MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Amycolatopsis orientalis HCCB10007

Total Repeats: 239523

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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39003	NC_021252	TCG	2	6	1446948	1446953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506929951
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39102	NC_021252	GCCG	2	8	1451203	1451210	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39103	NC_021252	GC	3	6	1451212	1451217	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39104	NC_021252	CCGG	2	8	1451231	1451238	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39105	NC_021252	TCG	2	6	1451283	1451288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506929953
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39115	NC_021252	CCG	2	6	1451742	1451747	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506929953
39116	NC_021252	CGG	2	6	1451830	1451835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506929953
39117	NC_021252	GTC	2	6	1451941	1451946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506929953
39118	NC_021252	CGT	2	6	1451953	1451958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506929953
39119	NC_021252	CGACA	2	10	1451974	1451983	40 %	0 %	20 %	40 %	506929953
39120	NC_021252	CCG	2	6	1451984	1451989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506929953
39121	NC_021252	ACC	2	6	1452251	1452256	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	506929953
39122	NC_021252	CCG	2	6	1452297	1452302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506929953
39123	NC_021252	CGG	2	6	1452385	1452390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506929953
39124	NC_021252	CGT	2	6	1452427	1452432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506929953
39125	NC_021252	GC	3	6	1452435	1452440	0 %	0 %	50 %	50 %	506929953
39126	NC_021252	TCG	2	6	1452510	1452515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506929953
39127	NC_021252	CGA	2	6	1452520	1452525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506929953
39128	NC_021252	GCACC	2	10	1452528	1452537	20 %	0 %	20 %	60 %	506929953
39129	NC_021252	GGT	2	6	1452538	1452543	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	506929953
39130	NC_021252	GGT	3	9	1452547	1452555	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	506929953
39131	NC_021252	GCAC	2	8	1452711	1452718	25 %	0 %	25 %	50 %	506929953
39132	NC_021252	CG	3	6	1452731	1452736	0 %	0 %	50 %	50 %	506929953
39133	NC_021252	CGG	2	6	1452759	1452764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506929953
39134	NC_021252	GGC	2	6	1452770	1452775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506929953
39135	NC_021252	TCG	2	6	1452786	1452791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506929953
39136	NC_021252	CGC	2	6	1452795	1452800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506929953
39137	NC_021252	CGG	2	6	1452855	1452860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506929953
39138	NC_021252	ACG	2	6	1452906	1452911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506929953
39139	NC_021252	CGA	3	9	1452916	1452924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506929953
39140	NC_021252	ACT	2	6	1452930	1452935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	506929953
39141	NC_021252	CGG	2	6	1452991	1452996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506929953
39142	NC_021252	ATC	2	6	1452998	1453003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	506929953
39143	NC_021252	CGA	2	6	1453009	1453014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506929953
39144	NC_021252	CGG	2	6	1453032	1453037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506929953
39145	NC_021252	CGG	2	6	1453054	1453059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506929953
39146	NC_021252	CCG	2	6	1453065	1453070	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506929953
39147	NC_021252	AGCCGG	2	12	1453071	1453082	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	506929953
39148	NC_021252	AAG	3	9	1453091	1453099	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	506929953
39149	NC_021252	GAA	2	6	1453108	1453113	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	506929953
39150	NC_021252	GAA	2	6	1453123	1453128	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	506929953
39151	NC_021252	CTCGG	2	10	1453166	1453175	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
39152	NC_021252	CGC	2	6	1453176	1453181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
39153	NC_021252	GCG	2	6	1453345	1453350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
39154	NC_021252	TCGCG	2	10	1453470	1453479	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
39155	NC_021252	TGG	2	6	1453572	1453577	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	506929954
39156	NC_021252	AGG	2	6	1453629	1453634	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	506929954
39157	NC_021252	CGCC	2	8	1453648	1453655	0 %	0 %	25 %	75 %	506929954
39158	NC_021252	GGCT	2	8	1453685	1453692	0 %	25 %	50 %	25 %	506929954
39159	NC_021252	ACC	2	6	1453694	1453699	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	506929954
39160	NC_021252	GTC	2	6	1453700	1453705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506929954
39161	NC_021252	ACG	2	6	1453761	1453766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506929954
39162	NC_021252	GCC	2	6	1453768	1453773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506929954
39163	NC_021252	GCT	2	6	1453777	1453782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506929954
39164	NC_021252	CGA	2	6	1453789	1453794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506929954
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39166	NC_021252	GCT	2	6	1453813	1453818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506929954
39167	NC_021252	TCGG	2	8	1453826	1453833	0 %	25 %	50 %	25 %	506929954
