MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Alistipes shahii WAL 8301 draft genome

Total Repeats: 82744

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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26002	NC_021030	T	6	6	1199478	1199483	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26003	NC_021030	CGT	2	6	1199512	1199517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26004	NC_021030	CGC	2	6	1199522	1199527	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
26005	NC_021030	GGACG	2	10	1199595	1199604	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
26006	NC_021030	CCG	2	6	1199618	1199623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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26008	NC_021030	CCG	2	6	1199705	1199710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
26009	NC_021030	GCC	2	6	1199759	1199764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
26010	NC_021030	TGAAAA	2	12	1199801	1199812	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26011	NC_021030	CGC	2	6	1199815	1199820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
26012	NC_021030	GCGGAG	2	12	1199844	1199855	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
26013	NC_021030	CGG	2	6	1200059	1200064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479185997
26014	NC_021030	CGG	3	9	1200103	1200111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479185997
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26021	NC_021030	GTCG	2	8	1200274	1200281	0 %	25 %	50 %	25 %	479185997
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26042	NC_021030	TTC	3	9	1201157	1201165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26043	NC_021030	AAGT	2	8	1201238	1201245	50 %	25 %	25 %	0 %	479185998
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26232	NC_021030	TCC	2	6	1208805	1208810	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479186000
26233	NC_021030	GGA	2	6	1208815	1208820	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479186000
26234	NC_021030	CGC	2	6	1208889	1208894	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479186000
26235	NC_021030	ATC	2	6	1208924	1208929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479186000
26236	NC_021030	GCG	2	6	1208940	1208945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479186000
26237	NC_021030	ACT	2	6	1208979	1208984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479186000
26238	NC_021030	ACG	2	6	1209093	1209098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479186000
26239	NC_021030	GTCT	2	8	1209181	1209188	0 %	50 %	25 %	25 %	479186001
26240	NC_021030	GAA	2	6	1209219	1209224	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479186001
26241	NC_021030	CTT	2	6	1209231	1209236	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479186001
26242	NC_021030	GAC	2	6	1209265	1209270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479186001
26243	NC_021030	CGCC	2	8	1209300	1209307	0 %	0 %	25 %	75 %	479186001
26244	NC_021030	CTG	2	6	1209331	1209336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479186001
26245	NC_021030	TCA	2	6	1209344	1209349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479186001
26246	NC_021030	GTTC	2	8	1209374	1209381	0 %	50 %	25 %	25 %	479186001
26247	NC_021030	AGG	2	6	1209521	1209526	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479186001
26248	NC_021030	ACGCCA	2	12	1209719	1209730	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	479186001
26249	NC_021030	CTG	3	9	1209748	1209756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479186001
26250	NC_021030	GAC	2	6	1209775	1209780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479186001
26251	NC_021030	TCA	2	6	1209878	1209883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479186001
26252	NC_021030	GC	4	8	1209951	1209958	0 %	0 %	50 %	50 %	479186001
26253	NC_021030	GAA	2	6	1209981	1209986	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479186001
26254	NC_021030	GAA	2	6	1210020	1210025	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479186001
26255	NC_021030	CGA	2	6	1210074	1210079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479186001
26256	NC_021030	CTGG	2	8	1210098	1210105	0 %	25 %	50 %	25 %	479186001
26257	NC_021030	AGAAGG	2	12	1210148	1210159	50 %	0 %	50 %	0 %	479186001
26258	NC_021030	CTA	2	6	1210224	1210229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479186001
26259	NC_021030	CCA	2	6	1210235	1210240	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479186001
26260	NC_021030	ACG	2	6	1210295	1210300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479186001
26261	NC_021030	TCA	2	6	1210304	1210309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479186001
26262	NC_021030	TCA	2	6	1210334	1210339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479186001
26263	NC_021030	GGC	2	6	1210368	1210373	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479186001
26264	NC_021030	A	6	6	1210375	1210380	100 %	0 %	0 %	0 %	479186001
26265	NC_021030	T	7	7	1210433	1210439	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26266	NC_021030	GC	3	6	1210453	1210458	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26267	NC_021030	AC	3	6	1210506	1210511	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
26268	NC_021030	CTG	2	6	1210534	1210539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479186002
26269	NC_021030	TGA	2	6	1210583	1210588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479186002
26270	NC_021030	TCA	2	6	1210640	1210645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479186002
26271	NC_021030	CGA	2	6	1210653	1210658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479186002
26272	NC_021030	CTA	2	6	1210680	1210685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479186002
26273	NC_021030	GCT	2	6	1210692	1210697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479186002
26274	NC_021030	TGC	2	6	1210721	1210726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479186002
26275	NC_021030	CAA	2	6	1210743	1210748	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479186002
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26278	NC_021030	AAC	2	6	1210945	1210950	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479186002
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26290	NC_021030	CGA	2	6	1211535	1211540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479186002
26291	NC_021030	GC	3	6	1211547	1211552	0 %	0 %	50 %	50 %	479186002
26292	NC_021030	CGA	2	6	1211559	1211564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479186002
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26302	NC_021030	TCGA	2	8	1211890	1211897	25 %	25 %	25 %	25 %	479186002
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26316	NC_021030	CG	3	6	1212416	1212421	0 %	0 %	50 %	50 %	479186003
