MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Amycolatopsis orientalis HCCB10007

Total Repeats: 239523

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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38004	NC_021252	CGA	2	6	1407028	1407033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506929916
38005	NC_021252	CGA	2	6	1407097	1407102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506929916
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38117	NC_021252	ACG	2	6	1411203	1411208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506929920
38118	NC_021252	CGG	2	6	1411265	1411270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506929920
38119	NC_021252	CGC	2	6	1411276	1411281	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506929920
38120	NC_021252	GAG	2	6	1411304	1411309	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	506929920
38121	NC_021252	CG	3	6	1411396	1411401	0 %	0 %	50 %	50 %	506929920
38122	NC_021252	GCT	2	6	1411411	1411416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506929920
38123	NC_021252	GGCG	2	8	1411417	1411424	0 %	0 %	75 %	25 %	506929920
38124	NC_021252	CGA	2	6	1411465	1411470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506929920
38125	NC_021252	GC	3	6	1411482	1411487	0 %	0 %	50 %	50 %	506929920
38126	NC_021252	CTG	3	9	1411523	1411531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506929920
38127	NC_021252	TCG	2	6	1411545	1411550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506929920
38128	NC_021252	TGG	3	9	1411551	1411559	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	506929920
38129	NC_021252	GCG	2	6	1411579	1411584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506929920
38130	NC_021252	CAC	2	6	1411598	1411603	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	506929920
38131	NC_021252	GAA	2	6	1411604	1411609	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	506929920
38132	NC_021252	GCG	2	6	1411694	1411699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506929920
38133	NC_021252	GAA	2	6	1411760	1411765	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	506929920
38134	NC_021252	GGA	2	6	1411771	1411776	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	506929920
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38137	NC_021252	ACA	2	6	1411845	1411850	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	506929920
38138	NC_021252	TGC	2	6	1411902	1411907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506929920
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38142	NC_021252	CG	3	6	1412018	1412023	0 %	0 %	50 %	50 %	506929920
38143	NC_021252	CTG	2	6	1412033	1412038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506929920
38144	NC_021252	CTG	2	6	1412042	1412047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506929920
38145	NC_021252	CGC	2	6	1412062	1412067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506929920
38146	NC_021252	CCG	2	6	1412091	1412096	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506929920
38147	NC_021252	ATC	2	6	1412101	1412106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	506929920
38148	NC_021252	GGC	2	6	1412130	1412135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506929920
38149	NC_021252	GAT	2	6	1412153	1412158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	506929920
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38151	NC_021252	GAG	2	6	1412228	1412233	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	506929920
38152	NC_021252	ACG	2	6	1412273	1412278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38153	NC_021252	GCG	2	6	1412287	1412292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
38154	NC_021252	GGCT	2	8	1412306	1412313	0 %	25 %	50 %	25 %	506929921
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38173	NC_021252	GTCG	2	8	1412986	1412993	0 %	25 %	50 %	25 %	506929921
38174	NC_021252	CTA	2	6	1412995	1413000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	506929921
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38179	NC_021252	CGC	2	6	1413162	1413167	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506929921
38180	NC_021252	C	6	6	1413188	1413193	0 %	0 %	0 %	100 %	506929921
38181	NC_021252	AGG	2	6	1413195	1413200	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	506929921
38182	NC_021252	CGT	2	6	1413243	1413248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506929921
38183	NC_021252	AGC	2	6	1413252	1413257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506929921
38184	NC_021252	CAG	2	6	1413302	1413307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506929921
38185	NC_021252	AGA	2	6	1413435	1413440	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	506929921
38186	NC_021252	GCG	2	6	1413466	1413471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506929921
38187	NC_021252	CTG	2	6	1413482	1413487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506929921
38188	NC_021252	CTG	2	6	1413569	1413574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506929921
38189	NC_021252	GAAGA	2	10	1413653	1413662	60 %	0 %	40 %	0 %	506929921
