MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Alistipes shahii WAL 8301 draft genome

Total Repeats: 82744

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
27001	NC_021030	ACG	2	6	1241989	1241994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27002	NC_021030	GGCAT	2	10	1242063	1242072	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
27003	NC_021030	CG	3	6	1242124	1242129	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27004	NC_021030	GGC	2	6	1242131	1242136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
27005	NC_021030	CGC	2	6	1242149	1242154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
27006	NC_021030	GCG	2	6	1242200	1242205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
27007	NC_021030	GATT	2	8	1242227	1242234	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
27008	NC_021030	A	6	6	1242264	1242269	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27009	NC_021030	CGC	2	6	1242345	1242350	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479186022
27010	NC_021030	CTA	2	6	1242474	1242479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479186022
27011	NC_021030	TTC	2	6	1242523	1242528	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479186022
27012	NC_021030	GGA	2	6	1242534	1242539	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479186022
27013	NC_021030	TAC	2	6	1242628	1242633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479186022
27014	NC_021030	CTT	2	6	1242744	1242749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479186022
27015	NC_021030	AAG	2	6	1242865	1242870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479186022
27016	NC_021030	GAC	2	6	1242921	1242926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479186022
27017	NC_021030	GAC	3	9	1242976	1242984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479186022
27018	NC_021030	GCA	2	6	1243025	1243030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479186022
27019	NC_021030	TGA	2	6	1243082	1243087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479186022
27020	NC_021030	T	6	6	1243094	1243099	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27021	NC_021030	CGA	2	6	1243123	1243128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27022	NC_021030	GC	4	8	1243132	1243139	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27023	NC_021030	A	7	7	1243153	1243159	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27024	NC_021030	TTG	2	6	1243189	1243194	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27025	NC_021030	AAAC	2	8	1243213	1243220	75 %	0 %	0 %	25 %	479186023
27026	NC_021030	GAC	3	9	1243247	1243255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479186023
27027	NC_021030	ACC	2	6	1243259	1243264	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479186023
27028	NC_021030	ATCC	2	8	1243285	1243292	25 %	25 %	0 %	50 %	479186023
27029	NC_021030	TCA	3	9	1243308	1243316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479186023
27030	NC_021030	TGA	2	6	1243437	1243442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479186023
27031	NC_021030	ACG	2	6	1243449	1243454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479186023
27032	NC_021030	CGAACG	2	12	1243498	1243509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479186023
27033	NC_021030	TGA	2	6	1243521	1243526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479186023
27034	NC_021030	AAG	2	6	1243535	1243540	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479186023
27035	NC_021030	AGG	2	6	1243581	1243586	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479186023
27036	NC_021030	CAA	2	6	1243648	1243653	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479186023
27037	NC_021030	TCA	2	6	1243659	1243664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479186023
27038	NC_021030	TCG	2	6	1243694	1243699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479186023
27039	NC_021030	GC	3	6	1243708	1243713	0 %	0 %	50 %	50 %	479186023
27040	NC_021030	GCC	2	6	1243733	1243738	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479186023
27041	NC_021030	ACA	2	6	1243746	1243751	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479186023
27042	NC_021030	GCA	2	6	1243812	1243817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479186023
27043	NC_021030	CGC	2	6	1243840	1243845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479186023
27044	NC_021030	CAA	2	6	1243897	1243902	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479186023
27045	NC_021030	ACC	2	6	1243946	1243951	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479186023
27046	NC_021030	CTA	2	6	1244047	1244052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479186023
27047	NC_021030	CGC	2	6	1244068	1244073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479186023
27048	NC_021030	GCC	2	6	1244106	1244111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479186023
27049	NC_021030	GGT	2	6	1244128	1244133	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479186023
27050	NC_021030	GTCGT	2	10	1244178	1244187	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
27051	NC_021030	GCC	2	6	1244207	1244212	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
27052	NC_021030	CCG	2	6	1244230	1244235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
27053	NC_021030	GCG	2	6	1244274	1244279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
27054	NC_021030	CCG	2	6	1244303	1244308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
27055	NC_021030	GCC	2	6	1244350	1244355	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
27056	NC_021030	GCA	2	6	1244381	1244386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27057	NC_021030	AGG	3	9	1244415	1244423	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27058	NC_021030	CCT	3	9	1244435	1244443	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
27059	NC_021030	CCG	2	6	1244461	1244466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
27060	NC_021030	GTGC	2	8	1244553	1244560	0 %	25 %	50 %	25 %	479186024
27061	NC_021030	CGA	2	6	1244606	1244611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479186024
27062	NC_021030	GCG	2	6	1244744	1244749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479186024
