MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Amycolatopsis orientalis HCCB10007

Total Repeats: 239523

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2502	NC_021252	TCG	2	6	92658	92663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506928642
2503	NC_021252	CGG	2	6	92682	92687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506928642
2504	NC_021252	GC	3	6	92699	92704	0 %	0 %	50 %	50 %	506928642
2505	NC_021252	TCT	2	6	92859	92864	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	506928642
2506	NC_021252	GTC	2	6	92930	92935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506928642
2507	NC_021252	CGA	2	6	93089	93094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506928643
2508	NC_021252	TGG	2	6	93103	93108	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	506928643
2509	NC_021252	TCG	2	6	93133	93138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506928643
2510	NC_021252	CGA	2	6	93224	93229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506928643
2511	NC_021252	GCC	2	6	93259	93264	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506928643
2512	NC_021252	CAG	2	6	93282	93287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506928643
2513	NC_021252	GTG	2	6	93330	93335	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	506928643
2514	NC_021252	AAG	3	9	93357	93365	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	506928643
2515	NC_021252	CGA	2	6	93368	93373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506928643
2516	NC_021252	GAG	2	6	93381	93386	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	506928643
2517	NC_021252	ATG	2	6	93387	93392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	506928643
2518	NC_021252	CGG	2	6	93449	93454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506928643
2519	NC_021252	GCA	3	9	93455	93463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506928643
2520	NC_021252	GCGTCG	2	12	93466	93477	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	506928643
2521	NC_021252	CG	3	6	93476	93481	0 %	0 %	50 %	50 %	506928643
2522	NC_021252	TGC	2	6	93505	93510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506928643
2523	NC_021252	CTG	2	6	93570	93575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506928643
2524	NC_021252	GACC	2	8	93584	93591	25 %	0 %	25 %	50 %	506928643
2525	NC_021252	GAA	2	6	93593	93598	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	506928643
2526	NC_021252	CGA	2	6	93626	93631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506928643
2527	NC_021252	CGA	2	6	93725	93730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506928643
2528	NC_021252	TCG	2	6	93745	93750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506928643
2529	NC_021252	AGC	2	6	93769	93774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506928643
2530	NC_021252	GCT	2	6	93779	93784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506928643
2531	NC_021252	CAG	2	6	93870	93875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506928643
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2533	NC_021252	GGTG	2	8	93922	93929	0 %	25 %	75 %	0 %	506928643
2534	NC_021252	GGC	2	6	94044	94049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506928643
2535	NC_021252	CGA	2	6	94114	94119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506928643
2536	NC_021252	CAG	2	6	94122	94127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506928643
2537	NC_021252	GAG	2	6	94134	94139	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	506928643
2538	NC_021252	CGA	2	6	94145	94150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506928643
2539	NC_021252	CGG	2	6	94156	94161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506928643
2540	NC_021252	TCG	2	6	94211	94216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506928644
2541	NC_021252	CGC	2	6	94252	94257	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506928644
2542	NC_021252	TGC	2	6	94260	94265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506928644
2543	NC_021252	TCG	2	6	94269	94274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506928644
2544	NC_021252	CAG	2	6	94297	94302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506928644
2545	NC_021252	CGC	2	6	94336	94341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506928644
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2548	NC_021252	CGT	2	6	94381	94386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506928644
2549	NC_021252	GCG	2	6	94457	94462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506928644
2550	NC_021252	CCGCGC	2	12	94497	94508	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506928644
2551	NC_021252	GTGCTG	2	12	94514	94525	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	506928644
2552	NC_021252	CGG	2	6	94549	94554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506928644
2553	NC_021252	CGC	2	6	94564	94569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506928644
2554	NC_021252	GCT	2	6	94591	94596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506928644
2555	NC_021252	TGC	2	6	94602	94607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506928644
2556	NC_021252	GCA	2	6	94627	94632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506928644
2557	NC_021252	GGCC	2	8	94732	94739	0 %	0 %	50 %	50 %	506928644
2558	NC_021252	G	6	6	94798	94803	0 %	0 %	100 %	0 %	506928644
2559	NC_021252	CTG	2	6	94811	94816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506928644
2560	NC_021252	GCT	2	6	94888	94893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506928644