38190	NC_021252	GGC	2	6	1413760	1413765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506929921
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38192	NC_021252	CGT	2	6	1413811	1413816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506929921
38193	NC_021252	TCCG	2	8	1413899	1413906	0 %	25 %	25 %	50 %	506929921
38194	NC_021252	GC	3	6	1413927	1413932	0 %	0 %	50 %	50 %	506929921
38195	NC_021252	CGA	2	6	1413952	1413957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506929921
38196	NC_021252	CGT	2	6	1414079	1414084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506929922
38197	NC_021252	GGT	2	6	1414088	1414093	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	506929922
38198	NC_021252	GAT	2	6	1414112	1414117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	506929922
38199	NC_021252	CG	3	6	1414122	1414127	0 %	0 %	50 %	50 %	506929922
38200	NC_021252	ATCCGC	2	12	1414135	1414146	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	506929922
38201	NC_021252	CGC	2	6	1414160	1414165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506929922
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38203	NC_021252	TTC	2	6	1414206	1414211	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	506929922
38204	NC_021252	GAA	2	6	1414247	1414252	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	506929922
38205	NC_021252	CCG	2	6	1414358	1414363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506929922
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38207	NC_021252	GTC	2	6	1414410	1414415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506929922
38208	NC_021252	ACC	2	6	1414440	1414445	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	506929922
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38210	NC_021252	GCC	2	6	1414712	1414717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506929923
38211	NC_021252	GCT	2	6	1414786	1414791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506929923
38212	NC_021252	GCG	2	6	1414796	1414801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506929923
38213	NC_021252	TCG	2	6	1414842	1414847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506929923
38214	NC_021252	CAC	2	6	1414918	1414923	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	506929923
38215	NC_021252	ACG	2	6	1414926	1414931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506929923
38216	NC_021252	CCG	3	9	1414935	1414943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506929923
38217	NC_021252	GCC	2	6	1415026	1415031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506929924
38218	NC_021252	AG	4	8	1415034	1415041	50 %	0 %	50 %	0 %	506929924
38219	NC_021252	GCGG	2	8	1415136	1415143	0 %	0 %	75 %	25 %	506929924
38220	NC_021252	TGC	2	6	1415168	1415173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506929924
38221	NC_021252	GTG	2	6	1415299	1415304	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	506929924
38222	NC_021252	GAG	2	6	1415311	1415316	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	506929924
38223	NC_021252	GCGA	2	8	1415338	1415345	25 %	0 %	50 %	25 %	506929924
38224	NC_021252	CTG	2	6	1415359	1415364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506929924
38225	NC_021252	ATC	2	6	1415366	1415371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	506929924
38226	NC_021252	CGG	2	6	1415372	1415377	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506929924
38227	NC_021252	CGCC	2	8	1415403	1415410	0 %	0 %	25 %	75 %	506929924
38228	NC_021252	CAGCGG	2	12	1415425	1415436	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	506929924
38229	NC_021252	CCG	2	6	1415519	1415524	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506929924
38230	NC_021252	GAG	2	6	1415770	1415775	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38231	NC_021252	GCC	2	6	1415793	1415798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
38232	NC_021252	AGGGG	2	10	1415813	1415822	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
38233	NC_021252	TCG	2	6	1415892	1415897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506929925
38234	NC_021252	CGA	2	6	1415914	1415919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506929925
38235	NC_021252	CTG	2	6	1415921	1415926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506929925
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38240	NC_021252	GAT	2	6	1416292	1416297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	506929925
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38245	NC_021252	TCGC	2	8	1416562	1416569	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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38247	NC_021252	GCCGG	2	10	1416594	1416603	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
38248	NC_021252	G	6	6	1416622	1416627	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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38252	NC_021252	CGG	2	6	1416877	1416882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506929926
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38348	NC_021252	GCA	2	6	1420548	1420553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506929929