27063	NC_021030	CG	3	6	1244763	1244768	0 %	0 %	50 %	50 %	479186024
27064	NC_021030	ATC	2	6	1244803	1244808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479186024
27065	NC_021030	TGC	2	6	1244918	1244923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479186024
27066	NC_021030	CG	3	6	1244973	1244978	0 %	0 %	50 %	50 %	479186024
27067	NC_021030	CGTG	2	8	1244993	1245000	0 %	25 %	50 %	25 %	479186024
27068	NC_021030	TCG	2	6	1245056	1245061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479186024
27069	NC_021030	ACA	2	6	1245116	1245121	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479186024
27070	NC_021030	ATC	2	6	1245154	1245159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479186024
27071	NC_021030	CGC	2	6	1245170	1245175	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479186024
27072	NC_021030	TTC	2	6	1245178	1245183	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479186024
27073	NC_021030	GC	3	6	1245187	1245192	0 %	0 %	50 %	50 %	479186024
27074	NC_021030	ACGA	2	8	1245280	1245287	50 %	0 %	25 %	25 %	479186024
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27076	NC_021030	CTG	2	6	1245363	1245368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479186024
27077	NC_021030	GGT	2	6	1245413	1245418	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479186024
27078	NC_021030	GCG	2	6	1245425	1245430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479186024
27079	NC_021030	GCGGCC	2	12	1245487	1245498	0 %	0 %	50 %	50 %	479186024
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27082	NC_021030	A	6	6	1245571	1245576	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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27084	NC_021030	GGC	2	6	1245668	1245673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479186025
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27087	NC_021030	GTCACC	2	12	1245822	1245833	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	479186025
27088	NC_021030	GC	3	6	1245844	1245849	0 %	0 %	50 %	50 %	479186025
27089	NC_021030	CGG	2	6	1245907	1245912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479186025
27090	NC_021030	ATC	2	6	1245921	1245926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479186025
27091	NC_021030	GTC	2	6	1245938	1245943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479186025
27092	NC_021030	TGC	2	6	1245952	1245957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479186025
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27101	NC_021030	TCG	2	6	1246323	1246328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479186025
27102	NC_021030	CCT	2	6	1246342	1246347	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479186025
27103	NC_021030	GC	3	6	1246405	1246410	0 %	0 %	50 %	50 %	479186025
27104	NC_021030	CGATGC	2	12	1246411	1246422	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	479186025
27105	NC_021030	CGAA	2	8	1246438	1246445	50 %	0 %	25 %	25 %	479186025
27106	NC_021030	GC	3	6	1246461	1246466	0 %	0 %	50 %	50 %	479186025
27107	NC_021030	GTC	2	6	1246502	1246507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479186025
27108	NC_021030	CTT	2	6	1246520	1246525	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479186025
27109	NC_021030	GCC	2	6	1246592	1246597	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479186025
27110	NC_021030	T	6	6	1246619	1246624	0 %	100 %	0 %	0 %	479186025
27111	NC_021030	AGTT	2	8	1246646	1246653	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
27112	NC_021030	T	6	6	1246695	1246700	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27113	NC_021030	TCGC	2	8	1246845	1246852	0 %	25 %	25 %	50 %	479186026
27114	NC_021030	GGC	2	6	1246857	1246862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479186026
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27118	NC_021030	GCT	2	6	1246970	1246975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479186026
27119	NC_021030	ACG	2	6	1246978	1246983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479186026
27120	NC_021030	CAT	2	6	1246985	1246990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479186026
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27234	NC_021030	TGA	2	6	1250902	1250907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479186030
27235	NC_021030	ACGA	2	8	1250916	1250923	50 %	0 %	25 %	25 %	479186030
27236	NC_021030	GACC	2	8	1251020	1251027	25 %	0 %	25 %	50 %	479186030
27237	NC_021030	ACG	2	6	1251028	1251033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479186030
27238	NC_021030	CGT	2	6	1251056	1251061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479186030
27239	NC_021030	GAC	2	6	1251125	1251130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479186030
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27241	NC_021030	ACA	2	6	1251172	1251177	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479186030
27242	NC_021030	GAG	2	6	1251249	1251254	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479186030
27243	NC_021030	ACGA	2	8	1251270	1251277	50 %	0 %	25 %	25 %	479186030
27244	NC_021030	GGCG	2	8	1251290	1251297	0 %	0 %	75 %	25 %	479186030
27245	NC_021030	A	6	6	1251318	1251323	100 %	0 %	0 %	0 %	479186030
27246	NC_021030	GAC	2	6	1251356	1251361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479186030
27247	NC_021030	CTT	2	6	1251368	1251373	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479186030
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27252	NC_021030	CG	4	8	1251611	1251618	0 %	0 %	50 %	50 %	479186030
27253	NC_021030	GTG	3	9	1251690	1251698	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479186030
27254	NC_021030	GC	3	6	1251720	1251725	0 %	0 %	50 %	50 %	479186030
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27257	NC_021030	CCCG	2	8	1251918	1251925	0 %	0 %	25 %	75 %	479186030
27258	NC_021030	CGG	2	6	1251938	1251943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479186030
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27262	NC_021030	GCA	2	6	1252115	1252120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479186030
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27264	NC_021030	GCT	2	6	1252175	1252180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479186030
