MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Amycolatopsis orientalis HCCB10007

Total Repeats: 239523

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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6502	NC_021252	ATC	2	6	240113	240118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	506928784
6503	NC_021252	CCG	2	6	240123	240128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506928784
6504	NC_021252	GGCCT	2	10	240131	240140	0 %	20 %	40 %	40 %	506928784
6505	NC_021252	CATGG	2	10	240194	240203	20 %	20 %	40 %	20 %	506928784
6506	NC_021252	CGG	2	6	240247	240252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506928784
6507	NC_021252	ATC	2	6	240265	240270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6508	NC_021252	CGC	2	6	240272	240277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6509	NC_021252	CCG	2	6	240308	240313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506928785
6510	NC_021252	GCC	2	6	240346	240351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506928785
6511	NC_021252	GCG	2	6	240385	240390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506928785
6512	NC_021252	CGA	2	6	240435	240440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506928785
6513	NC_021252	GAA	2	6	240465	240470	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	506928785
6514	NC_021252	CGC	2	6	240530	240535	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506928785
6515	NC_021252	CGC	2	6	240588	240593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506928785
6516	NC_021252	TCG	2	6	240605	240610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506928785
6517	NC_021252	CCG	2	6	240639	240644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506928785
6518	NC_021252	TC	3	6	240663	240668	0 %	50 %	0 %	50 %	506928785
6519	NC_021252	CGCTGG	2	12	240683	240694	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	506928785
6520	NC_021252	CTG	3	9	240697	240705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506928785
6521	NC_021252	GCT	3	9	240714	240722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506928785
6522	NC_021252	GTC	2	6	240723	240728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506928785
6523	NC_021252	CGT	2	6	240762	240767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506928785
6524	NC_021252	TCC	2	6	240782	240787	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	506928785
6525	NC_021252	ACGA	2	8	240788	240795	50 %	0 %	25 %	25 %	506928785
6526	NC_021252	CGC	3	9	240801	240809	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506928785
6527	NC_021252	GATC	2	8	240843	240850	25 %	25 %	25 %	25 %	506928785
6528	NC_021252	TGC	2	6	240851	240856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506928785
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6533	NC_021252	GCTG	2	8	240959	240966	0 %	25 %	50 %	25 %	506928785
6534	NC_021252	CGG	2	6	240977	240982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506928785
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6539	NC_021252	GC	3	6	241112	241117	0 %	0 %	50 %	50 %	506928785
6540	NC_021252	CTG	2	6	241174	241179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506928785
6541	NC_021252	CGGCG	2	10	241203	241212	0 %	0 %	60 %	40 %	506928785
6542	NC_021252	GCTG	2	8	241229	241236	0 %	25 %	50 %	25 %	506928785
6543	NC_021252	CCG	2	6	241243	241248	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506928785
6544	NC_021252	CAT	2	6	241272	241277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	506928785
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6547	NC_021252	CTG	2	6	241363	241368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506928785
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6550	NC_021252	TCG	2	6	241550	241555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506928785
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6552	NC_021252	TCG	2	6	241592	241597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506928785
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6561	NC_021252	GCG	2	6	241808	241813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506928786
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6599	NC_021252	TCAC	2	8	243208	243215	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6600	NC_021252	GC	3	6	243223	243228	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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6607	NC_021252	GCCGAG	2	12	243505	243516	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	506928788
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6622	NC_021252	GGT	2	6	244454	244459	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	506928789
6623	NC_021252	CG	3	6	244489	244494	0 %	0 %	50 %	50 %	506928789
6624	NC_021252	TTC	2	6	244495	244500	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	506928789
6625	NC_021252	GTA	2	6	244512	244517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	506928789
6626	NC_021252	GGC	2	6	244630	244635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506928789
6627	NC_021252	GCGA	2	8	244651	244658	25 %	0 %	50 %	25 %	506928789
6628	NC_021252	GGC	2	6	244671	244676	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506928789
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6630	NC_021252	CCAGCG	2	12	244757	244768	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	506928789
6631	NC_021252	TCG	2	6	244771	244776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506928789
6632	NC_021252	CCGTCT	2	12	244814	244825	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	506928789
6633	NC_021252	GAT	2	6	244851	244856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	506928789
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6642	NC_021252	CG	3	6	245242	245247	0 %	0 %	50 %	50 %	506928789
6643	NC_021252	CG	3	6	245277	245282	0 %	0 %	50 %	50 %	506928789
6644	NC_021252	GCCCA	2	10	245341	245350	20 %	0 %	20 %	60 %	506928789
6645	NC_021252	CAG	2	6	245467	245472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6648	NC_021252	GCA	2	6	245522	245527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506928790
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6651	NC_021252	CGG	2	6	245578	245583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506928790
6652	NC_021252	GACGC	2	10	245639	245648	20 %	0 %	40 %	40 %	506928790
6653	NC_021252	GTGG	2	8	245650	245657	0 %	25 %	75 %	0 %	506928790
6654	NC_021252	CG	3	6	245666	245671	0 %	0 %	50 %	50 %	506928790
