MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Alistipes shahii WAL 8301 draft genome

Total Repeats: 82744

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_021030	TAC	2	6	183651	183656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479185272
4002	NC_021030	CTTC	2	8	183659	183666	0 %	50 %	0 %	50 %	479185272
4003	NC_021030	CCG	2	6	183703	183708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479185272
4004	NC_021030	ATC	2	6	183759	183764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479185272
4005	NC_021030	GCCG	2	8	183817	183824	0 %	0 %	50 %	50 %	479185273
4006	NC_021030	TAC	2	6	183851	183856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479185273
4007	NC_021030	GCT	2	6	183876	183881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479185273
4008	NC_021030	AAGCG	2	10	183986	183995	40 %	0 %	40 %	20 %	479185273
4009	NC_021030	CGG	2	6	184015	184020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479185273
4010	NC_021030	TTC	2	6	184049	184054	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479185273
4011	NC_021030	GCG	3	9	184080	184088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479185273
4012	NC_021030	CGT	2	6	184129	184134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479185273
4013	NC_021030	GCCG	2	8	184213	184220	0 %	0 %	50 %	50 %	479185274
4014	NC_021030	CGT	2	6	184428	184433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479185274
4015	NC_021030	CCG	2	6	184434	184439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479185274
4016	NC_021030	GCCG	2	8	184521	184528	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4017	NC_021030	GT	3	6	184543	184548	0 %	50 %	50 %	0 %	479185275
4018	NC_021030	AAGG	2	8	184573	184580	50 %	0 %	50 %	0 %	479185275
4019	NC_021030	GAA	2	6	184589	184594	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479185275
4020	NC_021030	CTT	2	6	184632	184637	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479185275
4021	NC_021030	CTT	2	6	184660	184665	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479185275
4022	NC_021030	GT	3	6	184673	184678	0 %	50 %	50 %	0 %	479185275
4023	NC_021030	CGGC	2	8	184722	184729	0 %	0 %	50 %	50 %	479185275
4024	NC_021030	TTC	2	6	184730	184735	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479185275
4025	NC_021030	TAC	2	6	184774	184779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479185275
4026	NC_021030	GTC	2	6	184780	184785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479185275
4027	NC_021030	GGC	2	6	184809	184814	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479185275
4028	NC_021030	CGT	2	6	184818	184823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479185275
4029	NC_021030	CGAA	2	8	184950	184957	50 %	0 %	25 %	25 %	479185275
4030	NC_021030	TAC	2	6	184969	184974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479185275
4031	NC_021030	CTT	3	9	185041	185049	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479185275
4032	NC_021030	GGT	2	6	185098	185103	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479185275
4033	NC_021030	TGCGT	2	10	185141	185150	0 %	40 %	40 %	20 %	479185275
4034	NC_021030	CGT	2	6	185166	185171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479185275
4035	NC_021030	TTG	2	6	185189	185194	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479185275
4036	NC_021030	TTG	2	6	185447	185452	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479185275
4037	NC_021030	CGT	2	6	185780	185785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479185276
4038	NC_021030	GTC	2	6	185910	185915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479185276
4039	NC_021030	TGC	2	6	185918	185923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479185276
4040	NC_021030	CGC	2	6	185927	185932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479185276
4041	NC_021030	GCC	2	6	185962	185967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479185276
4042	NC_021030	CCG	2	6	185968	185973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479185276
4043	NC_021030	CTTT	2	8	186014	186021	0 %	75 %	0 %	25 %	479185276
4044	NC_021030	GGT	2	6	186030	186035	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479185276
4045	NC_021030	CGT	2	6	186050	186055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479185276
4046	NC_021030	GTC	2	6	186144	186149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479185276
4047	NC_021030	T	6	6	186251	186256	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4048	NC_021030	GCC	2	6	186273	186278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479185277
4049	NC_021030	TGTA	2	8	186313	186320	25 %	50 %	25 %	0 %	479185277
4050	NC_021030	TTG	2	6	186349	186354	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479185277
4051	NC_021030	GCT	2	6	186418	186423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479185277
4052	NC_021030	CGT	2	6	186425	186430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479185277
4053	NC_021030	TCG	2	6	186466	186471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479185277
4054	NC_021030	GCC	2	6	186477	186482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479185277
4055	NC_021030	CGG	2	6	186568	186573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479185277
4056	NC_021030	TAG	2	6	186626	186631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479185277
4057	NC_021030	TTGC	2	8	186656	186663	0 %	50 %	25 %	25 %	479185277
4058	NC_021030	CCGG	2	8	186685	186692	0 %	0 %	50 %	50 %	479185277
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4061	NC_021030	CTT	2	6	186741	186746	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479185277
4062	NC_021030	CG	3	6	186761	186766	0 %	0 %	50 %	50 %	479185277
4063	NC_021030	TCCGCG	2	12	186787	186798	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	479185277
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4066	NC_021030	AGT	2	6	186952	186957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479185277
4067	NC_021030	TTAA	2	8	186996	187003	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4068	NC_021030	CAA	2	6	187009	187014	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4069	NC_021030	TAT	2	6	187022	187027	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4070	NC_021030	CAA	2	6	187075	187080	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4071	NC_021030	GGT	2	6	187110	187115	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4072	NC_021030	AAG	2	6	187185	187190	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4073	NC_021030	TAT	2	6	187208	187213	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4074	NC_021030	TCG	2	6	187293	187298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4075	NC_021030	CGG	2	6	187371	187376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4076	NC_021030	GCG	2	6	187390	187395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4077	NC_021030	CT	3	6	187490	187495	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4078	NC_021030	TC	3	6	187514	187519	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4079	NC_021030	TA	4	8	187520	187527	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4080	NC_021030	TTGT	2	8	187591	187598	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4081	NC_021030	GT	3	6	187597	187602	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4082	NC_021030	TAA	2	6	187607	187612	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4083	NC_021030	TTAT	2	8	187624	187631	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4084	NC_021030	TAT	2	6	187742	187747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4085	NC_021030	GCC	2	6	187810	187815	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4086	NC_021030	GCTGGT	2	12	187818	187829	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