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39169	NC_021252	CGGCC	2	10	1453864	1453873	0 %	0 %	40 %	60 %	506929954
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39171	NC_021252	CGG	2	6	1453947	1453952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506929954
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39173	NC_021252	CGA	2	6	1454011	1454016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506929954
39174	NC_021252	CGT	2	6	1454032	1454037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506929954
39175	NC_021252	GCC	2	6	1454054	1454059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506929954
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39177	NC_021252	GCC	2	6	1454192	1454197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506929954
39178	NC_021252	CAC	2	6	1454200	1454205	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	506929954
39179	NC_021252	TCGTG	2	10	1454238	1454247	0 %	40 %	40 %	20 %	506929954
39180	NC_021252	GCT	2	6	1454263	1454268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506929954
39181	NC_021252	TCG	2	6	1454289	1454294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506929954
39182	NC_021252	TCG	2	6	1454304	1454309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506929954
39183	NC_021252	TCGCC	2	10	1454335	1454344	0 %	20 %	20 %	60 %	506929954
39184	NC_021252	TCC	2	6	1454369	1454374	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	506929954
39185	NC_021252	TCG	2	6	1454375	1454380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506929954
39186	NC_021252	AAGT	2	8	1454381	1454388	50 %	25 %	25 %	0 %	506929954
39187	NC_021252	CGA	2	6	1454395	1454400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39188	NC_021252	GCCA	2	8	1454544	1454551	25 %	0 %	25 %	50 %	506929955
39189	NC_021252	GCT	2	6	1454560	1454565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506929955
39190	NC_021252	CGCGC	2	10	1454676	1454685	0 %	0 %	40 %	60 %	506929955
39191	NC_021252	CGA	2	6	1454735	1454740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506929955
39192	NC_021252	GCC	3	9	1454751	1454759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506929955
39193	NC_021252	ACG	3	9	1454767	1454775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506929955
39194	NC_021252	AGC	2	6	1454776	1454781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506929955
39195	NC_021252	TCA	2	6	1454809	1454814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	506929955
39196	NC_021252	TCA	2	6	1454836	1454841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	506929955
39197	NC_021252	CCG	2	6	1454851	1454856	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506929955
39198	NC_021252	TCG	2	6	1454910	1454915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506929956
39199	NC_021252	CTG	2	6	1454921	1454926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506929956
39200	NC_021252	GGGC	2	8	1455000	1455007	0 %	0 %	75 %	25 %	506929956
39201	NC_021252	GGT	2	6	1455049	1455054	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	506929956
39202	NC_021252	GCT	2	6	1455091	1455096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506929956
39203	NC_021252	GGC	2	6	1455124	1455129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506929956
39204	NC_021252	GGCG	2	8	1455151	1455158	0 %	0 %	75 %	25 %	506929956
39205	NC_021252	GTC	2	6	1455164	1455169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506929956
39206	NC_021252	CGC	2	6	1455179	1455184	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506929956
39207	NC_021252	TCG	2	6	1455234	1455239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506929956
39208	NC_021252	CGA	2	6	1455351	1455356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506929957
39209	NC_021252	GGCCGT	2	12	1455358	1455369	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	506929957
39210	NC_021252	CTC	2	6	1455377	1455382	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	506929957
39211	NC_021252	CAT	2	6	1455404	1455409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	506929957
39212	NC_021252	TCA	2	6	1455424	1455429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	506929957
39213	NC_021252	CACGAA	2	12	1455479	1455490	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	506929957
39214	NC_021252	CAG	2	6	1455551	1455556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506929957
39215	NC_021252	CCG	2	6	1455562	1455567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506929957
39216	NC_021252	AGA	2	6	1455592	1455597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	506929957
39217	NC_021252	ACG	2	6	1455600	1455605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506929957
39218	NC_021252	TCG	2	6	1455610	1455615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506929957
39219	NC_021252	CAC	2	6	1455650	1455655	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	506929957
39220	NC_021252	GAA	2	6	1455680	1455685	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	506929957
39221	NC_021252	ATC	2	6	1455699	1455704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	506929957
39222	NC_021252	GGA	2	6	1455721	1455726	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	506929957
39223	NC_021252	GCCCGC	2	12	1455773	1455784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506929957
39224	NC_021252	GCCC	2	8	1455794	1455801	0 %	0 %	25 %	75 %	506929957
39225	NC_021252	CTGC	2	8	1455803	1455810	0 %	25 %	25 %	50 %	506929957
39226	NC_021252	CGC	2	6	1455815	1455820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506929957
39227	NC_021252	GCC	2	6	1455821	1455826	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506929957
39228	NC_021252	CG	3	6	1455904	1455909	0 %	0 %	50 %	50 %	506929957
39229	NC_021252	CG	3	6	1455915	1455920	0 %	0 %	50 %	50 %	506929957
39230	NC_021252	CGA	2	6	1455931	1455936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506929957
39231	NC_021252	CCA	2	6	1455953	1455958	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	506929957
