MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Amycolatopsis orientalis HCCB10007

Total Repeats: 239523

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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16502	NC_021252	CGG	2	6	615158	615163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506929147
16503	NC_021252	CGT	2	6	615237	615242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16504	NC_021252	CGC	2	6	615300	615305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16505	NC_021252	CGC	2	6	615328	615333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506929148
16506	NC_021252	GCA	3	9	615342	615350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506929148
16507	NC_021252	TCC	2	6	615374	615379	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	506929148
16508	NC_021252	ACG	2	6	615440	615445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506929148
16509	NC_021252	TCG	2	6	615467	615472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506929148
16510	NC_021252	TGC	2	6	615510	615515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506929148
16511	NC_021252	GGT	2	6	615517	615522	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	506929148
16512	NC_021252	CGG	2	6	615540	615545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506929148
16513	NC_021252	CCG	2	6	615575	615580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506929148
16514	NC_021252	GTG	2	6	615590	615595	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	506929148
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16519	NC_021252	CGT	2	6	615955	615960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506929149
16520	NC_021252	GGC	2	6	616059	616064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506929149
16521	NC_021252	GCG	2	6	616081	616086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506929149
16522	NC_021252	GCA	2	6	616087	616092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506929149
16523	NC_021252	GGGGC	2	10	616108	616117	0 %	0 %	80 %	20 %	506929149
16524	NC_021252	TCG	2	6	616131	616136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506929149
16525	NC_021252	CGGA	2	8	616137	616144	25 %	0 %	50 %	25 %	506929149
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16528	NC_021252	GC	3	6	616342	616347	0 %	0 %	50 %	50 %	506929149
16529	NC_021252	GCCC	2	8	616384	616391	0 %	0 %	25 %	75 %	506929149
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16533	NC_021252	CGCC	2	8	616485	616492	0 %	0 %	25 %	75 %	506929150
16534	NC_021252	CG	3	6	616524	616529	0 %	0 %	50 %	50 %	506929150
16535	NC_021252	CGA	2	6	616545	616550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506929150
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16539	NC_021252	CCCA	2	8	616715	616722	25 %	0 %	0 %	75 %	506929150
16540	NC_021252	TCGAAC	2	12	616736	616747	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	506929150
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16544	NC_021252	GGT	2	6	616982	616987	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	506929151
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16553	NC_021252	GCCGTA	2	12	617129	617140	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	506929151
16554	NC_021252	CGC	2	6	617186	617191	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506929151
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16585	NC_021252	CGT	2	6	618305	618310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506929152
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16587	NC_021252	ACGG	2	8	618525	618532	25 %	0 %	50 %	25 %	506929152
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16596	NC_021252	TAC	2	6	618830	618835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16597	NC_021252	GA	3	6	618843	618848	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16598	NC_021252	CCG	2	6	618908	618913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16599	NC_021252	CCG	2	6	618920	618925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16600	NC_021252	TCA	2	6	618926	618931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16601	NC_021252	CGC	2	6	618984	618989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16602	NC_021252	CCGA	2	8	619029	619036	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
16603	NC_021252	CCA	2	6	619065	619070	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	506929153
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16609	NC_021252	GAG	2	6	619295	619300	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	506929153
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16615	NC_021252	CGT	2	6	619624	619629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506929154
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16618	NC_021252	CAG	3	9	619712	619720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506929154
16619	NC_021252	CGT	2	6	619783	619788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506929154
16620	NC_021252	TGA	2	6	619795	619800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	506929154
16621	NC_021252	GTC	2	6	619841	619846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506929154
16622	NC_021252	GGTTC	2	10	619881	619890	0 %	40 %	40 %	20 %	506929155
16623	NC_021252	CGA	2	6	619914	619919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506929155
16624	NC_021252	TGG	2	6	619946	619951	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	506929155
16625	NC_021252	TGC	2	6	620012	620017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506929155
16626	NC_021252	GCGTC	3	15	620122	620136	0 %	20 %	40 %	40 %	506929155
16627	NC_021252	CGG	2	6	620257	620262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506929156
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16629	NC_021252	CG	3	6	620433	620438	0 %	0 %	50 %	50 %	506929156
16630	NC_021252	CCG	2	6	620444	620449	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506929156
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16632	NC_021252	CGC	2	6	620468	620473	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506929156
16633	NC_021252	CCGC	2	8	620475	620482	0 %	0 %	25 %	75 %	506929156
16634	NC_021252	TCGCCG	2	12	620556	620567	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	506929156
16635	NC_021252	CGG	2	6	620578	620583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506929156
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16637	NC_021252	CG	3	6	620657	620662	0 %	0 %	50 %	50 %	506929156
16638	NC_021252	TCG	2	6	620670	620675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506929156
16639	NC_021252	CGG	2	6	620684	620689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506929156
16640	NC_021252	CCGG	2	8	620716	620723	0 %	0 %	50 %	50 %	506929156
16641	NC_021252	GGC	2	6	620726	620731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506929156
16642	NC_021252	CGT	2	6	620732	620737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506929156
16643	NC_021252	GAG	2	6	620741	620746	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	506929156