38349	NC_021252	GCA	2	6	1420587	1420592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506929929
38350	NC_021252	CAG	2	6	1420609	1420614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506929929
38351	NC_021252	GCG	2	6	1420625	1420630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506929929
38352	NC_021252	TGC	2	6	1420679	1420684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506929929
38353	NC_021252	GTT	2	6	1420737	1420742	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	506929930
38354	NC_021252	CGC	2	6	1420773	1420778	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506929930
38355	NC_021252	CGC	2	6	1420821	1420826	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506929930
38356	NC_021252	CGA	2	6	1420862	1420867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506929930
38357	NC_021252	CAG	3	9	1420905	1420913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506929930
38358	NC_021252	CGG	2	6	1420928	1420933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506929930
38359	NC_021252	CGC	2	6	1420955	1420960	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506929930
38360	NC_021252	GCC	2	6	1420977	1420982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506929930
38361	NC_021252	CG	3	6	1420994	1420999	0 %	0 %	50 %	50 %	506929930
38362	NC_021252	CAG	2	6	1421001	1421006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506929930
38363	NC_021252	CGA	2	6	1421012	1421017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506929930
38364	NC_021252	CAG	2	6	1421019	1421024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506929930
38365	NC_021252	CAGCAC	2	12	1421109	1421120	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	506929930
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38367	NC_021252	CAC	2	6	1421136	1421141	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	506929930
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38371	NC_021252	GCG	2	6	1421374	1421379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506929931
38372	NC_021252	CGA	2	6	1421380	1421385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506929931
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38376	NC_021252	CGA	2	6	1421672	1421677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506929931
38377	NC_021252	CCG	3	9	1421679	1421687	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506929931
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38382	NC_021252	CGA	2	6	1421851	1421856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506929931
38383	NC_021252	TTGCCG	2	12	1421883	1421894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506929931
38384	NC_021252	GGCCGA	2	12	1421911	1421922	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	506929931
38385	NC_021252	GCC	2	6	1421927	1421932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506929931
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38387	NC_021252	CCG	3	9	1422021	1422029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506929931
38388	NC_021252	TCG	2	6	1422075	1422080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506929931
38389	NC_021252	GCC	2	6	1422132	1422137	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506929931
38390	NC_021252	CT	3	6	1422179	1422184	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38391	NC_021252	GAG	2	6	1422269	1422274	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38392	NC_021252	CTC	2	6	1422311	1422316	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	506929932
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38394	NC_021252	CGT	2	6	1422370	1422375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506929932
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38400	NC_021252	CT	3	6	1422623	1422628	0 %	50 %	0 %	50 %	506929932
38401	NC_021252	CGA	2	6	1422685	1422690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506929932
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38404	NC_021252	CGG	2	6	1422720	1422725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506929932
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38413	NC_021252	CTG	2	6	1422989	1422994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506929932
38414	NC_021252	GAC	2	6	1423004	1423009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506929932
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38416	NC_021252	GACCTC	2	12	1423031	1423042	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	506929932
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38418	NC_021252	TGC	2	6	1423098	1423103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506929932
38419	NC_021252	TGA	2	6	1423185	1423190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	506929932
38420	NC_021252	CAG	2	6	1423213	1423218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506929932
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38422	NC_021252	CTG	2	6	1423286	1423291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506929932
38423	NC_021252	GC	3	6	1423357	1423362	0 %	0 %	50 %	50 %	506929932
38424	NC_021252	CG	3	6	1423374	1423379	0 %	0 %	50 %	50 %	506929932
