MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Alistipes shahii WAL 8301 draft genome

Total Repeats: 82744

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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24502	NC_021030	AAT	2	6	1131572	1131577	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24503	NC_021030	CAC	2	6	1131636	1131641	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479185955
24504	NC_021030	TGC	2	6	1131710	1131715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479185955
24505	NC_021030	GAC	2	6	1131720	1131725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479185955
24506	NC_021030	GTC	3	9	1131804	1131812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479185955
24507	NC_021030	GGA	2	6	1131852	1131857	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479185955
24508	NC_021030	GA	3	6	1131922	1131927	50 %	0 %	50 %	0 %	479185955
24509	NC_021030	CGG	2	6	1131941	1131946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479185955
24510	NC_021030	CGTC	2	8	1131947	1131954	0 %	25 %	25 %	50 %	479185955
24511	NC_021030	GTG	2	6	1131987	1131992	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479185955
24512	NC_021030	GCC	2	6	1132093	1132098	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479185955
24513	NC_021030	GCC	2	6	1132128	1132133	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479185955
24514	NC_021030	CAG	3	9	1132164	1132172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479185955
24515	NC_021030	CG	3	6	1132214	1132219	0 %	0 %	50 %	50 %	479185955
24516	NC_021030	CCG	2	6	1132247	1132252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479185955
24517	NC_021030	GAA	2	6	1132278	1132283	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479185955
24518	NC_021030	TCG	2	6	1132310	1132315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479185955
24519	NC_021030	CGG	2	6	1132337	1132342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479185955
24520	NC_021030	GCG	2	6	1132384	1132389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479185955
24521	NC_021030	TAG	2	6	1132414	1132419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479185955
24522	NC_021030	CGT	2	6	1132448	1132453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479185955
24523	NC_021030	GTC	2	6	1132500	1132505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479185955
24524	NC_021030	CGT	2	6	1132517	1132522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479185955
24525	NC_021030	TCCCC	2	10	1132543	1132552	0 %	20 %	0 %	80 %	479185955
24526	NC_021030	GTC	2	6	1132570	1132575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479185955
24527	NC_021030	CCG	2	6	1132643	1132648	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
24528	NC_021030	GGGA	2	8	1132669	1132676	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
24529	NC_021030	TGCG	2	8	1132713	1132720	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
24530	NC_021030	TCC	2	6	1132757	1132762	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479185956
24531	NC_021030	TGC	2	6	1132884	1132889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479185956
24532	NC_021030	CCGAA	2	10	1132923	1132932	40 %	0 %	20 %	40 %	479185956
24533	NC_021030	G	6	6	1132941	1132946	0 %	0 %	100 %	0 %	479185956
24534	NC_021030	TTA	2	6	1132952	1132957	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479185956
24535	NC_021030	GCC	2	6	1132993	1132998	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479185956
24536	NC_021030	CAT	2	6	1133064	1133069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479185956
24537	NC_021030	T	6	6	1133075	1133080	0 %	100 %	0 %	0 %	479185956
24538	NC_021030	CGG	2	6	1133169	1133174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479185956
24539	NC_021030	CTTGGC	2	12	1133257	1133268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479185956
24540	NC_021030	TCG	2	6	1133381	1133386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479185956
24541	NC_021030	TAA	2	6	1133613	1133618	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479185956
24542	NC_021030	GCG	2	6	1133648	1133653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479185956
24543	NC_021030	GTT	2	6	1133662	1133667	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479185956
24544	NC_021030	GCC	2	6	1133783	1133788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479185956
24545	NC_021030	T	7	7	1133814	1133820	0 %	100 %	0 %	0 %	479185956
24546	NC_021030	T	7	7	1133822	1133828	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24547	NC_021030	TCG	2	6	1133851	1133856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24548	NC_021030	TCC	2	6	1133883	1133888	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479185957
24549	NC_021030	TCC	2	6	1133892	1133897	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479185957
24550	NC_021030	GAT	2	6	1133966	1133971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479185957
24551	NC_021030	CGAG	2	8	1134016	1134023	25 %	0 %	50 %	25 %	479185957
24552	NC_021030	AGC	2	6	1134045	1134050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479185957
24553	NC_021030	CTCCAT	2	12	1134056	1134067	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	479185957
24554	NC_021030	AGC	2	6	1134154	1134159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479185957
24555	NC_021030	GTT	2	6	1134161	1134166	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479185957
24556	NC_021030	GCC	2	6	1134224	1134229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479185957
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24558	NC_021030	GGTG	2	8	1134244	1134251	0 %	25 %	75 %	0 %	479185957
24559	NC_021030	GAT	2	6	1134311	1134316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479185957
24560	NC_021030	GCC	2	6	1134342	1134347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479185957
24561	NC_021030	ATC	2	6	1134390	1134395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479185957
24562	NC_021030	GCC	3	9	1134473	1134481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479185957
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24566	NC_021030	ATA	2	6	1134770	1134775	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479185957
24567	NC_021030	GTC	2	6	1134779	1134784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479185957
24568	NC_021030	CAG	2	6	1134789	1134794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479185957
24569	NC_021030	GAG	2	6	1134795	1134800	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479185957
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24571	NC_021030	T	6	6	1134860	1134865	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24572	NC_021030	GAC	2	6	1134949	1134954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24573	NC_021030	GGCTGC	2	12	1135047	1135058	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