6655	NC_021252	CAC	2	6	245689	245694	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	506928790
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6659	NC_021252	GGT	2	6	245762	245767	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	506928790
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6729	NC_021252	GGCG	2	8	248369	248376	0 %	0 %	75 %	25 %	506928792
6730	NC_021252	CGC	2	6	248384	248389	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506928792
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6732	NC_021252	GGC	2	6	248433	248438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506928792
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6740	NC_021252	CCGCG	2	10	248741	248750	0 %	0 %	40 %	60 %	506928792
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6744	NC_021252	GCG	2	6	248871	248876	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506928792
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6753	NC_021252	CTG	2	6	249024	249029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506928792
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6863	NC_021252	CAG	2	6	253016	253021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506928798
6864	NC_021252	GTA	2	6	253043	253048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	506928798
6865	NC_021252	GCC	2	6	253088	253093	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506928798
6866	NC_021252	TCG	2	6	253200	253205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506928798
6867	NC_021252	GAA	2	6	253211	253216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	506928798
6868	NC_021252	CGA	2	6	253237	253242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506928798
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6871	NC_021252	CGA	3	9	253319	253327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506928798
6872	NC_021252	CGC	2	6	253347	253352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506928798
6873	NC_021252	ACC	2	6	253392	253397	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	506928798
6874	NC_021252	CAG	2	6	253436	253441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506928798
6875	NC_021252	TCG	2	6	253458	253463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506928798
6876	NC_021252	CGT	3	9	253474	253482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506928798
6877	NC_021252	GCCA	2	8	253485	253492	25 %	0 %	25 %	50 %	506928798
6878	NC_021252	CCCG	2	8	253541	253548	0 %	0 %	25 %	75 %	506928798
6879	NC_021252	CGC	2	6	253549	253554	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506928798
6880	NC_021252	CGA	2	6	253603	253608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506928798
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6883	NC_021252	CCGG	2	8	253660	253667	0 %	0 %	50 %	50 %	506928798
6884	NC_021252	GCG	2	6	253674	253679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506928798
6885	NC_021252	GAC	2	6	253724	253729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506928798
6886	NC_021252	CGA	2	6	253735	253740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506928798
6887	NC_021252	TCG	2	6	253767	253772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506928798
6888	NC_021252	TCG	3	9	253791	253799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506928799
6889	NC_021252	TCCA	2	8	253925	253932	25 %	25 %	0 %	50 %	506928799
6890	NC_021252	TGGC	2	8	253973	253980	0 %	25 %	50 %	25 %	506928799
6891	NC_021252	TTG	2	6	254033	254038	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	506928799
6892	NC_021252	CGC	2	6	254044	254049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506928799
6893	NC_021252	TCG	2	6	254069	254074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506928799
6894	NC_021252	AGGATC	2	12	254075	254086	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	506928799
6895	NC_021252	TCGA	2	8	254093	254100	25 %	25 %	25 %	25 %	506928799
6896	NC_021252	GTC	2	6	254197	254202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506928799
6897	NC_021252	GAT	3	9	254251	254259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	506928799
6898	NC_021252	ATGCCG	2	12	254288	254299	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	506928799
6899	NC_021252	CAG	2	6	254368	254373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506928799
6900	NC_021252	GCA	2	6	254376	254381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506928799
6901	NC_021252	CGT	2	6	254451	254456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506928799
6902	NC_021252	GAT	2	6	254467	254472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	506928799
6903	NC_021252	GCC	2	6	254500	254505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506928799
6904	NC_021252	CTT	3	9	254521	254529	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	506928799
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6908	NC_021252	AGA	2	6	254853	254858	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	506928800
6909	NC_021252	GAT	2	6	254911	254916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	506928800
6910	NC_021252	CAG	3	9	254920	254928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506928800
6911	NC_021252	GC	3	6	255012	255017	0 %	0 %	50 %	50 %	506928800
6912	NC_021252	ACGC	2	8	255023	255030	25 %	0 %	25 %	50 %	506928800
6913	NC_021252	GAA	2	6	255064	255069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	506928800
6914	NC_021252	GCA	2	6	255138	255143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506928800
6915	NC_021252	GCG	2	6	255156	255161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506928800
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6917	NC_021252	TGA	2	6	255228	255233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	506928800
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6919	NC_021252	GGAA	2	8	255266	255273	50 %	0 %	50 %	0 %	506928800
6920	NC_021252	AAC	2	6	255293	255298	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	506928800
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6922	NC_021252	GCT	2	6	255384	255389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506928800
6923	NC_021252	GGC	2	6	255427	255432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506928800
6924	NC_021252	CG	4	8	255457	255464	0 %	0 %	50 %	50 %	506928800
6925	NC_021252	CGG	2	6	255487	255492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506928800