38425	NC_021252	CGG	2	6	1423389	1423394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506929932
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38433	NC_021252	GCG	2	6	1423759	1423764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506929932
38434	NC_021252	GGC	2	6	1423766	1423771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506929932
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38437	NC_021252	TCG	3	9	1423838	1423846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506929933
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38451	NC_021252	CG	3	6	1424373	1424378	0 %	0 %	50 %	50 %	506929933
38452	NC_021252	GC	3	6	1424384	1424389	0 %	0 %	50 %	50 %	506929933
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38455	NC_021252	GC	3	6	1424576	1424581	0 %	0 %	50 %	50 %	506929934
38456	NC_021252	GGC	2	6	1424600	1424605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506929934
38457	NC_021252	TCG	2	6	1424613	1424618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506929934
38458	NC_021252	TGC	3	9	1424634	1424642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506929934
38459	NC_021252	TCG	2	6	1424643	1424648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506929934
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38461	NC_021252	CCGG	2	8	1424756	1424763	0 %	0 %	50 %	50 %	506929934
38462	NC_021252	CGGG	2	8	1424765	1424772	0 %	0 %	75 %	25 %	506929934
38463	NC_021252	GGCG	2	8	1424785	1424792	0 %	0 %	75 %	25 %	506929934
38464	NC_021252	CAG	2	6	1424807	1424812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506929934
38465	NC_021252	GCG	2	6	1424816	1424821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506929934
38466	NC_021252	GC	3	6	1424832	1424837	0 %	0 %	50 %	50 %	506929934
38467	NC_021252	GCCA	2	8	1424841	1424848	25 %	0 %	25 %	50 %	506929934
38468	NC_021252	GTC	2	6	1424858	1424863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506929934
38469	NC_021252	TCG	2	6	1424877	1424882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506929934
38470	NC_021252	GTC	2	6	1424897	1424902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506929934
38471	NC_021252	TGCT	2	8	1424937	1424944	0 %	50 %	25 %	25 %	506929934
38472	NC_021252	TCG	2	6	1425027	1425032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506929934
38473	NC_021252	GAT	2	6	1425171	1425176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38474	NC_021252	CGG	2	6	1425240	1425245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506929935
38475	NC_021252	CGT	2	6	1425270	1425275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506929935
38476	NC_021252	CAC	2	6	1425314	1425319	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	506929935
38477	NC_021252	GCTCGC	2	12	1425354	1425365	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	506929935
38478	NC_021252	GCG	3	9	1425466	1425474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506929935
38479	NC_021252	CTG	2	6	1425529	1425534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506929935
38480	NC_021252	CCGG	2	8	1425538	1425545	0 %	0 %	50 %	50 %	506929935
38481	NC_021252	CGA	2	6	1425560	1425565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506929935
38482	NC_021252	GAT	2	6	1425591	1425596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	506929935
38483	NC_021252	CTGC	2	8	1425717	1425724	0 %	25 %	25 %	50 %	506929935
38484	NC_021252	ACC	2	6	1425767	1425772	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	506929935
38485	NC_021252	TCACCG	2	12	1425797	1425808	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	506929935
38486	NC_021252	GCC	2	6	1425841	1425846	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506929935
38487	NC_021252	CGG	2	6	1425854	1425859	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506929935
38488	NC_021252	CCG	2	6	1425860	1425865	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506929935
38489	NC_021252	CGC	2	6	1425879	1425884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506929935
38490	NC_021252	GTCGCC	2	12	1425906	1425917	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	506929935
38491	NC_021252	GCC	3	9	1425961	1425969	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506929935
38492	NC_021252	GTC	2	6	1425970	1425975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506929935
38493	NC_021252	TAC	2	6	1426024	1426029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	506929935
38494	NC_021252	TCG	2	6	1426052	1426057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506929935
38495	NC_021252	CGC	2	6	1426076	1426081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506929935
38496	NC_021252	GACC	2	8	1426125	1426132	25 %	0 %	25 %	50 %	506929935
38497	NC_021252	CGG	2	6	1426137	1426142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506929935
38498	NC_021252	CG	3	6	1426143	1426148	0 %	0 %	50 %	50 %	506929935
38499	NC_021252	ATC	2	6	1426177	1426182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	506929935
38500	NC_021252	CGA	2	6	1426215	1426220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506929935

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