2561	NC_021252	TTC	2	6	94925	94930	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	506928644
2562	NC_021252	TGT	2	6	94984	94989	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	506928645
2563	NC_021252	CAT	2	6	95123	95128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	506928645
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2565	NC_021252	CGT	2	6	95174	95179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506928645
2566	NC_021252	TCG	2	6	95208	95213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506928645
2567	NC_021252	GCT	2	6	95222	95227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506928645
2568	NC_021252	GGCC	2	8	95228	95235	0 %	0 %	50 %	50 %	506928645
2569	NC_021252	ACCGGC	2	12	95259	95270	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	506928645
2570	NC_021252	TCCCCG	2	12	95296	95307	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	506928645
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2572	NC_021252	CGA	2	6	95345	95350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506928645
2573	NC_021252	ACT	2	6	95377	95382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	506928645
2574	NC_021252	CGC	2	6	95383	95388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506928645
2575	NC_021252	CGGCG	2	10	95426	95435	0 %	0 %	60 %	40 %	506928645
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2579	NC_021252	CGC	2	6	95543	95548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506928645
2580	NC_021252	CGAC	2	8	95653	95660	25 %	0 %	25 %	50 %	506928645
2581	NC_021252	GAC	2	6	95697	95702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506928645
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2583	NC_021252	ACGG	2	8	95741	95748	25 %	0 %	50 %	25 %	506928645
2584	NC_021252	CGC	3	9	95795	95803	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506928645
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2587	NC_021252	GTCGAC	2	12	95841	95852	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	506928645
2588	NC_021252	GAA	3	9	95888	95896	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	506928645
2589	NC_021252	TCA	2	6	95902	95907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	506928645
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2591	NC_021252	GCC	2	6	96053	96058	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506928646
2592	NC_021252	CCG	2	6	96061	96066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506928646
2593	NC_021252	CG	3	6	96065	96070	0 %	0 %	50 %	50 %	506928646
2594	NC_021252	GCT	2	6	96108	96113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506928646
2595	NC_021252	CTT	2	6	96172	96177	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	506928646
2596	NC_021252	CG	3	6	96212	96217	0 %	0 %	50 %	50 %	506928646
2597	NC_021252	CGC	2	6	96223	96228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506928646
2598	NC_021252	CTT	2	6	96274	96279	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	506928646
2599	NC_021252	GCG	2	6	96308	96313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506928646
2600	NC_021252	CGC	2	6	96316	96321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506928646
2601	NC_021252	TTC	2	6	96389	96394	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	506928646
2602	NC_021252	CTT	2	6	96397	96402	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	506928646
2603	NC_021252	GC	3	6	96442	96447	0 %	0 %	50 %	50 %	506928646
2604	NC_021252	TGT	2	6	96533	96538	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2605	NC_021252	CGCCC	2	10	96636	96645	0 %	0 %	20 %	80 %	506928647
2606	NC_021252	GCC	2	6	96652	96657	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506928647
2607	NC_021252	CAG	2	6	96658	96663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506928647
2608	NC_021252	CGCGA	2	10	96688	96697	20 %	0 %	40 %	40 %	506928647
2609	NC_021252	GCC	2	6	96766	96771	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506928647
2610	NC_021252	CGC	2	6	96801	96806	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506928647
2611	NC_021252	GC	3	6	96811	96816	0 %	0 %	50 %	50 %	506928647
2612	NC_021252	GC	3	6	96827	96832	0 %	0 %	50 %	50 %	506928647
2613	NC_021252	CGGCG	2	10	96859	96868	0 %	0 %	60 %	40 %	506928647
2614	NC_021252	CTC	2	6	96877	96882	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	506928647
2615	NC_021252	ACC	2	6	96958	96963	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	506928647
2616	NC_021252	TGA	2	6	96965	96970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	506928647
2617	NC_021252	CGG	2	6	97104	97109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506928647
2618	NC_021252	CGT	3	9	97131	97139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506928647
2619	NC_021252	CCTGG	2	10	97163	97172	0 %	20 %	40 %	40 %	506928647
2620	NC_021252	GC	3	6	97181	97186	0 %	0 %	50 %	50 %	506928647
2621	NC_021252	CCG	4	12	97232	97243	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506928647
2622	NC_021252	GAA	2	6	97249	97254	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	506928647
2623	NC_021252	TGG	2	6	97300	97305	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	506928647
2624	NC_021252	GTC	2	6	97351	97356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506928647
2625	NC_021252	GCGCC	2	10	97380	97389	0 %	0 %	40 %	60 %	506928647
2626	NC_021252	CGA	2	6	97431	97436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506928647
2627	NC_021252	CCG	2	6	97441	97446	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506928647
