MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Amycolatopsis orientalis HCCB10007

Total Repeats: 239523

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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178002	NC_021252	CCG	2	6	6660246	6660251	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506934441
178003	NC_021252	CCG	2	6	6660427	6660432	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506934441
178004	NC_021252	CCA	2	6	6660463	6660468	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	506934441
178005	NC_021252	GCCG	2	8	6660485	6660492	0 %	0 %	50 %	50 %	506934441
178006	NC_021252	AGC	2	6	6660501	6660506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506934441
178007	NC_021252	CTG	2	6	6660521	6660526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506934441
178008	NC_021252	CCA	2	6	6660598	6660603	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	506934441
178009	NC_021252	GCT	2	6	6660646	6660651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506934441
178010	NC_021252	CCA	2	6	6660706	6660711	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	506934441
178011	NC_021252	GCC	2	6	6660717	6660722	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506934441
178012	NC_021252	CGC	2	6	6660775	6660780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506934441
178013	NC_021252	CCT	2	6	6660790	6660795	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	506934441
178014	NC_021252	GCC	2	6	6660797	6660802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506934441
178015	NC_021252	CCG	2	6	6660804	6660809	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506934441
178016	NC_021252	AGC	2	6	6660859	6660864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506934441
178017	NC_021252	TCCG	2	8	6660874	6660881	0 %	25 %	25 %	50 %	506934441
178018	NC_021252	TTG	2	6	6660897	6660902	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	506934441
178019	NC_021252	CCT	2	6	6660943	6660948	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
178020	NC_021252	CGC	2	6	6660968	6660973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
178021	NC_021252	CGA	2	6	6660974	6660979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
178022	NC_021252	CCG	2	6	6660986	6660991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
178023	NC_021252	GTCC	2	8	6661000	6661007	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
178024	NC_021252	GTC	2	6	6661042	6661047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506934442
178025	NC_021252	TCG	2	6	6661085	6661090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506934442
178026	NC_021252	GCC	2	6	6661116	6661121	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506934442
178027	NC_021252	CGGGT	2	10	6661153	6661162	0 %	20 %	60 %	20 %	506934442
178028	NC_021252	TCG	2	6	6661169	6661174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506934442
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178030	NC_021252	CG	3	6	6661397	6661402	0 %	0 %	50 %	50 %	506934442
178031	NC_021252	CCG	2	6	6661476	6661481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
178032	NC_021252	GCCG	2	8	6661497	6661504	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
178033	NC_021252	GA	3	6	6661521	6661526	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
178034	NC_021252	CAT	2	6	6661544	6661549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	506934443
178035	NC_021252	GGC	2	6	6661617	6661622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506934443
178036	NC_021252	AGC	2	6	6661681	6661686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506934443
178037	NC_021252	CCA	2	6	6661702	6661707	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	506934443
178038	NC_021252	GTC	2	6	6661803	6661808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506934443
178039	NC_021252	CGT	2	6	6661850	6661855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506934443
178040	NC_021252	CGT	2	6	6661874	6661879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506934443
178041	NC_021252	AGG	2	6	6661891	6661896	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	506934443
178042	NC_021252	GCC	2	6	6661953	6661958	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506934443
178043	NC_021252	TGG	2	6	6661963	6661968	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	506934443
178044	NC_021252	CGGC	2	8	6662173	6662180	0 %	0 %	50 %	50 %	506934444
178045	NC_021252	CAG	2	6	6662198	6662203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506934444
178046	NC_021252	CCG	2	6	6662238	6662243	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506934444
178047	NC_021252	CGC	2	6	6662273	6662278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506934444
178048	NC_021252	AGC	2	6	6662346	6662351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506934444
178049	NC_021252	CG	4	8	6662362	6662369	0 %	0 %	50 %	50 %	506934444
178050	NC_021252	CTC	2	6	6662411	6662416	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	506934444
178051	NC_021252	CAG	2	6	6662429	6662434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506934444
178052	NC_021252	GAA	2	6	6662476	6662481	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
178053	NC_021252	CGG	2	6	6662491	6662496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506934445
178054	NC_021252	CGC	3	9	6662510	6662518	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506934445
178055	NC_021252	CCGC	2	8	6662559	6662566	0 %	0 %	25 %	75 %	506934445
178056	NC_021252	TCACGT	2	12	6662647	6662658	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	506934445
178057	NC_021252	TGC	2	6	6662676	6662681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506934445
178058	NC_021252	CAG	2	6	6662696	6662701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506934445
178059	NC_021252	TCGA	2	8	6662748	6662755	25 %	25 %	25 %	25 %	506934445
178060	NC_021252	GTA	2	6	6662780	6662785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	506934445
178061	NC_021252	GCG	2	6	6662790	6662795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506934445
178062	NC_021252	TCG	2	6	6662853	6662858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506934445
178063	NC_021252	TCT	2	6	6662896	6662901	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	506934445
178064	NC_021252	CCG	2	6	6662999	6663004	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506934445
178065	NC_021252	CCG	2	6	6663007	6663012	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506934445
178066	NC_021252	CCA	2	6	6663013	6663018	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	506934445