6926	NC_021252	GCA	2	6	255506	255511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506928800
6927	NC_021252	CGG	2	6	255516	255521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506928800
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6929	NC_021252	GAT	2	6	255571	255576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	506928801
6930	NC_021252	CTG	2	6	255666	255671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506928801
6931	NC_021252	CGC	2	6	255706	255711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506928801
6932	NC_021252	CCGG	2	8	255721	255728	0 %	0 %	50 %	50 %	506928801
6933	NC_021252	CCG	2	6	255767	255772	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506928801
6934	NC_021252	CGG	2	6	255779	255784	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506928801
6935	NC_021252	TCG	2	6	255831	255836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506928801
6936	NC_021252	CGT	2	6	255880	255885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506928801
6937	NC_021252	CCA	2	6	255909	255914	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	506928801
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6939	NC_021252	GCCGG	2	10	255961	255970	0 %	0 %	60 %	40 %	506928801
6940	NC_021252	TGG	2	6	256001	256006	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	506928801
6941	NC_021252	GTGCCG	2	12	256025	256036	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	506928801
6942	NC_021252	GTC	2	6	256046	256051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506928801
6943	NC_021252	GAA	2	6	256088	256093	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	506928801
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6946	NC_021252	CGT	2	6	256140	256145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506928801
6947	NC_021252	CGA	2	6	256186	256191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506928801
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6949	NC_021252	TCG	2	6	256236	256241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506928801
6950	NC_021252	CGC	2	6	256258	256263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506928801
6951	NC_021252	GCT	2	6	256273	256278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506928801
6952	NC_021252	CAGC	2	8	256327	256334	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6953	NC_021252	GCG	2	6	256378	256383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506928802
6954	NC_021252	CGA	2	6	256421	256426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506928802
6955	NC_021252	ACC	2	6	256480	256485	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	506928802
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6958	NC_021252	GGA	2	6	256601	256606	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	506928802
6959	NC_021252	GTCGCT	2	12	256616	256627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506928802
6960	NC_021252	GC	3	6	256662	256667	0 %	0 %	50 %	50 %	506928802
6961	NC_021252	CG	3	6	256727	256732	0 %	0 %	50 %	50 %	506928802
6962	NC_021252	CTG	2	6	256796	256801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506928803
6963	NC_021252	CGG	2	6	256835	256840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506928803
6964	NC_021252	CAC	2	6	256876	256881	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	506928803
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6966	NC_021252	CGT	2	6	256943	256948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506928803
6967	NC_021252	ACG	2	6	256965	256970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506928803
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6969	NC_021252	TCC	2	6	257070	257075	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	506928803
6970	NC_021252	GCC	2	6	257099	257104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506928803
6971	NC_021252	CGG	2	6	257143	257148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506928803
6972	NC_021252	TGC	2	6	257175	257180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506928803
6973	NC_021252	CG	3	6	257244	257249	0 %	0 %	50 %	50 %	506928803
6974	NC_021252	GTC	2	6	257252	257257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506928803
6975	NC_021252	GCC	2	6	257273	257278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506928803
6976	NC_021252	CCG	2	6	257281	257286	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506928803
6977	NC_021252	GAA	2	6	257293	257298	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	506928803
6978	NC_021252	TC	3	6	257350	257355	0 %	50 %	0 %	50 %	506928804
6979	NC_021252	CCG	2	6	257366	257371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506928804
6980	NC_021252	TCG	2	6	257430	257435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506928804
6981	NC_021252	GC	3	6	257454	257459	0 %	0 %	50 %	50 %	506928804
6982	NC_021252	CCGG	2	8	257482	257489	0 %	0 %	50 %	50 %	506928804
6983	NC_021252	AC	3	6	257511	257516	50 %	0 %	0 %	50 %	506928804
6984	NC_021252	GC	3	6	257581	257586	0 %	0 %	50 %	50 %	506928804
6985	NC_021252	TCT	2	6	257649	257654	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	506928804
6986	NC_021252	CCG	2	6	257673	257678	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506928804
6987	NC_021252	GCT	2	6	257683	257688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506928804
6988	NC_021252	TCG	2	6	257723	257728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506928804
6989	NC_021252	TCG	2	6	257733	257738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506928804
6990	NC_021252	ATC	2	6	257783	257788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	506928804
6991	NC_021252	CGG	2	6	257823	257828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506928804
6992	NC_021252	CG	4	8	257836	257843	0 %	0 %	50 %	50 %	506928804
6993	NC_021252	CGCC	2	8	257898	257905	0 %	0 %	25 %	75 %	506928804
6994	NC_021252	GCCT	2	8	257922	257929	0 %	25 %	25 %	50 %	506928804
6995	NC_021252	GGCG	2	8	257935	257942	0 %	0 %	75 %	25 %	506928804
6996	NC_021252	TCG	2	6	257955	257960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506928804
6997	NC_021252	GGC	2	6	257998	258003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506928804
6998	NC_021252	ACG	2	6	258054	258059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506928804
6999	NC_021252	GCG	2	6	258060	258065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506928804
7000	NC_021252	CG	3	6	258125	258130	0 %	0 %	50 %	50 %	506928804

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