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24575	NC_021030	CGT	3	9	1135119	1135127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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24577	NC_021030	TTG	2	6	1135268	1135273	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24578	NC_021030	CCA	2	6	1135279	1135284	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24579	NC_021030	CAG	2	6	1135390	1135395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24580	NC_021030	GAT	2	6	1135552	1135557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24581	NC_021030	GTT	2	6	1135591	1135596	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24582	NC_021030	GCC	2	6	1135605	1135610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
24583	NC_021030	GCC	2	6	1135638	1135643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
24584	NC_021030	TGA	2	6	1135674	1135679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24585	NC_021030	GTC	2	6	1135711	1135716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24586	NC_021030	CT	3	6	1135775	1135780	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24587	NC_021030	AGCCCG	2	12	1135822	1135833	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
24588	NC_021030	TTC	2	6	1135834	1135839	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24589	NC_021030	GAT	2	6	1135888	1135893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24590	NC_021030	GCGA	2	8	1135952	1135959	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
24591	NC_021030	CTC	2	6	1135960	1135965	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24592	NC_021030	CTT	2	6	1135978	1135983	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24593	NC_021030	ACA	2	6	1136089	1136094	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24594	NC_021030	ACGC	2	8	1136096	1136103	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
24595	NC_021030	A	6	6	1136164	1136169	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24596	NC_021030	TCC	2	6	1136198	1136203	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24597	NC_021030	T	6	6	1136208	1136213	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24598	NC_021030	AGCG	2	8	1136241	1136248	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
24599	NC_021030	CTT	2	6	1136256	1136261	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24600	NC_021030	TAT	2	6	1136294	1136299	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24601	NC_021030	ATCA	2	8	1136385	1136392	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
24602	NC_021030	N	729	729	1136439	1137167	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24603	NC_021030	CGT	2	6	1137215	1137220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24604	NC_021030	TTC	2	6	1137225	1137230	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24605	NC_021030	ACC	2	6	1137246	1137251	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24606	NC_021030	TTCC	2	8	1137254	1137261	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24607	NC_021030	GA	4	8	1137263	1137270	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24608	NC_021030	A	6	6	1137295	1137300	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24609	NC_021030	TGA	2	6	1137479	1137484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479185958
24610	NC_021030	GGCG	2	8	1137530	1137537	0 %	0 %	75 %	25 %	479185958
24611	NC_021030	T	6	6	1137582	1137587	0 %	100 %	0 %	0 %	479185958
24612	NC_021030	GCAT	2	8	1137640	1137647	25 %	25 %	25 %	25 %	479185958
24613	NC_021030	GCA	2	6	1137662	1137667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479185958
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24615	NC_021030	AAC	2	6	1137733	1137738	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479185958
24616	NC_021030	CTGC	2	8	1137753	1137760	0 %	25 %	25 %	50 %	479185958
24617	NC_021030	AG	3	6	1137765	1137770	50 %	0 %	50 %	0 %	479185958
24618	NC_021030	TCTT	2	8	1137787	1137794	0 %	75 %	0 %	25 %	479185958
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24620	NC_021030	TCT	2	6	1137998	1138003	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479185958
24621	NC_021030	AGG	2	6	1138049	1138054	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479185958
24622	NC_021030	ATC	2	6	1138099	1138104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479185958
24623	NC_021030	GGCG	2	8	1138346	1138353	0 %	0 %	75 %	25 %	479185958
24624	NC_021030	CCGG	2	8	1138415	1138422	0 %	0 %	50 %	50 %	479185958
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24628	NC_021030	TGT	3	9	1138583	1138591	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24629	NC_021030	GTT	2	6	1138834	1138839	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479185959
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24634	NC_021030	TCGG	2	8	1139074	1139081	0 %	25 %	50 %	25 %	479185959
24635	NC_021030	ATA	2	6	1139087	1139092	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479185959
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24640	NC_021030	CCG	2	6	1139325	1139330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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24643	NC_021030	CAA	2	6	1139576	1139581	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479185960
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24741	NC_021030	CTT	2	6	1144994	1144999	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24742	NC_021030	ATC	2	6	1145019	1145024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24743	NC_021030	CGG	2	6	1145030	1145035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
24744	NC_021030	GCC	2	6	1145085	1145090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479185962
24745	NC_021030	CTG	2	6	1145091	1145096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479185962
24746	NC_021030	GCGCCG	2	12	1145130	1145141	0 %	0 %	50 %	50 %	479185962
24747	NC_021030	TCG	2	6	1145158	1145163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479185962
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24760	NC_021030	CGT	2	6	1145819	1145824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479185962
24761	NC_021030	CG	3	6	1145862	1145867	0 %	0 %	50 %	50 %	479185962
24762	NC_021030	CTG	2	6	1145877	1145882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479185962
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24857	NC_021030	CGA	4	12	1149876	1149887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479185964
24858	NC_021030	CG	3	6	1149911	1149916	0 %	0 %	50 %	50 %	479185964
24859	NC_021030	CGC	2	6	1149954	1149959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479185964
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24977	NC_021030	GCT	2	6	1155439	1155444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479185967
24978	NC_021030	CTT	2	6	1155454	1155459	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479185967
24979	NC_021030	GCC	2	6	1155474	1155479	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479185967
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24981	NC_021030	A	7	7	1155530	1155536	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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24984	NC_021030	TTA	2	6	1155631	1155636	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24985	NC_021030	CGG	2	6	1155805	1155810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479185968
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