16644	NC_021252	CCGA	2	8	620760	620767	25 %	0 %	25 %	50 %	506929156
16645	NC_021252	CAG	2	6	620795	620800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506929156
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16648	NC_021252	GCA	2	6	620856	620861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506929157
16649	NC_021252	CAC	2	6	620869	620874	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	506929157
16650	NC_021252	GCC	2	6	620881	620886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506929157
16651	NC_021252	CCGT	2	8	620908	620915	0 %	25 %	25 %	50 %	506929157
16652	NC_021252	CCG	3	9	620916	620924	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506929157
16653	NC_021252	CGC	2	6	620952	620957	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506929157
16654	NC_021252	CCCG	2	8	620971	620978	0 %	0 %	25 %	75 %	506929157
16655	NC_021252	GTCGAT	2	12	621028	621039	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	506929157
16656	NC_021252	CGC	2	6	621046	621051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506929157
16657	NC_021252	CGA	2	6	621087	621092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506929157
16658	NC_021252	GAC	2	6	621097	621102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506929157
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16661	NC_021252	GTCG	2	8	621313	621320	0 %	25 %	50 %	25 %	506929157
16662	NC_021252	CG	3	6	621319	621324	0 %	0 %	50 %	50 %	506929157
16663	NC_021252	AGC	2	6	621338	621343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506929157
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16667	NC_021252	CGG	2	6	621398	621403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506929157
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16669	NC_021252	AAGGA	2	10	621548	621557	60 %	0 %	40 %	0 %	506929157
16670	NC_021252	CCG	2	6	621569	621574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506929157
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16676	NC_021252	GTC	2	6	621801	621806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506929157
16677	NC_021252	CG	3	6	621828	621833	0 %	0 %	50 %	50 %	506929157
16678	NC_021252	CGCGAG	2	12	621868	621879	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	506929157
16679	NC_021252	GCG	2	6	621970	621975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506929157
16680	NC_021252	CAC	2	6	622062	622067	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16681	NC_021252	CGTT	2	8	622094	622101	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
16682	NC_021252	GAC	2	6	622112	622117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16683	NC_021252	GCC	2	6	622126	622131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16684	NC_021252	CCT	3	9	622137	622145	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	506929158
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16686	NC_021252	GGT	2	6	622213	622218	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	506929158
16687	NC_021252	ATC	2	6	622231	622236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	506929158
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16689	NC_021252	GCCA	2	8	622303	622310	25 %	0 %	25 %	50 %	506929158
16690	NC_021252	TGG	2	6	622325	622330	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	506929158
16691	NC_021252	GGT	2	6	622335	622340	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	506929158
16692	NC_021252	GAC	2	6	622344	622349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506929158
16693	NC_021252	GGCG	2	8	622362	622369	0 %	0 %	75 %	25 %	506929158
16694	NC_021252	ATC	2	6	622372	622377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	506929158
16695	NC_021252	TAC	2	6	622381	622386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	506929158
16696	NC_021252	CTG	3	9	622393	622401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506929158
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16701	NC_021252	TTC	2	6	622690	622695	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	506929158
16702	NC_021252	CGC	2	6	622710	622715	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506929158
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16705	NC_021252	CCG	2	6	622916	622921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506929159
16706	NC_021252	CGA	2	6	622947	622952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506929159
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16710	NC_021252	GTC	2	6	623115	623120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506929159
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16721	NC_021252	GGCCG	2	10	623505	623514	0 %	0 %	60 %	40 %	506929159
16722	NC_021252	GCC	2	6	623586	623591	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506929159
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16729	NC_021252	GGGC	2	8	623888	623895	0 %	0 %	75 %	25 %	506929159
16730	NC_021252	GCG	2	6	623896	623901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506929159
16731	NC_021252	CG	3	6	623958	623963	0 %	0 %	50 %	50 %	506929159
16732	NC_021252	TGG	2	6	624011	624016	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16733	NC_021252	GAG	2	6	624088	624093	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16734	NC_021252	GCA	2	6	624118	624123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506929160
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16736	NC_021252	CGC	2	6	624163	624168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506929160
16737	NC_021252	GCG	2	6	624174	624179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506929160
16738	NC_021252	CGA	2	6	624190	624195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506929160
16739	NC_021252	GTG	2	6	624208	624213	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	506929160
16740	NC_021252	GGT	2	6	624229	624234	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	506929160
16741	NC_021252	TCG	2	6	624273	624278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506929160
16742	NC_021252	GC	3	6	624312	624317	0 %	0 %	50 %	50 %	506929160
16743	NC_021252	TGC	2	6	624382	624387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506929160
16744	NC_021252	CGG	2	6	624403	624408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506929160
16745	NC_021252	GC	3	6	624412	624417	0 %	0 %	50 %	50 %	506929160
16746	NC_021252	GGCG	2	8	624496	624503	0 %	0 %	75 %	25 %	506929160
16747	NC_021252	GGCGAT	2	12	624532	624543	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	506929160
16748	NC_021252	CGC	2	6	624850	624855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506929161
16749	NC_021252	CGT	2	6	624957	624962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506929161
16750	NC_021252	GAT	2	6	624988	624993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	506929161
16751	NC_021252	CCCGG	2	10	625006	625015	0 %	0 %	40 %	60 %	506929161
16752	NC_021252	CAG	2	6	625024	625029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506929161