4087	NC_021030	GTT	2	6	187897	187902	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4088	NC_021030	ATAG	2	8	188008	188015	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4089	NC_021030	TGCT	2	8	188029	188036	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4090	NC_021030	AT	3	6	188052	188057	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4091	NC_021030	T	6	6	188137	188142	0 %	100 %	0 %	0 %	479185278
4092	NC_021030	TAA	2	6	188173	188178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479185278
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4094	NC_021030	GTT	2	6	188239	188244	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479185278
4095	NC_021030	GAA	2	6	188263	188268	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479185278
4096	NC_021030	AAC	2	6	188278	188283	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479185278
4097	NC_021030	ACCCG	2	10	188369	188378	20 %	0 %	20 %	60 %	479185278
4098	NC_021030	GCTT	2	8	188452	188459	0 %	50 %	25 %	25 %	479185278
4099	NC_021030	CT	3	6	188526	188531	0 %	50 %	0 %	50 %	479185278
4100	NC_021030	CCA	2	6	188566	188571	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479185278
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4102	NC_021030	T	6	6	188766	188771	0 %	100 %	0 %	0 %	479185279
4103	NC_021030	GAA	2	6	188800	188805	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479185279
4104	NC_021030	ATAG	2	8	188863	188870	50 %	25 %	25 %	0 %	479185279
4105	NC_021030	TTA	2	6	188877	188882	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479185279
4106	NC_021030	TAA	2	6	188892	188897	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479185279
4107	NC_021030	ATT	2	6	188921	188926	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479185279
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4109	NC_021030	AAGG	2	8	188974	188981	50 %	0 %	50 %	0 %	479185279
4110	NC_021030	AGA	2	6	188988	188993	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479185279
4111	NC_021030	GAA	2	6	189010	189015	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479185279
4112	NC_021030	TA	3	6	189066	189071	50 %	50 %	0 %	0 %	479185279
4113	NC_021030	CGA	2	6	189073	189078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479185279
4114	NC_021030	AACG	2	8	189151	189158	50 %	0 %	25 %	25 %	479185279
4115	NC_021030	GTA	2	6	189237	189242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4116	NC_021030	AAGG	2	8	189296	189303	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4117	NC_021030	CTT	2	6	189322	189327	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479185280
4118	NC_021030	TCG	2	6	189338	189343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479185280
4119	NC_021030	CTGC	2	8	189366	189373	0 %	25 %	25 %	50 %	479185280
4120	NC_021030	TTC	2	6	189467	189472	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479185280
4121	NC_021030	ATA	2	6	189587	189592	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479185281
4122	NC_021030	CTG	2	6	189597	189602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479185281
4123	NC_021030	CTT	2	6	189696	189701	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479185281
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4247	NC_021030	TTC	2	6	196301	196306	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479185286
4248	NC_021030	TCT	2	6	196311	196316	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479185286
4249	NC_021030	GCC	2	6	196325	196330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479185286
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4251	NC_021030	TCG	2	6	196365	196370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479185286
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4267	NC_021030	TAT	3	9	197110	197118	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4279	NC_021030	TTA	2	6	197576	197581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4324	NC_021030	GTC	2	6	199710	199715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479185291
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4362	NC_021030	TTA	2	6	201463	201468	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4363	NC_021030	CTA	3	9	201484	201492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4365	NC_021030	TAC	2	6	201590	201595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4366	NC_021030	CTT	2	6	201675	201680	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4367	NC_021030	T	6	6	201712	201717	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4368	NC_021030	TAT	2	6	201819	201824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4369	NC_021030	AAAT	2	8	201922	201929	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4370	NC_021030	GGT	2	6	201971	201976	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4371	NC_021030	TAA	2	6	201978	201983	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4372	NC_021030	TCT	2	6	202029	202034	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479185295
4373	NC_021030	CTT	2	6	202091	202096	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479185295
4374	NC_021030	CGA	2	6	202189	202194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479185295
4375	NC_021030	CCG	2	6	202350	202355	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479185295
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4399	NC_021030	TGT	2	6	203614	203619	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479185295
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4401	NC_021030	ATC	2	6	203722	203727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479185296
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4494	NC_021030	CG	3	6	208482	208487	0 %	0 %	50 %	50 %	479185304
4495	NC_021030	GCTT	2	8	208639	208646	0 %	50 %	25 %	25 %	479185304
4496	NC_021030	GCT	2	6	208722	208727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479185304
4497	NC_021030	GTTC	2	8	208888	208895	0 %	50 %	25 %	25 %	479185305
4498	NC_021030	CCG	2	6	208909	208914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479185305
4499	NC_021030	CGTT	2	8	209024	209031	0 %	50 %	25 %	25 %	479185306
4500	NC_021030	CCG	2	6	209056	209061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479185306

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