MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Amycolatopsis orientalis HCCB10007

Total Repeats: 239523

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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171002	NC_021252	TCG	2	6	6399107	6399112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506934196
171003	NC_021252	CGG	2	6	6399152	6399157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506934196
171004	NC_021252	GCG	2	6	6399179	6399184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506934196
171005	NC_021252	CGG	2	6	6399207	6399212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506934196
171006	NC_021252	GACG	2	8	6399214	6399221	25 %	0 %	50 %	25 %	506934196
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171009	NC_021252	CCG	2	6	6399353	6399358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506934196
171010	NC_021252	GCGA	2	8	6399370	6399377	25 %	0 %	50 %	25 %	506934196
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171014	NC_021252	CGC	2	6	6399533	6399538	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
171015	NC_021252	CGG	2	6	6399625	6399630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506934197
171016	NC_021252	GTC	2	6	6399638	6399643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506934197
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171115	NC_021252	CAC	2	6	6403219	6403224	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	506934202
171116	NC_021252	GAG	2	6	6403227	6403232	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
171117	NC_021252	GGA	2	6	6403352	6403357	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
171118	NC_021252	CGA	2	6	6403372	6403377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506934203
171119	NC_021252	GCT	2	6	6403444	6403449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506934203
171120	NC_021252	GCG	2	6	6403465	6403470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506934203
171121	NC_021252	CCGCCC	2	12	6403473	6403484	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	506934203
171122	NC_021252	ACC	2	6	6403517	6403522	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	506934203
171123	NC_021252	GT	3	6	6403558	6403563	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
171124	NC_021252	TCT	2	6	6403569	6403574	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
171125	NC_021252	AGC	3	9	6403614	6403622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506934204
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171151	NC_021252	CGT	2	6	6404854	6404859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506934205
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171221	NC_021252	CCGCG	2	10	6407728	6407737	0 %	0 %	40 %	60 %	506934209
171222	NC_021252	GAC	2	6	6407759	6407764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506934209
171223	NC_021252	CCA	2	6	6407805	6407810	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	506934209
171224	NC_021252	CG	3	6	6407857	6407862	0 %	0 %	50 %	50 %	506934209
171225	NC_021252	CGA	2	6	6407953	6407958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506934209
171226	NC_021252	GGC	2	6	6408011	6408016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506934209
171227	NC_021252	GCAC	2	8	6408122	6408129	25 %	0 %	25 %	50 %	506934210
171228	NC_021252	TCACCC	2	12	6408145	6408156	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	506934210
171229	NC_021252	GGC	2	6	6408188	6408193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506934210
171230	NC_021252	GCG	2	6	6408197	6408202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506934210
171231	NC_021252	CG	3	6	6408220	6408225	0 %	0 %	50 %	50 %	506934210
171232	NC_021252	CGA	2	6	6408233	6408238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506934210
171233	NC_021252	GTC	2	6	6408240	6408245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506934210
171234	NC_021252	GCG	2	6	6408260	6408265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506934210
171235	NC_021252	CGA	2	6	6408275	6408280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506934210
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171240	NC_021252	GGCGT	2	10	6408484	6408493	0 %	20 %	60 %	20 %	506934210
171241	NC_021252	TGC	2	6	6408499	6408504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506934210
171242	NC_021252	CCG	3	9	6408529	6408537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506934210
171243	NC_021252	CCG	3	9	6408577	6408585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506934210
171244	NC_021252	CCG	2	6	6408588	6408593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506934210
171245	NC_021252	GCG	2	6	6408602	6408607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506934210
171246	NC_021252	GCA	2	6	6408634	6408639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506934211
171247	NC_021252	GCC	2	6	6408719	6408724	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506934211
171248	NC_021252	GCC	2	6	6408737	6408742	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506934211
171249	NC_021252	CGC	2	6	6408750	6408755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506934211
171250	NC_021252	GCC	2	6	6408800	6408805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506934211
171251	NC_021252	CCG	3	9	6408852	6408860	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506934211
171252	NC_021252	CCA	2	6	6408865	6408870	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	506934211
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171255	NC_021252	GCCA	2	8	6409020	6409027	25 %	0 %	25 %	50 %	506934211
171256	NC_021252	GCG	2	6	6409035	6409040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506934211
171257	NC_021252	CGCGA	2	10	6409058	6409067	20 %	0 %	40 %	40 %	506934211