178067	NC_021252	GCC	2	6	6663083	6663088	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506934445
178068	NC_021252	CGG	4	12	6663112	6663123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506934445
178069	NC_021252	CGA	2	6	6663136	6663141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506934445
178070	NC_021252	GCC	2	6	6663170	6663175	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506934445
178071	NC_021252	CG	3	6	6663239	6663244	0 %	0 %	50 %	50 %	506934445
178072	NC_021252	CAG	2	6	6663272	6663277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506934445
178073	NC_021252	CGT	2	6	6663283	6663288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506934445
178074	NC_021252	GC	4	8	6663289	6663296	0 %	0 %	50 %	50 %	506934445
178075	NC_021252	CGT	2	6	6663319	6663324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506934445
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178077	NC_021252	CGA	2	6	6663373	6663378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506934445
178078	NC_021252	CGC	2	6	6663392	6663397	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506934445
178079	NC_021252	TCC	2	6	6663414	6663419	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	506934445
178080	NC_021252	AGT	2	6	6663442	6663447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	506934445
178081	NC_021252	CG	3	6	6663464	6663469	0 %	0 %	50 %	50 %	506934445
178082	NC_021252	CGG	3	9	6663511	6663519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506934445
178083	NC_021252	GCG	2	6	6663538	6663543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506934445
178084	NC_021252	GAGG	2	8	6663574	6663581	25 %	0 %	75 %	0 %	506934445
178085	NC_021252	GCC	2	6	6663630	6663635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
178086	NC_021252	GTC	2	6	6663702	6663707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506934446
178087	NC_021252	AT	3	6	6663720	6663725	50 %	50 %	0 %	0 %	506934446
178088	NC_021252	AG	3	6	6663750	6663755	50 %	0 %	50 %	0 %	506934446
178089	NC_021252	CAT	2	6	6663762	6663767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	506934446
178090	NC_021252	CGA	3	9	6663769	6663777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506934446
178091	NC_021252	CGGC	2	8	6663795	6663802	0 %	0 %	50 %	50 %	506934446
178092	NC_021252	CGG	2	6	6663825	6663830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506934446
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178094	NC_021252	CGG	2	6	6663885	6663890	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506934446
178095	NC_021252	CGG	2	6	6663894	6663899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506934446
178096	NC_021252	CCGCG	2	10	6663924	6663933	0 %	0 %	40 %	60 %	506934446
178097	NC_021252	GCT	2	6	6663942	6663947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506934446
178098	NC_021252	AGC	2	6	6663953	6663958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506934446
178099	NC_021252	ATC	2	6	6663976	6663981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	506934446
178100	NC_021252	GCG	2	6	6664001	6664006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506934446
178101	NC_021252	CGA	2	6	6664059	6664064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506934446
178102	NC_021252	CAG	2	6	6664141	6664146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506934446
178103	NC_021252	ACG	2	6	6664178	6664183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506934446
178104	NC_021252	GGCG	2	8	6664212	6664219	0 %	0 %	75 %	25 %	506934446
178105	NC_021252	CGG	2	6	6664232	6664237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506934446
178106	NC_021252	CAG	2	6	6664270	6664275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506934446
178107	NC_021252	CGG	2	6	6664306	6664311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506934446
178108	NC_021252	ACG	2	6	6664360	6664365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506934447
178109	NC_021252	CTC	2	6	6664422	6664427	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	506934447
178110	NC_021252	GCC	2	6	6664454	6664459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506934447
178111	NC_021252	CGC	2	6	6664479	6664484	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506934447
178112	NC_021252	CGG	2	6	6664526	6664531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506934447
178113	NC_021252	TCA	2	6	6664553	6664558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	506934447
178114	NC_021252	GAA	2	6	6664587	6664592	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	506934447
178115	NC_021252	ATC	3	9	6664678	6664686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	506934447
178116	NC_021252	GCCC	2	8	6664688	6664695	0 %	0 %	25 %	75 %	506934447
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178221	NC_021252	GAT	2	6	6668427	6668432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	506934450
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178228	NC_021252	GAC	2	6	6668717	6668722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506934451
178229	NC_021252	CGCC	2	8	6668731	6668738	0 %	0 %	25 %	75 %	506934451
178230	NC_021252	CTT	2	6	6668747	6668752	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	506934451
178231	NC_021252	TTC	2	6	6668765	6668770	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	506934451
178232	NC_021252	CGG	2	6	6668781	6668786	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506934451
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178234	NC_021252	CGT	2	6	6668896	6668901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506934451
178235	NC_021252	GC	3	6	6669037	6669042	0 %	0 %	50 %	50 %	506934451
178236	NC_021252	GTA	2	6	6669044	6669049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	506934451
178237	NC_021252	CGA	2	6	6669052	6669057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506934451
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178239	NC_021252	CGA	2	6	6669101	6669106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506934451
178240	NC_021252	TCC	2	6	6669111	6669116	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	506934451
178241	NC_021252	TCT	2	6	6669142	6669147	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	506934451
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178245	NC_021252	CGG	2	6	6669247	6669252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506934452
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178251	NC_021252	GCG	3	9	6669528	6669536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506934452
