528986736
146470	NC_021285	GTC	2	6	5323512	5323517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528986736
146471	NC_021285	CGC	2	6	5323523	5323528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528986736
146472	NC_021285	CGT	2	6	5323544	5323549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528986736
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146474	NC_021285	GCA	2	6	5323577	5323582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528986736
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146484	NC_021285	GC	3	6	5323972	5323977	0 %	0 %	50 %	50 %	528986736
146485	NC_021285	ACG	2	6	5323987	5323992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528986736
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146487	NC_021285	CG	3	6	5324185	5324190	0 %	0 %	50 %	50 %	528986736
146488	NC_021285	CGG	2	6	5324197	5324202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528986736
146489	NC_021285	GAA	2	6	5324243	5324248	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528986736
146490	NC_021285	CTA	2	6	5324279	5324284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528986736
146491	NC_021285	GGT	2	6	5324288	5324293	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528986736
146492	NC_021285	CCGGC	2	10	5324299	5324308	0 %	0 %	40 %	60 %	528986736
146493	NC_021285	GC	3	6	5324350	5324355	0 %	0 %	50 %	50 %	528986736
146494	NC_021285	CAG	2	6	5324385	5324390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528986736
146495	NC_021285	CA	3	6	5324398	5324403	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
146496	NC_021285	GAA	2	6	5324412	5324417	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
146497	NC_021285	CGA	2	6	5324454	5324459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528986737
146498	NC_021285	CGCT	2	8	5324563	5324570	0 %	25 %	25 %	50 %	528986737
146499	NC_021285	CAT	2	6	5324598	5324603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528986737
146500	NC_021285	CGA	2	6	5324610	5324615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528986737

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