39232	NC_021252	AGA	2	6	1455967	1455972	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	506929957
39233	NC_021252	GCC	2	6	1455980	1455985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506929957
39234	NC_021252	AGT	2	6	1456054	1456059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	506929957
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39238	NC_021252	GAT	2	6	1456226	1456231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	506929957
39239	NC_021252	AGG	2	6	1456239	1456244	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	506929957
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39242	NC_021252	GC	3	6	1456300	1456305	0 %	0 %	50 %	50 %	506929957
39243	NC_021252	GCCGA	2	10	1456323	1456332	20 %	0 %	40 %	40 %	506929957
39244	NC_021252	ATG	2	6	1456353	1456358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	506929957
39245	NC_021252	GCG	2	6	1456405	1456410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506929957
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39247	NC_021252	CGA	2	6	1456474	1456479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506929957
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39250	NC_021252	TCG	2	6	1456548	1456553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506929957
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39258	NC_021252	CGT	2	6	1456807	1456812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506929957
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39265	NC_021252	CGA	2	6	1457023	1457028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506929957
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39268	NC_021252	CG	3	6	1457089	1457094	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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39345	NC_021252	GC	3	6	1459784	1459789	0 %	0 %	50 %	50 %	506929961
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39349	NC_021252	CGG	2	6	1459975	1459980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506929961
39350	NC_021252	ACG	2	6	1460076	1460081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506929961
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39352	NC_021252	CGG	2	6	1460095	1460100	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506929961
39353	NC_021252	GACC	2	8	1460113	1460120	25 %	0 %	25 %	50 %	506929961
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39384	NC_021252	AGGG	2	8	1461120	1461127	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
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39451	NC_021252	CTCG	2	8	1464523	1464530	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
39452	NC_021252	CG	3	6	1464567	1464572	0 %	0 %	50 %	50 %	506929966
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39463	NC_021252	ATGA	2	8	1464893	1464900	50 %	25 %	25 %	0 %	506929966
39464	NC_021252	GCC	2	6	1464905	1464910	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506929966
39465	NC_021252	TCA	2	6	1464913	1464918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	506929966
39466	NC_021252	GC	3	6	1464975	1464980	0 %	0 %	50 %	50 %	506929966
39467	NC_021252	GTT	2	6	1465031	1465036	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	506929966
39468	NC_021252	GCC	2	6	1465051	1465056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506929966
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39472	NC_021252	CGG	2	6	1465129	1465134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506929966
39473	NC_021252	GCC	2	6	1465136	1465141	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506929966
39474	NC_021252	CCT	2	6	1465144	1465149	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	506929966
39475	NC_021252	CGA	2	6	1465159	1465164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506929966
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39478	NC_021252	GTG	2	6	1465278	1465283	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	506929966
39479	NC_021252	CGG	3	9	1465324	1465332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
39480	NC_021252	GC	3	6	1465382	1465387	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39481	NC_021252	CGG	2	6	1465419	1465424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
39482	NC_021252	AGCCG	2	10	1465448	1465457	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
39483	NC_021252	ATCGG	2	10	1465483	1465492	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
39484	NC_021252	GCC	2	6	1465506	1465511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
39485	NC_021252	GCG	2	6	1465514	1465519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
39486	NC_021252	CGC	2	6	1465535	1465540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
39487	NC_021252	GCG	2	6	1465579	1465584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
39488	NC_021252	CAG	2	6	1465602	1465607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39489	NC_021252	TCCA	2	8	1465674	1465681	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
39490	NC_021252	GA	3	6	1465691	1465696	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
39491	NC_021252	GCA	2	6	1465721	1465726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39492	NC_021252	GAC	2	6	1465737	1465742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39493	NC_021252	GCG	2	6	1465806	1465811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
39494	NC_021252	GAC	2	6	1465869	1465874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39495	NC_021252	CG	4	8	1465877	1465884	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39496	NC_021252	CGG	2	6	1465922	1465927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
39497	NC_021252	GGT	2	6	1465938	1465943	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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39499	NC_021252	GCCA	2	8	1466019	1466026	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
39500	NC_021252	GCG	2	6	1466095	1466100	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding

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