26317	NC_021030	CCT	2	6	1212439	1212444	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479186003
26318	NC_021030	CCT	2	6	1212462	1212467	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
26319	NC_021030	CCA	2	6	1212486	1212491	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
26320	NC_021030	CCCGC	2	10	1212517	1212526	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
26321	NC_021030	CGG	2	6	1212550	1212555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
26322	NC_021030	CGG	2	6	1212575	1212580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
26323	NC_021030	GGC	2	6	1212726	1212731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
26324	NC_021030	T	6	6	1212781	1212786	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26325	NC_021030	A	8	8	1212952	1212959	100 %	0 %	0 %	0 %	479186004
26326	NC_021030	CGA	2	6	1213105	1213110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479186004
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26328	NC_021030	GCG	2	6	1213167	1213172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479186004
26329	NC_021030	GCA	2	6	1213192	1213197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479186004
26330	NC_021030	GAT	2	6	1213264	1213269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479186004
26331	NC_021030	GAT	2	6	1213288	1213293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479186004
26332	NC_021030	CGC	2	6	1213312	1213317	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479186004
26333	NC_021030	GCC	2	6	1213352	1213357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479186004
26334	NC_021030	GACG	2	8	1213375	1213382	25 %	0 %	50 %	25 %	479186004
26335	NC_021030	TTC	2	6	1213406	1213411	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479186004
26336	NC_021030	AGG	2	6	1213419	1213424	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479186004
26337	NC_021030	GAT	2	6	1213441	1213446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479186004
26338	NC_021030	GCG	2	6	1213474	1213479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479186004
26339	NC_021030	GCC	2	6	1213501	1213506	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
26340	NC_021030	T	6	6	1213527	1213532	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26341	NC_021030	TCCG	2	8	1213597	1213604	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
26342	NC_021030	GAA	2	6	1213708	1213713	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479186005
26343	NC_021030	GGT	2	6	1213734	1213739	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479186005
26344	NC_021030	TCG	2	6	1213805	1213810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479186005
26345	NC_021030	CG	3	6	1213817	1213822	0 %	0 %	50 %	50 %	479186005
26346	NC_021030	CCT	2	6	1213839	1213844	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479186005
26347	NC_021030	CAC	2	6	1213846	1213851	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479186005
26348	NC_021030	GCT	2	6	1213881	1213886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479186005
26349	NC_021030	TTG	2	6	1213916	1213921	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479186005
26350	NC_021030	GCA	2	6	1213929	1213934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479186005
26351	NC_021030	TCG	2	6	1213946	1213951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479186005
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26463	NC_021030	GAC	2	6	1218161	1218166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479186009
26464	NC_021030	CGA	2	6	1218188	1218193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479186009
26465	NC_021030	GCC	2	6	1218282	1218287	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479186009
26466	NC_021030	CGC	2	6	1218300	1218305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479186009
26467	NC_021030	CGGCCA	2	12	1218311	1218322	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	479186009
26468	NC_021030	GC	3	6	1218332	1218337	0 %	0 %	50 %	50 %	479186009
26469	NC_021030	GAT	2	6	1218347	1218352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479186009
26470	NC_021030	CGT	2	6	1218386	1218391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479186009
26471	NC_021030	TCG	3	9	1218417	1218425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479186009
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26473	NC_021030	GCC	2	6	1218672	1218677	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479186009
26474	NC_021030	CG	3	6	1218745	1218750	0 %	0 %	50 %	50 %	479186009
26475	NC_021030	AGA	2	6	1218853	1218858	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479186009
26476	NC_021030	CCA	2	6	1218859	1218864	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479186009
26477	NC_021030	ACC	2	6	1218867	1218872	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479186009
26478	NC_021030	ACA	2	6	1218892	1218897	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479186009
26479	NC_021030	AGG	2	6	1218928	1218933	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479186009
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26481	NC_021030	TCG	2	6	1219036	1219041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479186009
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26486	NC_021030	CGGA	2	8	1219349	1219356	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
26487	NC_021030	A	6	6	1219356	1219361	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26488	NC_021030	TCCG	2	8	1219371	1219378	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
26489	NC_021030	ACGG	2	8	1219444	1219451	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
26490	NC_021030	GAA	2	6	1219457	1219462	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26491	NC_021030	GAA	2	6	1219471	1219476	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26492	NC_021030	GAA	2	6	1219485	1219490	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26493	NC_021030	GCGG	2	8	1219497	1219504	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
26494	NC_021030	AG	3	6	1219507	1219512	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
26495	NC_021030	GCG	2	6	1219513	1219518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
26496	NC_021030	GAAC	2	8	1219519	1219526	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
26497	NC_021030	CAAA	2	8	1219535	1219542	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
26498	NC_021030	TAT	2	6	1219570	1219575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26499	NC_021030	AAG	2	6	1219646	1219651	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479186010
26500	NC_021030	GAC	2	6	1219667	1219672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479186010

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