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27271	NC_021030	GCC	2	6	1252506	1252511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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27313	NC_021030	CGT	2	6	1253891	1253896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479186031
27314	NC_021030	CTG	3	9	1253922	1253930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479186031
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27326	NC_021030	GTCG	2	8	1254244	1254251	0 %	25 %	50 %	25 %	479186032
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27332	NC_021030	GCT	2	6	1254511	1254516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479186032
27333	NC_021030	GAA	2	6	1254568	1254573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479186032
27334	NC_021030	GAG	2	6	1254590	1254595	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479186032
27335	NC_021030	ACG	2	6	1254632	1254637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479186032
27336	NC_021030	GCC	2	6	1254651	1254656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479186032
27337	NC_021030	CGT	2	6	1254661	1254666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479186032
27338	NC_021030	GCA	2	6	1254745	1254750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479186032
27339	NC_021030	GGA	2	6	1254790	1254795	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479186032
27340	NC_021030	GCT	3	9	1254802	1254810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479186032
27341	NC_021030	CGG	2	6	1254820	1254825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479186032
27342	NC_021030	ACA	2	6	1254909	1254914	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479186032
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27344	NC_021030	GC	3	6	1254941	1254946	0 %	0 %	50 %	50 %	479186032
27345	NC_021030	ATG	2	6	1254962	1254967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479186032
27346	NC_021030	CGC	2	6	1254985	1254990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479186032
27347	NC_021030	CTG	2	6	1255028	1255033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479186032
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27349	NC_021030	GCC	2	6	1255178	1255183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479186032
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27453	NC_021030	N	385	385	1259138	1259522	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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27460	NC_021030	TGA	2	6	1259712	1259717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27461	NC_021030	GCC	2	6	1259747	1259752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
27462	NC_021030	TCT	2	6	1259883	1259888	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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27465	NC_021030	TC	3	6	1260064	1260069	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
27466	NC_021030	CGA	2	6	1260162	1260167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27467	NC_021030	ACG	2	6	1260194	1260199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27468	NC_021030	CAC	2	6	1260262	1260267	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
27469	NC_021030	CAG	2	6	1260337	1260342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27470	NC_021030	ATTT	2	8	1260407	1260414	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
27471	NC_021030	CCG	2	6	1260415	1260420	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
27472	NC_021030	GA	3	6	1260638	1260643	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
27473	NC_021030	TAT	2	6	1260730	1260735	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479186036
27474	NC_021030	CGA	2	6	1260885	1260890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479186036
27475	NC_021030	ACAG	2	8	1261030	1261037	50 %	0 %	25 %	25 %	479186036
27476	NC_021030	TCAC	2	8	1261070	1261077	25 %	25 %	0 %	50 %	479186036
27477	NC_021030	CTGC	2	8	1261099	1261106	0 %	25 %	25 %	50 %	479186036
27478	NC_021030	AAC	2	6	1261163	1261168	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479186036
27479	NC_021030	AGG	2	6	1261250	1261255	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479186036
27480	NC_021030	GCC	2	6	1261315	1261320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479186036
27481	NC_021030	GCT	2	6	1261347	1261352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479186036
27482	NC_021030	ACC	2	6	1261430	1261435	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479186036
27483	NC_021030	GGCT	2	8	1261457	1261464	0 %	25 %	50 %	25 %	479186036
27484	NC_021030	CA	3	6	1261507	1261512	50 %	0 %	0 %	50 %	479186036
27485	NC_021030	CGC	2	6	1261665	1261670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479186036
27486	NC_021030	CGT	2	6	1261683	1261688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479186036
27487	NC_021030	CATA	2	8	1261731	1261738	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
27488	NC_021030	TAAT	2	8	1261828	1261835	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27489	NC_021030	A	6	6	1261952	1261957	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27490	NC_021030	GGC	2	6	1262029	1262034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
27491	NC_021030	AAC	2	6	1262120	1262125	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27492	NC_021030	GTC	2	6	1262182	1262187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479186037
27493	NC_021030	TGT	2	6	1262188	1262193	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479186037
27494	NC_021030	TCT	3	9	1262194	1262202	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479186037
27495	NC_021030	GCA	2	6	1262248	1262253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479186037
27496	NC_021030	GAA	2	6	1262378	1262383	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479186037
27497	NC_021030	CAG	2	6	1262476	1262481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479186037
27498	NC_021030	TCTTCC	2	12	1262538	1262549	0 %	50 %	0 %	50 %	479186037
27499	NC_021030	GAC	2	6	1262567	1262572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479186037
27500	NC_021030	ATC	2	6	1262601	1262606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479186037

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