171258	NC_021252	CGA	2	6	6409081	6409086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506934211
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171260	NC_021252	GC	3	6	6409138	6409143	0 %	0 %	50 %	50 %	506934211
171261	NC_021252	CCG	2	6	6409182	6409187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506934211
171262	NC_021252	TCGAG	2	10	6409201	6409210	20 %	20 %	40 %	20 %	506934211
171263	NC_021252	CG	4	8	6409229	6409236	0 %	0 %	50 %	50 %	506934211
171264	NC_021252	GC	3	6	6409282	6409287	0 %	0 %	50 %	50 %	506934211
171265	NC_021252	GGCT	2	8	6409293	6409300	0 %	25 %	50 %	25 %	506934211
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171272	NC_021252	TCG	3	9	6409600	6409608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506934212
171273	NC_021252	GCC	2	6	6409629	6409634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506934212
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171275	NC_021252	GATCCG	2	12	6409685	6409696	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	506934212
171276	NC_021252	CAG	2	6	6409713	6409718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506934212
171277	NC_021252	CG	3	6	6409761	6409766	0 %	0 %	50 %	50 %	506934212
171278	NC_021252	CAC	2	6	6409815	6409820	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	506934212
171279	NC_021252	CGA	2	6	6409826	6409831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506934212
171280	NC_021252	CAG	2	6	6409839	6409844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506934212
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171282	NC_021252	GC	4	8	6409876	6409883	0 %	0 %	50 %	50 %	506934212
171283	NC_021252	GTC	2	6	6409884	6409889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506934212
171284	NC_021252	GCA	2	6	6409910	6409915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506934212
171285	NC_021252	GTA	2	6	6409962	6409967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	506934212
171286	NC_021252	CGG	2	6	6409970	6409975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506934212
171287	NC_021252	ATC	2	6	6410002	6410007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	506934212
171288	NC_021252	AAC	2	6	6410041	6410046	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	506934212
171289	NC_021252	AGT	2	6	6410062	6410067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	506934212
171290	NC_021252	TCC	2	6	6410080	6410085	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	506934212
171291	NC_021252	GAC	2	6	6410091	6410096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506934212
171292	NC_021252	CTC	2	6	6410108	6410113	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
171293	NC_021252	CA	3	6	6410181	6410186	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
171294	NC_021252	CGG	2	6	6410321	6410326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506934213
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171297	NC_021252	GCC	3	9	6410458	6410466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506934213
171298	NC_021252	CGT	2	6	6410484	6410489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506934213
171299	NC_021252	GCG	2	6	6410530	6410535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506934213
171300	NC_021252	GGT	2	6	6410583	6410588	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	506934213
171301	NC_021252	TGCAGG	2	12	6410597	6410608	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	506934213
171302	NC_021252	TGGCGC	2	12	6410630	6410641	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	506934213
171303	NC_021252	GCC	3	9	6410701	6410709	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506934213
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171306	NC_021252	GTCGCC	2	12	6410800	6410811	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	506934213
171307	NC_021252	GTC	2	6	6410815	6410820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506934213
171308	NC_021252	ATC	2	6	6410824	6410829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	506934213
171309	NC_021252	GCT	2	6	6410841	6410846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506934213
171310	NC_021252	GCT	2	6	6410862	6410867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506934213
171311	NC_021252	TCGGCA	2	12	6410885	6410896	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	506934213
171312	NC_021252	ACG	2	6	6410908	6410913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506934213
171313	NC_021252	GAACAC	2	12	6410934	6410945	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	506934213
171314	NC_021252	TGA	2	6	6410960	6410965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	506934213
171315	NC_021252	GGA	2	6	6411045	6411050	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	506934213
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171318	NC_021252	TCA	2	6	6411110	6411115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	506934213
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171320	NC_021252	CGT	2	6	6411135	6411140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506934213
171321	NC_021252	CGG	2	6	6411173	6411178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506934213
171322	NC_021252	GTC	2	6	6411199	6411204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506934213
171323	NC_021252	CTG	2	6	6411217	6411222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506934213
171324	NC_021252	GGCG	2	8	6411255	6411262	0 %	0 %	75 %	25 %	506934213
171325	NC_021252	GAC	2	6	6411294	6411299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506934213
171326	NC_021252	AC	3	6	6411298	6411303	50 %	0 %	0 %	50 %	506934213
171327	NC_021252	TCG	2	6	6411323	6411328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506934213