16753	NC_021252	CCG	2	6	625043	625048	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506929161
16754	NC_021252	GCA	2	6	625053	625058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506929161
16755	NC_021252	GTC	2	6	625139	625144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506929161
16756	NC_021252	TCA	2	6	625293	625298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	506929161
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16758	NC_021252	AGGT	2	8	625484	625491	25 %	25 %	50 %	0 %	506929161
16759	NC_021252	TGG	2	6	625548	625553	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	506929161
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16762	NC_021252	CGT	2	6	625659	625664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506929161
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16768	NC_021252	TCG	2	6	625952	625957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506929161
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16772	NC_021252	ACGT	2	8	626027	626034	25 %	25 %	25 %	25 %	506929161
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16774	NC_021252	GCC	2	6	626071	626076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506929161
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16802	NC_021252	CGA	2	6	626937	626942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506929161
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16813	NC_021252	GTTT	2	8	627303	627310	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
16814	NC_021252	TCC	2	6	627343	627348	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16815	NC_021252	ACGCG	2	10	627386	627395	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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16822	NC_021252	TCG	2	6	627729	627734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506929162
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16851	NC_021252	CGA	2	6	629021	629026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16852	NC_021252	CGG	3	9	629084	629092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16853	NC_021252	CGG	2	6	629198	629203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16854	NC_021252	CCG	2	6	629251	629256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16855	NC_021252	GGAA	2	8	629308	629315	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16856	NC_021252	GAAG	2	8	629490	629497	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16857	NC_021252	GGC	2	6	629541	629546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506929164
16858	NC_021252	CGA	2	6	629583	629588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506929164
16859	NC_021252	CGC	3	9	629634	629642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506929164
16860	NC_021252	CTGG	2	8	629658	629665	0 %	25 %	50 %	25 %	506929164
16861	NC_021252	CTG	2	6	629686	629691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506929164
16862	NC_021252	CCTCGC	2	12	629706	629717	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	506929164
16863	NC_021252	TTC	2	6	629812	629817	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	506929164
16864	NC_021252	CGC	2	6	629841	629846	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506929164
16865	NC_021252	CGG	2	6	629855	629860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506929164
16866	NC_021252	CTG	2	6	629872	629877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506929164
16867	NC_021252	GCCG	2	8	629890	629897	0 %	0 %	50 %	50 %	506929164
16868	NC_021252	CTG	2	6	629923	629928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506929164
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16871	NC_021252	GCT	2	6	630042	630047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506929164
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16874	NC_021252	TCG	3	9	630122	630130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506929164
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16882	NC_021252	TCG	2	6	630359	630364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506929164
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16892	NC_021252	TCCGC	2	10	630590	630599	0 %	20 %	20 %	60 %	506929164
16893	NC_021252	GC	3	6	630614	630619	0 %	0 %	50 %	50 %	506929164
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16910	NC_021252	TCG	2	6	631109	631114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506929164
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16934	NC_021252	CTG	2	6	632107	632112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506929164
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16936	NC_021252	TAG	2	6	632419	632424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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16942	NC_021252	GGC	2	6	632651	632656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16943	NC_021252	CGGG	2	8	632714	632721	0 %	0 %	75 %	25 %	506929166
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16968	NC_021252	GTC	2	6	633527	633532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506929167
16969	NC_021252	TAAG	2	8	633588	633595	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
16970	NC_021252	AGC	2	6	633630	633635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506929168
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16973	NC_021252	CACGAC	2	12	633929	633940	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	506929168
16974	NC_021252	GC	3	6	633941	633946	0 %	0 %	50 %	50 %	506929168
16975	NC_021252	CG	3	6	633959	633964	0 %	0 %	50 %	50 %	506929168
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16978	NC_021252	CGG	2	6	634000	634005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506929168
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16980	NC_021252	CGT	2	6	634114	634119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506929168
16981	NC_021252	GCC	2	6	634121	634126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506929168
16982	NC_021252	CGT	2	6	634145	634150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506929168
16983	NC_021252	TCT	2	6	634198	634203	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	506929168
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16991	NC_021252	CGCC	2	8	634411	634418	0 %	0 %	25 %	75 %	506929168
16992	NC_021252	CCG	2	6	634426	634431	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506929168
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16995	NC_021252	GCC	3	9	634496	634504	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506929168
16996	NC_021252	TTC	2	6	634507	634512	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	506929168
16997	NC_021252	CGTT	2	8	634524	634531	0 %	50 %	25 %	25 %	506929168
16998	NC_021252	GTG	2	6	634630	634635	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16999	NC_021252	TGG	2	6	634689	634694	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	506929169
17000	NC_021252	GGA	2	6	634705	634710	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	506929169

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