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178255	NC_021252	CCGCG	2	10	6669784	6669793	0 %	0 %	40 %	60 %	506934452
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178260	NC_021252	CTG	2	6	6669857	6669862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506934452
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178264	NC_021252	CAG	2	6	6669932	6669937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506934452
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178267	NC_021252	GTG	2	6	6670039	6670044	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
178268	NC_021252	TCG	2	6	6670119	6670124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506934453
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178295	NC_021252	CGT	2	6	6670798	6670803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506934453
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178300	NC_021252	GT	3	6	6670897	6670902	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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178330	NC_021252	GAC	2	6	6671845	6671850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506934454
178331	NC_021252	GC	3	6	6671884	6671889	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
178332	NC_021252	CCG	2	6	6671896	6671901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
178333	NC_021252	TCG	2	6	6671919	6671924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
178334	NC_021252	CCG	2	6	6671998	6672003	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
178335	NC_021252	GAG	2	6	6672037	6672042	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
178336	NC_021252	GC	3	6	6672057	6672062	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
178337	NC_021252	AGTC	2	8	6672075	6672082	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
178338	NC_021252	TGA	2	6	6672148	6672153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
178339	NC_021252	GC	3	6	6672198	6672203	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
178340	NC_021252	CACGC	2	10	6672208	6672217	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
178341	NC_021252	CATGAC	2	12	6672238	6672249	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	506934455
178342	NC_021252	CGG	2	6	6672298	6672303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506934455
178343	NC_021252	CCG	2	6	6672310	6672315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506934455
178344	NC_021252	CGG	2	6	6672381	6672386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506934455
178345	NC_021252	GC	3	6	6672408	6672413	0 %	0 %	50 %	50 %	506934455
178346	NC_021252	CGC	2	6	6672417	6672422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506934455
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178350	NC_021252	GTG	2	6	6672566	6672571	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	506934455
178351	NC_021252	GTG	2	6	6672602	6672607	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	506934455
178352	NC_021252	TCGA	2	8	6672608	6672615	25 %	25 %	25 %	25 %	506934455
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178354	NC_021252	CGG	2	6	6672711	6672716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506934455
178355	NC_021252	CGG	2	6	6672761	6672766	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506934455
178356	NC_021252	GAG	2	6	6672770	6672775	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	506934455
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178359	NC_021252	GAC	2	6	6672936	6672941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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178363	NC_021252	GCTG	2	8	6673077	6673084	0 %	25 %	50 %	25 %	506934456
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178384	NC_021252	CAT	2	6	6673978	6673983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	506934457
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178451	NC_021252	CAG	2	6	6676370	6676375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506934459
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178454	NC_021252	AGT	2	6	6676593	6676598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	506934459
178455	NC_021252	CGA	2	6	6676637	6676642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506934459
178456	NC_021252	TCG	2	6	6676815	6676820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506934459
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178459	NC_021252	CGA	2	6	6676921	6676926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506934459
178460	NC_021252	TCGA	2	8	6676971	6676978	25 %	25 %	25 %	25 %	506934459
178461	NC_021252	CGG	2	6	6677008	6677013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506934459
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178482	NC_021252	CGA	2	6	6677788	6677793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506934460
178483	NC_021252	CGG	2	6	6677853	6677858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506934460
178484	NC_021252	ACTCC	2	10	6677905	6677914	20 %	20 %	0 %	60 %	506934460
178485	NC_021252	AGA	2	6	6677935	6677940	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	506934460
178486	NC_021252	CGGT	2	8	6677952	6677959	0 %	25 %	50 %	25 %	506934460
178487	NC_021252	GAC	2	6	6678008	6678013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506934460
178488	NC_021252	CTT	2	6	6678020	6678025	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	506934460
178489	NC_021252	CGG	2	6	6678085	6678090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506934460
178490	NC_021252	GT	3	6	6678146	6678151	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
178491	NC_021252	CTC	2	6	6678411	6678416	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	506934461
178492	NC_021252	TGA	2	6	6678437	6678442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	506934461
178493	NC_021252	CGGG	2	8	6678463	6678470	0 %	0 %	75 %	25 %	506934461
178494	NC_021252	CGC	2	6	6678524	6678529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506934461
178495	NC_021252	CCG	2	6	6678573	6678578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506934461
178496	NC_021252	CCA	2	6	6678587	6678592	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	506934461
178497	NC_021252	CTC	2	6	6678697	6678702	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	506934462
178498	NC_021252	TGC	2	6	6678710	6678715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506934462
178499	NC_021252	GCG	2	6	6678723	6678728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506934462
178500	NC_021252	GGC	2	6	6678819	6678824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506934462

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