171328	NC_021252	CGC	2	6	6411354	6411359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506934213
171329	NC_021252	TCG	2	6	6411377	6411382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506934213
171330	NC_021252	CGC	2	6	6411390	6411395	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506934213
171331	NC_021252	CCG	2	6	6411428	6411433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506934213
171332	NC_021252	ACC	2	6	6411442	6411447	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	506934213
171333	NC_021252	TCG	3	9	6411512	6411520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506934213
171334	NC_021252	CAG	2	6	6411556	6411561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506934213
171335	NC_021252	CGG	2	6	6411576	6411581	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506934213
171336	NC_021252	CGC	2	6	6411605	6411610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506934213
171337	NC_021252	GCT	2	6	6411639	6411644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506934213
171338	NC_021252	AGC	2	6	6411670	6411675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506934213
171339	NC_021252	TGC	2	6	6411809	6411814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506934213
171340	NC_021252	TCG	2	6	6411830	6411835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506934213
171341	NC_021252	CTG	3	9	6411847	6411855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506934213
171342	NC_021252	TCG	2	6	6411875	6411880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506934213
171343	NC_021252	TCGGT	2	10	6411908	6411917	0 %	40 %	40 %	20 %	506934213
171344	NC_021252	GTG	2	6	6411937	6411942	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	506934213
171345	NC_021252	GGCT	2	8	6411958	6411965	0 %	25 %	50 %	25 %	506934213
171346	NC_021252	GAC	2	6	6411987	6411992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506934213
171347	NC_021252	TGC	2	6	6412010	6412015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506934213
171348	NC_021252	GGA	2	6	6412086	6412091	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	506934213
171349	NC_021252	GCA	2	6	6412113	6412118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506934213
171350	NC_021252	CGT	2	6	6412152	6412157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506934213
171351	NC_021252	CGC	3	9	6412161	6412169	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506934213
171352	NC_021252	TGATCA	2	12	6412172	6412183	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	506934213
171353	NC_021252	GT	3	6	6412184	6412189	0 %	50 %	50 %	0 %	506934213
171354	NC_021252	TGG	2	6	6412259	6412264	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	506934213
171355	NC_021252	GCT	2	6	6412308	6412313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506934213
171356	NC_021252	GTG	2	6	6412326	6412331	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	506934213
171357	NC_021252	TGC	2	6	6412355	6412360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506934213
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171359	NC_021252	TGA	2	6	6412410	6412415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	506934213
171360	NC_021252	GTCC	2	8	6412444	6412451	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
171361	NC_021252	CCT	2	6	6412459	6412464	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
171362	NC_021252	AGG	2	6	6412486	6412491	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
171363	NC_021252	CG	3	6	6412516	6412521	0 %	0 %	50 %	50 %	506934214
171364	NC_021252	GCC	2	6	6412595	6412600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506934214
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171367	NC_021252	CCGCG	2	10	6412819	6412828	0 %	0 %	40 %	60 %	506934214
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171375	NC_021252	GC	3	6	6413087	6413092	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
171376	NC_021252	GCCA	2	8	6413116	6413123	25 %	0 %	25 %	50 %	506934215
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171383	NC_021252	GCC	2	6	6413321	6413326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
171384	NC_021252	GGACC	2	10	6413328	6413337	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
171385	NC_021252	GAG	2	6	6413371	6413376	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	506934216
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171404	NC_021252	CGA	2	6	6413978	6413983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506934217
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171406	NC_021252	GAC	2	6	6414026	6414031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506934217
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171447	NC_021252	TCG	2	6	6415846	6415851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506934220
171448	NC_021252	ACC	2	6	6415852	6415857	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	506934220
171449	NC_021252	AGC	2	6	6415879	6415884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506934220
171450	NC_021252	CCG	2	6	6415912	6415917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506934220
171451	NC_021252	GTT	2	6	6415923	6415928	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	506934220
171452	NC_021252	CCA	2	6	6415967	6415972	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	506934220
171453	NC_021252	GCC	2	6	6415978	6415983	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506934220
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171455	NC_021252	GAT	2	6	6416052	6416057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	506934220
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171482	NC_021252	TCG	2	6	6417015	6417020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506934221
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