2628	NC_021252	CGG	2	6	97458	97463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506928647
2629	NC_021252	ATC	2	6	97480	97485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	506928647
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2631	NC_021252	CG	3	6	97547	97552	0 %	0 %	50 %	50 %	506928647
2632	NC_021252	GTCGAC	2	12	97564	97575	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	506928647
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2644	NC_021252	GACC	2	8	98142	98149	25 %	0 %	25 %	50 %	506928647
2645	NC_021252	GAG	2	6	98256	98261	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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2650	NC_021252	GCCG	2	8	98513	98520	0 %	0 %	50 %	50 %	506928648
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2663	NC_021252	GA	3	6	98986	98991	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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2701	NC_021252	CAG	2	6	100648	100653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2723	NC_021252	GC	3	6	101445	101450	0 %	0 %	50 %	50 %	506928651
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2728	NC_021252	ACGA	2	8	101618	101625	50 %	0 %	25 %	25 %	506928651
2729	NC_021252	CGCC	2	8	101637	101644	0 %	0 %	25 %	75 %	506928651
2730	NC_021252	GC	3	6	101667	101672	0 %	0 %	50 %	50 %	506928651
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2732	NC_021252	CGA	2	6	101737	101742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506928651
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2734	NC_021252	CGT	3	9	101773	101781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506928651
2735	NC_021252	GTC	2	6	101852	101857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506928651
2736	NC_021252	GGC	2	6	101922	101927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506928651
2737	NC_021252	GCTGC	2	10	101933	101942	0 %	20 %	40 %	40 %	506928651
2738	NC_021252	TCA	2	6	102055	102060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	506928652
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2740	NC_021252	TGC	2	6	102111	102116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506928652
2741	NC_021252	TCG	2	6	102189	102194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506928652
2742	NC_021252	CGC	2	6	102209	102214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506928652
2743	NC_021252	CGG	2	6	102222	102227	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506928652
2744	NC_021252	GCG	3	9	102240	102248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506928652
2745	NC_021252	TCGA	2	8	102294	102301	25 %	25 %	25 %	25 %	506928652
2746	NC_021252	ATC	2	6	102339	102344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	506928652
2747	NC_021252	GC	3	6	102345	102350	0 %	0 %	50 %	50 %	506928652
2748	NC_021252	GTC	2	6	102431	102436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506928652
2749	NC_021252	GA	3	6	102445	102450	50 %	0 %	50 %	0 %	506928652
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2752	NC_021252	CGC	2	6	102497	102502	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506928652
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2882	NC_021252	CACCG	2	10	107600	107609	20 %	0 %	20 %	60 %	506928657
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2976	NC_021252	CCCGCC	2	12	111069	111080	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
2977	NC_021252	TGC	2	6	111100	111105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506928661
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2979	NC_021252	GTG	2	6	111153	111158	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	506928661
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2982	NC_021252	CTGG	2	8	111245	111252	0 %	25 %	50 %	25 %	506928661
2983	NC_021252	GCT	2	6	111269	111274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506928661
2984	NC_021252	CTA	2	6	111332	111337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	506928661
2985	NC_021252	TGC	2	6	111370	111375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506928661
2986	NC_021252	TCG	2	6	111418	111423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506928661
2987	NC_021252	CGG	2	6	111434	111439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506928661
2988	NC_021252	TGGCGG	2	12	111448	111459	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	506928661
2989	NC_021252	GTT	2	6	111467	111472	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	506928661
2990	NC_021252	CGGGC	2	10	111504	111513	0 %	0 %	60 %	40 %	506928661
2991	NC_021252	GTC	2	6	111537	111542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506928661
2992	NC_021252	CGG	2	6	111553	111558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506928661
2993	NC_021252	GCC	2	6	111573	111578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506928661
2994	NC_021252	CGC	2	6	111588	111593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506928661
2995	NC_021252	CGA	2	6	111602	111607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506928661
2996	NC_021252	GCACCG	2	12	111608	111619	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	506928661
2997	NC_021252	ACG	2	6	111661	111666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506928661
2998	NC_021252	TCG	2	6	111667	111672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506928661
2999	NC_021252	GAT	2	6	111686	111691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	506928661
3000	NC_021252	CAGG	2	8	111699	111706	25 %	0 %	50 %	25 %	506928661

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